Cell子刊：谁在推动干细胞的分化
美国凯斯西储大学的科学家们发现了多能干细胞分化的关键推手，这一突破性成果为干细胞的临床应用提供了宝贵的新线索，文章于六月五日发表在Cell旗下的Cell Stem Cell杂志上。 多能干细胞能够分化成为多种不同的细胞类型，具有修复机体损伤治疗疾病的巨大潜力。这项研究的两位资深作者，凯斯西储大学的助理教授Paul Tesar和副教授Peter Scacheri将干细胞生物学与基因组学技术结合起来，对两种密切相关的干细胞进行了表观基因组比较。他们发现了一类新型的遗传学开关，并将其称为Seed增强子。 胚胎干细胞和外胚层干细胞关系紧密，它们代表着发育的最早阶段，其中外胚层干细胞是Tesar于2007年首次分离到的。“这两种干细胞让我们可以深入研究哺乳动物发育的最初阶段，”文章的共同第一作者Daniel Factor说。 “干细胞能够再生组织，在再生医学领域备受关注，”文章的另一位第一作者Olivia Corradin说。“......阅读全文
为什么增强子对启动子没有专一性
（1）增强子可提高同一条DNA链上基因转录效率，可以远距离作用，通常距离l～4kb，个别情况下离开所调控的基因30kb仍能发挥作用，而且在基因的上游或下游都能起作用。 （2）增强子作用与其序列的正反方向无关，将增强子方向倒置依然能起作用。而将启动子倒置就不能起作用，可见增强子与启动子是很不相同
增强子转录在小麦基因表达调控中的作用获揭示
广州大学分子遗传与进化创新研究中心董志诚团队与复旦大学、中国科学院分子植物科学卓越创新中心张一婧团队合作，首次报道了植物中的增强子转录，初步阐释了增强子转录在小麦基因表达调控中的作用。相关研究近日发表于《基因组生物学》（Genome Biology）。 增强子是一种40
新一代单细胞itChIP技术解析早期胚胎细胞命运决定机制
2019年9月3日，北京大学分子医学研究所、北大-清华生命科学联合中心何爱彬组在《Nature Cell Biology》在线发表了题为Profiling chromatin state by single-cell itChIP-seq的文章，报道了利用一种全新的普适性，易操作的单细胞ChIP
美研究发现保持干细胞本性有关键作用的蛋白质因子
干细胞是细胞界“永远的少女”。人们认为它会一直保持静止状态，直到有某种信号迫使它分裂，产生差异而形成高度特化的细胞。理论上它们能发育成任何类型的成熟细胞，因而在组织与器官再生领域有着光明前景，但人们还需要更充分地掌握干细胞生理学。 据物理学家组织网9月25日报道，纽约大学朗格尼医学中心一项最新
CRISPR后起之秀：“20,000个平行实验”发现增强子
我们人体每个细胞的基因组中都有大致相同的22,000个基因，但每个细胞采用的都是这些基因的不同组合，根据不同的需求开启或关闭某个基因。就是这些基因的表达以及抑制模式决定了细胞会成为什么细胞，是肾脏细胞，脑细胞，皮肤细胞，还是心脏细胞。 要想操控这些转换模式，我们的基因中就必须有调节序列，比如“
科学家解析sirtuin长寿蛋白家族调控衰老的表观遗传机制
Sirtuin蛋白是一类从古细菌到人类高度保守的去乙酰化酶。Sirtuin蛋白的酶活依赖辅酶因子β-烟酰胺腺嘌呤二核苷酸NAD+，是通过热量限制延缓衰老策略的重要靶点，在多个物种中发挥着寿命调控的相关功能，被称为“长寿蛋白家族”。人类sirtuin家族的7个成员（SIRT1-7）均具有NAD+结合和
CRISPR触发的内源Oct4或Sox2基因位点染色质重塑激...（一）
CRISPR触发的内源Oct4或Sox2基因位点染色质重塑激活细胞重编程题目：CRISPR-Based Chromatin Remodeling of the Endogenous Oct4 or Sox2 Locus EnablesReprogramming to Pluripotency期刊：C
将CRISPRCas9基因编辑应用于造血干细胞中－治疗镰状细胞病
在一项新的研究中，来自美国达纳法伯癌症研究所、波士顿儿童医院和马萨诸塞大学医学院等研究机构的研究人员通过将CRISPR-Cas9基因编辑应用于患者自己的造血干细胞中，开发出一种治疗一种最为常见的遗传性血液疾病---镰状细胞病（sickle cell disease）---的策略。这种方法克服了之
研究证明增强子活性的维持不依赖H3K27乙酰化修饰
