天津工生所等开发出基于蛋白质乙酰化位点的生物信息工具
乙酰化(Acetylation)又称乙酰基化或乙酰化作用，是指将一个乙酰官能基团加入到一个有机化合物中的化学反应。在生命体中，蛋白质乙酰化作为一种非常重要的蛋白质翻译后修饰存在，它调控着细胞凋亡、DNA-蛋白质相互作用、DNA复制和修复、DNA转录活性及蛋白质稳定性等多种重要的生命过程。 中国科学院天津工业生物技术研究所宋江宁研究员带领的结构生物信息学与整合系统生物学研究组与中国农业大学生物信息学中心及澳大利亚蒙纳士大学医学院和信息技术学院的科研人员合作，对蛋白质乙酰化开展了一系列深入研究。该工作开发出新的生物信息学工具SSPKA(http://www.structbioinfor.org/Lab/SSPKA/)，用以精确识别基于物种特异性的蛋白质乙酰化位点。这一研究通过构建物种特异性高精度的蛋白质乙酰化数据集、提取各类有效特征，并结合高效的特征选择方法，建立了高准确率的随机森林机器学习模型预测蛋白质乙酰化，并针对不同物种......阅读全文
定量质谱研究食管癌细胞异常蛋白表达和修饰
定量蛋白质组学技术已成为当前大规模蛋白质鉴定的重要手段。本研究以高侵袭性的食管癌细胞SHEEC和食管上皮细胞SHEE为目标，分别采用轻、重稳定同位素进行细胞蛋白氨基酸标记（SILAC），通过多维液相色谱分离结合高分辨质谱，鉴定了两种细胞蛋白质组。共鉴定了7000多个蛋白质，并对其中3000多个蛋白质
细胞总乙酰化水平的快速测定方法
步骤一：亲和色谱分离提纯乙酰化蛋白 1. 用细胞裂解液裂解细胞，10000rpm 离心2 分钟，取上清备用。 2. 取20-40ul 抗乙酰化赖氨酸抗体填料(Anti-acetylated lysine Agarose,ICP0388，如右图所示)， 用PBS 洗2 次，每次1ml。
细胞总乙酰化水平的快速测定方法
步骤一：亲和色谱分离提纯乙酰化蛋白 1. 用细胞裂解液裂解细胞，10000rpm 离心2 分钟，取上清备用。 2. 取20-40ul 抗乙酰化赖氨酸抗体填料(Anti-acetylated lysine Agarose,ICP0388，如右图所示)， 用PBS 洗2 次，每次1
细胞总乙酰化水平的快速测定方法
细胞总乙酰化水平的快速测定方法 -------免疫亲和色谱-ELISA 方法 步骤一：亲和色谱分离提纯乙酰化蛋白 1. 用细胞裂解液裂解细胞，10000rpm 离心2 分钟，取上清备用。 2. 取20-40ul 抗乙酰化赖氨酸抗体填料(Anti-acetylated
乙酰化剂的物理性质介绍
乙酰氯为无色发烟液体，有强烈臭味和对眼的刺激性。相对密度1.1051 (20℃) ，熔点-112℃，沸点51～52℃，闪点4.4℃ (闭皿)。 在湿空气中缓慢分解而冒白烟，遇水猛烈水解成醋酸及氯化氢， 故应密封保存。 能和苯、丙酮、三氯甲烷、乙醚、冰醋酸、石油醚等混溶。液体重于水，蒸气比空气重
2025蛋白质组学大会之微生物蛋白质组学
2025年10月14日下午，聚焦于微生物蛋白质组学领域的专题分会场在广州白云国际会议中心107会议室正式拉开帷幕。会议由王恒樑、马庆伟、刘小云、李乐园四位教授召集，现场由刘小云、Paola Roncada教授主持。来自意大利卡坦扎罗“大希腊”大学、比利时根特大学、复旦大学、西湖大学、国家蛋白质科学中
组蛋白去乙酰化酶Rpd3S核小体去乙酰化和DNA－linker收紧的分子机制
近日，中国科学院广州生物医药与健康研究院联合澳门大学，在《细胞研究》（Cell Research）上，在线发表了题为Structural basis of nucleosome deacetylation and DNA linker tightening by Rpd3S histone de
上海药物所合作在赖氨酸琥珀酰修饰研究中取得新进展
蛋白翻译后修饰对蛋白的结构和功能起着非常重要的调节作用，赖氨酸琥珀酰化是中科院上海药物研究所和芝加哥大学共同合作在原核和真核细胞中最新发现的蛋白翻译后修饰通路。研究团队开创性地对哺乳动物细胞中的去乙酰化修饰酶Sirt5调控的琥珀酰化修饰底物进行了系统的蛋白质组学研究，发现了琥珀酰化修饰对能量代谢
深大特聘教授陈雪梅院士PNAS发表植物表观遗传学成果
