所有开花植物同类的基因组秘密
一个无油樟花。 据科学家们报告，代表最古老开花植物世系——一种有着乳白色花的小灌木——的单一物种的基因组序列终于被找到了，这让人们对开花植物是如何演化的提供了关键性的见解。研究当今地球上植物多样化的进化生物学家对无油樟(Amborella trichopoda)——该植物代表了被子植物系谱的第一个分支——感到特别着谜;这种带有花瓣的植物给所有开花植物(而不是像那些——如裸子植物—— 缺乏花瓣及其它被子植物特异性改变的植物)的演化铺平了道路。事实上，对无油樟DNA的分析一再地显示它位于或接近于开花植物系谱的基底部，但科学家们一直缺乏其完整的基因组序列——这是一种可通过与更多现代开花植物的基因组进行比较而帮助解释演化是如何影响我们当今所见的不同开花植物基因组的工具。 现在，据3项相关报告中的一篇指出，一组国际性的被称作无油樟基因组计划的作者首次提供了无油樟核基因组的综合序列。这使得这些科学家能够确定作为基本开......阅读全文
植物组织制备基因组DNA实验——氯化铯法
利用基因组DNA较长的特性，可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。在提取过程中，染色体会发生机械断裂，产生大小不同的片段，因此分离基因组DNA时应尽量在温和的条件下操作，如尽量减少酚/氯仿抽提、混匀过程要轻缓， 以保证得到较长的DNA。实验方法原理加入一定量的异丙醇或乙醇，基因组的大分子DNA即
研究发现种子植物祖先曾发生全基因组加倍
中国科学院武汉植物园研究员石涛与比利时根特大学教授Yves Van de Peer合作完成的研究成果，1月2日在国际期刊Science Advances上发表。该研究围绕被子植物和种子植物祖先是否发生过全基因组加倍展开。 据介绍，被子植物是种子植物中最为繁盛的类群，其起源与演化长期以来是植物进
2018年基因组测序盘点——各种新鲜的植物
作为人类的主要食物，植物在我们的生活中扮演着重要角色。然而，由于植物基因组比较大，表现出多种倍性，还存在着大量的重复区域，故植物基因组的测序工作一直进展缓慢。 如今，得益于新型的测序技术，比如PacBio和Oxford Nanopore的长读长测序技术，许多植物在2018年收获了基因组，或者说
植物基因组DNA提取、酶切及电泳分析
实验概要掌握植物基因组DNA提取的一般方法及注意事项。大分子量DNA分子的酶切分析。实验原理十六烷基三乙基溴化胺（CTAB）是一种去污剂，可溶解细胞膜，它能与核酸形成复合物，在高盐溶液中（0.7mol/L NaCl）是可溶的,当降低溶液盐浓度到一定程度(0.3 mol/L NaCl)时,从溶液中
用于PCR的植物基因组DNA快速制备方法（二）
2 结果与讨论2.1 PCR模板DNA的快速制备本方法是将少量植物叶片在TE溶液或去离子水中，经钨合金珠在离心管内的振荡破碎，直接获得DNA溶液。用多功能组织细胞研磨器（MTM-60）一次可操作60个样品。琼脂糖凝胶电泳表明，用TE和去离子水都可获得分子量较大的DNA片段（图1A）。用TE制备的DN
武汉植物园在裸子植物叶绿体基因组学研究方面获进展
篦子三尖杉(Cephalotaxus oliveri)是我国特有珍稀濒危植物，属裸子植物三尖杉科(Cephalotaxaceae)三尖杉属(Cephalotaxus)。它在三尖杉属中的地位特殊，形态、解剖、胚胎发育、孢粉、核型及分子系统学的研究均支持将其独立成篦子三尖杉组。 松杉类植物
基因组与植物进化研讨会在上海辰山植物园召开
10月13日，The Symposium of Genomics and Plant Evolution （基因组与植物进化研讨会）在上海辰山植物园（中国科学院上海辰山植物科学研究中心）报告厅举行。会议旨在促进植物领域基因组学和系统进化研究的交流与合作，从而推动其进一步发展。来自全球25个科研机
昆明植物所山茶属代表植物比较叶绿体基因组学研究获进展
山茶属是山茶科中包含许多举世闻名经济植物的一个重要类群，包括为人类提供天然保健饮料的茶（Camellia sinensis var. assamica 和C. sinensis var. sinensis），健康型高级食用植物油的油茶（C. oleifera）以及观赏花卉云南山茶（C. reti
荧光原位杂交技术检测植物基因组中整合的转基因片段...
