考拉保护正成为新风口

问题提出:考拉是否仅在人类抵达澳洲后才数量崩溃?悉尼大学与德州农工大学领衔的一项大型基因组分析改写了这一认知。研究表明,考拉(Phascolarctos cinereus)约在10万年前经历过一次严重的人口衰退,远早于人类约6.5万年前抵达澳洲的时间;当今每只考拉似乎都源自熬过剧烈环境变迁(包括冰期)的同一祖先种群。 "这项研究重写了考拉在澳洲的遗传史时间线,"主导研究的博士生 Toby Kovacs 说,"通过计算现代考拉种群的突变率,我们可以倒推构建直至10万年前的遗传时间线,一窥古代考拉种群的遗传多样性与规模。"化石证据过于有限,难以精确显示10万年前考拉数量,而基因组数据能保存早期种群规模与遗传多样性变化的线索。 深入分析:团队对四个亲子 trio 进行基因组测序以统计新发突变,据此算出考拉精确突变率——约为人类的一半,这也是对有袋类双门齿目(含袋熊、袋鼠、负鼠)首个直接突变率估计。此前研究基于人类、小鼠等远亲哺乳动......阅读全文

考拉保护正成为新风口

问题提出:考拉是否仅在人类抵达澳洲后才数量崩溃?悉尼大学与德州农工大学领衔的一项大型基因组分析改写了这一认知。研究表明,考拉(Phascolarctos cinereus)约在10万年前经历过一次严重的人口衰退,远早于人类约6.5万年前抵达澳洲的时间;当今每只考拉似乎都源自熬过剧烈环境变迁(包括

基因组分析阐明考拉生存环境

  日前,日本京都大学灵长类研究所的研究人员参加的国际研究团队,通过基因组(全遗传信息)分析阐明,在澳大利亚东部生活的有袋类考拉,是从以主食桉树叶所持有的毒素中感觉到的苦味而择食,并仅选择桉树叶为食从而进化的。该研究成果发表在美国《自然—遗传学》杂志电子版。  研究表明,桉树叶含有毒性而味苦,几乎所

PNAS首次评估表观遗传学突变率

  Groningen大学的科学家们在重要模式生物拟南芥中,精确评估了表观遗传学标志出现或消失的频率,有助于深入理解表观遗传学改变在植物进化中的重要性。这项研究发表在五月十一日的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。  表观遗传学修饰可以在不改变DNA序列的情况下影响基因的活性。大多数动物(包括人类)的

演化之谜揭晓:不同物种DNA突变率为何不同?

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495009.shtm和父母相比,每一个子女都会携带新产生的DNA突变,而不同物种的隔代突变率是不同的。浙江大学生命演化研究中心教授张国捷的团队通过跨物种比较分析,揭示了不同物种DNA突变率差异的根本原因和

澳大利亚科学家绘制出考拉基因图谱

  拯救和保护考拉是澳大利亚科学家,以及社会各界人士所关注并在积极努力开展的工作。澳媒10日报道说,澳科学家根据考拉数量逐渐减少的情况,为使考拉的疾病得到及时、切实的治疗,已在绘制考拉基因图谱方面取得新进展。   据报道,考拉的遗传基因研究受到国际关注。由澳大利亚博物馆和昆士兰科技大学的科学家经过

种间繁殖造就现代猞猁多样性

  西班牙科学家研究发现,古代伊比利亚猞猁的遗传多样性比现代猞猁要低,其背后原因是欧亚和伊比利亚猞猁的基因混合促进了现代伊比利亚猞猁的遗传多样性,虽然该种群规模近来有所下降。相关研究1月16日发表于《自然—生态与演化》。  约100万年前,伊比利亚猞猁从其姐妹物种欧亚猞猁分化而来,但它们的基因组显示

凭部分基因和表型“认亲”不靠谱

 巢穴中的小山猴   Roberto F. Nespolo摄■本报记者 张文静长期以来,用物种形态特征和分子数据构建物种关系树,是很多研究常用的做法。而实际上用这两种方法推断物种演化历程时,常常出现相互矛盾的情况,但相关研究非常有限。4月20日,《细胞》刊发了一项由中国科学家领衔的中外联合团队进行的

凭部分基因和表型“认亲”不靠谱

  长期以来,用物种形态特征和分子数据构建物种关系树,是很多研究常用的做法。而实际上用这两种方法推断物种演化历程时,常常出现相互矛盾的情况,但相关研究非常有限。  4月20日,《细胞》刊发了一项由中国科学家领衔的中外联合团队进行的研究。该研究不仅公布了对有袋类哺乳动物物种辐射性大爆发过程的研究结果,

