天津工生所等开发出基于蛋白质乙酰化位点的生物信息工具
乙酰化(Acetylation)又称乙酰基化或乙酰化作用，是指将一个乙酰官能基团加入到一个有机化合物中的化学反应。在生命体中，蛋白质乙酰化作为一种非常重要的蛋白质翻译后修饰存在，它调控着细胞凋亡、DNA-蛋白质相互作用、DNA复制和修复、DNA转录活性及蛋白质稳定性等多种重要的生命过程。 中国科学院天津工业生物技术研究所宋江宁研究员带领的结构生物信息学与整合系统生物学研究组与中国农业大学生物信息学中心及澳大利亚蒙纳士大学医学院和信息技术学院的科研人员合作，对蛋白质乙酰化开展了一系列深入研究。该工作开发出新的生物信息学工具SSPKA(http://www.structbioinfor.org/Lab/SSPKA/)，用以精确识别基于物种特异性的蛋白质乙酰化位点。这一研究通过构建物种特异性高精度的蛋白质乙酰化数据集、提取各类有效特征，并结合高效的特征选择方法，建立了高准确率的随机森林机器学习模型预测蛋白质乙酰化，并针对不同物种......阅读全文
科学家找到“秘密武器”用于清除癌细胞“帮凶”
新发现有望实现胰腺癌等早期诊断。 历经3年多潜心研究，上海医学院生物医学研究院长江学者讲座教授管坤良、熊跃和该院研究员雷群英率领的科研团队，终于找到肿瘤发生和恶化的“微环境”新机制。该研究有望实现胰腺癌等早期诊断，4月16日，国际权威杂志《癌细胞》刊发了这一重要成果。 “乳酸脱氢酶A
上海药物所合作在赖氨酸琥珀酰修饰通路研究中取得进展
蛋白翻译后修饰对蛋白质的结构和功能起着关键作用，是细胞精细调节生理活动的关键之一。因而，蛋白翻译后修饰通路研究是目前新药研发的重要热点之一。 中科院上海药物研究所化学蛋白质组学研究中心与美国芝加哥大学、密西根大学合作研究，首次在哺乳动物细胞中对去乙酰化调控酶Sirt5调控的琥珀酰底物进行了
清华大学、德克萨斯大学Cell联合发布表观遗传重要发现
谈到配送，就连联邦快递（Federal Express®）和UPS快递（UPS®）也无法与人体相比。在癌症生物学中存在着一个令人惊叹的包装和传送系统，其影响了人体是否将会形成癌症。 组蛋白，这一染色质的主要组成元件是一个让人感兴趣的领域。人们认为染色质畸变可导致与癌症相关的DNA损伤。来自清华
许瑞明课题组Nature子刊解析Sir3转录沉默新机制
8月11日，Nature structural & Molecular Biology 在线发表了中科院生物物理研究所生物大分子国家重点实验室许瑞明课题组的最新研究成果。该文章题为Nα-acetylated Sir3 stabilizes the conformation of a nu
复旦大学雷群英揭示肿瘤代谢信号调控新机制
3-磷酸甘油醛脱氢酶（Glyceraldehyde-3-phosphate Dehydrogenase,GAPDH）是一种至关重要的糖酵解酶，与许多的人类癌症相关联。来自复旦大学的研究人员在新研究中证实，响应葡萄糖信号GAPDH通过第254位赖氨酸（Lysine 254）乙酰化促进自身活化，推动
核自身抗原精子蛋白的研究进展
到目前为止（2012年）的研究发现，人的sNASP和tNASP均具有结合组蛋白H3/H4的分子伴侣活性，而且它们还都可以结合组蛋白H1，具有组蛋白H1分子伴侣活性。因此，可想而知，它们在DNA复制后的染色质重折叠的最后一步或者最后阶段中发挥着至关重要的作用。NASP在一级结构上以及通过现代计算生
MCM3基因的结构特点和生理作用
该基因编码的蛋白是一种高度保守的小染色体维持蛋白（mcm），参与真核生物基因组复制的启动。MCM蛋白形成的六聚体蛋白复合物是复制前复合物（pre-RC）的关键组成部分，可能参与复制叉的形成和其它DNA复制相关蛋白的募集这种蛋白质是由MCM2-7组成的蛋白质复合物的一个亚单位它已经被证明与MCM5/C
简述生物蛋白质保持活性方式和作用
一、生物蛋白质保持活性方式： 生物活性蛋白对环境的要求很高，高浓度的生物活性蛋白在常温下保存很容易失去活性，为了确保这些珍稀成分的特殊活性与功能，只能采取生物冻干工艺，在无菌环境下采用-80度的极速超低温真空冻干技术，使生物活性蛋白进入休眠状态，达到完整的保存其生物活性的目的。 作用： 一