实验材料核苷酸 试剂、试剂盒冰水 8-羟基喹啉
荧光原位杂交技术检测植物基因组中整合转基因片段实验
实验材料核苷酸试剂、试剂盒冰水8-羟基喹啉秋水仙素固定剂酶解缓冲液仪器、耗材载玻片玻璃盖玻片解剖针及镊子实验步骤原位杂交的基本操作方法（图 14 .2 ) 演化自 Southern 杂交：标底是玻片上的染色体和细胞核，探针是带标记的待测 DNA 序列 [ 本书中即是转基因和对照，图 14.3(a)
我国学者揭示花叶组重楼植物叶绿体基因组特征
重楼属植物主要生物活性物质为甾体皂苷，具有消炎、止血、抗肿瘤等功效，是云南白药、宫血宁等86种著名中成药的重要原料。重楼属花叶组包括花叶重楼与禄劝花叶重楼两种，与属内其它植物相比，叶具斑块，植株矮小，果实很小且产量低。花叶组重楼植物含有中国药典规定的四种重楼皂苷。然而，花叶组重楼生长十分缓慢，对
研究发现青藏高原植物须弥芥的基因组奥秘
近日，中国科学院昆明植物研究所副研究员张体操联合西藏大学、云南大学及国外多个实验室，对青藏高原特有分布的须弥芥进行了基因组适应性进化研究，为青藏高原植物适应极端环境的分子机制提供了新的线索。相关研究结果在线发表于《美国科学院院刊》。 据了解，须弥芥原本归在拟南芥属，1999年Ihsan Al-
高通量的PCR模板植物基因组DNA制备方法（一）
摘 要：制备大量生物样品的模板DNA用于PCR检测是费时费人工的工作。本文介绍一种高通量的植物基因组DNA(gDNA)快速制备及其用于PCR基因型检测的操作方法。将一小段单子叶植物苗叶片(长度约30 mm或40 mm，与96方孔板的孔深大致相同) 或一小块(约2~4 mg)双子叶植物叶片放入9
研究破译粉菠萝基因组，发现植物开花新机制
粉菠萝 品资所供图近日，中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所（以下简称品资所）种质资源保存研究团队破译了粉菠萝基因组并发现植物开花新机制。凤梨科植物包括菠萝和观赏凤梨，使用乙烯及其衍生物催花是凤梨科植物栽培中广泛使用的技术方法。该研究以粉菠萝（Aechmea fasciata）为实验
利用植物表型组学挖掘基因组学的成果
到2050年，全球人口将达到97亿，预计作物产量翻一番才能满足全球人口的粮食需求。为了达到这一目标，作物产量需每年增长2.4%，但目前作物产量平均增长率仅为1.3%。作物生产性能的遗传改良仍然是提高作物生产力的关键因素，但当前的改善速度无法满足可持续性和粮食安全的需要。为了确保粮食安全、生态系统的可
遗传发育所在植物基因组编辑方法研究中取得进展
基因组编辑技术是最新发展起来的植物基因功能研究及定向育种的重要手段。在植物中实现基因组编辑的常规方法是将序列特异性核酸酶（如CRISPR/Cas9）的编码DNA转化植物细胞，稳定表达进而实现对目的基因的定点编辑。这种情况下，CRISPR载体整合在植物染色体中，需通过后代分离获得不含CRISPR/
首个植物功能基因组学智能问答系统PlantGPT问世
近日，中国科学院院士、华南农业大学教授刘耀光和研究员祝钦泷团队联合清华大学，开发了一个以拟南芥为基础的植物功能基因组学专家问答系统PlantGPT，通过融合检索增强生成技术和大语言模型微调方法，实现了对植物功能基因组学专业问题的精准回答与分析。相关成果在线发表于《先进科学》（Advanced S
遗传发育所在植物基因组编辑方法研究中取得进展
基因组编辑技术是最新发展起来的植物基因功能研究及定向育种的重要手段。在植物中实现基因组编辑的常规方法是将序列特异性核酸酶（如CRISPR/Cas9）的编码DNA转化植物细胞，稳定表达进而实现对目的基因的定点编辑。这种情况下，CRISPR载体整合在植物染色体中，需通过后代分离获得不含CRISPR/
微生物所等发表植物基因组编辑研究综述
序列特异性核酸酶使得基因组编辑成为可能，快速推动了基础和应用生物学的发展。CRISPR-Cas9系统自出现以来，作为可转化植物的基因组编辑工具已得到广泛应用。CRISPR-Cas9对基因组靶位点进行定向切割，造成DNA双链断裂。DNA双链断裂主要通过两种高度保守的机制进行修复，即非同源末端连接(
研究揭示南岭山地特殊土壤生境植物基因组分化机制
