微生物组大数据搜索引擎入选中国医药生物技术十大进展
目前，中科院青岛生物能源与过程研究所研发的“微生物组大数据搜索引擎”（Microbiome Search Engine； MSE）入选“2016年中国医药生物技术十大进展”。 微生物组（又称“菌群”）在人体中与生俱来，与人体健康息息相关。因此，对海量微生物组“大数据”的搜索与挖掘，有助于认识微生物组与疾病或生态灾害的关系，从而服务于生态系统的精准健康、精准护理与精准营养。 MSE首先建立了针对元基因组数据的超高速比对算法和数字索引机制，通过机器学习等手段,自动建立基于菌群的疾病与生态灾害的诊断与预测模型,从而计算“微生物组诊断与预警指数”，以判别菌群针对特定疾病的状态和风险。青岛生物能源所通过国际科技合作，借助MSE在世界上率先建立了基于人体共生菌群的口腔健康风险评估体系。目前正通过全国和国际范围内的口腔菌群大数据分析，系统考察人种、年龄、地域、生活习惯等因素对于这一健康风险评估体系的影响。MSE正通过“生物高通量......阅读全文
全球微生物组大数据搜索引擎上线
日前，中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞研究中心正式发布首个微生物组大数据搜索引擎——MSE（Microbiome Search Engine； http://mse.single-cell.cn），使得以整个微生物组为分析单元的智能搜索和大数据挖掘成为现实。 微生物组，又称“菌群”。
微生物组大数据搜索引擎入选中国医药生物技术十大进展
目前，中科院青岛生物能源与过程研究所研发的“微生物组大数据搜索引擎”（Microbiome Search Engine； MSE）入选“2016年中国医药生物技术十大进展”。 微生物组（又称“菌群”）在人体中与生俱来，与人体健康息息相关。因此，对海量微生物组“大数据”的搜索与挖掘，有助于认
微生物所发表中国微生物组数据平台
10月26日，《核酸研究》（Nucleic Acids Research）在线发表中国科学院微生物研究所微生物资源与大数据中心、世界微生物数据中心马俊才团队题为gcMeta: a Global Catalogueof Metagenomics platform to support the ar
全球最大的海洋微生物组数据库建立
9月4日，《自然》在线发表中外科学家的合作成果，该成果建立了全球最大的海洋微生物组数据库，从中发掘塑料降解酶、基因编辑工具、抗菌肽等重要基因资源。山东大学微生物技术国家重点实验室教授李盛英为文章共同通讯作者，助理研究员刘琨为文章共同第一作者。 微生物已在生物制造、生物医药、生物农业、环境治理等
全球最大的海洋微生物组数据库建立
9月4日，《自然》在线发表中外科学家的合作成果，该成果建立了全球最大的海洋微生物组数据库，从中发掘塑料降解酶、基因编辑工具、抗菌肽等重要基因资源。山东大学微生物技术国家重点实验室教授李盛英为文章共同通讯作者，助理研究员刘琨为文章共同第一作者。该成果在《自然》报道 山东大学供图微生物已在生物制造、
LHC物理学家用数据搜索粒子
世界上最强大的粒子对撞机还没有发现新的物理学成果，现在一些物理学家正在转向另一种策略。 一种曾经备受争议的粒子物理学方法已经进入了大型强子对撞机（LHC）的主流队伍。目前，LHC主要的ATLAS实验已经正式支持这种方法—— 一种通过机器创建的进行大量数据搜索的替代方法，作为其探测超越粒子物理标
基于微生物组大数据的疾病检测方法来了
微生物组具有服务疾病诊治与生态监控的巨大潜力，但是其影响因素错综复杂。如何通过菌群检测实现快速精准的疾病诊断呢？中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心发明了基于菌群大数据搜索的疾病检测方法，为此共性问题提供了原创的解决方案。该工作于3月17日在线发表于mSystems（美国微生物学会会刊）
微生物组测序分析的一大问题
BMC Biology杂志上的一项研究指出，许多已发表的微生物组研究其实受到了污染，错误的报告了来自于环境的杂菌。研究人员认为，在临床样本中检测到出人意料的细菌时，不应过早将其于疾病联系在一起。 我们机体内生活着不计其数的微生物，它们组成的生态系统就是微生物组。微生物组参与了许多重要的机体功能
研究开发基于菌群大数据搜索的新疾病检测方法
