微生物测序会忽视一些重要信息

基因组测序应该能够揭示一个有机体的整个遗传组成。对于传染病专家来说,可以用这种技术来分析一种致病菌,以确定它能造成多大危害,以及它是否具有抗生素耐药性。但是,美国洛克菲勒大学的一项最新研究表明,目前的测序技术会忽视掉一些重要的信息:浮动在细菌染色体(细胞遗传物质的核心)外的DNA分离碎片。相关研究结果发表在2014年6月25日的《PLOS ONE》杂志。 本文资深作者、细菌致病机理和免疫学实验室负责人Vincent Fischetti指出:“目前已经在各种各样的病原微生物中开展了染色体DNA的广泛测序,但是这些序列没有发现存在于细胞质中的DNA元件。因此,所得到的致病菌DNA图谱就可能不完整。现在,我们想出了一种方法来鉴定这些元件。” 染色体外的DNA,包括细菌感染的病毒(被称为噬菌体),以及自我复制的DNA链(称为质粒),经常是从其他细菌感染。这些噬菌体和质粒可以很容易地在细菌细胞之间移动,因此一段时间来,科学家们认为......阅读全文

噬菌体:-开启生物宇宙暗物质研究大门

  20世纪初,大多数研究者认为DNA是一种“愚蠢的分子”,因为太简单而对于生命传输没有任何价值。相反地,科学家们更加拥护蛋白质,它们拥有很强的可变性和复杂性,是遗传的关键组成部分。然后到了20世纪50年代初,遗传学家Alfred Hershey 和 Martha Chase在对噬菌体的研究

同源染色体的研究意义

  在生物体的有性生殖过程中,有性生殖细胞是通过细胞分裂的一种——减数分裂形成的。在减数分裂的分裂间期,精原细胞的体积略微增大,染色体进行复制,成为初级精母细胞。复制后的每条染色体都含有两条姐妹染色体,这两条姐妹染色单体并列在一起,由同一个着丝点连接着。分裂期开始后不久,初级精母细胞中原来分散存在的

同源染色体的研究意义

在生物体的有性生殖过程中,有性生殖细胞是通过细胞分裂的减数分裂形成的。在减数分裂的分裂间期,精原细胞的体积略微增大,染色体进行复制,成为初级精母细胞。复制后的每条染色体都含有两条姐妹染色体,这两条姐妹染色单体并列在一起,由同一个着丝点连接着。分裂期开始后不久,初级精母细胞中原来分散存在的染色体进行配

λ噬菌体的局限性λ噬菌体

实验方法原理 本实验以含原λ噬菌体和缺陷噬菌体λdg的双重溶原菌gal+作为供体,经紫外线诱导后,获取能转导半乳糖发酵基因的高频转导噬菌体裂解液,然后让这些转导噬菌体将gal+基因转移到受体菌gal-中去。实验材料 供体菌 : Escherichia coli K12 F2 gal + (带有原噬菌

以色列研究探索用噬菌体抑制肠道有害细菌

以色列研究人员在美国新一期《细胞》杂志上发表论文说,动物实验显示噬菌体可有效减少肺炎克雷伯菌的影响,今后有望进一步探索利用噬菌体精准抑制肠道有害细菌。噬菌体是一类可感染细菌的病毒。以色列魏茨曼科学研究所等机构研究人员先选出会导致肠道炎症的肺炎克雷伯菌,然后针对这种细菌选择了5种噬菌体组成混合物。动物

噬菌体展示技术研究RNA结合蛋白实验

噬菌体展示技术研究RNA结合蛋白实验             实验方法原理 噬菌体展示技术是将外源基因与噬菌体的表面蛋白基因融合,在融合了外源基因的噬菌体颗粒的表面就会表达相应的外源

研究发现噬菌体协助细菌之间建立“界限”

  细菌是“高情商”的生物,懂得“社交”。他们以团结协作的群体形式生活在自然环境中,以抵抗来自外界环境的压力。同一细菌群体中还存在自我识别能力,可以区分哪些是同一家族,同时共同抵抗“异族”。具有扩散能力的化学信号分子和细菌的表面受体可作为细菌群体识别的语言和工具。  噬菌体是地球上数量最多的一种细菌

噬菌体展示技术研究RNA结合蛋白实验

实验方法原理噬菌体展示技术是将外源基因与噬菌体的表面蛋白基因融合,在融合了外源基因的噬菌体颗粒的表面就会表达相应的外源蛋白,即外源基因编码的蛋白被展示在噬菌体颗粒的表面。实验材料载体tRNA抗体寡核苷酸试剂、试剂盒抗生素储存液BCIP葡萄糖储存液X-Gal磁珠洗液蛋白酶抑制剂RNase 抑制剂TEN

