中科院院士贺福初:大发现时代的“生命组学”

纵观自然科学史,我们常常可以看到“厚积薄发”的现象:当人类对某个领域的认知积累到一定程度时,必然会出现一个甚至数个划破历史长空的科学巨星,他(们)促使重大发现蜂拥而至、喷薄而出,促使一个或多个相关学科呈现爆发式成长,乃至革命性突变,如此该学科可谓进入了“大发现时代”。 A 自然科学史上的若干“大发现时代” 人们对于自然科学的了解和学习大多从数学开始,近代许多重大突破,都是基于数学的发展。古希腊毕达哥拉斯学派的突出贡献,开启了自然科学的第一个大发现时代。该学派最早证明了勾股定理,提出了奇数、偶数、质数、亲和数、完全数等概念,他们发现:算术的本质是“绝对的不连续量”,音乐的本质是“相对的不连续量”,几何的本质是“静止的连续量”,天文学的本质是“运动的连续量”。在此基础上,该学派提出“数即万物”学说。 地理学的“大发现时代”爆发于短短的40年,却影响了世界数百年的格局。十五、十六世纪之交,以地球说为理论指导,借助......阅读全文

破译蛋白质组-打开生命“解剖图”

 据新一期英国《自然》杂志报道,人类蛋白质组组织前主席约翰·伯杰龙发起一项大规模的破译人类蛋白质组计划,目标是花费约10年时间将人体所有蛋白质归类并描绘出它们的特性,并揭示它们在细胞中所处的位置以及每种蛋白质与其他哪些蛋白质存在相互作用。 早在上世纪90年代,科学家就已经启动了基因组计划,并经过1

北京基因组所生命组学数据资源建设获进展

  近日,中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心团队题为The BIG Data Center: from deposition to integration to translation 的研究论文被国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表。该研究成

基因组学推动生命科学大步向前

  2010年下旬,河南安阳曹操墓真伪之辩正酣。而一则来自上海的重磅消息更是引发了多方关注。复旦大学现代人类学教育部重点实验室宣布,向全国征集曹姓男性DNA样本,拟用基因组科学的手段验证出土的头骨是否为曹操本人。   一下子,基因组科学成为热门,这一话题“落入寻常百姓家”。   事实上,伴随着2

细胞遗传学——比较基因组杂交(CGH)

·         Comparative Genomic Hybridization (CGH) CGH is a molecular Cytogenetic method of screening a tumor for genetic changes. The alterations are

全新角度探索生命奥秘:脂质组学

  血浆中约70%的代谢物是脂类,脂类代谢是动植物的第一大类代谢。加上质谱法的广泛应用,大大加速了脂质组学的发展,脂质组学已成为代谢组学中最为活跃的研究领域之一。  万事万物都存在着辩证,尽管我们对高血脂深恶痛绝,心痛它对我们身体的摧残。但脂质却又是人体无法舍弃的重要组成,少了它,生命将一团乱麻以至

脂质组学:全新角度探索生命奥秘

  血浆中约70%的代谢物是脂类,脂类代谢是动植物的第一大类代谢。加上质谱法的广泛应用,大大加速了脂质组学的发展,脂质组学已成为代谢组学中最为活跃的研究领域之一。  万事万物都存在着辩证,尽管我们对高血脂深恶痛绝,心痛它对我们身体的摧残。但脂质却又是人体无法舍弃的重要组成,少了它,生命将一团乱麻以至

空间转录组学开启生命科学基因研究的3D模式

  近来单细胞组学研究的发展使生命科学研究步入更加微观的层面。对单个细胞基因功能的了解不仅刷新了我们对组成组织的细胞类型的发现,也让我们对组织中的细胞功能和互作机制有了全新认识。但是,需要将新鲜组织进行单细胞解离,需要足够活性的细胞进行实验,这些要求使得很多研究在一开始就被拒之门外。另外,虽然通过数

空间转录组学开启生命科学基因研究的3D模式

近来单细胞组学研究的发展使生命科学研究步入更加微观的层面。对单个细胞基因功能的了解不仅刷新了我们对组成组织的细胞类型的发现,也让我们对组织中的细胞功能和互作机制有了全新认识。但是,需要将新鲜组织进行单细胞解离,需要足够活性的细胞进行实验,这些要求使得很多研究在一开始就被拒之门外。另外,虽然通过数据还

