我国尚未建立生物大数据研究中心:人才缺口较大

大数据时代已经来临。2014财年,美国政府就如何充分利用生物医学大数据,启动Big Data to Knowledge计划,这是继2012 年美国国家大数据计划实施后新一轮面向生物大数据的基础研究计划。目前,发达国家在生物大数据领域的技术和应用已远远走在前端。在我国,生物大数据还处于发展的初期阶段。该如何以最快的速度赶上这一潮流,如何从国家主权层面对生物大数据进行有效的保护和管理,如何在基础研究和技术市场应用上与世界同步,已成为不可回避且值得深入思考的话题。 谁是生物大数据技术的领航者 大数据发展的核心动力来自于人类记录、测量和分析世界的渴望。当前,高通量测序技术的快速发展,使生命科学研究获得了强大的数据产生能力。 哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院院长王亚东教授告诉科技日报记者,上世纪90年代,科学家花费10年时间、近30亿美元获得了第一个人类基因组图谱;而今天,完成一个个人基因组测序不到一天时间,费......阅读全文

中国生物技术发展中心调研生物大数据发展情况

   为应对大数据时代带来的挑战,了解大数据技术发展态势以及对未来我国生物技术领域的科研能力、公共管理和产业竞争力方面的影响,探讨应对措施,生物中心肖诗鹰副主任于2014年5月6-7日带队到复旦大学、浙江大学进行了调研。   在复旦大学、浙江大学科研管理部门的支持配合下,召开了题为“大数据对我国生物

阿里联合生物技术公司打造基因组数据云

   本报讯 近日,北京贝瑞和康生物技术有限公司与阿里云共同向外界宣布,双方将共同打造以海量的中国人群基因组数据为核心的数据云,实现对个人基因组数据的精准解读。此次,双方共同合作的“神州基因组数据云项目”将首先聚焦于基因组大数据在云平台上的批量计算、分析、存储,进而在基因大数据领域共同进行前沿探索。

生物信息分析数据挖掘

DNA芯片技术能够在基因组水平分析基因表达,检测许多基因的转录水平及在不同条件下的基因转录变化,显示反映特征组织类型、发育阶段、环境条件应答、遗传改变的基因谱。基因芯片产生了海量的数据,仅仅进行差异表达分析还远远不够,如何管理分析这些数据、从中挖掘信息已经成为利用这一技术的新的难点。芯片数据大量出现

生物数据唤醒日常家居

   谈到智能物体,多数的家居用品都相当地不够智能。它们蹲在固定位置,了无生气,跟主人毫无交流。但据亚力克斯·罗瑟拉和詹姆斯·克拉厄所言,即使是最不声不响的物体也能拥有神奇的互动性,而这只是个时间问题。这些设计师称,通过身体传达出的数据,家居用品将可以与我们进行互动。  在都柏林科学画廊生命记录展的

生物医疗大数据如何应用?

  随着生物科技和医疗技术的迅猛发展、高通量手段的成熟,生物医疗行业的大数据急剧膨胀。然而,与其它行业的数据不同,生物医疗行业的数据呈现分散、破碎、低透明度、以及意义尚等解析等特征。不象其它行业,数据具有时效性以及数据很轻、易于解析;生物医疗行业的数据普遍很“重”、信息量超大、不同的解析策略可能得出

技术数据AvaLIBS系统

技术数据AvaLIBS系统型号 描述 规格 AvaSpec-2048-1单通道光谱仪波长范围200-310nmAvaSpec-2048-2双通道光谱仪波长范围200-410nmAvaSpec-2048-3三通道光谱仪波长范围200-475nmAvaSpec-2048-4四通道光谱仪波长范围200-5

什么叫数据映射技术?

数据映射(Data Mapping) :给定两个数据模型,在模型之间建立起数据元素的对应关系,将这一过程称为数据映射。数据映射是很多数据集成任务的第一步,例如:数据迁移(data migration)、数据清洗(data cleaning)、数据集成、语义网构造、p2p信息系统。数据映射的方式有两种

美英生物医药学家运用新技术解决海量数据问题

  美国芝加哥伊利诺伊大学和英国诺威奇基因组分析中心的研究人员运用SGI(R)UV(TM)加速药物发现,进行复杂问题分析。生物技术领域的研究人员近期宣布在SGI(R) UV(TM)高效计算机(HPC)用于高密度计算实践中取得了突破性进展。SGI UV是当今工业应用的一种先进的可量化共享存储

