用于PCR的植物基因组DNA快速制备方法(二)

2 结果与讨论2.1 PCR模板DNA的快速制备本方法是将少量植物叶片在TE溶液或去离子水中,经钨合金珠在离心管内的振荡破碎,直接获得DNA溶液。用多功能组织细胞研磨器(MTM-60)一次可操作60个样品。琼脂糖凝胶电泳表明,用TE和去离子水都可获得分子量较大的DNA片段(图1A)。用TE制备的DNA在4℃下可保存10天以上,在冷冻下可保存半年。而用去离子水制备的DNA容易降解,保存时间较短,因此我们采用TE为主。图1 本方法制备的水稻和拟南芥基因组DNA。注:A: 用TE(泳道1~5)和去离子水(泳道6~10)制备的水稻基因组DNA (4~6mg叶片/200μl)。 M为分子量标记。B, C: 用200μl TE制备的不同浓度的水稻(B)和拟南芥(C)基因组DNA。泳道1~3为4~6mg叶片;4~6为12~15mg叶片;7~9为约25~30mg叶片。2.2 不同量的模板DNA的PCR扩增效果本方法制备的基因组DNA没有......阅读全文

用于PCR的植物基因组DNA快速制备方法(二)

2 结果与讨论2.1 PCR模板DNA的快速制备本方法是将少量植物叶片在TE溶液或去离子水中,经钨合金珠在离心管内的振荡破碎,直接获得DNA溶液。用多功能组织细胞研磨器(MTM-60)一次可操作60个样品。琼脂糖凝胶电泳表明,用TE和去离子水都可获得分子量较大的DNA片段(图1A)。用TE制备的DN

用于PCR的植物基因组DNA快速制备方法(一)

一种用于PCR的植物基因组DNA快速制备方法 来源:方统科技----------------------------------------------------------------------------------摘要: 本文介绍了一种用于PCR的植物基因组DNA的快速制备方法。该方法

高通量的PCR模板植物基因组DNA制备方法(二)

1.2  植物材料  1.2.1 水稻秧苗。将1.6-mL 96方孔板底部用6 mm电钻头打穿,或将旧96孔PCR板的底部剪去约4 mm。使用时将方孔板压入少量泥巴。每孔放入1粒萌动的水稻种子,在自然日光下(或人工气候箱)生长至3~4片叶。其他植物小苗也可用类似方法种植。 1.2.2 水稻大植株的鲜

高通量的PCR模板植物基因组DNA制备方法(一)

摘  要:制备大量生物样品的模板DNA用于PCR检测是费时费人工的工作。本文介绍一种高通量的植物基因组DNA(gDNA)快速制备及其用于PCR基因型检测的操作方法。将一小段单子叶植物苗叶片(长度约30 mm或40 mm,与96方孔板的孔深大致相同) 或一小块(约2~4 mg)双子叶植物叶片放入9

高通量的PCR模板植物基因组DNA制备方法(三)

将纯化定量的水稻品种(93-11)基因组DNA标准样品(0.5~8 ng)与1.0 µL本方法制备的水稻品种(02428)基因组DNA混合作为模板,用InDel 标记引物(表1)进行PCR扩增和PAGE检测。箭头指某反应(或2个反应之间)其02428与93-11条带的信号值大致相等(即DNA

高通量的PCR模板植物基因组DNA制备方法(四)

2.3  高通量的分子标记检测 本方法制备的DNA浓度虽然低,用96针复制器加入0.5~1 µL模板进行33~35个PCR循环就可获得足够浓度的产物,并不需要加入特别多的Taq酶(甚至使用量为每45~50 µL PCR反应液1 U也能扩增分子标记)。该方法已对数万份水稻样品进行了分子标记(S

用于-PCR-的模板-DNA-制备实验

酚-氯仿法提取石蜡组织中 DNA 改进的石蜡切片 DNA 提取方法 直接法(DNA 免提法) 冰冻片 含血标本 胸腹水或尿液            

用于-PCR-的模板-DNA-制备实验

实验方法原理 实验步骤 1. 10 mm 厚石蜡切片 10~15 张,置入消毒后的 1.5 ml Eppendorf 管中。2. 脱蜡 二甲苯 1200 μl,9000 r/min,8 min×3。3. 脱水无水乙醇 1200 μl,9000 r/min,5 min×3。4. 打开 Eppendor

用于PCR的模板DNA制备实验——改进的石蜡切片-DNA-提取方法

实验步骤1. 5 μm 厚的石蜡切片 5 至 10 张贴在干净的载玻片上,常规烘片,脱蜡,水化,蒸馏水清洗,无菌蒸馏水浸泡,取出晾至半干。2. 无菌尖头刀片刮下,放入 300~900 μl 组织裂解液中,并加入 20 mg/ml 蛋白酶 K(PK)10~15 μl,封口膜封口,置 55℃ 3 h 以