2月21日，Genome Biology 在线发表了中国科学院生物物理研究所朱冰课题组的研究论文“Histone H3K27 acetylation is dispensable for enhancer activity in mouse embryonic stem cells”。组蛋白H3
从全才到专家，Cell子刊揭示启动干细胞分化的蛋白团队
生物通报道：当植物将根扎进土壤的时候，根尖形成的新细胞就要担负不同的责任，比如输送水和营养物质或者感知重力。 Duke大学的研究人员在拟南芥根部鉴定了一组DNA结合蛋白。他们在Developmental Cell杂志上发表文章指出，这些蛋白共同作用帮助前体细胞选择性读取基因组的不同部分，从而走
Cell－Research解析小鼠原肠期胚胎胚层形成的表观遗传规律
细胞命运决定过程的调控机制是哺乳动物胚胎发育研究领域关注的重点。在哺乳动物胚胎发育过程中，具有全能性的合子会依次经过桑椹胚期、囊胚期、原肠胚期等，最终形成能够发挥完整生物学功能的个体。其中，外、中、内三个胚层形成的原肠运动时期对后续胚胎发育蓝图的构建起着至关重要的作用。 表观遗传调控在哺乳早期
干细胞的分类——多能干细胞、但能干细胞
1、多能干细胞：即能产生多种类型的细胞但失去了发育成完整个体能力的一类干细胞。如间充质干细胞，其不仅存在于骨髓中，在脂肪、骨骼、肝脏、脊髓、肺以及脐带中都能分离和制备间充质干细胞。间充质干细胞具有能支持造血和促进造血干细胞植入、调节免疫以及分离培养操作简便等特点，正日益受到人们的关注。随着间充质干细
遗传发育所等发现增强子调控茉莉酸信号途径的机理
增强子是真核细胞调控基因转录的重要元件。在模式动物中，增强子与相应的基因启动子通过形成染色质环在物理上相互靠近，从而精确调控基因的时空特异性表达。然而目前在植物中，如何界定特定基因的启动子和增强子元件尚未明确，特定生理途径中增强子的系统鉴定未见报道，增强子与启动子之间染色质环的形成及其作用机理也
Science：保守再生反应性增强子竟影响脊椎动物再生能力
在一项新的研究中，来自美国斯托瓦斯医学研究所、霍华德-休斯医学研究所和斯坦福大学的研究人员发现保守的与两种鱼类的尾部再生有关的再生反应性增强子（regeneration-responsive enhancer）。相关研究结果近期发表在Science期刊上，论文标题为“Changes in reg
基因组研究的“98K”——人工智能算法
每个分子遗传学家都希望找到一个易于使用的程序，可以比较来自不同细胞条件的数据集，识别增强子区域，然后将其分配给目标基因。 如今，柏林马克斯·普朗克分子遗传学研究所的马丁·温格隆（Martin Vingron）领导的研究小组现已开发出一个掌握所有这些内容的程序。 “ DNA非常无聊，因为它在每个
Nature－Medicine：β地贫CRISPR基因治疗最新进展
Dana-Farber/Boston儿童癌症和血液疾病中心以及麻省大学医学院的研究人员在《Nature Medicine》发文，将CRISPR-Cas9基因编辑应用于镰状细胞（贫血）病和β-地中海贫血患者自身的血液干细胞，加上今年1月他们在《Blood》发表的报告，该方法克服了先前的技术挑战，可
复旦大学Cell发布表观遗传重要发现
来自复旦大学、哈佛医学院的研究人员在新研究中揭示，由RACK7/KDM5C复合物充当增强子“刹车”，抑制了增强子过度激活。这一重要的研究发现发布在4月7日的《细胞》（Cell）杂志上。 复旦大学的蓝斐(Fei Lan)教授与施扬(Yang Shi)教授是这篇论文的共同通讯作者。蓝斐教授的主要科
陈玲玲研究员Cell－Res解析癌相关lncRNA
报道 来自中科院上海生命科学研究院、第二军医大学的研究人员在新研究中证实，人类结直肠癌特异性的CCAT1-L lncRNA调控了MYC基因位点的远程染色质相互作用。这一研究发现在线发表在3月25日的《细胞研究》(Cell Research)杂志上。 论文的通讯作者是中科院上海生命科学院
6月27日《自然》杂志精选
研究发现神经干细胞发育模式中的时间要素 大脑由很多不同类型的神经细胞和胶质细胞组成，但它们的亲本神经干细胞在发育过程中是怎样产生这种多样性的基本上不清楚。来自几个方面的证据指向神经干细胞发育模式中的一个时间要素，同时本期杂志上的两篇论文也用果蝇模型说明了“时间推进”在调控级联的控制下所起的
