研究发现种子植物祖先曾发生全基因组加倍
中国科学院武汉植物园研究员石涛与比利时根特大学教授Yves Van de Peer合作完成的研究成果,1月2日在国际期刊Science Advances上发表。该研究围绕被子植物和种子植物祖先是否发生过全基因组加倍展开。 据介绍,被子植物是种子植物中最为繁盛的类群,其起源与演化长期以来是植物进化研究的重要议题。全基因组加倍(WGD)被认为在种子植物和被子植物的起源与性状演化中发挥重要作用,但由于其遗传痕迹易受到基因丢失、染色体重排和基因同义替换饱和等因素影响,追溯远古多倍化事件面临较大技术挑战。 为厘清被子植物与种子植物祖先的多倍化历史,中国科学院武汉植物园与根特大学研究者引入“剂量敏感基因”作为古老WGD检测的演化标记。研究通过对已知经历不同WGD次数的代表性被子植物的直系同源基因家族(OGs)进行分析,验证了相对高敏感性基因在WGD检测中的优势。 研究进一步利用剂量敏感性较高的直系同源基因家族,整合基因树-物种树协......阅读全文
研究发现种子植物祖先曾发生全基因组加倍
中国科学院武汉植物园研究员石涛与比利时根特大学教授Yves Van de Peer合作完成的研究成果,1月2日在国际期刊Science Advances上发表。该研究围绕被子植物和种子植物祖先是否发生过全基因组加倍展开。 据介绍,被子植物是种子植物中最为繁盛的类群,其起源与演化长期以来是植物进
现存最原始种子植物苏铁基因组发布
近日,科学家完成苏铁基因组解析工作,发布苏铁完整基因组图谱,这意味着种子植物基因组演化研究中的最后一块拼图已顺利完成。4月18日,《自然-植物》(Nature Plants)以封面文章发表该研究成果。据悉,该研究成果数据公开共享,全球科学家可免费下载使用。苏铁是地球上现存最古老的种子植物,是著名的“
买麻藤类植物全基因组破译
近日,由深圳市中国科学院仙湖植物园,中科院中-非联合研究中心、武汉植物园、植物研究所,英国皇家植物园邱园等10余家国内外知名院所联合开展的“裸子植物——买麻藤全基因组计划”取得重要进展。 裸子植物和被子植物的起源、分歧及演化,是现代植物学科的基础热点领域。现存35万余种种子植物被分成苏铁类、松
昆明植物所破译稻属植物5个物种全基因组
亚洲栽培稻(一般称为水稻)是世界上最重要的粮食作物之一,是中国第一大粮食作物,养活了80%以上的中国人口。在水稻与其它约23个物种共同组成的稻属植物中,它和7个稻种(普通野生稻、尼瓦拉野生稻、非洲栽培稻、短舌野生稻、展颖野生稻、长雄蕊野生稻和南方野生稻)都是AA基因组类型,这些水稻近缘物种间断分
种子植物鉴定实验
实验方法原理植物分类主要是根据桢物各部分形态特征来进行的,在鉴定一种植物时,首先要对该种植物进行全面细致的分析观察,并作好描述记录,以利鉴定工作进行。实验材料植物材料 仪器、耗材放大镜
种子植物鉴定实验
实验方法原理 植物分类主要是根据桢物各部分形态特征来进行的,在鉴定一种植物时,首先要对该种植物进行全面细致的分析观察,并作好描述记录,以利鉴定工作进行。实验材料 植物材料仪器、耗材 放大镜实验步骤 (一)一般被子植物分析观察的内容1 生活型:是乔木、灌木、草本(一年生、二钉生或多年生),还是藤本(木
种子植物鉴定实验
实验方法原理植物分类主要是根据桢物各部分形态特征来进行的,在鉴定一种植物时,首先要对该种植物进行全面细致的分析观察,并作好描述记录,以利鉴定工作进行。实验材料植物材料仪器、耗材放大镜实验步骤(一)一般被子植物分析观察的内容1 生活型:是乔木、灌木、草本(一年生、二钉生或多年生),还是藤本(木质或草质
全基因组测序揭示喀斯特植物适应性进化机制
中国南方喀斯特起源古老、分布广泛,被认为是生态与进化研究的“天然实验室”。中国科学院华南植物园研究员康明团队等完成了首个喀斯特植物怀集报春苣苔的全基因组测序。相关研究近日在线发表于《新植物学家》。 喀斯特植物是我国植物多样性和特有性的重要组成部分,但迄今为止对喀斯特植物的多样性起源和适应性进
植物所发现植物全基因组应答低温中信使RNA降解新机制