植物组织制备基因组DNA实验

氯化铯法 CTAB法             实验方法原理 加入一定量的异丙醇或乙醇,基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中, 可用玻棒将其取出,而小分子DNA则

植物组织制备基因组DNA实验

实验方法原理 加入一定量的异丙醇或乙醇,基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中, 可用玻棒将其取出,而小分子DNA则只形成颗粒状沉淀附于壁上及底部, 从而达到提取的目的。实验材料 植物组织试剂、试剂盒 抽提缓冲液十二烷基肌氨酸钠TE异丙醇溴化乙锭氯化铯仪器、耗材 离心机实验步骤   收取1

用于-PCR-的模板-DNA-制备实验——冰冻片

实验步骤1. 将 10 μl 冰冻切片直接放入含组织裂解液的离心管中。2. 无菌尖头刀片刮下,放入 300~900 μl 组织裂解液中,并加入 20 mg/ml 蛋白酶 K(PK)10~15 μl,封口膜封口,置 55℃ 3 h 以上。3. 其间用指轻弹离心管以利裂解。若有沉淀,再加入 5~10 μ

用于-PCR-的模板-DNA-制备实验——含血标本

实验步骤1. 3 ml 外周血或 1 ml 骨髓液放入含 50 μl 0.5mol/L EDTA 的无菌离心管(15 ml 管)中。2. 2000 r/min 离心 10 min。吸去血浆,用指弹匀剩余的有核细胞和红细胞,加入红细胞溶解液 10 ml 并混匀,常温下放置 30 min。红细胞溶解液配

用于PCR的模板DNA制备实验——直接法(DNA-免提法)

实验步骤1. 标本太少时,可将一张石蜡切片经脱蜡,水化,蒸馏水清洗,无菌蒸馏水浸泡,取出晾至半干。2. 加入 20~80 μl 直接裂解液中,加 20 mg/ml 蛋白酶 K 0.2~1 μl,放置 55℃ 裂解 3 h 以上;100℃10 min 灭活蛋白酶 K;10000 r/min 离心 10

用于-PCR-的模板-DNA-制备实验——胸腹水或尿液

实验步骤1. 标本 10 ml 以上,2000 r/min 离心 10 分钟,倒去上清液。用指弹匀沉淀物,加入适量组织裂解液,37℃ 下放置半小时以上。2. 无菌尖头刀片刮下,放入 300~900 μl 组织裂解液中,并加入 20 mg/ml 蛋白酶 K(PK)10~15 μl,封口膜封口,置 55

植物组织制备基因组DNA实验——CTAB法

实验方法原理加入一定量的异丙醇或乙醇,基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中, 可用玻棒将其取出,而小分子DNA则只形成颗粒状沉淀附于壁上及底部, 从而达到提取的目的。实验材料植物组织试剂、试剂盒CTAB液2-疏基乙醇TE高盐TE氯仿异戊醇仪器、耗材研钵离心机培养箱实验步骤1.  在所需量

用于PCR的模板DNA制备实验——酚氯仿法提取石蜡组织中DNA

模板 DNA 质量直接影响 PCR 结果,是 PCR 成功的关键之一。根据其检测对象(组织细胞材料)的不同,有不同的制备方法,常用的材料有石蜡切片、冰冻切片、血细胞、胸腹水等。实验步骤1. 10 mm 厚石蜡切片 10~15 张,置入消毒后的 1.5 ml Eppendorf 管中。2. 脱蜡 二甲

植物基因组DNA-快速提取(50-次)说明书

植物基因组DNA 快速提取(50 次)概述:本方法可用于植物细胞DNA 的快速提取,可提取107 细胞,其质量能够满足各种分子生物学要求。组成:1.溶液A 1.2ml RNase A 10mg/ml。-20℃保存2.溶液B 60ml3.溶液C 180ml4.溶液D 3ml Resin 用时充分混匀5

植物组织制备基因组DNA实验——氯化铯法

利用基因组DNA较长的特性,可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。在提取过程中,染色体会发生机械断裂,产生大小不同的片段,因此分离基因组DNA时应尽量在温和的条件下操作,如尽量减少酚/氯仿抽提、混匀过程要轻缓, 以保证得到较长的DNA。实验方法原理加入一定量的异丙醇或乙醇,基因组的大分子DNA即