蛋白质对生物体的功能介绍
催化功能：有催化功能的蛋白质称酶，生物体新陈代谢的全部化学反应都是由酶催化来完成的。运动功能：从最低等的细菌鞭毛运动到高等动物的肌肉收缩都是通过蛋白质实现的。肌肉的松弛与收缩主要是由以肌球蛋白为主要成分的粗丝以及以肌动蛋白为主要成分的细丝相互滑动来完成的。运输功能：在生命活动过程中，许多小分子及离子
缩短蛋白质疗法的上游生物工艺时间（一）
过去十五年来，蛋白质疗法在全世界范围内的应用急剧增长。因此，对于很多生物制药公司而言，当务之急是寻找更经济和更有效的方法提升上游生物工艺生产。 提高上游生产的策略之一是使用生物工艺模型模仿大型生物反应器，以帮助选择最合适的克隆，并优化培养基、补料和过程参数。识别最佳的蛋白质生产克隆株并
缩短蛋白质疗法的上游生物工艺时间（二）
案例研究 克隆筛选和早期工艺开发 为了使自动化微型生物反应器成为可行的克隆选择和早期工艺开发模型，微型生物反应器培养的工艺参数、细胞增长和活性结果应与台式生物反应器的结果相似。为了确定这一点，用ambr15自动化微型生物反应器(3个复制品)、1L和3L玻璃台式生物反应器进行了比较。
单细胞蛋白质的微生物及用途
微生物 生产单细胞蛋白质的微生物种类很多，有酵母菌、细菌、霉菌和担子菌等。 糖质原料：酵母属和假丝酵母属为主要生产菌。 正烷烃：假丝酵母为最主要利用菌。 甲烷：能利用甲烷作为唯一碳源的微生物，主要是细菌，如甲烷假单胞菌等。 甲醇：主要以细菌为主，放线菌、酵母菌和霉菌次之。甲烷利用菌也为
蛋白质对生物体的功能介绍
催化功能：有催化功能的蛋白质称酶，生物体新陈代谢的全部化学反应都是由酶催化来完成的。运动功能：从最低等的细菌鞭毛运动到高等动物的肌肉收缩都是通过蛋白质实现的。肌肉的松弛与收缩主要是由以肌球蛋白为主要成分的粗丝以及以肌动蛋白为主要成分的细丝相互滑动来完成的。运输功能：在生命活动过程中，许多小分子及离子
生物样品的前处理技术蛋白质的提取
由于大部分蛋白质都能溶于水、稀盐、稀酸或稀碱溶液,所以蛋白质的提取一般是以水溶液为主,其中盐溶液和缓冲溶液对蛋白质的稳定性好、溶解度大,是提取蛋白质最常用的溶剂。当细胞粉碎后,用盐溶液或缓冲溶液提取蛋白质时,应注意以下一些条件。(1)盐浓度常用等渗盐溶液,尤其以0.02～0.05mol/L磷酸缓冲溶
Protein－Cell：病毒感染时翻译后修饰乙酰化的动态调控
天然免疫应答是机体应对病原微生物入侵的第一道防线，在杀伤病原微生物、清除感染细胞和维持体内稳态等方面发挥关键作用。蛋白质翻译后修饰（protein post-translational modifications，PTMs）广泛参与调控各种通路中信号分子的激活。非组蛋白乙酰化修饰（non-hi
表观遗传学修饰
组蛋白修饰 表观遗传学是指表观遗传学改变 (DNA 甲基化、组蛋白修饰和非编码 RNA 如 miRNA) 对 表观基因组基因表达的调节，这种调节不依赖基因序列的改变且可遗传表观。因素如 DNA 甲基化、组蛋白修饰和 miRNA 是对环境刺激因素变化的反映，这些表观遗传学因素相互作用以调节基因
施晓冰博士Cell发布表观遗传重要发现
谈到配送，就连联邦快递（Federal Express®）和UPS快递（UPS®）也无法与人体相比。在癌症生物学中存在着一个令人惊叹的包装和传送系统，其影响了人体是否将会形成癌症。 组蛋白，这一染色质的主要组成元件是一个让人感兴趣的领域。人们认为染色质畸变可导致与癌症相关的DNA损伤。来自德克
组蛋白去乙酰化酶抑制剂的简介
组蛋白去乙酰化酶抑制剂（histone deacetylase inhibitor，HDACI），简称HDACIs，是一类化合物，有干扰与组蛋白去乙酰化酶的功能。 组蛋白去乙酰化酶抑制剂通常可分为两大类：NAD + -依赖性酶和Zn2 +依赖性酶。Zn2+依赖性蛋白酶包括HDACsI、II、IV
有机化合物的乙酰化的优点
(1)产物转化率高，达到95%以上；(2)催化剂活性高，用量小；(3)反应条件温和，反应时间短；(4)催化剂可以重复使用数次仍保持高活性；(5)环保。
科学家发现神经系统“交警”
