我国构建近海生物DNA条形码数据库满足科研需求
科技部18日透露,通过科技基础性工作专项部署了“我国近海海洋生物DNA条形码资源库构建”重点项目,具体由中国科学院海洋研究所承担。根据不同类群的特点,项目将选择有代表性的重要海洋生物类群,如原核生物、植物、浮游动物、大型底栖无脊椎动物及鱼类等,在准确形态鉴定的基础上,系统并规模化地获取DNA条形码序列。 我国海洋生物资源丰富。当前海洋经济发展和海洋科学研究亟需对我国海洋生物多样性进行充分认知,对物种的准确识别是其中基础性的工作。 专家们认为,目前我国专业的海洋生物分类学研究团队规模有限,依靠传统经验为主的海洋生物形态鉴定方法无法满足日益增长的海洋科研、海洋经济和管理的需求。DNA条形码是一种新兴的物种快速准确鉴定的方法。DNA条形码资源库作为一个资源统合与共享的平台,其构建迫在眉睫。 据项目首席科学家李新正研究员介绍,本项目通过DNA条形码资源库的构建,可为海洋生态学、海洋分类学和海洋生物分子系统学研究提供基......阅读全文
纳米孔测序和DNA“条形码”相结合-一次检测数十种生物标志物
英国帝国理工学院的科学家与牛津纳米孔技术公司合作研制出一种新方法,可同时分析数十种不同类型的生物标志物,改变了对心脏病和癌症等疾病的检测,从而让临床医生收集到有关患者疾病的更多信息。研究成果25日发表在《自然·纳米技术》杂志上。 目前,许多疾病是通过血检来诊断的,血检能寻找一种生物标志物(例如
实蝇种类DNA条形码快速侦检技术研究项目通过成果鉴定
会议现场 受国家质检总局科技司委托,四川检验检疫局组织专家于1月7日对中国科学院成都生物研究所和四川检验检疫局联合完成的“实蝇种类DNA条形码快速侦检技术研究”成果进行了鉴定。 该项目以实蝇科20种重要的检疫性实蝇为代表,通过测定样品实蝇的DNA条形码序列,利用
2008中国真菌DNA条形码系统建设研讨会召开
一场给所有物种派发“身份证”的分类学革命 在超市的收银台前排队等候结账是一件无聊的事情,但如果没有条形码,你可能会感到更加无聊。现在,几乎所有超市的商品上都印有不同的条形码。利用光学识别系统,可以很容易地把保存在这种条纹图案上的信息阅读出来,加快顾客结账的速度。不久的将来,生命科学家会给每种生物派
华南植物园鼎湖山植物DNA条形码研究获进展
日前,中科院华南植物园研究人员在鼎湖山木本植物DNA条形码研究方面取得重要进展。相关结果在线发表于《多样性及其分布》上。 DNA条形码技术是一种利用标准的简短基因片段来实现物种快速识别的工具。动物界,线粒体COI基因应用非常成功。但是在植物界,由于进化历史复杂,标准条形码还没有达成共识。 针
植物生物学研究数据库
实验概要植物生物学研究数据库实验步骤http://bioinf.scri.sari.ac.uk/cgi-bin/plant_snorna/home 英国 Top 植物种的snoRNA基因数据库。 综合 http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plant
DNA数据库:游走在科学与伦理的边缘
你可以抛弃你的电脑,并留下你的手机在家里,但你不能逃脱你的DNA,因为他是属于你的唯一特征,但是现在它被越来越多的贡献给了某些政府当局。 世界各国当局政府打着打击恐怖主义和犯罪的旗号,正在搜集数以百万计公民的遗传信息。以美国为代表,最高法院近期就备份了许多被捕嫌疑人的DNA数据信息。英国警
植物DNA条形码研究项目2010年度会议在昆明召开
会 场 中国科学院大科学装置开放研究项目—依托种质资源库的植物DNA条形码研究年度进展会议于8月12日至13日在中国科学院昆明植物研究所召开,其间还举办了第二期“植物DNA条形码技术培训班”。来自中科院昆明植物研究所、中科院植物研究所、中科院华南植物园、中科院武汉植物园、中科院
科学家在种子植物DNA条形码研究方面取得重要进展
DNA条形码(DNA Barcoding)是利用标准基因片段对物种进行快速和准确鉴定的新技术。加拿大科学家Paul Hebert等于2003年提出这一概念后,DNA条形码已成为生物学领域发展最迅速的学科前沿之一。线粒体细胞色素C氧化酶基因CO1由于其引物通用性高、长度合适、进化速
第四届国际DNA条形码大会在澳大利亚召开
