DNA测序新突破将造福万千准妈咪

DNA测序已经以一种戏剧性的全新方式进入了医疗界:在早早孕时期检测染色体缺陷。25年来,我们知道,胎儿的DNA痕迹可以通过怀孕母亲的血液来进行检测,然而这些痕迹非常之小,而且到目前为止,我们尚没有技术来检测到DNA正常的多余染色体。 上周,在《新英格兰医学杂志》(The New England Journal of Medicine)上发表的一篇研究文章中,戴安娜?碧昂琪(Diana Bianchi)和她的同事们向我们展示了,DNA测序如何能以惊人的准确率帮助检测到多余的染色体。这篇报告开启了胎儿DNA检测的新时代。 首先让我们来了解一些背景知识:人体的第21对染色体多出一条变成三条就会引起唐氏综合征(Down syndrome),这种遗传学疾病导致智力缺陷和生长迟缓。唐氏综合征也被称为“21-三体综合征”,“三体”即染色体变成......阅读全文

解码“基因组学之父”桑格:测序,测序,测序

  “桑格当之无愧地被称为‘基因组学之父’,他的工作为人类读取和理解基因代码奠定了基础,彻底变革了生物学并极大促进了当今的医学发展。”、   有一天,65岁的英国生物化学家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的试验,转身走出实验室,宣布自己正式退休。那一年是1983

双脱氧法DNA测序实验——测序酶进行标记测序反应

在基本的双晩氧测序反应中,寡核苷酸引物退火于单链DNA摸板,在4种脱氧核糖核酸三磷酸存在时,引物为DNA聚合酶所延伸。反应混合物中也含有4种双脱氧核糖核苷三磷酸的其中一种,当它掺入到DNA的生长链时,可终止链的延伸。实验材料DNA试剂、试剂盒寡核苷酸引物测序酶终止混合液测序酶缓冲液焦磷酸酶混合液仪器

454测序应用于HBV耐药性突变检测

  HBV(Hepatitis B Virus)乙型肝炎是一种基因组长约3.2kb,部分双链环状DNA病毒。我国的乙肝病毒感染率约60%-70%,乙肝表面抗原携带率约占总人口的7%,以此计算,全国约有9300万人携带乙肝病毒,其中乙肝患者大约有3000万。由于HBV很

Proton和HiSeq测序平台比较:SNPs检测均表现良好

  美国国家癌症研究所的研究人员在近日发表的有关Proton和HiSeq 平台的对比研究显示,在进行外显子组测序时,Life Technologies的Ion Proton和Illumina的HiSeq 2000在单核苷酸变异(SNPs)检测方面均表现良好,但在准确检测插入缺失时存在某些问题

FDA批准下一代测序基因检测技术

  2月19日,美国药品管理局(FDA)批准了"23 and me"公司发明的,对引起"布鲁姆综合征"(一种可能导致身材矮小并伴随高发性癌症的疾病)的主效基因进行检测手段。  这一检测手段主要针对准备生育的人群。如果双亲这一基因都具有"BLMAsh"表型的话,子女就会出现这一症状。一般情况下发生的几

-卢煜明:血浆DNA测序技术检测红斑狼疮

  来自香港中文大学的研究人员采用基因组和甲基化组测序方法,揭示出了系统性红斑狼疮(SLE)患者血浆DNA的异常。研究结果发布在11月26日的《美国国家科学院院刊》(PNAS)上。  领导这一研究的是香港中文大学的卢煜明(Y. M. Dennis Lo)教授。卢煜明教授是分子生物学的临床应用专家,尤

New-Oncology计划研发新的液体活检测序技术

  作为德国研究和分析公司Blacefield的一个分支,New Oncology目前主要提供称作NeoPlus的靶向测序技术,该技术能够提供超过70个与癌症相关的点突变,基因扩增,基因融合和其他重排的情况的检测,其主要是通过靶向扩增和测序技术。  在过去的6个月中,New Oncology公司通过

斯坦福:无创DNA测序检测心脏移植排斥

  除了正在国内外如火如荼推广的无创产前唐氏筛查之外,针对血浆中游离DNA的NGS技术正在充分发挥其卓越的深度测序优势,为其他医疗领域带来全新的应用,解决更多的临床问题。  目前,斯坦福大学的研究人员设计出一种无创基因检测方法,能够比以前的方法更早期地检测到心脏移植的排斥反应(早数周或数月)。这种方

Science:测序需警惕!你可能检测到了“假突变”

