Science:中国科学家领衔“破译”绵羊基因组

由中国科学家领衔的一个国际科研小组 5 日宣布,历经 5 年时间,他们完成了对绵羊基因组的测序、组装及分析工作。这项成果使人们对反刍动物生物学有了崭新认识。更重要的是,中国是绵羊和山羊饲养及羊肉消费大国,新研究将促进选育出更优秀的肉羊新品种。 绵羊基因组的测序工作在 2009 年正式启动,其中中国科学院昆明动物研究所与华大基因联合测序一头母羊,而英国罗斯林研究所测序一头公羊,参考基因组序列在 2012 年对外正式发布。 此后,昆明动物研究所、西北农林科技大学、华大基因、澳大利亚联邦科学与工业研究组织、英国罗斯林研究所、法国国家农业研究院、美国犹他州立大学等 26 家单位联合对绵羊基因组进行分析,最新成果 5 日发表在美国《科学》杂志上。 最新分析表明,绵羊染色体上有 141 个大结构改变、近 1 万个拷贝数变异(即片段缺失或片段复制异常)、约 1000 万个单核......阅读全文

最大动物基因组图谱——南极磷虾基因组图谱破译

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495141.shtm   ? Cell官网截图。黄海水产研究所供图   日前,由中国水产科学研究院黄海水产研究所联合青岛华大基因研究院、德国阿尔弗雷德?魏格纳研究所、澳大利亚联邦科学

将基因组存进银行-迎接真正的基因组时代

  你知道在你身上什么东西比钱更有价值,并且还是唯一的吗?答案是:你的基因组。就像你的钱一样,你的基因组也应该被尽可能安全的存储起来。而那些负责存储你基因组的机构应该对如何存储、使用以及分享它进行监管。  随着医学科学的进步,人们能够控制和管理他们的个人基因组将变得越来越重要。为

基因组所人类基因组突变研究获进展

序列变异的周期性和与TCR相关联的突变   基因突变会导致人类疾病的产生,因此研究遗传变异的产生过程和那些能够引起疾病的突变对生命科学基础研究以及人类健康是十分关键和重要的。   近日,中国科学院北京基因组研究所于军研究员带领其研究团队,在有关人类基因组中以转录为中心的突变研究方面取得新进展

OPGEN全基因组图谱应用系列——鞭虫全基因组测序

鞭虫是一种常见的土壤传播寄生虫,地理分布广,感染率高,寄生于人体盲肠,导致人体慢性感染,对人类危害巨大。鞭虫的全基因组测序研究由著名的桑格研究院(Wellcome Trust Sanger Institute)完成,发表在世界顶级期刊《Nature Genetics》上。该研究通过对2种不同

移动基因组增加弧菌基因组可塑性的机制

移动基因组增加微生物物种多样性的示意图。研究团队 供图 6月27日,中国科学院南海海洋研究所热带海洋生物资源与生态重点实验室研究员王晓雪团队通过研究珊瑚体内具有生态竞争的假交替单胞菌和弧菌之间的互作,揭示了一种移动基因组增加弧菌基因组可塑性,驱动弧菌遗传和表型多样化的机制。相关研究在线发表

-震惊!Genbank参考基因组序列多处错误!

 震惊!Genbank参考基因组序列多处错误!   随着基因组测序技术的飞速发展以及测序成本的快速降低,全基因组数据也在急速增加。尽管参考基因组数据是非常有价值的资源,但是由于测序过程中的外源污染或者研究者对数据组装方法的误用,使得基因组数据面临很多问题。  近日,约翰霍

昆明动物所等家养动物线粒体DNA基因组学研究取得进展

  近年来,家养动物线粒体DNA(mtDNA)基因组学得到了迅速发展,积累了大量的mtDNA序列数据。与此同时,一些问题随之浮现出来。除了数据质量存在缺陷(Shi, et al. 2014. Mol Ecol)之外,mtDNA世系划分标准不一,世系命名混乱的问题也已开始干扰家养动物mtDNA的研究工

300多种反刍动物基因组将测序

科技日报北京8月8日电(记者刘霞)据最新一期《自然·遗传学》杂志报道,由多个机构组成的国际“端粒对端粒(T2T)”联盟正在推进“反刍动物端粒-端粒”项目,旨在对300多种反刍动物的基因组进行测序。研究团队期望通过测序得到的基因组图谱,推动农业的发展并促进动物保护工作的深入开展。该项目建立在T2T联盟

