基因组信息如何加密制定标准是必须
随着基因测序成本直线下降，专家认为，我们的基因组将有助于医生发现疾病，拯救生命。但并不是每个人都愿意将自己的基因组序列公之于众。现在，密码学家正在完善一个新的隐私保护工具，可将遗传信息转变成安全而实用的格式。 所谓的同态加密方法，可以帮助保持基因组隐私，就好像基因检测转移到廉价的在线云服务一样。 现有的加密技术常以数据无法使用为代价而保证数据安全的。正因为此，大多数基因序列在发送出去进行分析前，会被简单地匿名。然而，麻省剑桥郡 Whitehead生物医学研究所的计算生物学家Yaniv Erlich表示，随着遗传侦察技术的逐步推进，这些匿名的数据可以很容易追溯到其所属者，他已经准确地将12%的男性基因配对。 2009 年，IBM发布了第一个基于格的加密方案。几何为基础的加密方法允许数据通过乘法和加法运算来操作，而数据仍保持加密。研究人员意识到，基因测试中使用的复杂算法可以借两个基本的数学运算较精密......阅读全文
－英公开埃博拉病毒基因测序数据
一个英国科研团队成功完成了对埃博拉病毒的基因测序，并已将数据在网上公开发布，免费提供给全球科研人员使用。这有助于各国研发更高效的治疗药物和疫苗。 剑桥大学３日发布公告称，２０１４年埃博拉疫情在西非暴发后，来自该校及英国多个科研机构的研究人员开始在塞拉利昂采集病毒样本，并利用美国一家公司开发的新
AbbVie公布泛基因型丙肝疗法数据
图片来源于网络 近日，在美国肝病研究学会（AASLD）组织的The LiverMeeting？2018上， AbbVie公司宣布了关于其泛基因型慢性丙型肝炎病毒（HCV）疗法Mavyret（glecaprevir/pibrentasvir）的新数据。来自3b期临床试验EXPEDITION-8的结果
DNA－microarray相关的基因表达数据处理攻略
基因表达谱 的发展有助于科研工作人员进一步的理论知识充实及应用到研发等领域中。基因芯片是最近几年发展起来的基因表达重要工具，本文主要对这种技术的数据分析和管理方法作具体介绍。一、引言DNA微阵列(DNA microarray),也叫基因芯片，是近几年发展起来的一种能快速、高效检测DNA片段序列、基因
基因芯片数据处理流程与分析介绍
当人类基因体定序计划的重要里程碑完成之后，生命科学正式迈入了一个后基因体时代，基因芯片 (microarray) 的出现让研究人员得以宏观的视野来探讨分子机转。不过分析是相当复杂的学问，正因为基因芯片成千上万的信息使得分析数据量庞大，更需要应用到生物统计与生物信息相关软件的协助。要取得一完整的数据结
大数据与基因技术结合－拯救可怕的“帕金森”
医疗行业的变革正成为新的风口，今天作者想讲讲大数据与基因技术结合，正在产生什么新的想象力。其中尤以基因检测技术走到了前面，让我们谈谈“帕金森综合症”： 在未来，基因检测术将会成为医疗不可或缺的一部分。越来越多的人会进行基因测序来了解自己的生命体征和健康状况。国内最大的基因检测机构华大基因，也正
全球最大癌症基因数据库发布
美国国家癌症研究所(NCI)科学家发布了有史以来规模最大的癌症相关基因变异数据库，为研究者们提供了迄今为止最全面的方式，搞清楚如何将治疗药物靶向疾病。 周一NCI在一份声明中称，基于基因组学研究的新数据库，将对全球开放获取，预计将有助于研究人员加快新药的开发，同时能够更
北京基因组所数据资源建设取得进展
近日，中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心团队研究论文在线发表于《核酸研究》期刊。该研究成果的发表是国内首次以数据中心为模式，整体发布我国生命组学数据资源建设情况，标志着生命与健康大数据中心建设取得实质性重要进展，也标志着我国建设综合性基因组数据资源获得国际同行认可。 生命与健康大数
基因测序：数据深度挖掘和解读难题待解
作为一种新型基因检测技术，基因测序能够从血液或唾液中分析测定基因全序列，预测罹患多种疾病的可能性，个体的行为特征及行为合理。基因测序技术能锁定个人病变基因，提前预防和治疗。正因如此，今年华大基因的上市，就引发了资本市场的热烈追捧。 在日前在京召开的第四届全国功能基因组学高峰论坛上，与会的众多专
基因测序：数据深度挖掘和解读难题待解