《信息技术-生物特征识别数据交换格式-第14部分-DNA数据》国家标准解读

  一、 标准编号及标准名称   标准编号为: GB/T 26237.14-2023;标准名称:信息技术 生物特征识别数据交换格式 第14部分 DNA数据  二、 标准制定背景  DNA分型技术的出现,使得DNA作为生物特征进行身份验证已经被公安、司法、法医等领域高度认可,广泛应用于个体识别、亲权鉴

英国生物库数据开始对外开放

  英国生物库数据于3月30日正式面向研究人员开放。通过这一数据库,全球的科学家都可以将近50万英国人的各种健康数据用于研究,这无疑对全球医学研究起到积极的推动作用。   英国生物库项目于2006年8月正式启动,旨在收集大量的生物样本和医学数据用于医学研究。数据收集目标为40岁到65岁的英国人,数

生物医学大数据亟待深挖利用

图片来源于网络   “我国是人类遗传资源大国,但不是强国,随着健康中国、大数据等国家重大战略的实施,迫切需要加强对人类遗传资源的深入研究和信息挖掘。”  10月10日,人类遗传资源开发创新研究高层论坛在京召开。中国生物技术发展中心主任张新民坦承,国家人类遗传资源管理和保护涉及生命伦理和国家安全,在资

大数据:生物医学变革新契机

  “我国目前每年医疗费用总额超过2.4万亿元,如果按照麦肯锡报告的预测,我国医疗领域利用大数据每年将节省医疗费用近2000亿元。”军事医学科学院研究员朱云平在11月29日召开的“第五届重大疾病防治科技创新高峰论坛”上如是说。  大数据影响的深度和广度仍在不断扩张。对于生物医学来说,其发展过程中积淀

植物生物学研究数据库

实验概要植物生物学研究数据库实验步骤http://bioinf.scri.sari.ac.uk/cgi-bin/plant_snorna/home 英国 Top 植物种的snoRNA基因数据库。 综合 http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plant

微生物所发表中国微生物组数据平台

  10月26日,《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表中国科学院微生物研究所微生物资源与大数据中心、世界微生物数据中心马俊才团队题为gcMeta: a Global Catalogueof Metagenomics platform to support the ar

世界微生物数据中心落户微生物所

  在近日召开的第12届国际菌种保藏大会上,经过大会专家委员会评审并经世界菌种保藏联合会理事会审议通过,中国科学院微生物研究所在众多的竞争者中脱颖而出,成为世界微生物数据中心(World Data Center for Microorganisms, WDCM)新的主持单位。   W

自动化DMS干基点质萃取技术应用于生物信息数据收集的...

自动化DMS干基点质萃取技术应用于生物信息数据收集的优势从大数据的提取开始,一场生物信息研究的革命一触即发 生物信息研究可以细分为四个领域:收集、分析、存储、应用,信息收集是首要也是尤为关键的组成部分。生物信息数据的收集受到诸多因素的限制,给生物信息研究造成阻碍,使得天然的生物数据库未能得到充分利用

技术数据AvaLIBS系统性能

光谱范围 *200-1070 nm分辨率   (FWHM) < 0.1 nm探测器 CCD,每通道2048像元积分时间 1.1毫秒-10分钟触发延迟 -20纳秒-89秒,步长21纳秒触发抖动 ± 21纳秒温漂系数 环境温度每变化1℃仅漂移0.1个像元;计算机接口 USB 2.0,RS-232I/O接

热继电器的技术数据

  热继电器的主要技术数据是 整定电流。整定电流是指长期通过发热元件而不致使热继电器动作的 最大电流。当发热元件中通过的电流超过整定电流值的20%时,热继电器应在20分钟内动作。热继电器的整定电流大小可通过整定电流旋钮来改变。选用和整定热继电器时一定要使整定电流值与电动机的额定电流一致。  由于热继

数据采样器的技术特点

  数据采样器技术特点   1、整套设备为组合式设计:采样器、流量控制、制冷除湿装置,水分收集器、加热采样管、吸附管、干燥器等功能体有机组合,结构紧凑,轻巧便携;   2、取样管内管采用防吸附的聚四氟乙烯材料,全程伴热;   3、程序控制主采样吸附管与旁路吸附管的切换,无需手工参与

微生物组大数据搜索引擎入选中国医药生物技术十大进展

   目前,中科院青岛生物能源与过程研究所研发的“微生物组大数据搜索引擎”(Microbiome Search Engine; MSE)入选“2016年中国医药生物技术十大进展”。   微生物组(又称“菌群”)在人体中与生俱来,与人体健康息息相关。因此,对海量微生物组“大数据”的搜索与挖掘,有助于认