西北高原所等鉴定出调控绵羊卵母细胞及早期胚胎发育的关键代谢物

体外胚胎生产是现代繁殖技术的核心组成部分。近年来,结合活体采卵,体外胚胎生产快速推广,成为家畜遗传改良和良种扩繁的重要手段之一。然而,体外培养体系不完善,因而体外生产胚胎的质量低于体内生产胚。有研究发现,建立高效的胚胎培养体系存在两个制约因素。一是关于卵母细胞成熟和胚胎发育过程中代谢和代谢基因表达缺

西北高原所等鉴定出调控绵羊卵母细胞及早期胚胎发育的关键代谢物

  体外胚胎生产是现代繁殖技术的核心组成部分。近年来,结合活体采卵,体外胚胎生产快速推广,成为家畜遗传改良和良种扩繁的重要手段之一。然而,体外培养体系不完善,因而体外生产胚胎的质量低于体内生产胚。有研究发现,建立高效的胚胎培养体系存在两个制约因素。一是关于卵母细胞成熟和胚胎发育过程中代谢和代谢基因表

转基因动物的特点介绍

  人工转基因动物就是基因组中含有外源基因的动物。它是按照预先的设计 ,融合重组细胞、遗传物质转移、染色体工程和基因工程技术将外源基因导入精子、卵细胞或受精卵,再以生殖工程技术,有可能育成转基因动物。  通过生长素基因、多产基因、促卵素基因、高泌乳量基因、瘦肉精基因、角蛋白基因、抗寄生虫基因、抗病毒

转基因动物的研究的重要作用

  人工转基因动物就是基因组中含有外源基因的动物。  它是按照预先的设计,融合重组细胞、遗传物质转移、染色体工程和基因工程技术将外源基因导入精子、卵细胞或受精卵,再以生殖工程技术,有可能育成转基因动物。  通过生长素基因、多产基因、促卵素基因、高泌乳量基因、瘦肉精基因、角蛋白基因、抗寄生虫基因、抗病

2007:寻找人类基因组差异

中国青年报2007年12月26日报道  每逢年底,《科学》和《自然》等杂志都会评选出本年度一些重要的科学成果。在2007年出现的许多科学进展中,关于人类基因组差异的研究以及一种新的培育干细胞的方法,连同其他一些成果受到广泛关注。 照片:全基因组关联研究帮助科学家定位与Ⅱ型糖尿病有关的基因。

北京基因组所发布表观基因组数据库MethBank-3.0

  中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心发布表观基因组数据库MethBank 3.0,并将其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species为题,在线发表在Nucleic Acids Rese

基因组所肝癌全基因组合作研究取得新进展

  近日,由中国科学院北京基因组研究所所长吴仲义及其科学团队与国立台湾大学医学院陈定信院士、陈培哲院士共同合作开展的“肝癌癌症基因组合作研究”计划获最新进展,相关学术论文在在最新出版的PNAS杂志上发表。  “肝癌癌症基因组合作研究”计划于2009启动,作为基因组所一项长期的癌症基因

高质量豌豆参考基因组和泛基因组解析完成

9月22日,中国农业科学院作物科学研究所特色农作物优异种质资源发掘与创新利用创新团队联合国内外多家合作单位,成功绘制了中国豌豆基因组高质量精细物理图谱,构建了栽培和野生豌豆泛基因组,解析了豌豆基因组进化特征、群体遗传结构,为揭示豌豆起源驯化,以及基因挖掘、种质创新、育种改良提供了宝贵资源及数据支撑。

科学家进行基因组测序-成功破译金雕基因组

   作为一种知名度极高的猛禽,金雕经常以威猛霸气的形象出现在影视作品和小说中。现在,英国研究人员完成了对金雕的基因组测序工作,希望从基因层面深入了解这一物种,以便更好地保护它们。 金雕以巨大的体型和敏捷有力的飞行等特征而著名,其成鸟的翼展平均超过2米,体长可达1米。金雕一般生活于多山或丘陵地区

北京基因组所揭示线粒体基因组氧化损伤修复分子机制

  线粒体是真核生物细胞主要的能量代谢场所,其中呼吸链氧化磷酸化过程伴随有高水平的氧自由基(ROS)的产生。线粒体基因组缺乏组蛋白结合保护,所以容易受到ROS攻击而发生损伤,其突变的累积已证实与多种人类疾病(如神经退行性病变、糖尿病、心血管疾病和癌症等)的发生密切相关。有关核基因组DNA损伤修复分子