11月28日至12月3日,第四届国际DNA条形码大会在澳大利亚阿德莱德召开,来自全球61个国家和地区的479位代表参加了本次会议。本次会议由生命条码联盟(CBOL,即the Consortium for the Barcode of Life)和澳大利亚阿德莱德大学共同主办。本届会议我国
摸清生物资源家底我国将建红树林基因库
由中国科学院南海海洋研究所牵头承担的“红树林生物资源调查与重要种类DNA条形码库构建”项目近日在广州启动。该项目意在摸清我国红树林生物资源和重要种类基因资源“家底”,为我国的红树林研究、保护与管理以及资源可持续发展提供科学依据和基础数据。 项目将完成浙江福建红树林生物资源调查、红树林生物资源D
摸清生物资源家底--我国将建红树林基因库
由中国科学院南海海洋研究所牵头承担的“红树林生物资源调查与重要种类DNA条形码库构建”项目近日在广州启动。该项目意在摸清我国红树林生物资源和重要种类基因资源“家底”,为我国的红树林研究、保护与管理以及资源可持续发展提供科学依据和基础数据。 项目将完成浙江福建红树林生物资源调查、红树林生物资源D
全球首个冰川微生物数据库
青藏高原被称为世界“第三极”和“亚洲水塔”。除南北极外,它是全球最大的冰川分布区,现有冰川2万条以上,面积超过2万平方公里,也是我国及亚洲20亿人赖以生存的十多条大江大河的源头。青藏高原冰川是微生物的天然存储器,封存了不同历史时期的微生物。 现在,中国科学家构建的
“依托种质资源库的植物DNA条形码研究”取得阶段性进展
4月20日,中科院组织有关专家对昆明植物研究所李德铢研究员主持的中国科学院大科学装置开放研究项目“依托种质资源库的植物DNA条形码研究”的进展进行了评议。该项目从2009年开始运行,目前已取得下列阶段性成果。 通过项目的实施,联合了来自全国22个科研院所和高校的60余人的植物
各种模式生物必需基因在线数据库
Essential Genes are the genes that are indispensable to sustain cellular life. The functions encoded by essential genes are considered as a foundation
中国BIGD跻身国际生物组学数据库
测序技术的发展将生命科学领域带入组学时代,海量的数据产出成为常态。组学是将基因、蛋白及代谢物等生物分子以整体为单位进行系统性的研究,基因组学、蛋白质组学和代谢物组学等相应产生。相较于此前以个体为单位的研究,组学最主要的特征就是大数据。随着组学数据的产出,搭建组学数据库,实现海量信息的存储、整合及
动物所支持使用通用CO1基因片断开展动物DNA条形码研究
DNA条形码研究的核心是采用某一基因片断用于物种鉴别。在对动物的研究工作中,目前主要是采用线粒体细胞色素氧化酶1(CO1) 5’端约650bp左右的区域。但是该片断的选用没有充分的依据表明它的效力,并且有证据表明它不能很好的识别某些类群的物种。因此,中科院动物研究所科研人员基于真哺
DNA条形码迅速成为生命科学领域研究的前沿学科之一
DNA条形码(DNA Barcoding)最早由加拿大皇家学会会员Paul Hebert等于2003年提出,已迅速成为生命科学和生物技术领域研究的前沿学科之一。DNA条形码是利用标准的基因片段对物种进行快速鉴定的技术。随着全球气候变化、环境问题和能源问题的加剧,人类为实现可持续发展
加拿大开发出DNA条形码融合技术-实验效率可提高10倍
据最新一期《分子系统生物学》报道,加拿大研究人员开发出一种新技术,可将DNA(脱氧核糖核酸)条形码拼接在单个细胞内,以同时搜索数以百万计蛋白质对之间的相互作用。 近年来,DNA条形码技术使科学家开展高并行试验(许多不同类型的细胞在同一试管内进行试验)成为可能,而新一代DNA测序技术的发展,进一
近海沉积物微塑料污染特征及生物富集规律研究获进展
随着全球塑料产量的不断增多,海洋中塑料垃圾的积累不断增加,导致微塑料(粒径小于5mm的塑料颗粒)在海洋环境中普遍存在。微塑料作为一类新兴海洋污染物,已引起世界各国的广泛关注,近年来召开的联合国环境大会和海洋大会,都将微塑料污染列入全球重大环境问题进行关注。 中国科学院烟台海岸带研究所近海环境