组织学——显微解剖

Laser Capture Microdissection (LCM)Introduction to LCM  (BJMU)  Preparation, LCM and RNA/DNA extraction of Frozen Tissue Sections (NIH Laser Capture M

Nature发布单细胞基因组学新技术

  胚胎是如何形成我们肺脏、肌肉、神经和其他组织中的细胞的?一种新的方法可以解码使得胚胎万能细胞能够增殖并转变为机体许多特化细胞类型的遗传指令。   一开始是一团相同的细胞,随着增殖不断地改变形状和功能,最终变为我们肺脏、肌肉、神经和机体所有其他特化组织中的细胞。胚胎拥有这种创造奇迹的能力。  

《细胞》特辑:联接组学

  “Cell Press Selections”是由Cell出版社推出的一份推荐文章集合手册,主要介绍某个生命科学研究领域最新的进展及突出成果。相关特辑内容包括研究论文,评论性文章以及snapshots,涉及了同一领域的方方面面,更为重要的是这些文章由赞助商赞助,可以免费获取。  所谓联接组学(c

利用植物表型组学挖掘基因组学的成果

到2050年,全球人口将达到97亿,预计作物产量翻一番才能满足全球人口的粮食需求。为了达到这一目标,作物产量需每年增长2.4%,但目前作物产量平均增长率仅为1.3%。作物生产性能的遗传改良仍然是提高作物生产力的关键因素,但当前的改善速度无法满足可持续性和粮食安全的需要。为了确保粮食安全、生态系统的可

人体解剖学空间图谱-(SAHA)-项目——探索新细胞类型

  对宇航员的样本进行测序让威尔康奈尔医学院的克里斯梅森开始从天文学角度思考。 现在,他正在尝试进行与发现新行星相同的生物学研究——发现新的细胞类型。  就像通过与其他行星或恒星的引力相互作用发现行星一样,空间组学技术使研究人员能够“第一次看到相互作用以挑选出新型细胞”或功能改变的细胞,这些细胞实际

Nature论述:单细胞基因组学揭开“免疫新世界”

  人类对生命的好奇,从来没有减退。一个多世纪以来,科学家们一直试图解析构成我们机体的成千上万亿个细胞,从一米长的神经元到8微米宽的红细胞。他们希望从中找到解析重要生理、病理过程,挖掘重要的细胞类型和信号通路。  但是,过去几十年,包括荧光抗体标记技术、DNA和RNA测序技术等在内的研究工具却不能解

单细胞基因组学:通往个体化医疗之门

  随着第二代测序技术的普及,单细胞测序迎来了迅猛发展。  近日,南方科技大学生物学系副教授贺建奎在美国冷泉港参加了单细胞分析会议后,在科学网博客里写道:“这是一个非常令人激动的前沿学术会议,我深深地体会到了单细胞基因组学时代的来临。”  他对《中国科学报》表示:“单细胞基因测序技术的突破,只是开了

新产品前瞻-空间转录组学开启生命科学基因研究的3D模式

  近来单细胞组学研究的发展使生命科学研究步入更加微观的层面。对单个细胞基因功能的了解不仅刷新了我们对组成组织的细胞类型的发现,也让我们对组织中的细胞功能和互作机制有了全新认识。但是,需要将新鲜组织进行单细胞解离,需要足够活性的细胞进行实验,这些要求使得很多研究在一开始就被拒之门外。另外,虽然通过数

宏基因组测序揭示神秘的生命领域

  生物通报道:美国国家能源部Lawrence Berkeley实验室和加州大学伯克利分校的研究人员采用科罗拉多蓄水层的沉积物和地下水样本,通过宏基因组测序重建了二千五百多个微生物的基因组。这项研究发表在十月二十四日的Nature Communications杂志上,为人们揭示了地下世界惊人的生物学

解码基因组“暗物质”,拓宽生命认知疆域

  人类约有2万个基因,仅占DNA的2%,剩下的98%是什么?这些区域如同基因组中的“暗物质”,有待科学家去发现。非编码RNA(核糖核酸)是基因组“暗物质”中的一类重要分子,最近十几年才被发现。它们不仅在生命活动中发挥功能,还与许多疾病息息相关。  作为国际上较早从事长非编码RNA研究的科学家之一,

