Science解析热点基因组编辑工具

近来,Cas9酶作为一种有力的新基因组编辑工具,引起了人们极大的研究热情。现在加州大学伯克利分校的研究人员,首次成像了这种酶的精细三维结构,这一成果无疑会进一步提高Cas9的应用价值。文章于二月六日发表在Science杂志上。 加州大学的生化学家Jennifer Doudna和生物物理学家Eva Nogales领导研究团队,使用X射线晶体衍射技术,获得了两种主要Cas9酶的晶体结构,分辨率达到了2.6和2.2 Å。随后研究团队通过单颗粒电镜向人们展示了,Cas9搭档引导RNA与目标DNA相互作用的机制。这一结果可以帮助人们对Cas9酶进行改良,使其更适合基础研究和基因工程。 “我们在X射线晶体衍射和电镜单颗粒分析的帮助下发现,Cas9蛋白单独存在时处于非活性状态,但与引导RNA结合后,它的三维结构会经历剧烈的改变,允许Cas9与目标DNA结合。” Nogales说。 “获得两种主要Cas9的高分......阅读全文

关于小干扰RNA的结构介绍

  siRNA具有明确定义的结构:具有磷酸化5'末端的短(通常20至24bp)双链RNA(dsRNA)和具有两个突出核苷酸的羟基化3'末端。该切酶酶催化生产的siRNA由长的dsRNA和小发夹RNA。siRNA也可以通过转染引入细胞。由于原则上任何基因都可以被具有互补序列的合成siR

卫星RNA的概念和结构特点

卫星RNA是一类小的非编码RNA,基因组大小为200-1500nt,通常不编码蛋白,是一类存在于某专一病毒粒即辅助病毒的衣壳内并完全依赖于辅助病毒来完成复制、包被、移动和传播才能复制自己的小分子的RNA病原因子,且和其辅助病毒的基因组不存在序列同源性。因后来又发现少数种类是DNA,故有人把卫星RNA

信使RNA的结构功能相关介绍

  原核生物mRNA一般5′端有一段不翻译区,称前导区,3′端有一段不翻译区,中间是蛋白质的编码区,一般编码几种蛋白质。真核生物mRNA(细胞质中的)一般由5′端帽子结构、5′端不翻译区、翻译区(编码区)、3′端不翻译区和3′端聚腺苷酸尾巴构成。分子中除m7G构成帽子外,常含有其他修饰核苷酸,如m6

转运RNA的结构和功能特点

转运RNA(Transfer RNA),又称传送核糖核酸、转移核糖核酸,通常简称为tRNA,是一种由76-90个核苷酸所组成的RNA,其3'端可以在氨酰-tRNA合成酶催化之下,接附特定种类的氨基酸。转译的过程中,tRNA可借由自身的反密码子识别mRNA上的密码子,将该密码子对应的氨基酸转运

转移RNA的功能结构特点

转移RNA(tRNA)在蛋白质合成过程中负责转运氨基酸、解读mRNA遗传密码。tRNA占细胞总RNA的10%~15%,绝大多数位于细胞质中。tRNA由Crick于1955年提出其存在,Zamecnik和 Hoagland于1957年鉴定。1.tRNA一级结构具有以下特点:①是一类单链小分子RNA,长

Science解析热点基因组编辑工具

  近来,Cas9酶作为一种有力的新基因组编辑工具,引起了人们极大的研究热情。现在加州大学伯克利分校的研究人员,首次成像了这种酶的精细三维结构,这一成果无疑会进一步提高Cas9的应用价值。文章于二月六日发表在Science杂志上。   加州大学的生化学家Jennifer Doudna和生物物理学家

Science:CRISPR/Cas9大革命

        DNA编辑技术CRISPR近年来风生水起,已经开始取代了其它基因组编辑工具,如锌指核酸酶和 TALENs等。不过目前科学家们对于这一技术中的RNA引导核酸内切酶:Cas9了解的还不够多,如果能更精确的掌握这种酶在CRISPR系统中如何发挥作用的,将能提高这一技术的使用效率和

非编码小RNA的结构和功能

中文名称非编码小RNA英文名称small non-messenger RNA;snmRNA定  义细胞中一大类由几十核苷酸到几百核苷酸组成的、不编码蛋白质的RNA。本身或与蛋白质结合形成的复合体有生物学功能。如核小RNA、核仁小RNA、微RNA、干扰小RNA、时序小RNA等。应用学科生物化学与分子生