  你可能检测到了一个“假突变”!2月17日,科学家们在Science上表示,在DNA样本中检测到的的一些序列突变实际上可能是样本处理过程中遭受损伤所造成,诱导损伤引发的突变占据了大多数的低频及中频突变。更重要的是,他们发现,被广泛使用的测序数据集中也存在着DNA损伤的印迹,包括千人基因组计划数据集

临床质谱检测:或超过基因测序领头精准医疗

精准医疗指一个人基因组信息为基础,结合蛋白质组、代谢组等相关内环境信息,为病人量身设计出最佳治疗方案,以期达到治疗效果最大化和副作用最小化的专门定制医疗模式。精准医疗代表着未来医学诊断的发展方向,基因检测作为精准医疗不可或缺的一环,已经开始渗透进我们的生活并逐步扩大化,第三代测序技术的问世使基因测序

SNP的检测方法(直接测序法与PCRSSCP)

人类基因组中存在着广泛的多态性,最简单的多态形式是发生在基因组中的单个核苷酸的替代,即单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNPs)。SNP通常是一种二等位基因的(biallelic),即二态的遗传变异,SNP的数量大、分布广,在组成人类基因组的

单细胞测序是一种高效的检测技术

 单细胞测序技术又称“下一代“测序技术或深度测序技术,可以一次性对几十万至几百万条DNA分子进行序列测定,现已广泛应用在基因组测序、基因表达分析、非编码小分子RNA鉴定、转录因子靶基因筛选及DNA甲基化等相关的研究领域。  测序技术的突出优点是可以从细胞图谱的角度,探测细胞特异性以及细胞间的差异,探

关于新型基因检测技术—基因测序的操作设备介绍

  过长的测序周期以及上万美元的仪器成本,成了阻碍基因测序进入寻常百姓家的障碍。而运用新技术的基因测序仪大大降低了基因组测序的门槛,使得更多研究人员能够使用这项技术开发多种应用。  总部位于美国加州的生命技术公司(Life Technologies),最近正在中国推出台式基因测序仪Ion Proto

美国批准“纳米孔测序”新冠检测试剂EUA

  纽约  -美国食品药品监督管理局上周授予美国实验室公司紧急使用授权,用于基于纳米孔测序的检测SARS-CoV-2的试剂。  该试剂被称为Clear Dx SARS-CoV-2 WGS v3.0测试,使用牛津纳米孔技术的MinIon测序仪和Clear Labs Clear Dx自动样品制备和分析流

长读长测序的“灾难”——检测结构变异成为空谈!

   长读长测序技术以其读长的优势,能够更大程度的检测结构变异(Structural Variations,SV)。然而面对市面上常见的Nanopore测序技术,检测结构变异的事实真的如此吗?在今年11月bioRxiv杂志上发表的文章则指出:使用Nanopore对具有反向重复结构的CNV序列进行DN

全外显子测序和全基因检测的区别

全外显子测序和全基因检测的区别:全外显子组测序,是指利用序列捕获技术将只占基因组1%的外显子进行高通量测序,从而检测出约85%的致病突变,测序深度更高,数据更有效,变异检测更准确。全基因组测序,是利用高通量测序平台对一种生物的基因组中的全部基因进行测序,可以同时检测到外显子、内含子和调控序列,价格较

全基因测序和一般基因检测的区别

全基因测序和一般基因检测的区别:基因检测的作用就在于此:它可以先判定某人的CYP2C9是否发生了突变,并判定他属于哪种代谢类型,然后再根据代谢类型决定药物剂量。如果是强代谢型,那就适当提高剂量;如果是弱代谢型,那就降低剂量并注意药物在血液中的含量。这样就既保证了药物达到治疗效果,也不会出现ADR。一

4大基因测序技术在无创性产前检测中的应用

  近年来,通过高通量测序技术检测孕妇外周血中游离胎儿DNA(cfDNA)筛查胎儿染色体多倍体异常的无创性产前检测( noninvasive prenatal testing, NIPT)技术正越来越多地用于临床,其具有安全性、高效性及准确率高的特点,正在给产前诊断技术带来革命性的变化。NIPT技术

一项基于国产单分子测序平台的微量细胞研究成果

  近日,由中信湘雅生殖与遗传专科医院(以下简称“中信湘雅”)林戈课题组和深圳市真迈生物科技有限公司(以下简称“真迈生物”)联合组成的研究团队在预印本服务网站BioRxiv在线发表了题为Accurate CNV identification from only a few cells with lo

王晟:染色体微缺失微重复检测或将成为下一个热点

  问:王晟博士您好!感谢您接受采访。贝瑞和康本次会上展示的以NextSeq CN500测序仪为核心的高通量测序实验室整体解决方案看起来非常具有可操作性,那么这套系统是否已经在临床实验室成功运行?  答:是的,贝瑞和康以NextSeq CN500基因测序仪为核心的高通量测序目前已经在全国多家大型产前

无创产前基因检测是什么?