作为一种新型基因检测技术，基因测序能够从血液或唾液中分析测定基因全序列，预测罹患多种疾病的可能性，个体的行为特征及行为合理。基因测序技术能锁定个人病变基因，提前预防和治疗。正因如此，今年华大基因的上市，就引发了资本市场的热烈追捧。 在日前在京召开的第四届全国功能基因组学高峰论坛上，与会的众多
各种模式生物必需基因在线数据库
Essential Genes are the genes that are indispensable to sustain cellular life. The functions encoded by essential genes are considered as a foundation
基因组所完成开发RiceWiki数据库
近日，中国科学院北京基因组研究所章张研究员课题组与北京理工大学、中国林业科学研究院及华中农业大学合作开发完成RiceWiki数据库。该数据库是基于维基百科的水稻基因信息平台，是可编辑且内容公开的公众注释系统。研究成果在Nucleic Acids Research杂志发表。 水稻是人类重
肿瘤基因专家致力挖掘单细胞大数据潜能
近年来，随着测序技术的迅猛发展，单细胞测序技术已逐渐走入人们视野。2013年，单细胞测序技术成为《自然》评选的“Method of the Year”。大多数的基于NGS的基因检测，都是在大量细胞宏观水平上，对整个细胞群进行遗传分析。单细胞测序技术则是在单个细胞的水平上，对其遗传物质进行检测，从
基因表达谱数据聚类分析相关内容
DNA微阵列基因表达数据分析 对于基因表达谱数据的分析是生物信息学 的研究热点和难点。转化为数学问题，分析任务是从数据矩阵 M 中找出显著性结构，结构类型包括全局模型 (model) 和局部模式 (pattern) 。对基因表达谱数据的分析是数据挖掘问题，所采用的方法包括通过可视化进行探索性数据分析
全球首款基因编辑疗法公布长期数据
·Casgevy是一款自体细胞疗法，它利用CRISPR/Cas9基因编辑系统，在体外对来自患者的造血干细胞进行编辑，使血红细胞生产高水平的胎儿血红蛋白——一种健康的、携带氧气的血红蛋白。当地时间2024年6月14日，由美国生物技术公司福泰制药（Vertex Pharmaceuticals，VRTX.
基因表达数据分析主成分分析－PCA
DNA微阵列基因表达数据分析 主成分分析 ( Princ ipal Component Analysis ， PCA ) 是一种掌握事物主要矛盾的统计分析方法，它可以从多元事物中解析出主要影响因素，揭示事物的本质，简化复杂的问题。计算主成分的目的是将高维数据投影到较低维空间。给定 n 个变量的 m
北大重庆大数据研究院将共建“基因智能大数据实验室”
18日在重庆召开的2023世界中联中医药大数据产业高峰论坛上，北京大学重庆大数据研究院与上海睿昂基因科技股份有限公司签署共建“基因智能大数据联合实验室”(以下简称实验室)战略合作协议，双方将发挥各自优势，挖掘基因数据价值，赋能医疗健康。据介绍，实验室将整合北京大学北京国际数学研究中心和北京大学生物统
基因检测解码“生命说明书”－全球竞跑基因数据库
随着华大基因上市临近，基因检测概念再度被关注。 华大基因CEO尹烨曾在公开场合介绍，给基因学家一滴血，能查到生育、肿瘤、感染，从三检合一到N检合一，液体活检可以做更多的事情。 相比于传统的影像学检测手段只能检测出已经发生且长成一定大小的异物，基因检测技术的优势在于，在更早的发病初始期，从分子
解码“基因宝藏”：最全海洋微生物基因数据库出炉
9月4日晚，华大生命科学研究院（简称“华大”）联合山东大学、英国东安格利亚大学、中国海洋大学、厦门大学、丹麦哥本哈根大学等机构，在《自然》上发表研究成果。他们通过对目前已公开的海洋微生物宏基因组数据进行分析和深度挖掘，构建了迄今为止最完整的海洋微生物基因数据库，并从中发现了大量具有应用潜力的基因资源
北京基因组所发布表观基因组数据库MethBank－3.0
中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心发布表观基因组数据库MethBank 3.0，并将其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species为题，在线发表在Nucleic Acids Rese
北京基因组所发布表观基因组数据库MethBank－3.0