南岭山地是我国植物多样性和特有性中心之一。该地区喀斯特地貌和丹霞地貌等特殊土壤生境丰富多样，较强的土壤、地质异质性孕育了南岭丰富的生物多样性，但关于该地区生物多样性起源和演化机制尚缺乏深入研究。 报春苣苔属（Primulina）是典型的特殊土壤生境植物类群，广泛分布于我国南方喀斯特和丹霞地貌，
高通量的PCR模板植物基因组DNA制备方法（四）
2.3 高通量的分子标记检测 本方法制备的DNA浓度虽然低，用96针复制器加入0.5~1 µL模板进行33~35个PCR循环就可获得足够浓度的产物，并不需要加入特别多的Taq酶(甚至使用量为每45~50 µL PCR反应液1 U也能扩增分子标记)。该方法已对数万份水稻样品进行了分子标记(S
科学家破译模式植物金鱼草的基因组
金鱼草（Antirrhinum majus L.）也称龙头花（snapdragon），车前科多年生草本植物，因花似金鱼或龙头而得名，是常见的盆栽、切花及庭院观赏的园艺花卉，在古罗马时代就已完成了驯化。在过去的三十年中，金鱼草一直作为分子和发育遗传学的模式作物，很多关键基因是在金鱼草中被首次发现，
全基因组测序揭示喀斯特植物适应性进化机制
中国南方喀斯特起源古老、分布广泛，被认为是生态与进化研究的“天然实验室”。中国科学院华南植物园研究员康明团队等完成了首个喀斯特植物怀集报春苣苔的全基因组测序。相关研究近日在线发表于《新植物学家》。 喀斯特植物是我国植物多样性和特有性的重要组成部分，但迄今为止对喀斯特植物的多样性起源和适应性进
植物基因组DNA提取试剂盒MagExtractor®Plant－Genome
产品索引 5871 中文名称： 植物基因组DNA提取试剂盒 英文名称： MagExtractor®-Plant Genome- 产品编号： NPK -500 产品类别： 分子生物学 生产厂家： TOYOBO 产品价格：
Nat－Biotechnol：高彩霞团队开发植物基因组引导编辑技术
许多遗传和育种研究表明，点突变和插入/缺失（插入和缺失, indel）可以改变农作物的优良性状。尽管核酸酶启动的同源介导修复（homology-directed repair, HDR）可以产生这种变化，但它受到效率低的限制。碱基编辑器是用于进行碱基转换的强大工具，但不能用于进行碱基颠换、插入或
高通量的PCR模板植物基因组DNA制备方法（三）
将纯化定量的水稻品种(93-11)基因组DNA标准样品(0.5~8 ng)与1.0 µL本方法制备的水稻品种(02428)基因组DNA混合作为模板，用InDel 标记引物(表1)进行PCR扩增和PAGE检测。箭头指某反应(或2个反应之间)其02428与93-11条带的信号值大致相等(即DNA
线粒体基因组的植物细胞和哺乳动物相关介绍
植物细胞 植物细胞的线粒体基因组的大小差别很大，最小的为100kb左右，大部分由非编码的DNA序列组成，且有许多短的同源序列，同源序列之间的DNA重组会产生较小的亚基因组环状DNA，与完整的“主”基因组共存于细胞内，因此植物线粒体基因组的研究更为困难。 哺乳动物 哺乳动物的线粒体基因DNA
海南大学团队定义植物基因组学“终极参考图谱”
近日，记者从海南大学获悉，该校三亚南繁研究院陈飞教授团队首次构建了“分型端粒到端粒超级泛基因组”理论体系，实现了植物基因组从个体单倍型完整到群体遗传多样性全覆盖的技术跨越。相关成果发表在国际期刊《植物科学趋势》。植物基因组研究长期受制于参考基因组的局限——传统组装难以解析着丝粒、端粒等复杂区域，且无
《科学》：苔藓基因组有望揭开陆生植物进化之谜
一个国际科学家小组近日通过分析苔藓基因组发现，苔藓基因的丰富性超乎想象，并且具有许多独特的变异。根据苔藓在植物进化树上的独特位置，这一发现将有助于揭示植物从水生到陆生的过程。相关论文12月13日在线发表于《科学》（Science）杂志上。 图片说明：通过测序苔藓基因组，科学家有望弄清植物由水生到陆
基因组学研究重建苔类植物演化历程获突破
深圳市仙湖植物园研究团队与合作者使用转录组数据，首次对苔类目级系统框架进行了重建，得到了高支持的系统发育树。相关研究9月8日在线发表于Annals of Botany。该论文第一作者为深圳市仙湖植物园董珊珊副研究员，通讯作者为刘阳研究员。深圳市仙湖植物园张力研究员，深圳华大生命科学研究院联合培养研究