科学家发现功能增强子导致染色体外致癌基因扩增
近日，美国克利夫兰凯斯综合癌症中心等科研机构的科研人员在Cell上发表了题为“Functional Enhancers Shape Extrachromosomal Oncogene Amplifications”的文章，发现功能增强子导致染色体外致癌基因扩增 跨越致癌基因边界的非编码区扩增一
CAR增强子！让CART细胞更强、更持久，有效防止肿瘤复发
嵌合抗原受体T细胞疗法（CAR-T）作为一种单独疗法或与其他疗法联合使用，正在广泛研究用于各种实体瘤、血液系统恶性肿瘤和自身免疫性疾病的治疗。目前，美国FDA已批准6款CAR-T细胞疗法上市，其中4款靶向CD19，用于治疗B细胞白血病和淋巴瘤，2款靶向BCMA，用于治疗多发性骨髓瘤。 BCMA
岳峰课题组揭示“增强子劫持/共扩增”在脂肪肉瘤中
脂肪肉瘤（Liposarcoma）是成年人中一种常见的软组织肿瘤， 常常出现在四肢、腹腔和胸腔等部位。这种癌症目前缺乏有效的治疗方法，因此寻找其病因和治疗靶点非常重要。近年来，研究发现脂肪肉瘤中存在巨大染色体以及大量拷贝数变异[1]。然而，这些基因组上的变异与失控的癌基因转录调控有何关联尚不清楚
脑细胞类型中增强子遗传变异或预测精神/神经疾病风险
可能有人认为，大多数遗传相关疾病的主要原因来自编码DNA的突变---基因组编码区域的改变可以直接导致对健康人体重要的特定蛋白的表达发生变化。但是，人类DNA的大部分是非编码DNA，即不直接翻译成功能性蛋白的DNA区域。这些非编码DNA区域包含称为增强子的调节性序列元件，这些序列元件可以改变特定蛋
成也干细胞－败也干细胞
4月，英国心脏病学家Darrel Francis通过一篇论文驳斥了一份利用干细胞修复心脏的研究报告，震动了整个学界。无论是医生还是患者都对通过注入干细胞的方法修复心脏抱有强烈期待，但Francis指出这种方法其实并不是那么有效。 帝国理工学院的Francis专门研究治疗心脏病，他还热衷于揭露医疗
干细胞的分类——全能干细胞
干细胞（stem-cell）即为起源细胞，是指尚未发育成熟的细胞，它具有多分化潜能和自我复制的功能，在特定条件下，可以分化成不同的功能细胞，形成多种组织和器官。这是继药物治疗和手术治疗后有又一场医疗革命，被称之为医学上的奇迹。根据其分化潜能不同，可分为全能干细胞、多能干细胞、单能干细胞。1、全能干细
我国学者在肝细胞去分化调控机制研究方面取得新进展
图 Kupffer细胞来源IL-6通过损伤特异增强子诱导肝细胞去分化机制 在国家自然科学基金项目（批准号：92168202、31930030、T2122018）等资助下，中国科学院分子细胞科学卓越创新中心惠利健研究员团队与中国科学院上海营养与健康研究所李虹和李亦学研究员团队合作，在炎症信号调控肝细
5月13日《自然》杂志精选
封面故事： “伯吉斯页岩型”动物群落 在早奥陶世地层被发现 加拿大的伯吉斯页岩以含有各种各样软体动物化石而出名，这些动物来自寒武纪中期，距今约5.1亿年，它们提供了一个了解早期海洋动物的窗口。现在，人们知道类似的动物来自相距非常远的不同地方，如中国和格陵兰，但过去有关证据似乎表明
上海交大团队在雌性生殖干细胞研究中取得新进展
来自上海交通大学生物医学工程学院和Bio-X研究院的研究人员通过对小鼠雌性生殖干细胞表观遗传修饰谱的研究，发现了决定小鼠雌性生殖干细胞基本生物学特性的表观遗传调控机制，这一研究成果于2016年7月27日在Genome Biology杂志（影响因子：11.3）在线发表。 传统观点认为，女性和绝大
北大汤富酬发表表观基因组新成果
表观遗传学修饰可以在不改变DNA序列的情况下调控基因的活性。基因表达在时间和空间上的表观遗传学调控，对于人类发育是至关重要的。近年来，表观基因组已经成为了生物医学领域的一大研究热点。 北京大学的研究团队对早期人类胚胎进行深入研究，获得了胎儿大脑、心脏和肝脏的表观基因组景观。这一成果发表在十二月
十年探索，甲基化与癌症
组蛋白是负责包装DNA的蛋白，DNA与组蛋白互作调节着许多基础细胞活动，例如干细胞分化或者血细胞变为白血病细胞等。上述相互作用由抑制子和激活子之间的拉锯战控制，这两种因子会通过对组蛋白进行化学修饰，告诉组蛋白包装更紧还是松开让基因表达。 在十一月十九日Genes & Developme