天津工生所等开发出基于蛋白质乙酰化位点的生物信息工具

乙酰化(Acetylation)又称乙酰基化或乙酰化作用,是指将一个乙酰官能基团加入到一个有机化合物中的化学反应。在生命体中,蛋白质乙酰化作为一种非常重要的蛋白质翻译后修饰存在,它调控着细胞凋亡、DNA-蛋白质相互作用、DNA复制和修复、DNA转录活性及蛋白质稳定性等多种重要的生命过程。 中国科学院天津工业生物技术研究所宋江宁研究员带领的结构生物信息学与整合系统生物学研究组与中国农业大学生物信息学中心及澳大利亚蒙纳士大学医学院和信息技术学院的科研人员合作,对蛋白质乙酰化开展了一系列深入研究。该工作开发出新的生物信息学工具SSPKA(http://www.structbioinfor.org/Lab/SSPKA/),用以精确识别基于物种特异性的蛋白质乙酰化位点。这一研究通过构建物种特异性高精度的蛋白质乙酰化数据集、提取各类有效特征,并结合高效的特征选择方法,建立了高准确率的随机森林机器学习模型预测蛋白质乙酰化,并针对不同物种......阅读全文

水生所蛋白质翻译后修饰组学研究获进展

  蛋白质的翻译后修饰,如磷酸化、乙酰化等,是调节蛋白质生物学功能的关键步骤,是蛋白质动态反应和相互作用的一个重要分子基础,也是细胞信号网络调控的重要靶点。由于翻译后修饰蛋白质在样本中含量低且动态范围广,其研究极具挑战性。近期,中国科学院水生生物研究所葛峰研究员学科组在蛋白质翻译后修饰组学及其功能方

结核杆菌研究新进展:乙酰化修饰图谱公布

  近日,发表于杂志Int J Biochem Cell Biol.上的一篇文章中,来自西南大学和杭州景杰生物科技有限公司的研究者公布了结核分歧杆菌的乙酰化修饰谱图。近年来科学家都非常有兴趣致力于病原微生物的蛋白质翻译后修饰研究,本文中作者首次全面鉴定了结核分歧杆菌的乙酰化修饰。这也是继公布首张结合

复旦团队发现生命新陈代谢“乙酰化”新机制

  人体80%疾病与代谢有关,揭开代谢的奥秘就等于找到了制服疾病的密钥。2月19日出版的国际权威刊物《科学》同时刊发了两篇复旦大学科研人员对生命新陈代谢乙酰化作用新机制的最新研究成果。两篇题为《代谢酶的乙酰化协调碳源的利用和代谢》和《蛋白赖氨酸的乙酰化调控》文章,以蛋白质向能量转化过程中“乙酰化修饰

蛋白质与生物小分子结合

生物大分子,首先先说一下什么是生物大疯子,生物大分子指的是作为生物体内主要活性成分的各种分子量达到上万或更多的有机分子.高相对分子量的生物有机化合物(生物大分子)主要是指蛋白质、核酸以及高相对分子量的碳氢化合物.常见的生物大分子包括蛋白质、核酸、多糖.但是,这只是相对的说法,这个定义只是概念性的,与

蛋白质的生物意义和功能

蛋白质是由许多α氨基酸按照一定的序列通过酰胺键 (或肽键)缩合而成的,具有较稳定的构象并具有一定生物功能的生物大分子。蛋白质是生命的载体,任何有生命的机体都不可能离开蛋白质。蛋白质在生命活动和种族繁衍中有重要的生物学意义,承担着强大的功能。 ① 结构功能:蛋白质是生物组织和细胞的组成成分,并发挥着保

生物活性物质蛋白质的简介

  蛋白质是由许多α氨基酸按照一定的序列通过酰胺键 (或肽键)缩合而成的,具有较稳定的构象并具有一定生物功能的生物大分子。蛋白质是生命的载体,任何有生命的机体都不可能离开蛋白质。蛋白质在生命活动和种族繁衍中有重要的生物学意义,承担着强大的功能。  ① 结构功能:蛋白质是生物组织和细胞的组成成分,并发

蛋白质芯片技术生物分子反应

使用时将待检的含有蛋白质的标本如尿液、血清、精液、组织提取物等,按一定程序做好层析、电泳、色谱等前处理,然后在每个芯池里点入需要的种类。一般样品量只要2-10μL即可。根据测定目的不同可选用不同探针结合或与其中含有的生物制剂相互作用一段时间,然后洗去未结合的或多余的物质,将样品固定一下等待检测即可。

蛋白质生物合成过程的介绍

  1.氨基酸的活化与搬运:氨基酸的活化以及活化氨基酸与tRNA的结合,均由氨基酰tRNA合成酶催化完成。反应完成后,特异的tRNA3’端CCA上的2’或3’位自由羟基与相应的活化氨基酸以酯键相连接,形成氨基酰tRNA。  2.活化氨基酸的缩合——核蛋白体循环:活化氨基酸在核蛋白体上反复翻译mRNA