生物通报道：在植物中，组蛋白去乙酰化酶（HDACs）属于一个大的蛋白质家族，但是很少有人知道每个HDAC的靶标特异性是如何实现的。12月5日在《PNAS》发表的一项研究中，来自深圳大学、加州大学河滨分校、韩国基础科学研究院和湖南农业大学等处的研究人员指出，一对含有SANT (SWI3/DAD2/
特殊蛋白质打破生物学核心规则
生物学核心规则是：一个细胞中的信息往往从DNA开始，然后通过核糖核酸(RNA)通路到达蛋白……然而Phys.org报道称，在1月2日发表于《科学》的论文中，研究人员发现了一种打破这种规则的蛋白。当一个细胞在建立蛋白时出现某种错误后，另一个蛋白Rqc2就趁虚而入，在没有DNA或RNA的任何指导下向
模拟生物生长的蛋白质电路获ZL
亚利桑那大学工程师模拟生物生长发明的蛋白质电路制造工艺获得美国ZL。该制造工艺是生物工程的一项突破，通过将生物过程和无电镀铜沉积结合起来，制成了内部是铜、外部是蛋白质的绝缘导线，可用来构建电路，这将使微电子学产生巨大飞跃，或将完全改变微芯片制造的方向，使之进入生物组装时代。 该工艺的ZL号为
蛋白质的生物合成标记实验（一）
甲硫氨酸短时间标记悬液中的细胞生物按照从脱氧核糖核酸 (DNA)转录得到的信使核糖核酸（mRNA）上的遗传信息合成蛋白质的过程。由于mRNA上的遗传信息是以密码（见遗传密码）形式存在的，只有合成为蛋白质才能表达出生物性状，因此将蛋白质生物合成比拟为转译或翻译。实验材料蛋白质试剂、试剂盒甲硫氨酸PBS
蛋白质的生物合成的过程相关介绍
蛋白质在生物体内常处于合成和分解的动态平衡。因而各种蛋白质都以其固有的速度进行分解或重新合成。在细胞内合成蛋白质的场所是核蛋白体。核蛋白体在细胞内以游离的或结合在粗面内质网上的状态而存在，前者主要进行细胞质（酶）的合成，后者主要是以分泌蛋白质（酶）及膜组成成分的蛋白质的合成。蛋白质的一级结构，即
蛋白质的生物合成相关内容
蛋白质在生物体内常处于合成和分解的动态平衡。因而各种蛋白质都以其固有的速度进行分解或重新合成。在细胞内合成蛋白质的场所是核蛋白体。核蛋白体在细胞内以游离的或结合在粗面内质网上的状态而存在，前者主要进行细胞质（酶）的合成，后者主要是以分泌蛋白质（酶）及膜组成成分的蛋白质的合成。蛋白质的一级结构，即
生物碱试剂沉淀蛋白质的原理
生物碱试剂沉淀蛋白质的原理：植物体内具有显著生理作用的含氮碱性化合物成为生物碱。 能沉淀生物碱或与其产生颜色反应的物质称为生物碱试剂。 当溶液PH小于等电点时，蛋白质颗粒带正电荷， 容易与生物碱试剂的负离子发生反应而沉淀。生物碱试剂本质就是酸类，它们一般均导致蛋白质变性。 因为反应机理是， 跟蛋白
缩短蛋白质疗法的上游生物工艺时间
过去十五年来，蛋白质疗法在全世界范围内的应用急剧增长。因此，对于很多生物制药公司而言，当务之急是寻找更经济和更有效的方法提升上游生物工艺生产。 提高上游生产的策略之一是使用生物工艺模型模仿大型生物反应器，以帮助选择最合适的克隆，并优化培养基、补料和过程参数。识别最佳的蛋白质生产克隆株并优化其
蛋白质的生物合成标记实验（三）
实验材料细胞试剂、试剂盒甲硫氨酸PBS仪器、耗材离心机培养箱实验步骤1. 准备和用［35S］甲硫氨酸标记细胞，用0.2~1 mCi/ml 的［35S］甲疏氨酸脉冲标记细胞5~30 min。 2. 脉冲标记后，除去［35S］甲硫氨酸培养基，用10 ml 于37℃追加培养基冼细胞1次，加入10 ml
蛋白质的生物合成遗传密码表
在mRNA的开放式阅读框架区,以每3个相邻的核苷酸为一组,代表一种氨基酸 (amino acid) 或其他信息,这种三联体形势称为密码子(codon)。通常的开放式阅读框架区包含500个以上的密码子。
蛋白质在原核生物中的表达
实验概要将克隆化基因插入合适载体后导入大肠杆菌用于表达大量蛋白质的方法一般称为原核表达。这种方法在蛋白纯化、定位及功能分析等方面都有应用。大肠杆菌用于表达重组蛋白有以下特点：易于生长和控制；用于细菌培养的材料不及哺乳动物细胞系统的材料昂贵；有各种各样的大肠杆菌菌株及与之匹配的具各种特性的质粒可供选择
微生物是怎样生产蛋白质的
