天津工生所等解析出结核杆菌二萜合成酶Rv3378c的晶体结构

结核杆菌(Mycobacterium tuberculosis)是结核病的致病菌,全球发病率、死亡率极高,每年约有两百万人死于结核病。随着结核病感染率的提高,越来越多的药物被广泛应用于结核病的治疗。药物泛滥使结核杆菌对药物具有一定的耐药性,一般的药物已很难根治结核病。 中国科学院天津工业生物技术研究所郭瑞庭研究组与UIUC大学 Eric Oldfield 教授研究组合作,在Rv3378c的研究方面取得了突破性进展,得到了来源于Mycobacterium tuberculosis的Rv3378c的酶蛋白结构空结构、底物以及二磷酸盐抑制剂BPH-629的复合体结构。Rv3378c二聚体结构,与cis-异戊烯基转移酶采用相同的折叠方式,此结构也是第一个来源于细菌的二萜合成酶结构。 分析二磷酸盐抑制剂BPH-629的复合体结构,发现其中一个BPH-629在底物结合位点内,另一分子则位于二聚体的接触面。通过定点突变研究发现D3......阅读全文

我国学者揭示酵母乙酰转移酶的“钻戒”结构

   本报讯 具有“钻戒”结构的组蛋白乙酰转移酶/反式激活蛋白结合蛋白复合物,能促进生物体内多种重要过程,包括转录、DNA损伤修复和信号传导等。中国科学技术大学蔡刚课题组和加拿大拉瓦尔大学癌症研究中心雅克·科特课题组合作,实现了对酿酒酵母中该乙酰转移酶结构的高精度描绘,揭示了组装和调控机制,并描绘了

Nature:-蛋白复合体有望成为新的癌症治疗靶标

  科学家们发现,热激蛋白(Heat-shock protein, HSP)是大型蛋白复合体(英文名为epichaperome)的组成部件。鉴于这些蛋白复合体起到了维持肿瘤细胞存活的作用,所以有望成为治疗癌症的新靶点。  当肿瘤血管的形成速度跟不上肿瘤生长的速度时,肿瘤细胞就会处于应激条件下,例如缺

隋森芳等揭示硅藻光系统II捕光天线超级复合体结构

硅藻是海洋主要的浮游生物之一,贡献了地球上每年原初生产力的20%左右,且在生物地球化学循环中起着重要作用,这都与其光系统II(PhotosystemII,PSII)以及外周捕光天线的功能密切相关。不同于绿藻和高等植物,硅藻PSII的外周捕光天线是结合了岩藻黄素和叶绿素a/c的蛋白(Fucoxanth

科学家成功解析乳腺癌风险相关蛋白复合体的精细结构

  近日,来自英国弗朗西斯-克里克研究所(Francis Crick Institute)的研究人员通过研究描述了一种关键肿瘤抑制蛋白的分子结构,或为后期阐明该蛋白在细胞中的关键角色提供新的思路,相关研究刊登于国际杂志Cell Reports上。  BRCA1是一种人类机体基因,其能够产生名为BRC

Sci-Rep:酵母组蛋白甲基转移酶COMPASS复合体的完整结构

   国际学术期刊Scientific Reports在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所丛尧研究组的最新成果“Architecture and subunit arrangement of the complete Saccharomyces cerevisiae COMPASS com

分子对接技术研究D7152441-抑制剂与PB2蛋白的结合模式

  从本期起,小编将带领大家使用殷赋云计算平台(http://cloud.yinfotek.com/)来做一系列计算“文章”。这一期咱们来重现一篇2018年文献[1]的计算结果,看看作者是如何运用分子对接技术来阐明机理、升华文章的。该文献影响因子4.6,是典型的“实验+计算”模式,比较接近大多数科研

同源异形复合体的概念

中文名称同源异形复合体英文名称homeotic complex;HOM-C定  义昆虫胚胎发育中控制体节和形态建成的同源异形基因成簇存在而形成的复合体。应用学科遗传学(一级学科),发育遗传学(二级学科)

同源异形复合体的定义

中文名称同源异形复合体英文名称homeotic complex;HOM-C定  义昆虫胚胎发育中控制体节和形态建成的同源异形基因成簇存在而形成的复合体。应用学科遗传学(一级学科),发育遗传学(二级学科)

多酶复合体是什么?