信使RNA(mRNA)降解的动态模式是生物发育调控和适应环境的重要机制。但对植物mRNA降解在环境胁迫下的作用模式知之甚少。中科院植物研究所种康研究组通过RNA末端平行分析(parallel analysis of RNA ends)和转录组检测,并借助高通量测序手段揭示了单子叶模式植物二穗
植物全磷、全氮、全钾的测定
一、植物全氮测定(一)H2SO4-H2O2消煮法1、适用范围本方法不包括硝态氮的植物全氮测定,适合于含硝态氮低的植物样品的测定。2、方法提要植物中的氮、磷大多数以有机态存在,钾以离子态存在。样品经浓H2SO4和氧化剂H2O2消煮,有机物被氧化分解,有机氮和磷转化成铵盐和磷酸盐,钾也全部释出。消煮液经
OPGEN全基因组图谱应用系列——鞭虫全基因组测序
鞭虫是一种常见的土壤传播寄生虫,地理分布广,感染率高,寄生于人体盲肠,导致人体慢性感染,对人类危害巨大。鞭虫的全基因组测序研究由著名的桑格研究院(Wellcome Trust Sanger Institute)完成,发表在世界顶级期刊《Nature Genetics》上。该研究通过对2种不同
植物所揭示丁香属全基因组、演化历史及花香形成机制
丁香属为温带起源的木本芳香植物,是木犀科(Oleaceae)中较为古老的类群,全属30余种(变种),除3种在巴尔干半岛和北海道分布以外,其余在中国均有野生分布。作为观赏植物,丁香拥有约1400年的栽培历史和约200年的育种历史,其药用功能的开发和芳香精油的利用由来已久。然而,丁香属全基因组信息的
种子植物标本采集、制作与保存
[目的要求] 通过植物标本的采集、制作及保存的讲述及具体操作,使学生掌握植物标本的采集、制作和保存的一整套方法。 [材料用品] 1.材料:标本夹、采集箱、丁字小镐、枝剪和高枝剪、手锯、放大镜、空盒气压计、全球定位仪(GPS)用于观测方向和坡向、钢卷尺、照相机
全基因组扩增技术介绍
研究人员通常会在下游分析中遭遇DNA样本量有限或不足的问题。QIAGEN的全基因组扩增技术通过以包括单细胞在内的小量样本或珍贵样本扩增获得基因组DNA,解决此类难题。REPLI-g Kit能够准确地复制原始DNA样本,不会造成偏差,扩增后的DNA可以直接应用于广泛的遗传学分析。什么是全基因组扩增(w
人类全基因组测序计划
全基因组测序是对未知基因组序列的物种进行个体的基因组测序。 1986年, Renato Dulbecco是Z早提出人类基因组测序的科学家之一。他认为如果能够知道所有人类基因的序列,对癌症的研究将会很有帮助。美国能源部(DOE)与美国国家卫生研究院(NIH),分别在1986年与1987年加入人类基
虎尾海马全基因组破译
中科院南海海洋研究所、德国康斯坦茨大学、华大基因和新加坡A*STAR研究院联合破译了虎尾海马的全基因组。有关研究成果日前以封面文章的形式发表在《自然》杂志上。 海马隶属于海龙科。与其他硬骨鱼不同,海马呈现高度特殊的形态,例如头部前方具有管状长嘴,无腹鳍和尾鳍,尾端卷曲,全身覆盖硬骨骼,没有鳞片
分子植物卓越中心等揭示种子植物崛起的秘密
11月6日,中国科学院分子植物科学卓越创新中心晁代印研究组联合湖北大学生命科学学院吕世友研究组,在《自然-植物》(Nature Plants)上,在线发表了题为The evolutionary innovation of root suberin lamellae contributed to
分子植物卓越中心等揭示种子植物崛起的秘密
11月6日,中国科学院分子植物科学卓越创新中心晁代印研究组联合湖北大学生命科学学院吕世友研究组,在《自然-植物》(Nature Plants)上,在线发表了题为The evolutionary innovation of root suberin lamellae contributed to th
全基因组的比较基因组杂交技术介绍
Whole-Genome and Custom Fine-Tiling Array CGHComparative Genomic Hybridization (CGH) measures DNA copy number differences between a reference genome a
《云南药山种子植物名录》正式出版