中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心发布表观基因组数据库MethBank 3.0，并将其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species为题，在线发表在Nucleic Acids Rese
保护个人生物资讯，斯坦福团队研发－DNA－加密技术
为了找出致病基因，研究人员常需要大量患者与健康者的基因资讯，甚至针对全基因体进行分析比较，找出关键的差异。然而，个体 DNA 差异也正是每一个人独有的生物特征。有些人因此担忧，自己的 DNA 资讯可能会因为提供样本进行研究或遗传检测而外流。 因此，美国斯坦福大学研究团队开发了一种 DNA
科学家开发出能加密和破译图像的生物计算机
据美国物理学家组织网2月8日(北京时间)报道，美国加州斯克里普斯研究院和以色列理工学院科学家开发出一种生物计算机，目前可用于破译存储在DNA芯片中的加密图像。这是首次通过实验演示基于DNA计算的分子图像密码系统。相关论文发表在最新一期《应用化学》上。 电子计算机由硬件、软件、输入和输出4个
－“数学拼图”加密软件固若金汤－即便花费数百年也不能破译
据物理学家组织网7月30日(北京时间)报道，美国加州大学洛杉矶分校与IBM的研究人员共同设计出一个固若金汤的“数学拼图”加密软件系统，在允许用户将其作为一个程序使用的同时，可阻止任何潜藏在背后的破译。该研究成果经同行审阅后将于10月召开的第54届IEEE研讨会计算机科学基础会议上提交。 这
重庆对三峡试验性蓄水期间水质实施加密监测
新华网重庆10月15日电(记者徐旭忠)记者从重庆市环保局了解到，为及时掌握三峡工程175米试验性蓄水期间水质变化情况，重庆市环保部门对蓄水期间水质实施加密监测，以确保三峡库区水质安全。 9月10日，三峡工程启动试验性蓄水工作。重庆水质监测的范围主要是三峡库区“三江”(长江、嘉陵江、乌江)干
国际癌症基因组联盟公布逾1万个癌症基因组数据
国际癌症基因组联盟(International Cancer Genome Consortium，简称"ICGC")近日向科研界公布了超过1万个癌症基因组的数据。这些数据能更好地帮助全世界的癌症研究者从基因方面了解癌症，加快对癌症的研究并帮助更多癌症靶向治疗的发展。 安大略癌症研究所所
基因数据表明STAP细胞并不存在
Teruhiko Wakayama 两篇发表于《自然》杂志的关于一种可将成熟细胞转化为干细胞的新方法的争议性论文被指控存在数据篡改和捏造问题。现在，论文共同作者提供的基因数据显示，这种方法所获得的细胞并非研究小组声称的那样。该说法也得到了另一个来源的支持——用这种方法制造的STAP细胞（由刺激触
定量－PCR－基因表达的实验数据应如何处理？
总的来说，有三个层次的校正是必须要做的。 参比信号校正。试剂中必须包含固定浓度的 ROX，这样由于反应总体积的差异、所在孔的位置不同、试管壁的厚度差异、管盖透光性能的差异等所引起的荧光信号波动都能够被扣除，使数据真正反映 PCR 进程。ROX 校正能够极大地改进定量的精确度，提高重复管之间的
大型衰老相关基因表达谱数据库建成
英国《自然·通讯》杂志30日发表的一项研究称，包括人类在内的4个物种的大型衰老相关基因表达谱数据库建成。德国科学家团队分析数据后发现，衰老相关基因的表达变化与退行性慢性病相关基因的表达变化轨迹一致，但与癌症的相反。 对衰老及衰老相关疾病的研究，一直是人类医学的难题。但随着“衰老基因”的确定，衰
科学家搭建草莓基因组数据库
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2021/3/454861.shtm 草莓为蔷薇科草莓属，因芳香多汁、营养丰富受到喜爱，在全国各地均可种植。栽培草莓为异源多倍体，基因组复杂，杂合度高。 2019年，《自然—遗传学》发表了利用三代测序数据组装的高
科学家提出基因测序数据分类新标准
有助于开发出更有效的疫苗;更迅速应对潜在公共卫生突发事件 最近，美国洛斯阿拉莫斯国家实验室(LANL)的一个遗传学小组和一国际财团联合提出了一套旨在阐明可公开获取的基因测序数据信息的质量标准。新标准最终可使遗传研究人员开发出更有效的疫苗，或有助于公共健康部门或安全人员更迅速地应对潜在的公共卫生