多酶复合体(multienzymecomplex)常包括三个或三个以上的酶,组成一个有一定构型的复合体。复合体中第一个酶催化的产物,直接由邻近下一个酶催化,第二个酶催化的产物又为复合体第三酶的底物,如此形成一条结构紧密的“流水生产线”,使催化效率显着提高。葡萄糖氧化分解过程的丙酮酸脱氢酶复合体,属于

T细胞受体复合体介绍

T细胞受体复合体是一个跨膜的八聚体,由TCR二聚体和负责信号传递的CD3 δ/ε二聚体、CD3 γ/ε二聚体以及CD247 ζ/ζ或是ζ/η二聚体构成。各个二聚体通过电离的氨基酸残基间的相互作用联系在一起。T细胞受体的胞内末端很短,极有可能并不参与信号的传递。整个复合体可以高效地将受体接受到的信号传

肿瘤干细胞抑制剂显示早期疗效,化学结构令人担忧

  【新闻事件】:昨天大日本住友旗下 Boston Biomedical 宣布将在今年的 ASCO 年会上公布 11 个有关他们两个肿瘤干细胞抑制剂 napabucasin 和 amcasertib 的早期临床结果。据称这两个药物与化疗联用在早期临床试验中可以以较高比例控制包括肺癌、胰腺癌、结直肠癌

Science揭示CXCR4与趋化因子结合的晶体结构

  趋化因子是一种免疫信号蛋白,它与受体的互作与癌症、炎症和HIV感染有关,现在科学家们首次捕捉到了这一互作的3D结构。  加州大学和南加州大学的科学家们克服重重困难,获得了细胞受体CXCR4与趋化因子结合时的晶体结构,这一突破性成果发表在一月二十二日的Science杂志上。CXCR4与趋化因子的互

上海生科院发现裂殖酵母端粒结合蛋白Taz1结构

  国际学术期刊Cell Research 于6月19日在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所国家蛋白质科学中心(上海)雷鸣研究组的最新研究成果“Fission yeast telomere-binding protein Taz1 is a functional but

日探明麻疹病毒感染细胞结合部立体结构

  日本研究人员在10日的《自然·结构和分子生物学》网络版上发表论文说,他们从原子层面探明麻疹病毒入侵细胞时起重要作用的蛋白质及其受体结合部位的立体结构,这项成果有望帮助人们开发抗麻疹病毒新药。   麻疹病毒表面的“H-蛋白质”在病毒感染细胞时发挥着重要作用,这种蛋白质和人体细胞表

Raf-蛋白-Ras-结合结构域的简并进化库合成

实验材料寡核苷酸引物Tag 聚合酶BL21 电转感受态细胞试剂、试剂盒氨苄青霉素卡那霉素仪器、耗材琼脂糖凝胶实验步骤3.1 概论3.1.1 PCA 对空间排列的要求PCA 片段的三维朝向对于 PCA 报告蛋白是否能正确折叠至关重要,它取决于形成复合体的目的蛋白 N 端或 C 端的朝向(图 15.1

华南植物园关于植物转录起始调控机制的研究获进展

  转录复合体将DNA转录为RNA,是遗传信息由细胞核向细胞质转递的基础。由于核小体与基因组的紧密结合,转录复合体需克服核小体障碍进而确保功能基因的表达。染色质重塑复合体(Chromatin Remodeler)被认为在转录过程中发挥了重要作用。这类蛋白复合体能通过水解ATP来调控核小体的组成和分布

植物转录起始调控机制研究获进展

在国家自然科学基金面上项目和青年项目的资助下,中国科学院华南植物园研究员陈琛团队联合广东省农业科学院研究员刘军、加拿大农业部伦敦研发中心研究员崔玉海在植物转录起始调控机制研究方面取得新进展。相关研究近日发表于《核酸研究》(Nucleic Acids Research)。  转录复合体将DNA转录

解析SNARE解聚分子机器20S复合体的三维结构-解密解聚机制

  膜融合是生命基本和重要的过程之一,真核细胞多种形式的胞内区间具有不同的生物化学性质,细胞维持这些胞内分区之间的动态平衡主要依赖的是囊泡转运,该过程与许多重要疾病密切相关。  囊泡转运即包含转运物质的囊泡从供体出芽然后转移至目标膜,锚定之后与目标膜融合,从而使得膜蛋白、磷脂和内容物转运至另一个细胞

含辅助亚基和动物毒素的人源Nav1.7通道复合体结构

在人电压门控钠(Nav)通道的九种亚型中,由SCN9A编码并在外周感觉神经元中高表达的Nav1.7与疼痛综合征有直接关系。Nav1.7的突变出现在许多疼痛综合征中,包括极度疼痛障碍等。Nav1.7的精确结构模型将有助于这一有前途的目标的药物发现。Nav1.7-PT和Nav1.7-HS的总体结构真核细

周强组解析首个人源氨基酸转运体LAT1–4F2hc复合体结构

  L 型氨基酸转运体1,简称LAT1(也被称作SLC7A5),属于反向转运蛋白,能向胞内转运不带电氨基酸,此外还参与药物的吸收、甲状腺激素及激素前体物质如L-DOPA的跨膜运送。LAT1和 LAT2(SLC7A8)同属于SLC7 家族,其介导氨基酸反向协同转运过程不依赖于钠离子,其中LAT1也不依