细胞内核小RNA的基本结构

细胞内有核小RNA(small nuclearRNA,snRNA)。它是真核生物转录后加工过程中RNA剪接体(spliceosome)的主要成分,参与mRNA前体的加工过程。其长度在哺乳动物中约为100-215个核苷酸,共分为7类,由于含U丰富,故编号为U1~U7。snRNA只存在于细胞核中,其中U

核糖体RNA的组成及结构

  组成  rRNA一般与 核糖体蛋白质结合在一起,形成 核糖体(ribosome),如果把rRNA从核糖体上除掉,核糖体的结构就会发生塌陷。 原核生物的核糖体所含的rRNA有5S、16S及23S三种。S为 沉降系数(sedimentation coefficient),当用 超速离心测定一个粒子的

关于核糖体RNA的结构介绍

  测定rRNA的空间排列方式的方法主要有电镜法和交联法。其功能部位通过几种方法确定在70S核糖体图1中显示了rRNA分子的结合部位和方向。在电镜下,16SrRNA的排列呈V型,一个臂比一个臂稍厚和长。23S的大小和形状可与50S"皇冠"式样很好匹配。有结论认为,rRNA形成了核糖体亚基的骨架,蛋白

核糖体RNA的结构及功能

  结构  测定rRNA的空间排列方式的方法主要有电镜法和交联法。其功能部位通过几种方法确定在70S核糖体图中显示了rRNA分子的结合部位和方向。在电镜下,16SrRNA的排列呈V型,一个臂比一个臂稍厚和长。23S的大小和形状可与50S"皇冠"式样很好匹配。有结论认为,rRNA形成了核糖体亚基的骨架

CRISPR/Cas9蛋白切割DNA过程中的调控和校验机制

  清华大学生命科学学院陈春来研究组在《Cell Reports》杂志发表了研究论文,题目为“The Conformational Dynamics of Cas9 Governing DNA Cleavage Are Revealed by Single-Molecule FRET”(利用单分子F

Science:可编程的DNA剪刀

  劳伦斯伯克利国家实验室(Berkeley Lab)的科学家发现了一种更有效的基因组编辑新方法,为基因工程和基因组研究者带来了福音。基因工程改造的微生物(如细菌和真菌)在生物能源和药物研发等方面起到了关键作用,而这一研究成果能为科学家提供极大的帮助。   劳伦斯伯克利国家实验室的研究团队发现

张锋Nature发表重要突破:用-CRISPR启动基因

  麻省理工的科学家们对目前最热门的基因编辑系统CRISPR/Cas9进行了改造,这一成果发表在十二月十日的Nature杂志上。现在,人们可以用这一技术在活细胞中有效启动任何基因。  这个系统可以让科学家们更简便地研究不同基因的功能,领导这项研究的CRISPR技术先驱张锋(Feng Zhang)说。

一种与众不同的CRISPR核酸酶

   CRISPR是一种出色的基因组编辑工具,深受研究人员的欢迎。其中,大家比较熟悉的是来自化脓链球菌的Cas9(SpCas9)。不过,这并不是唯一的选择。一种新型核酸酶Cas13a(以前称为C2c2)正逐渐走进人们的视野,它具有独特的性质,进一步扩展了CRISPR工具箱。在此,我们将介绍一下Cas

Cell发布CRISPR/Cas9重要研究成果

  来自东京大学、麻省理工学院与哈佛大学Broad研究所的研究人员,在新研究中揭示出了新凶手弗朗西丝菌Cas9(FnCas9)的结构,并利用这一结构信息对FnCas9进行改造构建出了一个变异体。研究成果发布在2月25日的《细胞》(Cell)杂志上。  京东大学医学科学研究所基础医学系Osamu Nu

转运RNA的一级结构的介绍

  自1965年R.W.霍利等首次测出酵母丙氨酸tRNA的一级结构即核苷酸排列顺序到1983年已有200多个tRNA(包括不同生物来源、不同器官、细胞器的同功受体tRNA以及校正tRNA)的一级结构被阐明。按照A-U、G-C以及G-U碱基配对原则,除个别例外。

新研究“点亮”荧光RNA成像的结构机制

  5月17日,中国科学院生物物理研究所方显杨研究组与动物研究所李幸研究组合作在《自然-通讯》上发表研究论文,揭示荧光点亮RNA适配体RhoBAST结合与激活荧光团TMR-DN的机制,为理性设计和优化这一重要的FLAP系统提供了机制见解。  在活细胞中对生物大分子如蛋白质和RNA等进行时空定位和追踪

