基因组信息如何加密制定标准是必须
随着基因测序成本直线下降，专家认为，我们的基因组将有助于医生发现疾病，拯救生命。但并不是每个人都愿意将自己的基因组序列公之于众。现在，密码学家正在完善一个新的隐私保护工具，可将遗传信息转变成安全而实用的格式。 所谓的同态加密方法，可以帮助保持基因组隐私，就好像基因检测转移到廉价的在线云服务一样。 现有的加密技术常以数据无法使用为代价而保证数据安全的。正因为此，大多数基因序列在发送出去进行分析前，会被简单地匿名。然而，麻省剑桥郡 Whitehead生物医学研究所的计算生物学家Yaniv Erlich表示，随着遗传侦察技术的逐步推进，这些匿名的数据可以很容易追溯到其所属者，他已经准确地将12%的男性基因配对。 2009 年，IBM发布了第一个基于格的加密方案。几何为基础的加密方法允许数据通过乘法和加法运算来操作，而数据仍保持加密。研究人员意识到，基因测试中使用的复杂算法可以借两个基本的数学运算较精密......阅读全文
癌症研究人员联手汇集肿瘤基因组数据
研究人员希望，数据分享将为利用诸如这些脑部腺癌细胞等肿瘤的基因组信息带来更好的方法。 这是为大型癌症研究中心的很多病人提供的最新希望：“让我们测序你的肿瘤，或许我们能将其同击败这种恶性疾病的药物匹配。”不过，现实是基因组分析仍然仅为癌症病人提供了一小部分帮助。“我们多半时候不知道如何处理这些
基因序列排序与整理、数据库比对与意义
由于定序系统的定序方法都是将体细胞内的基因序列打断成很多段落后，再利用DNA扩增的方式原理，在扩增的同时借由侦测萤光的方式（将不同碱基原料接上萤光讯号，只要这有接讯号的碱基被合成了，即会发出不同强度的萤光讯号）即能得到大量的片段式基因序列。经数字化后的基因序列需经整理将每段落的头尾相接成一个完整的基
基因测序：数据处理与标准问题仍待解
图片来源：百度图片 目前我国在数据行业标准方面概念还很模糊，这就导致科研机构、医疗机构、企业在利用基因数据的时候，没有统一的规则，也造成基因测序行业良莠不齐。这种情况，亟须得到改变。 基因测序，一直被视为生命科学和生物技术发展的重大革命。在经历过前些年的积累之后，今年的基因测序行
基因组新数据或改写人类进化史
新的人类进化模型表明，人类起源于非洲大陆的多个祖先种群。5月17日发表在《自然》杂志上的一项新研究对主流理论提出了挑战，认为智人是从非洲多个不同的种群进化而来的，在经历了长期的基因混合后，最早可检测到的分裂发生在12万至13.5万年前。 在检测非洲当前种群的遗传物质，并将其与那里早期智人种群的现有
欧洲食品安全局开放转基因数据
图片来源：blog.friendseat.com 欧洲食品安全局(EFSA)近日公布了孟山都公司为获转基因玉米NK603的批准证书而提交的文件和资料。这些资料在EFSA发布的一份公告中出现，这样做说明EFSA打算着手满足公众所倡仪的透明度，旨在通过数据使得广大科学社
《细胞系统》：基因数据噪音或可保护患者隐私
大型基因组数据库对于科学家寻找同疾病相关的遗传变异来说是必不可少的。不过，对于贡献了DNA的人来说，这会带来隐私风险。一项2013年的研究显示，黑客能利用网络上公开可用的信息，从被匿名的基因组数据中辨别出人们的身份。 为解决这些担忧，一个由美国麻省理工学院计算机科学家Bonnie Berg
科学家构建首个油菜基因转录数据库
近日，中国农业科学院油料作物研究所油料作物基因组学与抗病性改良创新团队破译了油菜基因组的全转录信息密码，构建了油菜十万余个基因的转录全景图，使得油菜基因功能研究第一次有了标准的可参考的基因转录数据库，将有力支撑油菜功能基因的相关研究。该项研究成果在线发表在《植物学报（The Plant Jour
科学家搭建草莓基因组数据库
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2021/3/454861.shtm 草莓为蔷薇科草莓属，因芳香多汁、营养丰富受到喜爱，在全国各地均可种植。栽培草莓为异源多倍体，基因组复杂，杂合度高。 2019年，《自然—遗传学》发表了利用三代测序数据组装的高
加拿大个人基因组计划公布首批数据