生物组织中蛋白质的检测

  蛋白质的鉴定原理:鉴定生物组织中是否含有蛋白质时,常用双缩脲法,使用的是双缩脲试剂。双缩脲试剂的成分是质量浓度为0.1 g/mL的氢氧化钠溶液和质量浓度为0.01 g/mL的硫酸铜溶液。在碱性溶液(NaOH)中,双缩脲(H2NOC—NH—CONH2)能与Cu2+作用,形成紫色或紫红色的络合物,这

2025蛋白质组学大会之模式生物蛋白质组

2025年10月13日14:00-16:00,模式生物蛋白质组分论坛成功举办。论坛云集圣保罗大学、中国科学院昆明动物研究所、国家蛋白质科学中心(北京)、中国科学院大连化学物理研究所、湖南师范大学、东北林业大学、南方海洋科学与工程广东省实验室(广州)、湖北工业大学等10余家国内外高校及科研机构的顶尖专

生物物理所揭示N端乙酰化修饰促进Sir3的转录沉默功能

  8月11日,Nature structural & Molecular Biology 在线发表了中科院生物物理研究所生物大分子国家重点实验室许瑞明课题组的最新研究成果。该文章题为Nα-acetylated Sir3 stabilizes the conformation of a nu

用质谱可检测生物体糖蛋白末端唾液酸氧乙酰化修饰

  近日,江汉大学研究生吴兆冠的论文《基于基质辅助激光解析电离质谱结合全甲基化和甲胺化衍生测定唾液酸化聚糖的氧乙酰化》(Characterization of O-acetylation in Sialoglycans by MALDI-MS Using a Combination of Methy

组蛋白乙酰化定量分析

组蛋白乙酰化修饰是基因表观转录调控的重要机制.组蛋白翻译后修饰所引起的染色质结构重塑在真核生物基因表达调控中发挥着重要的作用.组蛋白乙酰化主要发生在H3、H4的N端比较保守的赖氨酸位置上,是由组蛋白乙酰转移酶和组蛋白去乙酰化酶协调进行。组蛋白乙酰化呈多样性,核小体上有多个位点可提供乙酰化位点,但特定

生命新陈代谢乙酰化新机制

人体80%疾病与代谢有关,揭开代谢的奥秘就等于找到了制服疾病的密钥。2月19日出版的国际权威刊物《》同时刊发了两篇复旦大学人员对生命作用新机制的最新研究成果。两篇题为《代谢酶的乙酰化协调碳源的利用和代谢》和《赖氨酸的乙酰化调控》文章,以向能量转化过程中“乙酰化修饰”的重要发现,为肝病、等代谢疾病的药

代谢物和细胞周期信号调控组蛋白乙酰化

  足够的营养是细胞增殖和组织发育的必要条件。细胞增殖和组织发育需要上调组蛋白乙酰化来激活基因转录。二者之间的联系,也就是:“营养物信号如何被传递到组蛋白乙酰化?”这个基础生物医学问题,长期未能得到阐明。  2021年6月17日,复旦大学赵世民团队/徐薇团队合作在Nature Metabolism杂

《科学》聚焦中国生物医学新成果

  研究在一个全新的层面上呈现出广阔前景   美国当地时间2月19日,最新出版的《科学》杂志,罕见地同时发表两篇复旦大学生物医学研究院的最新成果。其中关于蛋白质向能量转化过程中“乙酰化修饰”的重要发现,对肝病、肿瘤等代谢疾病的药物研发提供了开拓性的思路,生物医学研究在一个全新的层面上呈现出广阔的前

生物分子蛋白质核磁共振光谱

利用核磁谱研究蛋白质,已经成为结构生物学领域的一项重要技术手段。X射线单晶衍射和核磁都可获得高分辨率的蛋白质三维结构,不过核磁常局限于35kDa以下的小分子蛋白,尽管随着技术的进步,稍大的蛋白质结构也可以被核磁解析出来。另外,获得本质上非结构化(Intrinsically Unstructured)

蛋白质的生物合成标记实验

甲硫氨酸短时间标记悬液中的细胞 甲硫氨酸短时间标记贴壁培养细胞 甲硫氨酸对细胞进行脉冲追踪标记             实验材料 蛋白质

蛋白质的生物合成过程的介绍

  第一步,氨基酸活化与转运。这个过程是在氨基酸活化酶和镁离子作用下把氨基酸激活成为活化氨基酸。当然,这一过程还有许多其它因子的参与,其发生部位在细胞质。  第二步,肽链(蛋白质)合成的起动。以原核细胞中肽链合成的起动为例:首先是原核细胞中的起始因子结合在核蛋白体的小亚基上,使大小亚基分开,再与信使