分子对接技术研究D7152441-抑制剂与PB2蛋白的结合模式-二

4、 准备受体分子与配体不同,受体分子通常是生物大分子,无法通过手绘准备。平台提供了其他输入方式。点击上传文件,选择刚才下载的4cb4.pdb文件,然后按提示进行下去。通常来说,从PDB库下载的晶体结构文件里边包含了很多组分,不仅有(单条或多条)肽链,通常还有有机小分子和溶剂分子(水分子、金属离子)

分子对接技术研究D7152441-抑制剂与PB2蛋白的结合模式--一

【前言】从本期起,小编将带领大家使用殷赋云计算平台(http://cloud.yinfotek.com/)来做一系列计算“文章”。这一期咱们来重现一篇2018年文献[1]的计算结果,看看作者是如何运用分子对接技术来阐明机理、升华文章的。该文献影响因子4.6,是典型的“实验+计算”模式,比较接近大多数

分子对接技术研究D7152441-抑制剂与PB2蛋白的结合模式-二

6、 提交计算任务Dock6方案为我们提供了多种对接计算模式,这里稍微解释一下。在各种模式中,蛋白受体都是刚性不动的。因为Dock6的Grid算法实际上并非直接采用蛋白结构进行对接,而是采用其模型(正是前面生成的格点)。根据配体运动的方式,分为下面几种情况:1) 柔性配体对接,即配体在对接过程中是柔

Nature:肿瘤关键蛋白结构被成功解析

  发表在国际杂志Nature上的一项研究报告中,来自阿贡国家实验室等处的研究者利用高特异性的X射线晶体学技术解析了低氧诱导性因子(HIFs)的蛋白结构,低氧诱导性因子是肿瘤对低氧反应的重要调节子,该研究或为寻找新型药物切断癌细胞的氧气和营养供给最终治疗癌症提供新的思路。  研究者Fraydoon

溴结构域蛋白9选择性抑制剂研究获进展

近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院许永团队针对溴结构域家族蛋白抑制剂选择性难题,报道了一种在急性髓系白血病治疗中具有显著疗效的溴结构域蛋白9(BRD9)选择性抑制剂Y22073,为急性髓系白血病精准治疗提供了新的解决方案。溴结构域蛋白9(BRD9)是哺乳动物SWI/SNF染色质重塑复合物家族中

中国科大揭示一种酵母乙酰转移酶的“钻戒”结构

 钻戒可以增进两个爱人之间的感情,具有“钻戒”结构的组蛋白乙酰转移酶/反式激活蛋白结合蛋白复合物(下称该复合物)能促进生物体内多种重要过程,包括转录、DNA损伤修复和信号传导等。中国科学技术大学蔡刚教授课题组和加拿大拉瓦尔大学癌症研究中心雅克·科特教授课题组合作研究,实现了对酿酒酵母中该

中国科大揭示一种酵母乙酰转移酶的“钻戒”结构

  钻戒可以增进两个爱人之间的感情,具有“钻戒”结构的组蛋白乙酰转移酶/反式激活蛋白结合蛋白复合物(下称该复合物)能促进生物体内多种重要过程,包括转录、DNA损伤修复和信号传导等。中国科学技术大学蔡刚教授课题组和加拿大拉瓦尔大学癌症研究中心雅克·科特教授课题组合作研究,实现了对酿酒酵母中该乙酰转移酶

NIBS饶枫研究组《PNAS》解析泛素链接酶作用新机制

   2016年3月15日,北京生命科学研究所饶枫实验室与约翰霍普金斯大学Snyder实验室合作在《PNAS》杂志上在线发表题为“Inositol hexakisphosphate (IP6) generated by IP5K mediates Cullin-COP9 signalosome in

植物转录起始调控机制研究获进展

  在国家自然科学基金面上项目和青年项目的资助下,中国科学院华南植物园研究员陈琛团队联合广东省农业科学院研究员刘军、加拿大农业部伦敦研发中心研究员崔玉海在植物转录起始调控机制研究方面取得新进展。相关研究近日发表于《核酸研究》(Nucleic Acids Research)。  转录复合体将DNA转录

联会拉链复合体的特点介绍

联会拉链复合体(synaptonemal zipper complex)的逐渐溶解和同源染色体区域的轻微分离标志着细胞周期进入双线期(源自希腊语,意为双重的“twofold”或双倍的“double”)。每一个二价体的对齐同源染色体仍然在其长度上以称为交叉(单数chiasma;复数chiasmata)