宏基因组测序揭示神秘的生命领域

  美国国家能源部Lawrence Berkeley实验室和加州大学伯克利分校的研究人员采用科罗拉多蓄水层的沉积物和地下水样本,通过宏基因组测序重建了二千五百多个微生物的基因组。这项研究发表在十月二十四日的Nature Communications杂志上,为人们揭示了地下世界惊人的生物学多样性,给生

整合基因组和组织学信息-基因组学公司联手开拓新前沿

  10x Genomics公司宣布收购位于瑞典斯德哥尔摩的Spatial Transcriptomics公司。Spatial Transcriptomics公司是空间基因组学(spatial genomics)领域的领先公司。空间基因组学是一个新兴领域,它不但让研究人员可以获得单细胞内的基因组数据

美印药物基因组学与癌症基因组学检测商业化

美国Companiondx实验室拟与健康信息技术服务商Enable Healthcare合作,向医生推广药物基因组学检测;印度癌症医学公司HCG宣布建立一个新的肿瘤基因中心,旨在下代测序技术能够帮助定位肿瘤,从而提高化疗和放疗的效率和响应率  美国药物基因组学检测商业化  Companiondx实验

贺福初院士:“生命组学”研究模式已现端倪

  近日,来自军事医学科学院、北京蛋白质组研究中心的贺福初院士介绍了生命科学领域的“大发现时代”,指出集多种组学之大成的“生命组学”研究模式已现端倪,大发现时代将如影随形。相关论文发表在《中国科学: 生命科学》2013年第一期。  自然科学史表明,当人类对某一领域的认知积累到一定程度时,常

第一届生命组学与精准医学大会

    大会主题:   生命组学与精准医学,从基础研究到临床应用  精准医学在出生缺陷防控领域的前沿进展  精准医学在肿瘤精准检测领域的前沿进展  精准医学在微生物快速检测领域的前沿进展  创业投资助力精准医学发展  基本信息:  会议报到:2015年12月11日全天 

聚焦生命组学与精准医学大会-引领未来-共享精彩

  邀请函  大会背景  精准医学是对现有医疗模式的革新和革命,本质上是通过基因组、蛋白质组、代谢组、糖基组、分子成像等组学技术,精确寻找到疾病的原因和治疗的靶点,为患者提供更具有针对性和有效性的治疗措施,最终实现精准治疗。在中国,精准医疗已被列入“

Science专题:癌症基因组学

  在2001年完成人类基因组测序后,许多的研究人员立即将目光放到了利用这些信息来更好地了解遗传学上。最近,越来越多的研究确定了表观遗传学在癌症的发生、形成及发展过程中起效应。从鉴别与遗传性癌症相关的单基因变异的前基因组时代转向,测序技术的进步使得研究人员能够利用全基因组方法来检测基因组间的差异,以

毒理基因组学的定义

毒理基因组学(toxicogenomics)是从多基因、全基因组水平研究毒物作用与基因表达的相互影响。其研究内容主要包括3个方面:促进环境应激原与疾病易感性关系的理解、阐明毒性分子机制、筛选和确认与疾病和毒物暴露相关的生物标志物(biomarkers)。

药物基因组学的定义

药物基因组学(pharmacogenomics),又称基因组药物学或基因组药理学,是药理学的一个分支,定义为在基因组学的基础上,通过将基因表达或单核苷酸的多态性与药物的疗效或毒性联系起来,研究药物如何由于遗传变异而产生不同的作用。

细胞核重编程与癌症基因组学论坛召开

  近日,由《自然—遗传学》杂志主办、中科院广州生物医药与健康研究院承办的“细胞核重编程与癌症基因组学”论坛在广州召开。  据了解,在干细胞研究中,诱导多能干细胞的重编程是该领域最受关注的问题之一。目前,干细胞研究和肿瘤研究存在很多交叉。将这两个领域的研究结合起来,有利于更好地使再生医学得以应用并辅

PNAS:-融合基因组学揭示横纹肌肉瘤细胞起源

  基因融合一直被认为是肿瘤独有的特征。基因融合是指染色体上两个异位的基因嵌合在一起,由于染色体发生易位、缺失或者倒置造成的,通常在癌症的发生发展扮演着重要的角色,并且可以作为诊断和治疗癌症的靶标。基因融合现象最早在慢性粒细胞白血病中发现 BCR-ABL基因融合(费城染色体)。除血液系统肿瘤外,在实