BMCBiology:含Cas酶的新型转座子
转座子是一种可移动的遗传元件,能够在基因组的不同位点之间跳跃,这种DNA片段广泛存在于自然界的各种生物中。近日,科学家们在细菌和古生菌中发现了一类新型的转座子,这种转座子不仅含有Cas内切酶的编码基因,还依赖这种酶整合到新的基因组区域。 细菌一直在与病毒或入侵核酸(质粒)进行斗争,为此它们演化出了多种防御机制。CRISPR/Cas适应性免疫系统就是其中之一。在CRISPR和Cas的帮助下,细菌可以经由小RNA分子的引导,靶标和沉默入侵者遗传信息的关键部分。 现在,CRISPR与Cas9的组合已经成为了一个通用工具,被用来对真核生物进行位点特异性的基因组编辑。这种新兴的基因组编辑工具,引起了人们极大的研究热情。 在这项新研究中,法国巴斯德研究所和美国国家生物技术信息中心的研究人员,比较了几种古生菌和细菌的基因组序列。他们发现,这些基因组编码Cas1蛋白的区域,表现出了可移动遗传元件的特征。 “Cas1持续出现在这些转座......阅读全文
PNAS:衰老过程的罪魁祸首――转座子
多年来,科学家们一直在研究遗传因素对衰老的贡献,但是成果甚少。最近,一项新的研究阐明了转座子在加速衰老过程中的作用。在过去的十年中,科学家们已经开始认识到非编码序列在我们基因组中所起的重要生物作用。一种特别“狡猾”的非编码元件――高度重复的转座子,能将自己插入到我们基因组中任何可访问的部分,从而有可
关于反转录转座子的基本信息介绍
反转录转座子(retrotransposon或retroposon)指通过RNA为中介,反转录成DNA后进行转座的可动元件。这样的转座过程称为反转座作用(retrotrans—position)。 反转座作用出现在真核生物,包括能自由地感染宿主细胞的反转录病毒,以及通过以RNA为中介进行转座的
Science重要成果:人类癌症反转录转座子图谱
在人类基因组中,称为反转录转座子(retrotransposon)的小DNA元件通过自我复制和重新插入到基因组的多个位点从而具有造成突变性破坏的潜力。正常的成人细胞通过抑制机制阻止这些元件四处跳跃,然而根据发表在6月28日《科学》(Science)杂志上的一篇研究报道,这些机制在某些癌症中可能发
我国科学家构建目前最大活跃DNA转座子数据集
DNA转座子也称跳跃基因,可被用作基因工程工具。近日,中国科学院动物研究所张勇和王皓毅研究组开展了迄今为止最大规模的DNA转座子活性筛选,构建了目前最大的活跃DNA转座子数据集,极大扩展了基于DNA转座子的基因工程工具箱。相关研究成果5日在线发表于《细胞》杂志。130个新型DNA转座子和20个已知活
Cell:永不停息的基因战争
我们的细胞中进行着激烈的基因战争,入侵的外源DNA频频试图破坏人类的基因蓝图。现在,加州大学旧金山分校UCSF的研究人员发现了,细胞保护自身基因抵抗入侵者的新分子机制。 这一机制负责识别和靶标外源DNA,被研究人员称为SCANR。UCSF的研究人员是在酵母中发现SCANR机制的,由于酵母与
转座子插入是白菜驯化表型变异的重要来源
近日,《植物生物技术杂志》(Plant Biotechnology Journal)在线发表了中国农业科学院蔬菜花卉研究所王晓武团队完成的研究论文。这是王晓武团队在前期白菜泛基因组研究基础上,进一步挖掘白菜基因组变异获得的研究成果。 王晓武介绍,转座子序列广泛存在
转座子插入是白菜驯化表型变异的重要来源
近日,《植物生物技术杂志》(Plant Biotechnology Journal)在线发表了中国农业科学院蔬菜花卉研究所王晓武团队完成的研究论文。这是王晓武团队在前期白菜泛基因组研究基础上,进一步挖掘白菜基因组变异获得的研究成果。 王晓武介绍,转座子序列广泛存在于植物基因组中,在作物驯化
转座子插入是白菜驯化表型变异的重要来源
近日,《植物生物技术杂志》(Plant Biotechnology Journal)在线发表了中国农业科学院蔬菜花卉研究所王晓武团队完成的研究论文。这是王晓武团队在前期白菜泛基因组研究基础上,进一步挖掘白菜基因组变异获得的研究成果。 王晓武介绍,转座子序列广泛存在于植物基因组中,在作物驯化中发
X射线辐照在候选放射抗性基因的作用
用转座子进行全面的基因筛选是系统鉴定抗性基因的新方法。本研究旨在利用该技术鉴定食管鳞状细胞癌中的候选放射抗性基因。转座子是一种碱基序列,可以随机转换到基因组中的另一个位置。通过在转座子中插入巨细胞病毒启动子作为转录激活因子,新位置的下列基因变得过表达,位于转座子插入位点的基因被下调。因此,可以获得使
我国创建世界上最大转座子插入资源库
不知你有没有注意到,从菜市场买回来的玉米,有的是黄灿灿的,有的却像个大花脸,中间夹杂着紫色、白色的玉米粒? 其实,这是玉米的天性使然。玉米基因中有很多非常活跃的转座子,它们就像一支“小画笔”,跳到哪个基因上,就会抹去那里本来的“颜色”。因此导致籽粒颜色变化有一部分是转座子运动产生的。 转座
Gene-Dev:研究发现抗癌基因有助于控制“跳跃”基因
所有肿瘤中约有一半具有基因p53的突变,通常负责抵御癌症。现在,UT西南大学的科学家发现了p53在对抗肿瘤中的新作用:防止逆转座子或“跳跃基因”在人类基因组中跳跃。研究小组发现,在p53缺失或突变的细胞中,逆转座子的移动与扩增比平时更为常见。这一发现可能会导致检测或治疗具有p53突变的癌症的新方
X射线辐照在候选放射抗性基因下面的作用有哪些?