研究揭示对环境高度敏感的鼠兔类群的进化响应

  在当今保护生物学领域,如何保育栖息地片段化不断加剧的濒危物种和地理小种群受到了学者的高度关注。人为辅助为地理隔离的种群提供与同种异域种群甚至是姐妹种杂交的机会,能够促进基因流动,即遗传拯救(genetic rescue),被认为是颇具潜力的有效物种保育手段。已有研究表明,杂交能够提高遗传多样性,

昆明动物所等揭示朱鹮群体演化历程

  1月11日,《当代生物学》以The Genomic Footprints of the Fall and Recovery of the Crested ibis为题,在线发表了中国科学院昆明动物研究所张国捷课题组、西班牙庞培法布拉大学、丹麦哥本哈根大学等单位合作的研究成果。该工作将57份博物馆

自发突变的概念

自发突变是在无人工干预条件下,自然发生的基因突变。生物体自发突变发生的频率比有机体暴露在诱变剂中引起遗传物质改变所产生的频率要低,通常用突变率表示。 从理论上讲,一个生物种群的自发突变率是受到自然选择作用的,这种作用必定反映在种群的基因组结构上。也就是说自发突变率是由整个基因组来调节和控制的。人们所

广东连山发现新物种“密疣掌突蟾”

密疣掌突蟾。 广东连山笔架山省级自然保护区 摄  中新网广州11月30日电 (许青青 邓茜元)记者30日从广东连山笔架山省级自然保护区(以下简称“连山笔架山保护区”)获悉,该保护区确认发现了全球新物种——密疣掌突蟾。相关科研成果已在国际性学术期刊《Herpetozoa》(中文译名《爬虫》)发表。  

基因帮考拉百毒不侵

图片来源:ROB D/500PX本报讯 想象一下在嗅到或者舔吃一大块奶酪后就能马上知道它的营养价值。这是考拉在进食其独家食物时所做的事情。这种食物是毒性足以杀死大多数哺乳动物的桉树叶。如今,研究人员知道了哪些基因让这种可爱的澳大利亚标志性动物如此贪吃。 在对考拉的基因组进行测序并且确定哪些基因活

基因技术:华南虎的一线生机

华南虎 受访者供图 东北虎  受访者供图虎年接近尾声,一项由中国科研团队主导的华南虎和东北虎的高质量基因组研究在《分子生态学资源》(Molecular Ecology Resources)以封面文章形式发表。这一年,另一个团队主导的孟加拉虎基因组也在预印本上发表。一年3个虎亚种高质量基因组发表,占现

线粒体DNA突变与母亲年龄

  一项研究探索了与诸如癌症和糖尿病等疾病有联系的遗传突变的母亲到子女的传播。细胞的代谢动力工厂线粒体拥有自己的从母亲遗传来的基因组,有时候在一个人身上可能含有多个线粒体DNA(mtDNA)类型,这种现象被称为异质性。Kateryna D. Makova及其同事探索了异质性在一个人类人群中的普遍

动物所等揭示金丝猴属物种演化历史与环境变迁的关系

  灵长类的遗传多样性、演化历史及其与环境变化的关系一直是动物学、生态学和进化生物学等学科研究的焦点。金丝猴(也称仰鼻猴属Rhinopithecus)是仅分布在亚洲的一类濒危灵长类,也是国内生态保护的旗舰物种之一。继首次完成川金丝猴基因组的de novo测序和分析后,近日,中国科学院动物研究所李明研

保育培养的技术特点

细胞单独培养不能生育但与其他培养组织共存时有活跃分裂的现象。因此,在细胞接种的同时,把少数几个培养组织置于平面培养基上,细胞繁殖率可达30%左右。

南京大学田大成教授团队揭示遗传突变的重要分子机制

  南京大学生命科学学院田大成教授所领衔的国际团队,利用拟南芥、水稻等自花传粉植物,构建了来自相同遗传背景的、经历一次减数分裂的纯合体、杂合体(F1)及其分离世代(F2到F4),进而测序检测遗传突变的发生。该成果《Parent-progeny sequencing indicates higher

桉树叶为食从而“进化”

  日前,日本京都大学灵长类研究所的研究人员参加的国际研究团队,通过基因组(全遗传信息)分析阐明,在澳大利亚东部生活的有袋类考拉,是从以主食桉树叶所持有的毒素中感觉到的苦味而择食,并仅选择桉树叶为食从而进化的。该研究成果发表在美国《自然—遗传学》杂志电子版。  研究表明,桉树叶含有毒性而味苦,几乎所