生物学家告诉我们：蛋白质是生命活动的物质基础，一切动植物的体内都有蛋白质。动植物这些显眼的“大生物”含有蛋白质，那些肉眼难见的“小不点儿”微生物，是否也应有蛋白质的成分呢？是的，微生物虽小，也有蛋白质成分。由于微生物大多是很小很小的单细胞生物，因而人们生产出来的蛋白质，叫作“单细胞蛋白”。单细胞蛋白
蛋白质的生物合成标记实验（二）
实验材料细胞试剂、试剂盒PBS甲硫氨酸仪器、耗材培养箱离心机实验步骤1. 在100 mm 直径的培养皿上培养贴壁细胞（0.5~2×107）至70%~90%汇片，吸去培养液，用10 ml 于37℃短时间标记培养基轻轻搖晃冼两次细胞。2. 加入5 ml 于37℃短时间标记培养基，在5%CO2的加湿培
蛋白质的生物合成遗传密码的特点
一方向性:密码子及组成密码子的各碱基在mRNA序列中的排列具有方向性(direction),翻译时的阅读方向只能是5ˊ→3ˊ;二连续性:mRNA序列上的各个密码子及密码子的各碱基是连续排列的,密码子及密码子的各个碱基之间没有间隔,每个碱基只读一次,不重叠阅读;三简并性:一种氨基酸可具有两个或两个以上
复旦大学雷群英教授Cell子刊癌症研究新文章
来自复旦大学、上海交通大学医学院的研究人员在新研究中证实，ATP-柠檬酸裂解酶(ATP-Citrate Lyase，ACLY)乙酰化促进了脂类生物合成及肿瘤生长。这一研究发现在线发表在8月8日的《分子细胞》(Molecular Cell)杂志上。 论文的通讯作者是复旦大学上海医学院的雷
Cell子刊：组蛋白乙酰化的惊人发现
在给定细胞中，表观遗传学信号可以决定基因的表达情况。科学家们开发了一种新分析法，对表观遗传学标签进行了系统性研究。 多细胞生物的每个细胞都携带着相同的遗传学信息。不过，不同类型的细胞只激活功能所需的特定基因。举例来说，肌肉细胞和神经细胞中的基因表达情况就大不相同。哪些基因在何时被激活，很大程度
细胞乙酰化的辐射增敏研究取得进展
近日，中国科学院合肥物质科学研究院技术生物与农业工程研究所研究员黄青课题组在前期工作的基础上，开展了细胞乙酰化的辐射增敏研究，相关研究结果在辐射研究的专业期刊Mutation Research上在线发表。 组蛋白乙酰化是表观遗传修饰的重要方式之一。肿瘤的产生与组蛋白乙酰化与去乙酰化的调控失衡关
表观遗传之组蛋白修饰—组蛋白乙酰化
大家好，我又来啦~~今天给大家放送的是表观遗传之组蛋白修饰相关的内容噢，组蛋白修饰也是一个比较复杂的过程，今天呢，我们就给大家讲讲组蛋白乙酰化及相关的产品。 一 组蛋白修饰 真核生物染色质的基本结构单位是核小体，它由约 146 bp DNA 缠绕组蛋白八聚体组成，其中组蛋白八聚体包含 2 (H2
研究证明乙酰化过程与基因转录有重要关联
最近，一个来自格拉德斯通研究所的科学团队对一个最基本的生物学过程——基因转录有了重要发现。 2013年，Gladstone的高级研究员Melanie Ott博士发现，在哺乳动物等复杂生物体的基因转录过程中，聚合酶的调控尾部也会发生另一种称为乙酰化的修饰。然而，到目前为止，没有人知道乙酰化是做什
中外学者合作Cell子刊解析蛋白翻译后修饰
来自密西根大学，中科院上海药物研究所，芝加哥大学等处的研究人员发表了题为“SIRT5-Mediated Lysine Desuccinylation Impacts Diverse Metabolic Pathways”的文章，首次在哺乳动物细胞中对去乙酰化调控酶Sirt5调控的琥珀酰底
如何为你的科研项目选择特异可靠的抗乙酰化赖氨酸抗...
如何为你的科研项目选择特异可靠的抗乙酰化赖氨酸抗体得到可靠的结果最近,科学家在JBC(Journal of Biological Chemistry 291, 5270-5277) 发表了一篇很有价值的文献， 发现Naa10这个蛋白并不具备蛋白质赖氨酸乙酰转移酶的性质。 文献采用了2家不同抗体公
第八届中国蛋白质组学大会圆满闭幕
以“人类蛋白组计划：让人类更健康”为主题，由中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会（CNHUPO）主办，军事医学科学院放射与辐射医学研究所、重庆医科大学、蛋白质组学国家重点实验室、北京蛋白质组研究中心共同承办的第八届中国蛋白质组学大会于2013.9.8-10日在重庆市国际会展中心成功召开