美国研究人员发现一种蛋白质帮助维持大脑细胞内的“交通秩序”，“指挥”细胞内营养物质和废弃物何去何从。 这一发现有助研究帕金森氏症和阿尔茨海默氏症（早老性痴呆症）等神经系统疾病的治疗方法。“交警” 这种蛋白质名为MEC-17。它的发现纯属好奇结果。 美国趣味科学网站9月8
Virology：博尔纳病毒研究新突破
来自重庆医科大学，复旦大学及杭州景杰生物科技有限公司等研究人员发现在博尔纳病毒（Borna disease virus）感染后的人少突神经胶质细胞蛋白质组水平及组蛋白中乙酰化水平有着明显的变化。这项研究工作在2014年9月著名的科学杂志《Virology》上发表，题为"Human borna d
复旦学者找到清除胰腺癌发生恶化的“微环境”新机制
乙酰“武装”蛋白质可抑制肿瘤。 复旦大学学者找到了肿瘤发生和恶化的“微环境”新机制，这一研究有望为胰腺癌等早期诊断提供可能。国际权威杂志《癌细胞》今天以《乳酸脱氢酶A去乙酰化导致胰腺癌发生》为题，刊发了这一引人关注的重要成果。 “乳酸脱氢酶A”是人体内的蛋白质，也是一种能够产生乳酸的
第六届AOHUPO大会报告集锦（二）
第六届亚太人类蛋白质组组织(AOHUPO)大会于2012年5月5日下午在北京国家会议中心开幕。这是亚太地区规模最大、影响最广、学术水平最高的蛋白质组学学术峰会。有20多个国家和地区的1000多名专家学者参会，提交相关领域学术论文近400篇。5月6日，大会继续进行，各
华东理工大学PNAS发表代谢研究新发现
来自华东理工大学的研究人员发现了Sirtuin依赖性的、可逆的谷氨酰胺合成酶赖氨酸乙酰化作用，由此揭示出了放线菌氮代谢中的一个自反馈回路。这项研究工作发布在5月31日的《美国国家科学院院刊》（PNAS）上。 文章的通讯作者是华东理工大学的叶邦策（Bang-Ce Ye）教授。其主要研究方向包括生
复旦大学Nature子刊发布表观遗传新成果
来自复旦大学、香港浸会大学的研究人员证实，在低氧条件下醋酸作为一种表观遗传代谢产物促进了脂质合成。这一研究发现发布在6月30日的《自然通讯》（Nature Communications）杂志上。 复旦大学的雷群英（Qun-Ying Lei）教授与杨芃原（Peng-Yuan Yang）教授是这篇
动脉粥样硬化新靶点｜香港中文大学田小雨教授团队揭示内皮细胞SIRT3在AS中的保护作用
2024年1月17日，香港中文大学田小雨教授团队在Adv. Sci.（IF 15.1）上在线发表了题为“Role of Argininosuccinate Synthase 1 -Dependent L-Arginine Biosynthesis in the Protective Effect o
关于组蛋白的医学应用介绍
１、预测 最新研究结果显示：组蛋白修饰的整体模式可预测低分级前列腺癌的复发风险。该研究第一作者加利福尼亚大学的Siavash K. Kurdistani表示：这种修饰模式最终可作为前列腺或其他类型癌症的预后或诊断指标，也可作为预测何种患者、患者会对一类o组蛋白去乙酰酶抑制剂新药产生反应的指标。
中大长江学者发表CRISPR成果
在细胞中，对于不稳定的蛋白质来说，稳定性调控是特别重要的。然而，目前还没有开发出一种方便而无偏差的方法，能够确定蛋白质稳定性的调节因子。近期，来自中山大学肿瘤防治中心的研究人员，在《Cell Discovery》杂志发表的一项研究中，通过将全基因组CRISPR-Cas9文库与双荧光蛋白稳定性报告
支架蛋白BRPF2如何调控组蛋白乙酰转移酶HBO1的活性？
2月24日，国际学术期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所国家蛋白质科学中心（上海）丁建平研究组的最新研究成果：Structural and mechanistic insights into regulation of H
聚能生物与国家蛋白质平台开展广泛合作
JNBIO(聚能生物)是一家由留学人员创办的高新技术企业，自主创新与欧洲前沿技术相融合，开发生产低温超高压连续流细胞破碎仪，是国家技术创新基金立项扶持的项目。 JNBIO系列低温超高压连续流细胞破碎仪自投入市场以来，积极开展与国家蛋白质科学研究平台的合作。到目前为止，中国科学院生物物理研究