基于菌群大数据搜索引擎实现疾病检测的原理 微生物组具有服务疾病诊治与生态监控的巨大潜力，但是其影响因素错综复杂。如何通过菌群检测实现快速精准的疾病诊断呢？中科院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心发明了基于菌群大数据搜索的疾病检测方法，为此共性问题提供了原创解决方案。该研究成果近日在线发表于《美国微
生物信息学数据库和软件的搜索实验
实验方法原理熟练掌握上网搜索生物信息学数据库和软件的方法及技能。实验材料电脑实验步骤一、搜索生物信息学数据库或者软件数据库是生物信息学的主要内容，各种数据库几乎覆盖了生命科学的各个领域。核酸序列数据库有GenBank， EMBL， DDB等，蛋白质序列数据库有SWISS-PROT， PIR，OWL，
青岛能源所微生物组大数据分析工具开发获进展
元基因组是当前微生物组大数据最主要的存在形式之一。由于元基因组数据的复杂性、异质性以及指数级增长的体量，从中深度且快速发掘微生物群落结构和功能上的变化规律，一直是业界的一个重要技术瓶颈。近日，中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞研究中心发表了元基因组高性能计算分析软件Parallel-MET
华大参与：复杂宏基因组数据的新分析法
当前分析宏基因组数据的大多数方法，都依赖于与参考基因组的对比，但是许多环境中的微生物多样性远远超过了参考数据库所覆盖的范围。将复杂的宏基因组数据从头划分为特定的生物学实体（如特定的菌株或病毒），在很大程度上仍然是一个未解决的问题。 在2014年7月6日的《Nature Biotechnolog
使用NIST库搜索Xevo－TQGC系统数据以鉴定分析物
目的：证明Xevo™ TQ-GC系统生成的EI谱图可以与 NIST标准数据库v17中对应的谱图进行很好的 匹配。 背景：EI GC-MS是一种用于未知物分析的成熟技 术。尤其是EI的特性之一能够可重现地生成 丰富的特征碎裂模式，这对于成功使用EI数 据鉴定未知化合物十分重要。由于EI碎
使用NIST库搜索Xevo－TQGC系统数据以鉴定分析物
目的：证明Xevo™ TQ-GC系统生成的EI谱图可以与 NIST标准数据库v17中对应的谱图进行很好的 匹配。 背景：EI GC-MS是一种用于未知物分析的成熟技 术。尤其是EI的特性之一能够可重现地生成 丰富的特征碎裂模式，这对于成功使用EI数 据鉴定未知化合物十分重要。由于EI碎
苏晓泉团队开发出基于微生物组大数据的疾病检测方法
微生物组具有服务疾病诊治与生态监控的巨大潜力，但是其影响因素错综复杂。如何通过菌群检测实现快速精准的疾病诊断呢？中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心发明了基于菌群大数据搜索的疾病检测方法，为此共性问题提供了原创的解决方案。该工作于3月17日在线发表于mSystems（美国微生物学会会刊）
“百万微生态”计划将构建全球最大人体微生物组数据库
2019年10月26日，“百万微生态”国际合作计划（MMHP）在深圳第14届国际基因组学大会（ICG-14）上正式启动，来自中国、瑞典、丹麦、法国、拉托维亚等多国科学家将合作开展微生物宏基因组研究，致力于在未来三至五年内对100万份来自肠道、口腔、皮肤、生殖道等器官的微生物组样品进行测序分析，绘
数据标注优秀案例集之四十七－|－云藏搜索引擎藏文信息处理数据标注
云藏搜索引擎藏文信息处理数据标注 申报单位：海南藏族自治州藏文信息技术研究中心 推荐单位：青海省数据局 一、案例简介 藏文信息处理面临语言结构复杂、标注标准缺失、数字化资源不足等问题。本案例通过系统化数据标注技术，构建高质量藏文语料库，赋能藏文信息化行业，推动藏文自然语言处理技术的进步和实用
Nature：药物对肠道微生物组的影响比人们想象的要大
我们是生活在地球上用药最多的几代人之一。2型糖尿病、肥胖和冠状动脉疾病等心脏代谢性疾病的发病率持续上升，并共同构成了全世界最高的死亡原因。受影响的人往往不得不连续数月甚至数年每天服用多种药物。 如今，在一项新的研究中，位于德国海德堡的欧洲分子生物学实验室（EMBL）的Peer Bork团队与一
青岛能源所提出“微生物组影响指数”
微生物组是微生物在自然界的存在形式，与人体、空气、土壤与海洋的健康息息相关。因此，微生物组科学与产业已经成为国际科技合作与竞争的“战略高地”。然而，大数据挖掘工具的匮乏，阻碍着微生物组研究从“数据分析”向“数据科学”的跨越。2010年，来自43个国家的500多名研究人员联合启动了“地球微生物组计