在科技部平台项目和国家自然科学基金项目的资助下,经过中科院昆明植物所专家历时6年的采集研究,日前,《云南药山种子植物名录》由云南科技出版社正式出版。这将为深入研究中国种子植物特有属提供可靠的科学依据。 药山国家级自然保护区分布于云南省昭通市巧家县境内,总面积302115亩。自然保护区
种子植物的配子体特点介绍
种子植物的配子体即花粉粒和胚囊,(配子体所对应的雌雄配子分别为花粉粒——精子(雄配子),胚囊——卵细胞(雌配子)其中有关花粉粒致死基因典型代表为女娄菜)仅由很少细胞组成,不能独立生活,寄生在孢子体上。形成配子并进行繁殖的世代称为配子世代,配子世代的生物体称为配子体。一般植物配子体为单倍染色体(n)。
植物种子大小研究综述发表
植物种子大小是重要的产量性状,种子大小的调控也是重要的发育生物学问题。因此,解析种子大小调控的分子机制,可以为作物的高产育种提供理论基础和基因资源。近年来植物种子大小的调控机制研究进展迅速,目前已成为植物领域研究的热点和前沿。 中国科学院遗传与发育生物学研究所李云海研究组长期致力于植物种子大小
昆明植物所完成六种木本竹子叶绿体基因组全序列的测定
竹亚科(Bambusoideae)隶属于禾本科(Poaceae),全世界共分布有一千余种。木本竹子因种类数目多,形态性状复杂多变及多年生一次性开花等原因而成为系统发育学研究难点。随着新一代测序技术的兴起,系统发育基因组学为解决这类困难类群的系统发育关系带来了曙光。 中国科学院昆明植物研究所李德
全基因组测序的诊断价值
根据《Nature Genetics》上发表的一项新成果,全基因组测序有望用于临床上的遗传病诊断。这项研究评估了影响全基因组测序在临床诊断中取得成功的因素。 这个国际研究小组由英国的研究人员领导,对156个病例或家庭开展了临床基因组测序。这些病例有着遗传疾病的特征,但无法通过之前的筛查检测来解
多国实施全基因组分析计划
由于基因测序可以探查与特定疾病相关的基因,该疗法正在成为日益受欢迎的诊断方法。 英国计划到2017年对10万人进行基因组测序。 美国加州一对龙凤胎出生后,他们的父母非常忧虑:两个婴儿不仅发育缓慢,而且肌肉松软无力。大脑扫描结果显示,男婴或存在大脑性麻痹;然而医生对造成女婴震颤和癫痫的原因却不
全基因组研究解码口吃根源
口吃跨越不同语言和血统,影响着全球约7000万人。过去,许多人认为口吃能够通过自主控制来改善。但数十年来的研究表明,口吃实际上是一种高度遗传的不可控疾病,其原因复杂且模糊。而一项7月28日发表于《自然-遗传学》上的研究让口吃的部分原因变得清晰。 研究人员利用基因检测服务公司23andMe的庞大
全血基因组提取操作步骤
操作步骤((200ul全血))* 第一次使用前请先在15ml漂洗液WB中加入60ml无水乙醇! 1. 取200ul新鲜、冷冻或加入各种抗凝剂的血液,放入1.5ml离心管。对如果全血起始量小于200μl,则用缓冲液BB补足到200μl。如果起始量介于200μl-300μl之间,则后续操作需要按照比例增
昆虫全基因组DNA的提取
实验概要利用改进的CTAB 法提取昆虫全基因组DNA。主要试剂1. 蛋白酶K[美国Merck公司]2. 三羟甲基氨基甲烷(Tris)[美国Amresco公司]3. Taq DNA聚合酶及dNTP[NEB公司]4. 琼脂糖及溴化乙锭(EB)[美国Amresco公司生产]5. 乙二胺四乙酸钠(Na2ED
全基因组测序各步骤工具
全基因组测序(WGS)是下一代测序技术,用于快速,低成本地确定生物体的完整基因组序列。基因组的深度测序对于临床研究的意义重大,解读WGS数据并了解基因组突变在健康和疾病中的重要性是精准医疗的基石。WGS分析流程能分为三大块,数据处理、检测变异和综合分析,具体如下图所示:由于WGS现在已经非常成熟了,
“从种子到衬衫”-的全产业链闭环
新疆棉田。国棉联盟供图 接近年底,国家棉花产业联盟副理事长、海南好棉科技集团有限公司(简称好棉集团)董事长王进华和联盟副秘书长黄群还在海南忙碌着。自从今年3月好棉集团作为联盟实体化运行机构成立后,他们就在抓紧推进海南高品质棉花国内国际双循环服务贸易中心的建设工作。 这是国家棉花产业联盟(以