北京基因组所细菌陆生化研究取得阶段性成果
近日，中国科学院北京基因组研究所章张课题组对DnaE2酶的研究取得了新进展。该研究合理地解释了新基因产生和基因组进化对细菌环境适应性的影响，并进一步讨论了真核生物与陆生菌之间的共进化。研究成果在Nature子刊The ISME (International Society for Microbial Ecology) Journal上发表。 DnaE2酶是细菌复制酶DnaE1的一个同源蛋白，但研究发现该酶已经发生功能异化——主要参与易错修复而不是复制，而且被认为是造成细菌基因组GC 含量增加的主要原因。另外，有研究发现该酶还与部分细菌的耐药性有关，因此，近年来对DnaE2酶的功能及结构研究备受关注。 在该研究中，科研人员通过对菌群结构归类、进化分析及大规模宏基因组数据(metagenomics)筛选发现，DnaE2基因很可能在陆生菌(terrabacteria，最先开始陆生化的一类细菌)中最先出现，含有D......阅读全文
Nature子刊：基因编辑揭开细菌基因组秘密
由美国伊利诺伊大学香槟分校化学和生物分子工程系的赵惠民教授(音译，Huimin Zhao)带领的一个研究团队指出，他们利用一种创新的DNA工程技术，发现了隐藏在细菌基因组中的潜在的、有价值的功能。这项研究成果发表在12月5日的Nature Communications杂志上。 每种
新疆启动试验向沙漠喷洒陆生藻固沙
风吹沙跑，有没有办法治理？6月14日，在“天山对话：推动新疆科技创新与产业创新”活动上，“新疆产汇流调控下的生态保育与土地改良工程”启动。该工程将以向沙漠喷洒陆生藻的方式，将沙子粘连起来，遏制沙丘流动，进而通过覆绿工程和生态恢复，有效遏制沙漠扩张。6月14日，“新疆产汇流调控下的生态保育与土地改良工
细菌的抗药性早有基因根源
抗生素作为药物问世还不到一百年，如今具有抗药性的“超级病菌”已让医学界头疼。的抗药性如何产生？加拿大研究人员最近报告说，他们从3万多年前的细菌DNA中分离出了抗药基因，首次通过严谨的实验表明，抗药性基因根植于细菌，甚至远早于人类发现抗生素。 加拿大麦克马斯特大学的研究人员从该国西北部的育空地区钻取沉
Cell子刊：揭秘细菌的耐受基因
科学家们发现，细菌的一个基因能够关闭自身的蛋白合成进入休眠状态，以便逃过抗生素的攻击。文章发表在Cell旗下的Molecular Cell杂志上。 上世纪四十年代人们发现，一群细菌中总有那么一两个，能够在抗生素的攻击下生存下来，这一现象被称为细菌的耐药性。细菌耐药性依赖于细胞的休眠，这
细菌中制备基因组DNA实验
小量制备 氯化铯法 实验方法原理 提取DNA的一般过程是将分散好的组织细胞在含SDS（十二烷基硫酸钠）和蛋白酶K的溶液中消化分解蛋白质，再用酚和氯仿
细菌基因组DNA提取方法综述
细菌基因组DNA的提取方法综述，提供了5种方法。 1 快速微量提取法A.取1.5ml菌体培养物于一灭菌Ep管中，12000rpm离心1min, 丢去上清夜，收集菌体。B.加入400ul裂解液（40mMTris-醋酸，20mM醋酸钠,1mMEDTA,1%SDS,pH7.8）混匀,置于37oC水浴1hr
细菌中制备基因组DNA实验
实验方法原理 提取DNA的一般过程是将分散好的组织细胞在含SDS（十二烷基硫酸钠）和蛋白酶K的溶液中消化分解蛋白质，再用酚和氯仿/异戊醇抽提分离蛋白质，得到的DNA溶液经乙醇沉淀使DNA从溶液中析出。实验材料 细菌试剂、试剂盒 TE氯化铯溴化乙锭NaCl乙醇CTAB仪器、耗材 离心机摇床实验步骤 1
Nature:－人类肠道细菌具有获得性细菌防御（AID）基因簇
近日，美国华盛顿大学的科研人员在Nature上发表了题为“Human gut bacteria contain acquired interbacterial defence systems”的文章，发现肠道中的几种拟杆菌属（Bacteroidales sp.）的细菌具有基因簇防御功能，可以中和
植物细胞的特征