聚焦基因组组装-至今最大组装竞赛寻找最优基因组指标

  2013年7月23日,由华大基因和BioMed Cental联合创办的开放式期刊《GigaScience》发表了当前最大、最系统的基因组组装过程及评价结果。在第二届Assemblathon竞赛中,共有21个团队基于由三种不同的测序技术所得的鸟、鱼和蛇的未组装基因组数据,提交了43个组装结果,

美国百万基因组PK英国十万基因组-只为助力“精准医疗”?

  1月下旬,美国总统奥巴马在2015年国情咨文演讲中深情地说道,美国已经消灭了小儿麻痹症、绘制出人类基因组等举措,这意味着美国已经 使人类医学迈入一个新的时代……接下来,我们致力于治愈癌症和糖尿病等疾病,让所有人获得需要保障自己和家人健康的个性化的信息,并宣布了新的项目——精 准医疗计划(Pr

北京基因组所发布表观基因组数据库MethBank-3.0

  中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心发布表观基因组数据库MethBank 3.0,并将其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species为题,在线发表在Nucleic Acids Rese

植物基因组“剪刀”-被成功打造-可编辑基因组任意位置

中科院上海植物逆境生物学研究中心朱健康课题组通过模仿和改造微生物中的一种抵御外源侵染的防护机制,成功开发出能对植物基因组进行精确定点修饰的技术,从而使高效植物分子改良性状成为可能。这一适用于植物的CRISPR-Cas技术就像一把剪刀,可以对基因组中任意感兴趣的位置进行编辑,它的成功开发将革命性地改变

宏基因组学技术测序木乃伊的肺结核基因组

  来自华威大学的研究者使用宏基因组学技术发现215年之久的木乃伊的肺结核基因组。   由Mark Pallen带领的研究团队试图用技术来发现组织学标本中的肺结核的DNA。   宏基因组学是一种从样本中检测DNA序列的技术,并且样本不需要培养或扩增。这种方法避免了与细菌培养或DNA扩增

北京基因组研究所Plant-cell基因组研究新成果

  来自中科院北京基因组研究所、荷兰瓦赫宁根大学和中科院/马普学会等10多家机构的研究人员组成的一个研究小组,通过测序及分析醉蝶花(Tarenaya hassleriana)的基因组提供了关于十字花科植物繁殖性状和基因组进化的新认识。相关研究发表在植物学权威期刊The Plant Cell杂志上

前基因组的概念

中文名称前基因组英文名称pregenome定  义某些病毒基因组DNA进入细胞核后,在宿主RNA聚合酶作用下产生的一条作为遗传信息载体的信使核糖核酸(mRNA)。可以通过逆转录形成双链的病毒基因组DNA。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

Nature:基因组的“气味”

  问问你身边的十个人,他们是如何寻找自己的伴侣的,也许你会得到十份不同的答案。不过也许他们都错了,一项最新的研究指出,嗅觉系统具有超乎想象的敏感性,能精确鉴别遗传上的相关性,这表明这种能力能为同类识别,伴侣选择,以及其它社会相互联系类型提供必要的信息。   许多方面的动物行为都需要了解

线粒体基因组的简介

  线粒体是真核细胞的一种细胞器,有它自己的基因组,编码细胞器的一些蛋白质。除了少数低等真核生物的线粒体基因组是线状DNA分子外(如纤毛原生动物Tetrahymena pyniform和Paramecium aurelia以及绿藻Clam ydoomonas rein—hardtia 等),一般都是

转基因组的定义

将一个生物或细胞的整个基因组转移到另一个细胞或物种里的转基因技术,包括,细胞核移植、动物克隆技术和人工合成基因组的合成生物学等领域。

基因组重排的定义

基因组重排将重组的对象从单个基因扩展到整个基因组,可以在更为广泛的范围内对菌种的目的性状进行优化组合。

基因组大小如何决定?

基因组大小是一个拷贝的单倍体基因组中DNA碱基对的总数。基因组大小与原核生物和低等真核生物的形态复杂性呈正相关。然而,在软体动物和上述所有其它高等真核生物之后,这种相关性已不再存在,主要是因为重复DNA的缘故。