噬菌体新应用被以色列研究人员发现

以色列研究人员在美国新一期《细胞》杂志上发表论文说,动物实验显示噬菌体可有效减少肺炎克雷伯菌的影响,今后有望进一步探索利用噬菌体精准抑制肠道有害细菌。噬菌体是一类可感染细菌的病毒。以色列魏茨曼科学研究所等机构研究人员先选出会导致肠道炎症的肺炎克雷伯菌,然后针对这种细菌选择了5种噬菌体组成混合物。动物

X染色体的测序及研究

2003年6月,美国的研究人员在Nature杂志上发表了已完成的对人类Y染色体的详细分析。2005年3月17日,在Nature杂志上发表的一篇文章宣告基本完成对人类X染色体的全面分析。对X染色体的详细测序是在英国Wellcome Trust Sanger研究中心领导下,世界各地多所著名学院超过250

染色体畸变的研究与发展

染色体结构畸变最早在黑腹果蝇中发现。美国遗传学家C.B.布里奇斯在1917年发现染色体缺失,1919年发现重复,1923年发现易位。美国遗传学家A.H.斯特蒂文特在1926年发现倒位。染色体数目畸变最早也在果蝇中发现。1916年布里奇斯在果蝇的研究中发现多一个和少一个X染色体的现象。1920年美国遗

研究构建染色体融合小鼠模型、模拟染色体演化过程

  9月21日,Cell Research在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)李劲松研究组撰写的题为Creation of artificial karyotypes in mice reveals robustness of genome organizati

微生物测序会忽视一些重要信息

  基因组测序应该能够揭示一个有机体的整个遗传组成。对于传染病专家来说,可以用这种技术来分析一种致病菌,以确定它能造成多大危害,以及它是否具有抗生素耐药性。但是,美国洛克菲勒大学的一项最新研究表明,目前的测序技术会忽视掉一些重要的信息:浮动在细菌染色体(细胞遗传物质的核心)外的DNA分离碎片。相关研

研究揭示噬菌体蛋白调控宿主转录的分子机制

  7月11日,国际学术期刊《自然-通讯》(Nature Communications)在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所合成生物学重点实验室张余研究组与浙江大学医学院冯钰研究组合作完成的题为Structural basis for transcription anti

噬菌体展示技术研究RNA结合蛋白实验(三)

4. 免疫印迹检测外源蛋白的展示情况pDTSPLAY-B 空载体生成的噬菌体表面不含外源基因,仅有带有 6 个组氨酸标签和 Myc 标签的锚定蛋白(基因 Ⅲ 编码),此蛋白 SDS-PAGE 中的条带在 65 kDa 的位置(实际 Mr 为 45 kDa)。pDISPLAY-B 载体中插入外

温和噬菌体衣壳蛋白防御超感染研究获进展

近日,中国科学院南海海洋研究所热带海洋生物资源与生态重点实验室研究员王晓雪团队解析了丝状噬菌体编码的衣壳蛋白在细菌宿主超感染排除和噬菌体防御方面的作用。相关研究发表于《环境微生物学》。噬菌体是一种侵染细菌的病毒。烈性噬菌体在侵染细菌宿主后会迅速繁殖,以裂解细胞的方式从细菌宿主中释放。温和噬菌体在侵染

噬菌体展示技术研究RNA结合蛋白实验(一)

实验方法原理 噬菌体展示技术是将外源基因与噬菌体的表面蛋白基因融合,在融合了外源基因的噬菌体颗粒的表面就会表达相应的外源蛋白,即外源基因编码的蛋白被展示在噬菌体颗粒的表面。实验材料 载体tRNA抗体寡核苷酸试剂、试剂盒 抗生素储存液BCIP葡萄糖储存液X-Gal磁珠洗液蛋白酶抑制剂RNase 抑制剂

Lambda噬菌体

·         Lambda DNA Preparation (Stanford DNA Sequence & Technology Center)Detailed protocol for lambda DNA preparation with recipes·         Isolati

大麦6号染色体基因测序研究

  2013年11月15日,成立于1875年的嘉士伯实验室和华大基因旗下子公司――深圳华大科技服务有限公司(简称“华大科技”)宣布,双方将联合开展大麦6号染色体基因组破译工作,旨在为培育大麦新品种提供具有价值的资源。  基因序列信息是开展快速及现代育种的核心,有助于挖掘有利遗传突变,加速农作物育种改

B染色体精细图谱和功能研究

  早在一个多世纪前发现B染色体在很多植物、动物和真菌基因组中广泛存在。B染色体对于个体的生命活动来说不是必需的,但它们仍然通过不同的机制存在于种群中。例如玉米B染色体不与任何A染色体配对,其传递不遵循孟德尔遗传定律,花粉第二次有丝分裂B染色体会发生不分离 (nondisjunction),包含B染