加拿大个人基因组计划（PGP-Canada）于2012年启动，欲建立一个在线的加拿大人基因组数据库，供全世界的研究人员使用。近日，该计划公布了首批测序数据。根据《加拿大环球邮报》（the Globe and Mail）的报道，研究人员发现了许多意想不到的结果。 这个计划测序了首批56名参与者的
新一批敲除小鼠序列数据存入基因银行
美国得克萨斯州基因组医学研究所将其敲除小鼠库的超过275000个核苷酸序列信息存入了美国国立卫生研究院的基因银行。 以休斯敦为根据地的得克萨斯州基因组医学研究所于今年5月加入国际敲除小鼠协会。在美国国立卫生研究院号召在国际科学界广泛分享小鼠研究信息后，该研究所表示愿意向美国健康研究院提供基因序列
外媒：基因数据是中美较量的新领域
在美国联邦调查局(FBI)，没有很多特工像埃德•尤(Ed You)那样。在这个鼓励工作人员让自己看上去平淡无奇的工作环境中，他那剃得锃亮的光头十分抢眼。尽管他的多数同事都是出了名的口风严密，但尤却是科技会议上健谈的明星，例如西南偏南大会(South-by-Southwest)和拉斯维加斯国际黑客
全球药典草药基因组数据库已上线
近期，中国中医科学院中药研究所团队建立了全球药典基因组数据库(GPGD)。该数据库是全球首个针对药典收载草药物种的大型基因组学数据库。相关研究成果发表在《Science China-Life Sciences》杂志，标题为“Global Pharmacopoeia Genome Database
Illumina收购Edico－Genome，加速基因组数据分析
Edico的DRAGEN™ Bio-IT平台为新一代测序带来了更快更简化的输出。 圣迭戈——2018年5月15日——Illumina公司（纳斯达克代码：ILMN）宣布收购新一代测序（NGS）数据分析加速解决方案的领先供应商Edico Genome。Edico Genome的DRAGEN™ B
《细胞系统》：基因数据噪音或可保护患者隐私
大型基因组数据库对于科学家寻找同疾病相关的遗传变异来说是必不可少的。不过，对于贡献了DNA的人来说，这会带来隐私风险。一项2013年的研究显示，黑客能利用网络上公开可用的信息，从被匿名的基因组数据中辨别出人们的身份。 为解决这些担忧，一个由美国麻省理工学院计算机科学家Bonnie Berger
15000年前“农民”全基因组数据出炉
英国《自然·通讯》杂志近日发表的一项遗传学报告中，德国科学家公布了生活在15000年前的安纳托利亚“农民”的首个全基因组数据。该研究结果有助于认识欧亚大陆的农业起源。图片来源于网络 农业在公元前10000年至9000年左右起源于亚洲西南部的新月沃土（Fertile Crescent），随后传
众包个体基因数据库缓慢发展
Yaniv Erlich 计算遗传学家Yaniv Erlich因其建立了世界最大“家谱”而引人注目。而目前，他的DNA.land又引发新一轮个体基因数据库“众包热潮”。 早在2013 年，Erlich 团队就发表了一篇论文，介绍了如何利用公共资源，通过交叉比对的方法确定遗传学研究参与者的个人身
人和未来加速基因数据分析－助推精准医疗
6月8日，人和未来生物科技有限公司(Genetalks，以下简称“人和未来”)受邀参加第二届“精准医疗时代的协作创新——2016英特尔生命科学信息技术论坛”，公司CTO宋卓博士出席论坛并发表演讲。作为世界首家将FPGA加速技术应用于基因检测实践的生物科技企业，宋卓博士在论坛上对其公司最新产品GT
基因测序：数据处理与标准问题仍待解
【导读】目前我国在数据行业标准方面概念还很模糊，这就导致科研机构、医疗机构、企业在利用基因数据的时候，没有统一的规则，也造成基因测序行业良莠不齐。这种情况，亟须得到改变。 目前我国在数据行业标准方面概念还很模糊，这就导致科研机构、医疗机构、企业在利用基因数据的时候，没有统一的规则，也造成基因测
新一代肿瘤基因测序，数据质量是基石
肿瘤细胞的一个明确特点是其复杂的异质性，存在个体不同细胞间，不同个体间，另根据现有的研究基础，已经发现肿瘤基因层面变异频率普遍较低，各种因素告诉我们，在复杂的背景中确定肿瘤突变，首先测序碱基的准确率必须过关。原始数据的碱基识别准确性越高，使用的信息分析方法越合理标准，对测序深度的要求就会越低。在
日本量子密码通信技术传送人类基因组实验成功