植物细胞的细胞壁构造在细胞膜外，由纤维素，半纤维素和果胶组成。其组成与对比的细胞壁的真菌，其是由几丁质的，细菌，这是由肽聚糖和古细菌，其是由pseudopeptidoglycan。在许多情况下，原生质体将木质素或木栓质分泌为初级细胞壁内的次级壁层。角蛋白它被分泌到叶片，茎和其他地上器官的表皮细胞的原
独脚金内酯与karrikin信号途径起源研究获进展
独脚金内酯（strigolactones，SLs）最初作为寄生植物种子萌发的刺激物被发现，近些年被确认为一类新型的植物激素。独脚金内酯影响植物生长发育的较多方面（如调控分枝和根系形态等），并能作为植物与根际微生物之间的交流信号。Karrikins（KARs）是植物燃烧产生的小分子，包含一个类似于独脚
小小角苔－会“借”基因——首个高质量角苔参考基因组发布
中国科学院植物研究所研究员陈之端团队通过一系列精细设计的去污染流程，得到了119 Mb的芽胞角苔基因组组装结果，获得了第一个高质量的角苔参考基因组，填补了苔藓类植物相关研究的空白。相关成果2月10日作为封面文章在线发表于国际学术期刊《自然—植物》（Nature Plants）上。图片来源于网络
用转基因光合细菌生产单糖好处多
美国哈佛大学维斯生物启迪工程研究所和哈佛医学院的研究人员表示，光合细菌进行基因工程改造后能够产生单糖和乳酸，利用该项研究成果有望开发出新的环保型生产日用化工产品的方法。相关研究刊登在新出版的《应用和环境生物》杂志上。 光合细菌（PSB）是一种能进行光合作用而不产氧的特殊生理
科学家从北极细菌提取“耐寒基因”
加拿大研究人员从北极的喜寒细菌中提取的基因可以让某些细菌变得对温度非常敏感，因此，植入了这些耐寒基因的细菌菌株在一定温度下会死亡，这有助于研究人员研发出稳定的肺结核和其他传染病活疫苗。相关论文发表在最近出版的美国《国家科学院院刊》（PNAS）上。 研究人员表示，所有的细菌在进化过程中
英发明高效识别细菌“有用”基因新技术
英国研究人员16日报告说，他们发明一种快速高效分析细菌基因组中成千上万个基因的新技术，可以在一次实验中识别出“有用”的基因，从而防治细菌导致的疾病。 英国桑格研究所16日发布新闻公报说，这种名为TraDIS技术的实质是在基因层面上的“剪切和粘贴”。基因是DNA链上具有特定功能的一个片段，如
“超级细菌”的耐药性基因可遗传
德国科学家日前发布的一项研究成果显示，让细菌具有耐药性的基因不仅能够跨越不同物种传播，还能通过接触染色体而遗传。 以某些大肠杆菌为代表的革兰氏阴性菌已对多种抗生素具有耐药性。目前，多粘菌素是对抗耐药性细菌的最后一道防线，但是一个名为MCR－1的基因会让细菌对多粘菌素也产生耐药性，变成“超级细
反义RNA的调控细菌基因的表达功能
反义RNA对编码CAP的基因的调控作用已如前述。这里再介绍一下micF RNA对ompF基因的表达的调控。ompF蛋白质是大肠杆菌的外膜蛋白的主要成分这一。micF RNA是从另一基因(ompC基因)附近的DNA序列转录而来，和o-mpFn RNA的5'端有70%的序列互补，因此在体外mic
《科学》：古老蛋白塑造细菌紧凑基因组
该发现可能有助于开发其它标靶Rho的抗生素 与人类相比，细菌不携带过多的“垃圾DNA”，它们的基因组要“整洁”得多。比如大肠杆菌大约90%的基因组都包含编码蛋白质的DNA，而人类基因组的90%都是非编码的“垃圾DNA”。 美国科学家近日研究发现，细菌基因组的这种“整洁”可能要归功于一种名为R
科学家发现细菌基因表达常规机理
美国纽约大学兰贡（Langone）医学中心的科学家发现和阐述了细菌体内控制转录延伸（transcription elongation）的常规机理。在4月23日出版的《科学》杂志上，他们表示，该机理依赖游离核糖体和核糖核酸聚合酶（RNAP）之间的协同作用，因为这种协同作用使得转录率对应于转
美用转基因细菌合成高能火箭燃料
图：石油基燃料和先进生物燃料的能量密度比较。先进生物燃料(绿色)与石油基燃料(黑色)相比，能量密度较低。蒎烯二聚体(红色)与石油基燃料JP-10能量密度类似。 目前的生物燃料体积热值太低，在应用与火箭、导弹中时，高能燃料非常重要。有一种从树木中提炼的化合物蒎烯，经二聚化后生成蒎