本研究旨在利用该技术鉴定食管鳞状细胞癌中的候选放射抗性基因。 转座子是一种碱基序列,可以随机转换到基因组中的另一个位置。通过在转座子中插入巨细胞病毒启动子作为转录激活因子,新位置的下列基因变得过表达,位于转座子插入位点的基因被下调。因此,可以获得使用转座子方法具有差异过表达或下调基因的各
研究发现水稻转座子受驯化选择和抗病抗逆中的调节功能
6月19日,Molecular Plant 杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所何祖华研究组题为Elimination of a retrotransposon for quenching genome instability in modern rice 的研究
转座子活动与染色质高级结构进化奥秘
近日,华中农业大学棉花遗传改良团队发表相关研究论文,首次公布了棉属中比四倍体棉花基因组更大的K2基因组,并对A2基因组和D5基因组进行了升级,发现基因组特异的转座子扩增导致了基因组扩张,通过比较三维基因组研究揭示了年轻的转座子扩增伴随着棉属特异的染色质高级结构形成。 棉花(Gossypium)
美科学家发现自私DNA-在进化中起重要作用
自然界中的基因有千万种,哪类基因最为常见和最为丰富?由美国南佛罗里达州立大学、圣迭戈州立大学和芝加哥大学科学家组成的研究小组在对大量基因组进行成功解码后找到了答案,那就是有“自私DNA(脱氧核糖核酸)”之称的转座子。转座子基因的丰度和广度表明,它们在进化和生物多样性的保持中发挥了至关重要的作用。
表观遗传调控水稻重要农艺性状研究获进展
转座子(transposon)是一段自身能够插入到基因组上的DNA片段,上世纪40年代,芭芭拉·麦克林托克(Barbara McClintock)首先在玉米中发现了转座子。从简单的细菌到复杂的人类,转座子广泛存在。转座子随机插入到重要基因中,会引发疾病、癌症和其他生理缺陷。DNA甲基化、组蛋
研究者首次发现“驯化”的水稻“外来DNA”
转座子是一种可以改变自身基因组位置的DNA序列,其通过转座事件改变细胞遗传特性和基因组大小。转座子通常被认为是外来DNA,“寄生”于宿主基因组中,但它们也可以在基因组中被“驯化”,并进化出有益于宿主的新功能。迄今为止,大多数驯化转座子都在哺乳动物中发现,只有少数转座子驯化在植物中被报道。在农作物
Cell子刊:生殖细胞的piRNA通路大名单
转座子广泛存在于生物的基因组中,能够自我复制,并随机插入到染色体上,因此又被称为跳跃基因。转座子在生殖细胞中特别危险,可能导致不孕或对后代发育产生严重影响。在进化过程中,复杂生物形成了一套生殖细胞基因组的防御机制,这一机制被称为piRNA通路。 冷泉港实验室(CSHL)Gregory
我国科研人员在DNA转座子研究领域取得新突破
DNA转座子是存在于染色体DNA上可自主复制和位移的基本单位,是基因组中一段可移动的DNA序列,可以通过切割、重新整合等一系列过程从基因组的一个位置“跳跃”到另一个位置,对于生命科学研究具有非常重要的意义。中国科学院动物研究所科研团队基于自然界丰富的动物遗传资源开展了迄今为止最大规模的DNA转座子活
中国医学科学院最新文章:关键逆转录转座子与癌症
LINE-1是现今人体内存在的唯一具有自主转座活性的转座子,约有 500 000个拷贝,占人类基因组总量的17%。LINE-1是通过转录和逆转录在内的转座过程产生新的DNA拷贝,并使新产生的DNA拷贝插入基因组的不同位 置。LINE-1转座会影响基因组中其他基因的表达或调控,因而会对基因组的稳定
Nature:科学家发现能够“驯化”人类基因组的特殊蛋白