据日本《共同社》获悉，日本东芝公司和日本东北大学东北Medical Megabank机构（仙台市）近日宣布，成功开展了利用可防止信息被偷窥的新一代技术“量子密码通信”传送人类遗传信息（基因组）完整数据的实证试验。据悉，容量庞大的基因组数据传送在全球尚属首次，东芝介绍称这一实验确认了量子密码技术的
德阳市环境监测中心站开展饮用水源水质加密监测
人民渠为德阳市集中式饮用水水源地，自3月17日起，其上游蒲阳河将进行为期10天的河道整治，水量将出现变化。为及时掌握水质变化情况，为西郊水厂取水提供可靠数据，保证德阳市饮用水源地水质安全。德阳市市环保局发文部署市、县两级站及时开展水质加密监测工作。 德阳市环境监测中心站接到任务后，响应迅速，根
黑龙江加密汛期水质监测－严密监控饮用水源地
黑龙江省环保厅日前启动了全省主要断面的水质加密监测工作，防止环境污染事故及次生灾害发生。截至目前，全省各地未发生突发环境事件。 针对入汛以来黑龙江流域和松花江流域部分地区发生严重洪涝灾害可能对水质造成的影响，黑龙江省环保部门迅速排查消除环境安全隐患，及时掌握汛期水质变化情况。黑龙江省环保厅
美国安局研发量子计算机－几乎可破任何加密技术
美国国家安全局正在研发一款用于破解加密信息的量子计算机。 爱德华-斯诺登向《华盛顿邮报》提供了相关的秘密文件，美国国家安全局的该项目由此曝光。 美国国家安全局希望利用这种特殊的量子计算机加快其密码破解工作。 据信美国国家安全局已为该项目投资了约8000万美元(约合4900万英镑
新量子弱磁场共振分析仪加密中款检测项目和功能特点
检测项目： 量子弱磁场共振检测法是一种新兴的快速、准确、无创波谱检测方法，特别适用于 产品疗效对比 和亚健康的检查，其检测项目主要有：心脑血管、骨密度、微 量元素、血铅、风湿病、肺呼吸道、肾病、 血糖、肠胃、肝胆、脑神经、妇科、前列 腺、骨病、钙铁锌硒等近30种检测项目。 功能特点: 1、
黑龙江加密汛期水质监测－严密监控饮用水源地
黑龙江省环保厅日前启动了全省主要断面的水质加密监测工作，防止环境污染事故及次生灾害发生。截至目前，全省各地未发生突发环境事件。 针对入汛以来黑龙江流域和松花江流域部分地区发生严重洪涝灾害可能对水质造成的影响，黑龙江省环保部门迅速排查消除环境安全隐患，及时掌握汛期水质变化情况。黑龙江省环保厅
基于同源基因簇的水稻泛基因组综合数据库建成
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498300.shtm近日，华中农业大学作物遗传改良全国重点实验室、湖北洪山实验室教授张建伟课题组联合国内外高校与科研机构在《自然—通讯》与《分子植物》连续发表两篇研究论文。这两项工作以代表亚洲稻群体结构的
北京基因组所构建完成质体基因组结构变异数据库
多相催化是实现高效定向化学转化的关键技术，其中的一个重要基础科学问题是如何通过精确设计和调控催化活性位结构及所在环境，从而强化其定向催化功能并创造新型高效催化剂。近日，中国科学技术大学熊宇杰教授课题组和江俊教授课题组继在电催化体系中提出表面极化概念后,再次通过与黄伟新教授课题组合作，证实界面极化
蛋白质数据+基因序列精准构建进化树
西班牙基因组调控研究中心的科学家们在最新一期《自然·通讯》上发表了一项创新研究，展示了如何利用蛋白质三维形状，解开生命中古老的“历史密码”，揭示了生命之树中最古老的进化关系。这项研究首次将蛋白质的形状数据与基因序列数据结合，提高了进化树的准确性。蛋白质结构解决“饱和问题”（艺术概念图）。图片来源：《
香港理工研发大数据分析平台揭示癌症基因关系
记者23日从香港理工大学获悉，该校癌症基因组的大数据分析取得重大突破，通过建立一个创新的大数据分析平台，分析基因之间的相互作用，揭示在癌症中基因网络的失控机制。 这项突破是理大医疗科技及资讯学系讲座讲授翁一鸣、陈颖志和黄思铨联同哈佛大学生物统计学专家所组成的研究团队所取得的成果。 研究团队还
迄今最详细人类基因组分析数据出炉
迄今最详细的人类基因组分析数据出炉。图片提供：ENCODE计划 一项大型国际计划显示，与青少年在学校掌握的知识相比，人类基因组—— 一个人的遗传信息总和——包含有更多的蛋白质编码基因。当研究人员决定在上世纪90年代晚期对人类基因组进行测序时，他们专注于寻找那些用来确定全部生