细菌基因或推动陆地植物进化
数亿年前从微生物转移到绿藻的基因可能推动了陆地植物的进化。一项分析表明，来自细菌、真菌和病毒的数百种基因已被整合到植物中，使后者具有适于陆地生活的特性。3月2日，相关论文发表于《分子植物》。 “我们的研究改变了陆地植物进化的传统观点。”论文通讯作者、美国东卡罗莱纳大学生物学专家黄金玲（音译）说，
基因改造细菌将废气转为化工原料
美国西北大学和郎泽科技公司研究人员在最新一期《自然·生物技术》发表论文称，他们在一项新的试点研究中，将一种梭菌进行遗传工程改造，用于合成此前它们无法产生的化合物，这种选择、设计和优化细菌菌株的过程，成功地证明了其将CO2转化为丙酮和异丙醇的能力。这种新的气体发酵过程不仅可从大气中去除温室气体，还
细菌的限制修饰系统包含哪些基因？
细菌的限制修饰系统包含三个连锁基因：（1）hsd R：编码限制性核酸内切酶（2）hsd M：编码限制性甲基化酶（3）hsd S：编码限制性酶和甲基化酶的协同表达
人造细胞－美利用人造基因“复活”细菌
美国一个研究小组20日报告说，他们合成了一个人工基因组，并用它使一个被掏空的单细胞细菌“起死回生”。研究人员表示，这是第一个完全由人造基因指令控制的细胞，它向人造生命形式迈出了关键一步。 美国J·克雷格·文特尔研究所的研究人员在最新一期美国《科学》杂志上报告说，他们人工合成了一种名为
反义RNA调控细菌基因的表达功能介绍
反义RNA对编码CAP的基因的调控作用已如前述。这里再介绍一下micF RNA对ompF基因的表达的调控。ompF蛋白质是大肠杆菌的外膜蛋白的主要成分这一。micF RNA是从另一基因(ompC基因)附近的DNA序列转录而来，和o-mpFn RNA的5'端有70%的序列互补，因此在体外m
真菌细菌如何影响基因表达和肿瘤存活
共聚焦显微镜下可见白色念珠菌生物膜代谢物刺激SCC25细胞 一项由巴西São Paulo州立大学(UNESP)的一组研究人员进行的体外研究显示了真菌和细菌如何激活与头颈部肿瘤相关的基因，由于生物膜的代谢(这些微生物以一种有结构和协调的方式自组织的群落)通过有利于肿瘤发展和抵抗治疗所需的细胞
细菌基因转移与重组的方式有哪些？
1.接合作用：当细菌与细菌相互接触时，质粒DNA就可从一个细菌转移到另一个细菌。2.转化作用：由外源性DNA导入宿主细胞，并引起生物类型改变或使宿主细胞获得新的遗传表型的过程，称为转化作用。3.转导作用：当病毒从被感染的细胞释放出来，再次感染另一细胞时，发生在供体细胞与受体细胞之间的DNA转移及基因
科学家发现细菌基因表达常规机理
美国纽约大学兰贡（Langone）医学中心的科学家发现和阐述了细菌体内控制转录延伸（transcription elongation）的常规机理。在4月23日出版的《科学》杂志上，他们表示，该机理依赖游离核糖体和核糖核酸聚合酶（RNAP）之间的协同作用，因为这种协同作用使得转录率对应于
基因测序是怎么判断病毒或者细菌来源
目前以新冠病毒来解释，首先病毒的体外活性，其实他与病毒的种类和体外环境因素有关。病毒的起源似乎并不一定与其体外失活有关。由于病毒不能形成化石，其复制机制复杂，因此研究病毒的起源非常困难。事实上，它们可以感染几乎所有的生物，这使得问题更加复杂。一些病毒如疱疹病毒和单核细胞增多症病毒与其宿主细胞的基因有
独脚金内酯与karrikin信号途径起源研究获进展
独脚金内酯（strigolactones，SLs）最初作为寄生植物种子萌发的刺激物被发现，近些年被确认为一类新型的植物激素。独脚金内酯影响植物生长发育的较多方面（如调控分枝和根系形态等），并能作为植物与根际微生物之间的交流信号。Karrikins（KARs）是植物燃烧产生的小分子，包含一个类似于
稻子为何能陆生？进化分蘖调控机制是关键
记者从云南大学获悉，该校农学院胡凤益研究员及其合作团队近日成功揭示了陆稻在陆生适应性进化中的分蘖调控作用机制。《自然》子刊《自然·通讯》在线发表了这一成果。 植物株型对作物产量具有重要作用，许多禾本科作物的驯化历史都经历了共有、平行的株型变化模式，即具有分蘖减少的转变。例如，玉米、高梁、小麦、