快速制备酵母DNA法

实验概要本实验制备了酵母转化质粒,快速从转化酵母菌中分离了用于Southern分析的基因组DNA。主要试剂2% Triton X-100,1%SDS,100mmol/L NaCl,10mmol/L Tris-HCl(pH8),1mmol/L Na2EDTA,苯酚:氯仿:已戊醇(25:24:1),YP

基因组DNA的快速纯化

第 1 天1. 大约 1.5 cm 长的尾部活检样品放在一个 1.5 ml 盛有 0.7 ml 尾部缓冲液的小离心管中,加 35 μl 10 mg/ml蛋白酶 K,在 55℃ 振摇温育过夜。尾部缓冲液(配 25 ml)50 mmol/L Tris,pH 8                      

植物基因组DNA的RFLP

实验概要本实验介绍了植物基因组DNA的RFLP多态性分析的原理及操作步骤。通过本实验可了解不同植物或同一植物不同个体之间基因组DNA顺序的差异性,掌握DNA限制性酶切片段长度多态性研究的基本方法。实验原理DNA多态性是指DNA碱基顺序的差异性。这种差异性不仅存在于不同的植物之间,也存在于同一种植物的

纯化DNA实验_基因组DNA的快速纯化

试剂、试剂盒尾部缓冲液蛋白酶 K仪器、耗材离心管玻璃棒实验步骤第 1 天1. 大约 1.5 cm 长的尾部活检样品放在一个 1.5 ml 盛有 0.7 ml 尾部缓冲液的小离心管中,加 35 ul 10 mg/ml 蛋白酶 K,在 55℃ 振摇温育过夜。尾部缓冲液(配 25 ml)50 mmol/L

哺乳动物中制备基因组DNA实验——制备DNA

在DNA提取过程中应尽量避免使DNA断裂和降解的各种因素,以保证DNA的完整性,为后续的实验打下基础。一般真核细胞基因组DNA有107-9bp,可以从新鲜组织、培养细胞或低温保存的组织细胞中提取,常是采用在EDTA以及SDS等试剂存在下用蛋白酶K消化细胞,随后用酚抽提而实现的。实验材料动物组织试剂、

PCR技术(二):PCR反应模板的制备

PCR反应的关键因素主要有引物的选择与设计,酶的质量.模板的制备,在前二者都稳定可行的情况下,PCR模板的制备尤为重要.模板处理方法的选择及操作人员的基 本技能,决定分离模板核酸(DNA或RNA)的质和量及PCR的成败.而提高模板核酸质量的 关键是除去杂质(蛋白质、酶、脂肪等).除去抑制Taq DN

用于基因组文库的真核DNA的部分酶切(制备反应)实验

通过限制酶部分酶切可将高分子质量 DNA 片段化。在预实验中,建立了适宜的部分酶切条件。对于将用于克隆的基因组 DNA 来说,预实验的结果确定了对其进行制备的三个大规模反应的条件,这将在本方案叙述。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理通过限制酶部分酶切可将高分子质量 DNA

用于基因组文库的真核DNA的部分酶切(制备反应)实验

            实验方法原理 通过限制酶部分酶切可将高分子质量 DNA 片段化。在预实验中,建立了适宜的部分酶切条件。对于将用于克隆的基因组 DNA 来说,预实验的结果确定了对其进行制备的三个大规模反应的条件,这将在本方案叙述。

用于基因组文库的真核DNA的部分酶切(制备反应)实验

实验方法原理 通过限制酶部分酶切可将高分子质量 DNA 片段化。在预实验中,建立了适宜的部分酶切条件。对于将用于克隆的基因组 DNA 来说,预实验的结果确定了对其进行制备的三个大规模反应的条件,这将在本方案叙述。实验材料 限制性内切核酸酶基因组 DNAλ 噬菌体 DNA质粒寡聚体试剂、试剂盒 乙酸铵

小鼠肝基因组DNA制备

原理DNA 以核蛋白形式存在于细胞核中,制备 DNA 的原则是既要将 DNA 与蛋白质、脂类和糖类等分离,又要保持 DNA 分子的完整。蛋白酶K 及链霉蛋白酶 E 的应用使这两个原则得到了保证。蛋白酶K 或链霉蛋白酶 E 均为广谱蛋白酶,其重要特性是能在 SDS 和 EDTA 存在下保持很高的活性。

小鼠肝基因组DNA制备

原理DNA 以核蛋白形式存在于细胞核中,制备 DNA 的原则是既要将 DNA 与蛋白质、脂类和糖类等分离,又要保持 DNA 分子的完整。蛋白酶K 及链霉蛋白酶 E 的应用使这两个原则得到了保证。蛋白酶K 或链霉蛋白酶 E 均为广谱蛋白酶,其重要特性是能在 SDS 和 EDTA 存在下保持很高的活性。