  无创产前基因检测也被称为无创DNA产前检测或者其他什么相似的名字,这是一种应用高通量测序技术通过母亲的血液检测胎儿染色体数目异常的产前检测方法。无创产前基因检测是一项全新的技术,但是也是一项极其引人关注的技术。2011年10月17日,Sequenom公司在美国发布了第一款在临床用于针对唐

从“基因测序仪”观“测序行业”!

基因测序仪:基因测序“皇冠上的明珠”  基因测序仪是测序产业链的起点也是关键环节,它为整个中下游测序服务提供最基本的测序支撑,同时也是壁垒最高的部分,处于基因测序产业价值链顶端。基因测序仪对于基因产业的重要性,如同发动机之于汽车行业,芯片之于电子通信行业,可谓是基因测序“皇冠上的明珠”。  到目前为

测序技术及测序仪器的比较

自sanger测序技术发明以来,经人类基因组计划的促进,测序技术有了跨越式的发展,以实验方法与实验仪器的改进为标志,测序技术经历了三代的发展,同时测序技术向着高通量测序,单分子测序,低价格测序的方向发展,目前测序技术已成为分子生物学实验中的重要的实验手段。本文主要简单回溯了测序技术的发展历史,介绍了

DNA测序454-焦磷酸测序简介

  该方法在油溶液包裹的水滴中扩增DNA(即emulsion PCR),每一个水滴中开始时仅包含一个包被大量引物的磁珠和一个链接到微珠上的DNA模板分子(控制DNA浓度出现的大概率事件)。将emlusion PCR产物加载到特制的PTP板上,板上有上百万个孔,每个微孔只能容纳一个磁珠。DNA Pol

DNA测序自动测序法简介

  基因分析仪(即DNA测序仪),采用毛细管电泳技术取代传统的聚丙烯酰胺平板电泳,应用该公司ZL的四色荧光染料标记的ddNTP(标记终止物法),因此通过单引物PCR测序反应,生成的PCR产物则是相差1个碱基的3'末端为4种不同荧光染料的单链DNA混合物,使得四种荧光染料的测序PCR产物可在一

DNA测序技术的测序的规律

生成互相独立的若干组带放射性标记的寡核苷酸,每组寡核苷酸都有固定的起点,但却随机终止于特定的一种或者多种残基上。由于DNA上的每一个碱基出现在可变终止端的机会均等,因此上述每一组产物都是一些寡核苷酸混合物,这些寡核苷酸的长度由某一种特定碱基在原DNA全片段上的位置所决定。在可以区分长度仅差一个核苷酸

illumina测序是转录组测序吗

转录组测序属于测序应用的一种,Illumina测序属于测序技术的一种,两者没有包含于被包含关系,只能说Illumina测序可以做转录组测序。

蛋白质测序的测序要求

  ●1 样品必需纯(>97%以上);  ●2 知道蛋白质的分子量;  ●3 知道蛋白质由几个亚基组成;  ●4 测定蛋白质的氨基酸组成;并根据分子量计算每种氨基酸的个数。  ●5 测定水解液中的氨量,计算酰胺的含量。

无创产检技术再升级

如果说2015年是中国NIPT的元年,那么2016年或将成为NIPT-plus的新纪元。NIPT-plus,简单地说是传统NIPT的迭代更新,是一项基于高通量基因测序技术,通过一管孕妇外周血排查更多胎儿染色体非整倍体、染色体微缺失微重复综合征的产前检测项目。2015年底,湖南家辉遗传专科医院与北京贝

Science医学:捕捉癌症的蛛丝马迹

  约翰霍普金斯大学Kimmel癌症中心的科学家们在一项测试中将血液癌症DNA检测与基因组测序技术结合到一起,证实其可用于筛查癌症,监控癌症患者复发,以及寻找手术后的残留癌。   “这种方法利用了基因组测序能够检测血液中循环肿瘤DNA的能力,为我们提供了一种敏感的途径来检测和监控癌症,”约翰霍普金