台科研人员参与生命条形码国际研究
中新网消息,台湾“中研院”生物多样性中心与国际生命条形码联盟,18日合作举办“第二届生命条形码国际会议及东亚区域合作会议”,期待未来能够替所有的物种建立身份证。 据台湾《联合报》报道,“中研院”生物多样性中心主任邵广昭表示,东南亚地区生物种类极为庞杂,是一座遗传资源的大宝库;因此这次会议特别
生物样本DNA的提取
DNA的提取DNA主要存在于细胞核中,绝大数以脱氧核糖核蛋白形式存在。以1mol/L氯化钠溶液提取,将得到的脱氧核苷酸核蛋白黏液与含少量辛醇和戊醇的氯仿一起摇荡,除去蛋白质。
2019年科技基础性工作专项微生物领域项目数据集公布
近日,国家微生物科学数据中心发布了由中国科学院微生物研究所、中国人民解放军军事科学院军事医学研究院、中国科学院海洋研究所等单位牵头的2019年科技基础性工作专项微生物领域项目数据集,所有公开数据通过国家微生物科学数据中心门户对国内外科学家共享(www.nmdc.cn)。此次共开放数据集107个,
融智生物发布全球首个商用化生物组学微生物质谱数据库
近日,融智生物宣布建设完成基于全新生物组学理念的微生物质谱数据库。这是全球首次发布商品化生物组学微生物质谱数据库。 传统上,基于不同的细菌或真菌内蛋白组成分特别是核糖体蛋白有显著的差异,对核糖体蛋白组的质谱测试,可用于快速、高准确度鉴定微生物。基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TO
我国首个蜻蜓综合性参考数据库建立
蜻蜓目是现存最古老的飞行昆虫类群之一,也是重要的环境指示物种。中国作为全球蜻蜓物种多样性最高的国家之一,已记录蜻蜓超过900种,其丰富的类群与独特的地理分布,在生物多样性研究与生态保护中具有重要意义。长期以来,国内缺乏系统性整合形态、生态、分布与分子数据的蜻蜓专题数据库,制约了蜻蜓大尺度生态演化研究
动物所研发出面向DNA数据库的物种界定规程
公共DNA数据库中包含很多生物类群,为系统学提供了大量数据来源。目前,基于分子数据的物种鉴别和界定工作已经逐步开展。现代测序技术的飞速发展,带来了海量分子数据的同时,也导致很多研究人员无法为相关数据提供准确的分类学信息。这些分类信息不够完整的分子数据,阻碍了在物种一级水平上开展精细的数据挖掘。同
全球最大的海洋微生物组数据库建立
9月4日,《自然》在线发表中外科学家的合作成果,该成果建立了全球最大的海洋微生物组数据库,从中发掘塑料降解酶、基因编辑工具、抗菌肽等重要基因资源。山东大学微生物技术国家重点实验室教授李盛英为文章共同通讯作者,助理研究员刘琨为文章共同第一作者。该成果在《自然》报道 山东大学供图微生物已在生物制造、
全球最大的海洋微生物组数据库建立
9月4日,《自然》在线发表中外科学家的合作成果,该成果建立了全球最大的海洋微生物组数据库,从中发掘塑料降解酶、基因编辑工具、抗菌肽等重要基因资源。山东大学微生物技术国家重点实验室教授李盛英为文章共同通讯作者,助理研究员刘琨为文章共同第一作者。 微生物已在生物制造、生物医药、生物农业、环境治理等
全球最大数字微生物数据库建成
来自爱尔兰、法国和意大利的科学家携手,成功构建了全球最大的数字微生物库——“阿波罗”(APOLLO)。“阿波罗”囊括了247092个计算模型,其中包含迄今为止最全面的人体微生物组计算模型,有望增进科学家对人体微生物组及其对健康影响的理解。相关论文发表于最新一期《细胞系统》杂志。 研究团队重点关
天然产物与生物来源图谱数据库NPBS-Atlas发布
据统计,超过50%的上市小分子药物均直接或间接源自天然产物或其化学结构启发。这些由植物、动物、微生物在亿万年进化中淬炼出的天然分子,拥有人工合成难以企及的复杂结构与强大生物活性,是创新药物发现的源泉。近日,中国科学院上海有机化学研究所发布了天然产物与生物来源图谱数据库——NPBS Atlas。NPB
近海污染监测的新模式
“‘通量监测、区域治理’是国内外都没有的新的监测与管理方法,有望成为解决我国海洋环境污染顽症的有效方法。”近日由中国海洋大学教授赵进平和国家海洋环境监测中心主任关道明撰写、海洋出版社出版的《“通量监测、区域治理”——近海污染监测的新模式》一书,详细分析了我国海洋环境污染的现状和问题,创新性地提出