对蛋白质生物塑料性能的研究

     自从我国的经济取得了一定的发展,人们对产品蛋白质含量有了进一步的要求,一些科学家已经在不断的研究如何提高动植物体内的蛋白质方法,并且使用一些相关的仪器像全自动定氮仪来准确的了解蛋白质的含量。我们主要还是需要对蛋白质的性能特点进行了解的,主要包括拉伸度以及数量等,也就是我们常说的蛋白质活性以

蛋白质的生物合成标记实验

甲硫氨酸短时间标记悬液中的细胞 甲硫氨酸短时间标记贴壁培养细胞 甲硫氨酸对细胞进行脉冲追踪标记             实验材料 蛋白质

单细胞蛋白质的微生物

  生产单细胞蛋白质的微生物种类很多,有酵母菌、细菌、霉菌和担子菌等。  糖质原料:酵母属和假丝酵母属为主要生产菌。  正烷烃:假丝酵母为最主要利用菌。  甲烷:能利用甲烷作为唯一碳源的微生物,主要是细菌,如甲烷假单胞菌等。  甲醇:主要以细菌为主,放线菌、酵母菌和霉菌次之。甲烷利用菌也为甲醇利用菌

蛋白质的生物合成标记实验

实验材料 蛋白质试剂、试剂盒 甲硫氨酸PBS仪器、耗材 培养箱离心管实验步骤 1.  培养悬浮细胞至对数增长期,室温300 g 离心5 min。回收107~108细胞。 2.  每2×107细胞用约10 ml 37℃的短时间标记培养基在圆锥型试管中洗涤,于室温300 g 离心5 min 回收细胞,小

蛋白质生物合成的抑制剂

蛋白质生物合成的抑制剂 许多蛋白质生物合成抑制剂具有高度专一性,这对于研究合成机制很重要。许多临床有效的抗生素是通过特异抑制原核生物的蛋白质合成而发挥作用的,它们抑制细菌生长而不损害人体细胞。利用两类生物蛋白质合成的差异,可以找出治疗细菌感染引起的疾病的药物。表中列出一些较为重要的蛋白质生物合成抑制

蛋白质生物合成的抑制剂

蛋白质生物合成的抑制剂 许多蛋白质生物合成抑制剂具有高度专一性,这对于研究合成机制很重要。许多临床有效的抗生素是通过特异抑制原核生物的蛋白质合成而发挥作用的,它们抑制细菌生长而不损害人体细胞。利用两类生物蛋白质合成的差异,可以找出治疗细菌感染引起的疾病的药物。表中列出一些较为重要的蛋白质生物合成抑制

关于生物蛋白质的充分-条件介绍

  要使蛋白质具有活性,多肽链要进行修饰、加工等,还要进行折叠具有一定的空间结构。  刚合成的多肽链是没有生物活性的。  蛋白质的结构可以分为四个等级。  一级结构:构成蛋白质的单元氨基酸通过肽键连接形成的线性序列,为多肽链。  二级结构:一级结构中部分肽链的弯曲或折叠产生二级结构。  三级结构:在

生物样品蛋白质的常用分离技术

(1)加热法当待测组分热稳定性好时,可采用加热的方法将一些热变性蛋白质沉淀。加热温度视待测组分的热稳定性而定,通常可加热到90℃。蛋白质沉淀后可用离心或过滤除去,这种方法最简单,但只能除去热变性蛋白质。(2)盐析法利用不同蛋白质在高浓度的盐溶液中溶解度不同程度的降低来沉淀除去蛋白质。在低盐浓度下,蛋

生物物理所揭示白藜芦醇促进去乙酰化酶SIRT1酶活性机制

  6月15日,美国Genes & Development 杂志发表了中国科学院生物物理研究所许瑞明研究组关于白藜芦醇促进去乙酰化酶SIRT1酶活性作用机制的最新研究进展,标题为Structural basis for allosteric, substrate-dependent stimulat

重要次生代谢产物合成调控与植物抗逆研究取得系列进展

近日,中国科学院东北地理与农业生态研究所,在蛋白翻译后修饰调控植物次生代谢产物合成,以及植物逆境胁迫适应方面取得系列进展。研究团队在药用植物丹参次生代谢调控研究中取得成果。科研人员通过整合代谢组、蛋白质组与磷酸化蛋白质组学分析,解析了丹参不同器官中丹参酮类成分积累与蛋白质表达谱的关联,鉴定出丝裂原活

上海药物所发现赖氨酸丙二酰化的新蛋白修饰及其调控酶

  蛋白翻译后修饰是调控诸多生物学过程和疾病的主要生物学通路之一,因而,蛋白翻译后修饰通路研究正成为目前新药研发的重要热点之一。近日,中科院上海药物研究所联合美国芝加哥大学Ben May癌症研究所赵英明教授实验室建立的中科院上海药物所化学蛋白质组学研究中心发现了细胞中赖氨酸丙二酰化的新蛋白修饰及