水德浮游生物大数据平台的使用与数据分析方法

水德浮游生物大数据平台 目前,绝大多数海洋和淡水生态领域的研究机构和业务监测单位,对浮游生物的研究手段还停留在人工镜检及手工测定的阶段,这样经常导致操作过程繁琐、工作量巨大、分析结果滞后,而且需要资深专业技术人员。此平台用于对浮游生物样品进行快速安全清洗、扫描成像、种类鉴定、数量统计、大小测量、生物

生物大数据研讨会聚焦前沿问题

  首届中国生物大数据统计方法研讨会近日在重庆举行。会议围绕大数据统计方法与传统统计方法的关系、生物大数据的特征与分类、生物医学大数据的功能与运用等前沿问题展开专题报告和自由研讨。  会议由中国卫生信息学会卫生统计理论与方法专业委员会主办,第三军医大学军事预防医学院承办,来自北京大学、重庆大学、中山

-生物医学基因大数据:现状与展望

  生物医学大数据广泛涉及人类健康相关的各个领域:临床医疗、公共卫生、医药研发、医疗市场与费用、个体行为与情绪、人类遗传学与组学、社会人口学、环境、健康网络与媒体数据。  大数据(big data)是指由于容量太大和过于复杂,无法在一定时间内用常规软件对其内容进行抓取、管理、存储、检索、共享、传输和

JAMA:生物医学大数据缺失的环节

  有人认为,大数据将有助于提高医疗保健行业的效率,促进在该行业推行问责制。然而到目前为止,其他行业在这方面要成功得多:通过对多种数据源进行大规模的整合和分析,获得了实用价值。那些成功行业弄明白了一个问题,那就是:当不同的数据集在具体某个人的层面上连接起来时,大数据就会产生变革性的价值。相比之下,生

英国生物样本库发布大规模遗传数据

  近日在线发表于《自然》的两篇论文集中介绍了英国生物样本库的遗传数据。两篇论文对整个数据集进行了详细描述,并对大脑遗传结构进行了深入研究。该数据集涵盖了约50万个个体的全基因组遗传数据、临床测量以及健康记录。  英国生物样本库包含50万年龄(招募时)在40~69岁之间英国人的遗传和临床数据,这些资

全球首个冰川微生物数据库

青藏高原被称为世界“第三极”和“亚洲水塔”。除南北极外,它是全球最大的冰川分布区,现有冰川2万条以上,面积超过2万平方公里,也是我国及亚洲20亿人赖以生存的十多条大江大河的源头。青藏高原冰川是微生物的天然存储器,封存了不同历史时期的微生物。 现在,中国科学家构建的

生物制药(3)生物技术

目前,各国、各组织对生物技术产业的定义和圈定的范围很不统一,甚至不同人的观点也常常大相径庭。本文采纳有关学者的观点,将现代生物技术产业界定为:生物技术是以现代生命科学理论为基础,利用生物体及其细胞的、亚细胞的和分子的组成部分,结合工程学、信息学等手段开展研究及制造产品,或改造动物、植物、微生物等,并

山东环保数据打假:用技术创新反制技术造假

  石敬华很忙。  作为山东省环境信息与监控中心污染源监控室主任,他忙数据分析,忙执法检查,还忙着到全国各地讲课——现在,他已经是打击污染源监测数据造假的专家。  石敬华长得粗壮敦实,身上都是故事。记者跟着他、磨着他,连续地走、不断地看、起劲地聊。  不到3年时间,山东省查处环保监测数据造假案件36

生物芯片技术

生物芯片技术是通过缩微技术,根据分子间特异性地相互作用的原理,将生命科学领域中不连续的分析过程集成于硅芯片或玻璃芯片表面的微型生物化学分析系统,以实现对细胞、蛋白质、基因及其它生物组分的准确、快速、大信息量的检测。按照芯片上固化的生物材料的不同,可以将生物芯片划分为基因芯片、蛋白质芯片、多糖芯片和神

生物芯片技术

一、 概述:     生物芯片这一名词最早是在80年代初提出的,主要指分子电子器件。美国海军实验室研究员Carter 等试图把有机功能分子或生物活性分子进行组装,想构建微功能单元,实现信息的获取、贮存、处理和传输等功能。用以研制仿生信息处理系统和生物计算机。产生了"分子电子学"同时取得了一些重要进展