转座子插入是白菜驯化表型变异的重要来源
近日,《植物生物技术杂志》(Plant Biotechnology Journal)在线发表了中国农业科学院蔬菜花卉研究所王晓武团队完成的研究论文。这是王晓武团队在前期白菜泛基因组研究基础上,进一步挖掘白菜基因组变异获得的研究成果。 王晓武介绍,转座子序列广泛存在于植物基因组中,在作物驯化中发挥了重要作用。白菜是十字花科芸薹属重要蔬菜,种内多样性极高,包含了大白菜、小白菜、菜心、油用白菜和芜菁等形态差异显著的类型。在白菜基因组中,转座子含量高达50%。但是,由于系统识别群体中转座子插入变异一直存在挑战,因此关于转座子在白菜类作物驯化中发挥的作用缺乏明确的论述。 该研究开发了将白菜泛基因组和群体重测序数据相结合,鉴定白菜物种转座子插入变异的方法。基于白菜群体中转座子插入多态性信息,研究团队开展了不同类型白菜群体结构分析,发现转座子插入变异不仅与白菜不同形态型的驯化密切相关......阅读全文
转座子插入是白菜驯化表型变异的重要来源
近日,《植物生物技术杂志》(Plant Biotechnology Journal)在线发表了中国农业科学院蔬菜花卉研究所王晓武团队完成的研究论文。这是王晓武团队在前期白菜泛基因组研究基础上,进一步挖掘白菜基因组变异获得的研究成果。 王晓武介绍,转座子序列广泛存在于植物基因组中,在作物驯化中发
转座子插入是白菜驯化表型变异的重要来源
近日,《植物生物技术杂志》(Plant Biotechnology Journal)在线发表了中国农业科学院蔬菜花卉研究所王晓武团队完成的研究论文。这是王晓武团队在前期白菜泛基因组研究基础上,进一步挖掘白菜基因组变异获得的研究成果。 王晓武介绍,转座子序列广泛存在于植物基因组中,在作物驯化
与结球白菜驯化相关的重要候选基因的鉴定
021年5月31日,Genome Biology(IF3y=12.683)在线发表了中国农业科学院蔬菜花卉研究所王晓武团队完成的题为“Impacts of allopolyploidization and structural variation on intraspecific diversi
结构变异:甘蓝进化的“分子加速器”
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/517537.shtm结球甘蓝、抱子甘蓝、羽衣甘蓝、球茎甘蓝,加上芥蓝、青花菜、花椰菜……这些看起来长得非常不一样的蔬菜,都是甘蓝。 甘蓝群体具有丰富的形态多样性。受访者供图“甘蓝类蔬菜作物表型变异
转座子插入引起的基因突变
一、原理转座子(Tn)是能在不同复制子之间转移位置的核苷酸顺序。它一般来自抗药性质粒,由一个或几个抗药性基因加上两端两个顺序相同(但是方向不一定相同)的核苷酸片段(称为插入顺序IS)构成。当一个转座子转移位置而插入某一基因时,能使这一基因失活,即发生突变。各个转座子的抗药性基因、转移频率、插入位置、
由转座子插入引起的基因突变
实验概要本实验介绍了由转座子插入引起基因突变的原理和实验方法。实验原理转座子(Tn)是能在不同复制子之间转移位置的核苷酸顺序。它一般来自抗药性质粒,由一个或几个抗药性基因加上两端两个顺序相同(但是方向不一定相同)的核苷酸片段(称为插入顺序IS)构成。当一个转座子转移位置而插入某一基因时,能使这一基因
基因交流是牛属物种驯化的重要手段
牛是人类的老朋友,它们在数千年来的文明发展进程中占有重要地位,但牛属动物中的很多关键科学问题长期困扰着人们。中科院昆明动物研究所的研究人员利用大规模基因组数据,最新阐明了基因交流在牛属动物的驯化以及环境适应中的重要作用。 牛属现存物种包括普通牛、瘤牛、大额牛、印度野牛、爪哇野牛、牦牛、欧洲
基因交流是牛属物种驯化的重要手段
牛是人类的老朋友,它们在数千年来的文明发展进程中占有重要地位,但牛属动物中的很多关键科学问题长期困扰着人们。中科院昆明动物研究所的研究人员利用大规模基因组数据,最新阐明了基因交流在牛属动物的驯化以及环境适应中的重要作用。牛属现存物种包括普通牛、瘤牛、大额牛、印度野牛、爪哇野牛、牦牛、欧洲野牛和美洲野
首个玉蜀黍属超级泛基因组助力玉米遗传改良
玉蜀黍属超级泛基因组特征 受访者供图8月24日,《基因组生物学》(Genome Biology)在线发表华中农业大学作物遗传改良全国重点实验室和洪山实验室玉米团队最新研究成果。该团队利用721份玉蜀黍属材料的基因组数据,构建了首个玉蜀黍属“超级泛基因组(super pan-genome)”图