融智生物发布全球首个商用化生物组学微生物质谱数据库
近日，融智生物宣布建设完成基于全新生物组学理念的微生物质谱数据库。这是全球首次发布商品化生物组学微生物质谱数据库。 传统上，基于不同的细菌或真菌内蛋白组成分特别是核糖体蛋白有显著的差异，对核糖体蛋白组的质谱测试，可用于快速、高准确度鉴定微生物。基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI-TO
【限时促销】百科网“搜索”焕新颜－广告大促前20名
亲爱的家人们：客户的每一次搜索都代表了一个需求，来到分析测试百科网的客户，就更是您锁定的精准目标。今日，搜索已不再仅是锁定目标，丰富的形式更赋予它对品牌力的完美展现。更精准，变幻形式，更多链接，彰显品牌实力，分析测试百科网“搜索”频道换新颜，快来看看有哪些功能特性？1. 可维护的广告内容多，链接多，
李小兵教授：微生物组学是影响未来的三大科技之一
近日，由中国广告主协会标准与认证咨询专业委员会承办，多家行业研究机构协办的2019年中国广告主大会“标准与认证服务发展论坛”在杭州举行。国家工程实验室教授、黔酸宝生物实验室主任李小兵 国家工程实验室教授、黔酸宝生物实验室主任李小兵出席论坛，并发表“标准与认证是中国大健康产业发展的基石”主题演讲
百度、360搜索大战升级－搜索引擎市场或变局
8月中旬，周鸿祎宣布推出综合搜索业务后，搜索引擎市场领头羊百度的“太平”日子即将终结。 28日晚，百度低调反击360，趁夜“围堵”其搜索业务。昨天下午4点多，奇虎360发声明称要建设一个安全、干净、有效竞争的互联网搜索市场。百度有关负责人接
世界微生物数据中心落户微生物所
在近日召开的第12届国际菌种保藏大会上，经过大会专家委员会评审并经世界菌种保藏联合会理事会审议通过，中国科学院微生物研究所在众多的竞争者中脱颖而出，成为世界微生物数据中心（World Data Center for Microorganisms, WDCM）新的主持单位。 W
碳卫星获取首组观测数据
记者2月23日从中科院获悉：中国首颗全球二氧化碳监测科学实验卫星（简称“碳卫星”）已成功获取首批观测数据。 碳卫星于2016年12月22日在酒泉卫星发射中心成功发射入轨。经过平台测试、载荷加热排污等一系列工作后，有效载荷于今年1月12日成功开机，13日转入在轨观测任务模式并获取首批观测数据。
研究构建绵羊和山羊肠道高质量微生物基因组数据库
近日，西北农林科技大学羊遗传改良与生物育种团队携手国内外多家科研机构，在绵羊和山羊肠道微生物基因组数据库构建及肠道粘蛋白和多糖代谢功能菌种挖掘方面取得进展，研究成果发表在Microbiome上。研究团队在全国范围内的32个羊场收集了来自21个绵羊和山羊品种共计320个肠道样本，分别构建了包含1.6亿
暨南大学最新文章：制定蛋白质组“开放式搜索”质控标准
生物质谱具有高通量、高灵敏度的分析特点，是蛋白质组学研究的核心技术之一。基于数据库搜索的肽段质谱图谱鉴定方法是目前最有效和最广泛使用的蛋白质鉴定方法，然而仅有25%的图谱能被该方法识别。生物质谱具有高通量、高灵敏度的分析特点，是蛋白质组学研究的核心技术之一。基于数据库搜索的肽段质谱图谱鉴定方法是目前
Google向美国区域的搜索实验室用户开放搜索生成体验
在GoogleI/O之后注册了搜索实验室的美国用户现在可以开始使用一些早期实验，包括SGE（搜索生成体验）、代码提示和添加到表单。如果你想尝试这些功能，你可以通过访问这个网站注册，如果你已经注册，还可以在那里查看你的等待名单状态。该公司表示，其生成性人工智能驱动的搜索将使搜索更容易，用户将能够更快地
缺乏数据使用指导原则，基因组数据共享遇阻
基因组数据共享将生物医学研究推向快车道，但向公共领域发布的现有数据指南一方面承认免费和无条件使用数据的重要性，另一方面还未能解决这种重要性与数据生产者首次发布数据的“权利”之间的关系。 在美国能源部联合基因组研究所负责人Nikos Kyrpides看来，这种自相矛盾导致了数据生产者和数据使用
雅虎推出搜索浏览服务Axis
尽管雅虎公司近来负面新闻不断，但它近日新推出的搜索浏览服务Axis却让人颇有“小清新”的感觉，赢得不少积极评价。 据雅虎的演示视频介绍，Axis可以让用户在输入搜索词后，跳过传统的链接列表，将最接近的搜索结果以一排水平的网页缩略图显示。虽然缩略图实质上还是搜索结果列表，但用户界面和体