近日,一项刊登在国际杂志Nature上的研究报告中,来自洛桑联邦理工大学的研究人员对一个庞大且神秘的人类蛋白质家族进行了一项基因组和进化研究,从而发现这些蛋白质或许能够调节人类基因组中数百万个转座子元件,相关研究也揭示了一个大型的物种特异性基因调节网络,该基因调节网络或许会影响人类机体生物学机制
基因组中“暗物质”关键调控机制
中国科学院广州生物医药与健康研究院陈捷凯课题组与南方科技大学Andrew P. Hutchins课题组合作,以小鼠胚胎干细胞为模型,揭示了基因组中转座元件的关键表观遗传调控机制,相关成果以Transposable elements are regulated by context-specif
Nature子刊:华中农大发现转座子可抑制mRNA翻译
来自华中农业大学生命科学学院,作物遗传改良国家重点实验室的研究人员发现水稻中的一类DNA转座子具有翻译抑制功能,这揭示了微小反向重复转座元件的新功能,对研究其他重复序列的功能提供了借鉴意义,同时也拓宽了对于转座子的认识。 这一研究成果公布在3月3日的Nature Communications杂
关于转座重组的转座效应介绍
DNA转座可以影响转座位点基因的功能和活性: ①转座位点位于编码序列内,转座子插入导致基因突变。 ②转座位点位于调控序列内,转座子插入影响基因表达。 ③在转座位点插入转座子基因,赋予新表型,例如抗药性。 ④链内复制转座后,转座子拷贝之间发生位点特异性重组,导致缺失或倒位。
Science:跳跃基因如何找到目标?
为了了解转座子如何形成基因组,极其重要的是,要发现它们定向整合(targeted integration)背后的机制。最近,来自法国国家健康与医学研究院病理学实验室的研究人员,与法国CEA-Saclay和美国一个实验室合作,确定了两种蛋白质之间的相互作用,是一个转座子整合到酵母基因组中一个特定区
中科院PNAS表观遗传研究新进展
近日来自中国科学院遗传与发育生物学研究所的研究人员在组蛋白H3K4去甲基化酶研究中取得重要进展,证实水稻中的H3K4特异性去甲基酶JMJ703参与控制了转座子活性,相关研究论文于1月14日在线发表在《美国科学院院刊》(PNAS)杂志上。 领导这一研究的是中国科学院遗传发育所基因组生物学研究
转座子-Tol2-的转座机制与转座优势详述(一)
Tol2转座子提及转基因,大家首先映入脑海的是什么呢?转基因大豆?玉米?食用油?(对于那些一个都想不到的孩纸们,小编我只想哭晕在厕所)名词很熟悉,各大超市随处可见,可何为转基因,如何得到转基因产品?今天小编简单来跟大家聊一聊。所谓转基因,顾名思义,就是外源基因整合进入宿主基因组,目前哺乳动物系统最常
中国医学科学院最新文章:关键逆转录转座子与癌症
“核心刊物”栏目创办于2002年,主旨在于向国内专业人士展示科研核心刊物,以及生命科学领域杂志每期重点内容,为读者呈现精彩纷呈的国内科研动向,和重大科研进展。目前包括《遗传》、《中国生物工程杂志》、《科学通报》等重点期刊,也欢迎生物类期刊联系合作(联系邮箱:journal@ebiotrade.c
PGBD1基因的结构特点和主要作用
在不同的动物中发现的猪瘟蛋白家族是与飞蛾典型的猪瘟转座子(trichoplusia ni)的转座子相关的转座子。这个家族还包括一些基因组中的基因,包括人类,这些基因似乎是从猪的转座子中获得的。该基因属于猪瘟转座因子衍生(pgbd)基因的亚家族。PGBD蛋白似乎是新的,与其他转座酶或其他已知蛋白家族没
Nat-Genet:通过表观遗传疗法激发转座子新抗原,推进癌症免疫治疗
近年来,免疫疗法已在多种癌症的治疗中取得了突破性的进展。这种疗法通过利用肿瘤中特异性表达的新抗原(neoantigen),使免疫细胞能够精准地锁定并消灭癌细胞【1】。传统上,人们认为这些新抗原主要源于编码基因的突变。然而,近年研究表明,基因组中非编码区域在肿瘤中的异常表达也可能导致新抗原的产生,