植物所在玉米耐旱基因克隆研究中取得进展
玉米是我国最重要的粮食作物之一,其生产常常受到干旱等自然灾害的威胁,在干旱严重的年份或区域甚至面临绝收的危险。发掘控制玉米耐旱性的遗传位点、克隆玉米耐旱基因、揭示其生物学功能的分子机理,具有重要的研究价值和应用价值。中国科学院植物研究所秦峰研究组利用全球不同地区的玉米材料组成的自然变异群体,运用
揭示了多倍化和结构变异对白菜种内分化的影响机制
524个白菜品种亲缘关系 中国农科院供图 BrPIN3.3中的结构变异与大白菜叶球驯化相关 中国农科院供图 近日,《基因组生物学》(Genome Biology)在线发表了中国农业科学院蔬菜花卉研究所蔬菜分子设计育种创新团队揭示的多倍化和结构变异对白菜种内分化的影响机制。该研究鉴定了与
甜橙体细胞变异可影响果实风味
北京时间2021年6月17日晚23时,Nature Plants在线发表了华中农业大学园艺林学学院徐强课题组题为“Somatic variations led to the selection of acidic and acidless orange cultivars”的研究论文。 华中农
武汉植物园发现桃基因组转座元件的进化机制
桃原产于我国,驯化和栽培历史超过三千年,桃花形态和颜色多样,集中在早春时节开放,成为春季主要的观赏景观之一,自2千多年前成书的《诗经》开始,一直是历代诗人反复歌咏的对象。而桃的果实风味鲜美、营养丰富,深受人们喜爱。桃自交亲和且基因组很小(230Mb左右),但品种间的表型差异相当丰富。 中国科学
研究发现水稻转座子受驯化选择和抗病抗逆中的调节功能
6月19日,Molecular Plant 杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所何祖华研究组题为Elimination of a retrotransposon for quenching genome instability in modern rice 的研究
武汉植物园在菱属泛基因组和结构变异研究中获进展
水稻、玉米和小麦是三大主粮作物,但主粮来源单一成为粮食安全和营养安全的隐患,因此对“孤儿作物”(orphan crop)的重视利用是应对粮食安全危机的有效手段之一。然而,随着城乡现代化进程的持续推进和现代集约化农业的快速发展,“孤儿作物”野生种和地方品种资源正日趋减少,与主粮作物相比,其种质资源
全基因组重测序技术揭示绵羊尾脂形成的分子生物学机制
近日,中国农业科学院北京畜牧兽医研究所肉羊遗传育种科技创新团队揭示了中国地方绵羊品种在适应性驯化过程中,如何通过基因组层面的选择和重组来影响绵羊尾型的遗传进化机制。相关研究成果已发表在《BMC Genomics》上。图片来源于网络 绵羊的尾型是一个重要的经济性状,可以为绵羊提供能量抵御恶劣环境
中国农科院研究团队揭开白菜甘蓝两类蔬菜作物驯化秘密
中国农业科学院蔬菜花卉研究所王晓武科研团队,对白菜和甘蓝两类芸薹属作物的驯化进行了深入研究,揭示了驯化与古多倍化形成的亚基因组的关系,相关研究结果于8月15日在线发表于英国《自然·遗传学》杂志。 白菜和甘蓝类蔬菜是大众餐桌上最常见的蔬菜,其最大特点是类型极其丰富多样。但这两个物种为什么能被驯
中国农科院Nat-Genet发表蔬菜育种重大突破
大头菜和白菜有很多共同之处:它们都有紧密包裹起来的叶子,形成一个多叶的头状。然而,值得注意的是,这两种作物起源于两种不同的芸薹属植物, 是由来自不同大洲的农民所使用和驯化。8月15日在《Nature Genetics》发表的一项研究中,来自中国农科院、南京农业大学以及荷兰瓦赫宁根大学的科学家表明
我国创建世界上最大转座子插入资源库
不知你有没有注意到,从菜市场买回来的玉米,有的是黄灿灿的,有的却像个大花脸,中间夹杂着紫色、白色的玉米粒? 其实,这是玉米的天性使然。玉米基因中有很多非常活跃的转座子,它们就像一支“小画笔”,跳到哪个基因上,就会抹去那里本来的“颜色”。因此导致籽粒颜色变化有一部分是转座子运动产生的。 转座
凭借一个突变,小菜蛾进化出稳定抗药性
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/497511.shtm苏云金芽胞杆菌(Bt)能产生多种杀虫蛋白,高效特异的杀死多种宿主昆虫。然而目前,全世界已经有9种重要的农业害虫对Bt生物杀虫剂或转Bt基因抗虫作物产生了抗药性。 ?小菜蛾。
什么是DNA插入元件?