新研究“点亮”荧光RNA成像的结构机制

5月17日,中国科学院生物物理研究所方显杨研究组与动物研究所李幸研究组合作在《自然-通讯》上发表研究论文,揭示荧光点亮RNA适配体RhoBAST结合与激活荧光团TMR-DN的机制,为理性设计和优化这一重要的FLAP系统提供了机制见解。在活细胞中对生物大分子如蛋白质和RNA等进行时空定位和追踪,对于理

核糖体小RNA的概念和结构

中文名称核糖体小RNA英文名称small ribosomal RNA定  义(1)核糖体小亚基的RNA。如真核生物的18S rRNA和原核的16S rRNA。(2)核糖体中的小分子RNA,除18S和16S rRNA,还包括5S和5.8S rRNA。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因

核内不均一RNA的结构特点

hnRNA的结构有以下特点:(1) 5′端有帽结构;(2) 3′端有poly(A)尾巴;(3) 帽结构后有3个寡聚U区,每个长约30nt;(4) 有重复序列,位于寡聚U区后面;(5) 有茎环结构,可能分布于编码区(非重复序列)的两侧;(6) 非重复序列中有内含子区。

核内不均一RNA的结构特点

hnRNA的结构有以下特点:(1) 5′端有帽结构;(2) 3′端有poly(A)尾巴;(3) 帽结构后有3个寡聚U区,每个长约30nt;(4) 有重复序列,位于寡聚U区后面;(5) 有茎环结构,可能分布于编码区(非重复序列)的两侧;(6) 非重复序列中有内含子区。

新研究“点亮”荧光RNA成像的结构机制

5月17日,中国科学院生物物理研究所方显杨研究组与动物研究所李幸研究组合作在《自然-通讯》上发表研究论文,揭示荧光点亮RNA适配体RhoBAST结合与激活荧光团TMR-DN的机制,为理性设计和优化这一重要的FLAP系统提供了机制见解。在活细胞中对生物大分子如蛋白质和RNA等进行时空定位和追踪,对于理

新研究“点亮”荧光RNA成像的结构机制

5月17日,中国科学院生物物理研究所方显杨研究组与动物研究所李幸研究组合作在《自然-通讯》上发表研究论文,揭示荧光点亮RNA适配体RhoBAST结合与激活荧光团TMR-DN的机制,为理性设计和优化这一重要的FLAP系统提供了机制见解。在活细胞中对生物大分子如蛋白质和RNA等进行时空定位和追踪,对于理

核糖体RNA的结构和功能特点

核糖体RNA,即rRNA,是细胞内含量最多的一类RNA,也是3类RNA(tRNA,mRNA,rRNA)中相对分子质量最大的一类RNA,它与蛋白质结合而形成核糖体,其功能是在mRNA的指导下将氨基酸合成为肽链(肽链在内质网、高尔基体作用下盘曲折叠加工修饰成蛋白质,原核生物在细胞质内完成)。rRNA占R

核内不均一RNA的结构特点

hnRNA的结构有以下特点:(1) 5′端有帽结构;(2) 3′端有poly(A)尾巴;(3) 帽结构后有3个寡聚U区,每个长约30nt;(4) 有重复序列,位于寡聚U区后面;(5) 有茎环结构,可能分布于编码区(非重复序列)的两侧;(6) 非重复序列中有内含子区。

Science发现RNA全新结构,可抵抗酶降解

  美国科罗拉多大学医学院的研究人员在黄病毒(flavivirus)中发现了一种全新的RNA结构,该结构允许RNA抵抗宿主核酸外切酶的降解。这一发现可以帮助人们开发治疗药物或疫苗,对抗那些致病性的黄病毒,例如登革热病毒、西尼罗病毒、黄热病病毒和乙型脑炎病毒等等。   据介绍,世界上约有40%的人面

icSHAPEMaP可探测完整的RNA结构

  RNA的结构决定了它的生物功能,然而目前的RNA结构探测方法只能捕获部分结构信息。测量完整(即全长)的RNA结构的能力将促进对小RNA的功能和调节机制的调查,并确定功能位点的短片段。   2021年6月7日,来自清华大学张强锋和斯坦福大学Mark A. Kay等研究团队在Nature Commu

多个sgrna作用于同一个基因相互之间会不会有影响

但因为结构得到了简化更方便研究者使用,进而对目的DNA双链进行切割。 由于PAM序列结构简单(5’-NGG-3’)。 通过基因工程手段对crRNA和tracrRNA进行改造CRISPR (clustered,作用是时间也比较长、鱼类及哺乳动物细胞, regularly interspaced,且长期