多线染色体的发现与研究

1881年E.G.巴尔比安尼首先在双翅目摇蚊(Chironomus)幼虫的唾腺细胞中观察到多线染色体,但未引起注意。1933年在遗传学成就的影响下T.S.佩因特在果蝇唾腺,E.海茨和H.鲍尔等在毛蚊属(Bibio)再次看到这种染色体后,人们才予重视。此后在昆虫的多种组织如肠、气管、脂肪体细胞和马尔皮

研究实现大片段DNA染色体整合

近期,中国科学院分子植物科学卓越创新中心开发了创新的、基于可重复利用靶点的大片段DNA染色体整合策略,构建了首株能够脱离质粒、稳定合成红霉素A的大肠杆菌菌株,并提升了产量。红霉素是临床重要的广谱大环内酯类抗生素。传统研究多采用多质粒系统进行表达,但质粒的不稳定性、抗生素的使用及细胞代谢负担过重,限制

研究实现大片段DNA染色体整合

近期,中国科学院分子植物科学卓越创新中心开发了创新的、基于可重复利用靶点的大片段DNA染色体整合策略,构建了首株能够脱离质粒、稳定合成红霉素A的大肠杆菌菌株,并提升了产量。红霉素是临床重要的广谱大环内酯类抗生素。传统研究多采用多质粒系统进行表达,但质粒的不稳定性、抗生素的使用及细胞代谢负担过重,限制

通过噬菌体ELISA鉴定得到的噬菌体克隆

经过3~4轮的筛选后,应该能够富集到能与受体特异性结合的噬菌体群体。通常而言,在后几轮的筛选中,每次获得的噬菌体总量都会增加,但是单就这个现象并不一定能说明已经筛选到了受体特异性结合的肽段。能与靶分子非特异性结合或者能与筛选基质的噬菌体克隆也会造成这一现象。噬菌体ELISA可以说是最灵敏的鉴定所获取

灵长类动物研究显示:Y染色体进化速度快于X染色体

科技日报北京6月19日电 (记者刘霞)美国国立卫生研究院国家人类基因组研究所科学家对6种灵长类动物及人类开展了一项最新研究。结果表明,包括人类在内,灵长类动物雄性Y染色体的进化速度快于X染色体。相关论文发表于近日出版的《自然》杂志。在这项研究中,科学家比较了黑猩猩、倭黑猩猩、西部低地大猩猩、婆罗洲猩

Nature:新研究揭示cGAMP信号保护细菌免受噬菌体感染

  cGAS-STING途径是动物中细胞自主性先天免疫系统的重要组成部分。cGAS蛋白(cyclic GMP–AMP synthase, 环状GMP-AMP合酶)是细胞质病毒DNA的传感蛋白,一旦在细胞质中检测到病毒DNA,就会产生结合STING蛋白并激活免疫反应的环状GMP-AMP(cGAMP)信

细菌宿主对温和噬菌体“沉默激活”机制研究进展

  近期,中国科学院南海海洋研究所研究员王晓雪团队发现细菌宿主H-NS蛋白调控原噬菌体的“沉默-激活”过程的新机制。相关研究成果以Xenogeneic silencing relies on temperature-dependent phosphorylation of the host H-NS

新研究发现噬菌体CRISPRCas系统新机制

CRISPR-Cas系统广泛存在于细菌和古细菌中,是原核生物的一种适应性免疫系统,用来抵御病毒、质粒等外源核酸的侵入。然而在2013年,有研究人员在ICP1噬菌体中发现了I-F型CRISPR-Cas系统。噬菌体的CRISPR-Cas系统相较于细菌CRISPR-Cas系统有何特点尚待研究。2024年7

新研究发现噬菌体CRISPRCas系统新机制

  CRISPR-Cas系统广泛存在于细菌和古细菌中,是原核生物的一种适应性免疫系统,用来抵御病毒、质粒等外源核酸的侵入。然而在2013年,有研究人员在ICP1噬菌体中发现了I-F型CRISPR-Cas系统。噬菌体的CRISPR-Cas系统相较于细菌CRISPR-Cas系统有何特点尚待研究。  20

简述原核生物转座因子的类别

  转座因子大致分为三类:  (1)插入序列 , 这是一类除了和它的转座作用有关的基因以外不带有任何其他基因的转座因子。它们是较小的转座因子,可以在染色体、质粒上发现它们。F因子和大肠杆菌的染色体上有一些相同的插入序列(IS) ,现已搞清至少有五种DNA插入序列,它既可独立地,也可以作为其他转座因子