中文名称插入元件英文名称insertion element定 义能在基因(组)内部或基因(组)间改变自身位置的一段DNA序列。通常是转座子的一种,一般长度为0.7~1.4 kb,只能引起转座效应而不含有其他任何基因。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
科学家开发高性能大片段插入删除变异鉴定工具
10月13日,华中农业大学生物信息团队杨庆勇课题组联合新加坡国立大学Sung Wing-Kin(宋永健)课题组在《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表论文,开发出高性能的大片段插入删除变异(InDel)鉴定工具IndelEnsembler,使大片段InDel鉴定准确
研究揭示结构变异和新基因在家犬驯化中的作用
近日,中国科学院昆明动物研究所遗传资源与进化国家重点实验室、动物进化与遗传前沿交叉卓越创新中心张亚平团队与中国农业科学院农业基因组研究所开展合作,第一次系统地构建了家犬在驯化中的结构变异(Structural Variations)图谱、探讨了新基因在驯化中的作用、并指出了大尺度基因组变异在驯化
农业科学院牧医所揭秘蒙古羊肥尾表型的遗传进化机制
近日,中国农业科学院北京畜牧兽医研究所肉羊遗传育种创新团队联合中国科学院上海生命科学研究院等单位在绵羊肥尾性状功能解析方面取得重要进展,揭示了中国地方绵羊品种在适应性驯化过程中,如何通过基因组层面的选择和重组来影响绵羊尾型的遗传进化机制。该研究完善了绵羊尾脂形成的分子生物学机制,同时为绵羊分子育
西农大发表世界首个-大规模小麦全基因组重测序结果
西北农林科技大学旱区作物逆境生物学国家重点实验室在基因组学领域国际知名期刊Ge-nomeBiology上发表论文,揭示了六倍体小麦遗传多样性来源于频繁的与野生小麦的种内杂交及与更远缘野草的种间杂交,为了解小麦起源、进化和驯化历史,克服小麦遗传资源同质化,促进小麦遗传改良提供了重要的数据资源。
研究揭示苹果转座子调控等位基因特异性表达机制
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/8/484573.shtm 苹果花瓣颜色与MYB10和MYB110a的表达量相关。中国农科院果树所供图 近日,中国农业科学院果树研究所苹果资源与育种创新团队联合国内外科研机构,从全基因组层面上阐
为国产优异大豆品种培育奠定基础-中黄13基因组发布
中科院遗传与发育生物学研究所联合中国科技大学、江苏省农业科学院种质资源与生物技术所、北京贝瑞和康生物技术有限公司等,对中国国审大豆品种“中黄13”(Gmax_ZH13)的基因组进行从头组装,最终得到1.025 Gb的基因组序列,包含20条染色体和1条叶绿体。相关成果近日以封面文章形式在线发表于《
揭示玉米DNA甲基化变异对表型的贡献
DNA甲基化对植物的生长发育和环境响应起着十分重要的作用。作为一种较为稳定的遗传信息,DNA甲基化既可由DNA序列变异诱发,也可独立于DNA序列产生纯表观遗传变异,这种独立的程度和DNA甲基化对基因表达以及表型变异的影响一直是研究热点。近日,华中农业大学和美国明尼苏达大学合作解析了玉米自然群体中
β胡萝卜素是维生素A的重要来源
β-胡萝卜素,摄入人体消化器官后,可以转化成维生素A,是较安全补充维生素A的产品(单纯补充化学合成维生素A,过量时会使人中毒)。它可以维持眼睛和皮肤的健康,改善夜盲症、皮肤粗糙的状况,有助于身体免受自由基的伤害。 1919年Steenkbock发现β-胡萝卜素可能具有维生素A活性。1928年发
什么是表型?如何产生的?
表现型,一译“表型”。有机体可被观察到的结构和功能方面的特性,如形态和行为方面的特征。表现型是基因型和环境交互作用的产物,即特定的基因型在一定环境条件下的表现形式。