研究在印尼哈马黑拉海海流输运及变率获进展

  近日,美国气象学会《物理海洋学报》在线发表了中国科学院海洋研究所袁东亮课题组与印尼科学院海洋研究中心在哈马黑拉海取得的最新研究成果“Moored observations of transport and variability of Halmahera Sea currents”,揭示了基于哈

重拾“记忆”:突破小麦D基因组改良瓶颈

   在小麦驯化过程中,人们曾因过度追求某些性状(如产量、面粉品质等)而“弄丢”了另一些重要基因。同时,育种过程中长期使用骨干亲本,多倍化和进化的“瓶颈”导致其遗传基础日益狭窄,与A、B亚基因组相比,小麦D亚基因组的遗传多样性尤其匮乏。  为找回小麦D基因组里那些拥有优良性状的“美好记忆”,河南大学

重拾“记忆”:突破小麦D基因组改良瓶颈

节节麦 受访者供图  在小麦驯化过程中,人们曾因过度追求某些性状(如产量、面粉品质等)而“弄丢”了另一些重要基因。同时,育种过程中长期使用骨干亲本,多倍化和进化的“瓶颈”导致其遗传基础日益狭窄,与A、B亚基因组相比,小麦D亚基因组的遗传多样性尤其匮乏。  为找回小麦D基因组里那些拥有优良性状的“美好

2018年基因组测序盘点——各种有趣的动物

  2018年,各国科学家继续卯足了劲,对本国的珍(qi)稀(pa)动物进行基因组测序。他们的目标是保护濒危动物(如考拉、金枪鱼),对付入侵物种(如小龙虾、海蟾蜍),抑或是从中发现长寿的秘密(如乌龟、鹦鹉)。  与之前采用单一技术的研究不同,如今的基因组测序研究大多结合Illumina短读长和Pac

科技赋能,野生动植物保护走出“长隆模式”

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/518305.shtm2024年3月3日是第11个“世界野生动植物日”,今年的全球主题是“连接人类与地球——探索野生动植物保护中的数字创新”。记者从广州长隆野生动物世界(以下简称长隆)获悉,长隆致力于生物多

全基因组测序解决虎亚种纷争:6亚种体系

  研究人员运用群体基因组学方法描绘了迄今为止最完整的虎演化史,解析了其自然选择和生态适应性的遗传基础,确认了现存虎应划分为孟加拉虎、马来虎等6亚种,由此解决了数十年以来关于虎亚种划分的争议,奠定了世界虎保护单元策略制定的科学基础。  虎的物种形成时间大约在2-3百万年前,群体基因组学分析将现代虎的

微卫星DNA分子标记及其应用(一)

微卫星(Microsatellite,MS)又称短串联重复(Short Tandem Repeats,STR)或简单序列重复(Simple Sequnce Repeat,SSR),是指基因组中以少数几个核苷酸(多数为2-4个)为单位多次串联重复组成的长达几十个核苷酸的序列。其中最常见的是双核

线粒体基因组的DNA相关介绍

  与细胞核DNA相比,mtDNA作为生物体种系发生的“分子钟”(molecular clock)有其自身的优点:①突变率高,是核DNA的10倍左右,因此即使是在近期内趋异的物种之间也会很快地积累大量的核苷酸置换,可以进行比较分析;②因为精子的细胞质极少,子代的mtDNA基本上都是来自卵细胞,所以m

又一灭绝物种全基因组数据解析

日前,吉林大学考古学院蔡大伟教授团队与西北农林科技大学动物科技学院姜雨教授团队在马属动物古DNA研究领域取得重要进展。该研究在国际上首次成功获取已灭绝马属动物奥氏马的高质量全基因组数据,重建了马属动物的演化历史。  马科动物自古以来就与人们的关系密切,对人类社会文明的发展产生了重大影响。中国家马起源

马科动物基因组与物种形成理论

  一项研究发现,包括马、驴和斑马在内的马科动物的进化史与物种形成的某些理论相矛盾。尽管细节丰富的马科动物化石记录常常作为进化的例子,导致现代马科动物多样性的一系列事件仍然不清楚。为了填补这些动物的进化历史——目前代表这一历史的只有马和家驴的遗传史——Ludovic Orlando及其同事对每一个现

动物全物种基因组测序仍有很大空白

   近日,美国华盛顿州立大学领导的一项研究发现,目前对动物基因组进行的测序多数集中在与人类相似的动物上,研究人员警告称,该现状可能会忽视大量的生物多样性和机会。相关研究结果发表于美国《国家科学院院刊》。  研究人员分析发现,近3300种动物的基因组已被测序。虽然动物物种测序工作一直在进行,但与世界