微生物组测序分析的一大问题
BMC Biology杂志上的一项研究指出，许多已发表的微生物组研究其实受到了污染，错误的报告了来自于环境的杂菌。研究人员认为，在临床样本中检测到出人意料的细菌时，不应过早将其于疾病联系在一起。 我们机体内生活着不计其数的微生物，它们组成的生态系统就是微生物组。微生物组参与了许多重要的机体功能，比如消化食物、合成营养物质和抵御疾病。就算在微生物数量较少的机体区域，菌群改变也被认为与疾病的发展有关，比如肺部的慢性阻塞性肺病和哮喘。 日新月异的DNA测序技术推动了微生物组研究的快速发展。然而，Wellcome Trust Sanger研究所的科学家们发现，DNA提取试剂盒、化学试剂和实验室环境中的杂菌很容易造成污染，影响微生物组分析的结果。 研究人员发现，没有污染的话对照样本应该只有一种菌，但有时却出现了270种不同的细菌。与高生物量的样本相比（粪便样本），来自血液或肺部的低生物量样本尤其容易受到污染。 “现在的DNA测......阅读全文
熟食更易被致病微生物污染
市场上烹饪好的熟食、卤味、半成品等食物在目前也是很受年轻人的喜欢，方便快捷美味，但是这些食物也存在着很多食品安全隐患。霍尔德仪器建议现吃现烹，尽量少吃散装卤味等熟食制品。 因为气温高时，卤制的肉类和豆干等室温易变质走味儿，即使在冰箱内过夜，也很容易被霉菌、致病菌类“盯上”。 同时食材中微生物
微生物污染的预防措施
预防微生物的污染主要是通过减弱或消除微生物污染食品的各种因素和机会来实现的。要减弱或消除微生物污染,就要在原材料的收集、前处理、加工、运输及贮藏等各个环节严格控制,加强环境卫生的管理,从生产的环境、设备和工作人员等各个方面尽可能减少徽生物污染食品的机会,防止微生物污染食品。食品原料在加工前,不论是动
传统检测微生物污染的方法
通过对水系统中微生物限度的在线监控，以实现对制水系统的过程控制，通过合理制定消毒清洗周期，最大限度地提高水系统的利用率，从而达到降低生产成本的目的；通过微生物结果实时反馈的特点，可快速排查水系统中出现的问题，并对解决方案进行现场验证，提高对于偏差的响应速度，降低生产风险。 产品简介：
微生物污染对生活的危害
①加强卫生宣传:告诉群众,不吃不清洁的食物。凡是肉、鱼、蛋等食品均应充分煮熟后食用。 ②搞好厨房卫生:要经常打扫干净,夏季应有防蝇设备,积极消灭老鼠、苍蝇、蟑螂等。 ③不用生粪对蔬菜施肥。蔬菜食用前必须用清水洗净, 最好熟食。夏季吃生冷蔬菜及瓜、果时均应洗净,最好用开水烫过。剩余的隔餐饭菜,特别是肉
增城新塘镇污染严重－泥样本中镉超标128倍
洗水车间排出略带牛仔蓝的深色污水，污水流经栅栏时，较大的悬浮物被截留；进入沉砂池、筛网过滤池进行再次过滤后，先后进入调节池、厌氧池、耗氧池、沉淀池、氧化塘，至此原本令人作呕的污水终于达到“标准”，再经过处理后可供给洗水车间循环使用。 这是牛仔裤洗水污水在广州创兴服装集团有限公司（以下简称创兴集
后微生物组时代－首次发现人体特有的病毒组
我们人体中的病毒会影响微生物群体的结构和行为，但是关于身体许多区域的噬菌体，也就是感染细菌的病毒，科学家们所知甚少。近期一组研究人员发现，在膀胱中整合进细菌基因组的是噬菌体要比细菌本身多得多，这项出乎人意料的研究发现公布在1月29日的the Journal of Bacteriology杂志上。
美推出国家微生物组计划
美国政府日前发起一项新的努力，研究在人体和整个生态系统中茁壮成长的数量巨大且大部分不可见的微生物组，旨在推进对微生物世界的认知，从而在卫生保健、食品生产和环境恢复等领域有所应用。 白宫发表的一份声明指出，多年来，美国政府一直在微生物组领域投资，且近年来力度不断增加。2014财年的联邦投资是20
中国微生物组研究期待新突破
在这个广袤的世界上，存在无数各种各样的微生物，但我们对微生物了解很少，甚至不知道在我们周围有什么样的微生物。世界上所有的哺乳动物和鸟类，几乎已经全部被认知，而我们认知的微生物还不到1%。要知道，我们每个人体内都有大量微生物，一个100斤重的人，体内大约有1.5斤的微生物，它们在我们体内发挥着什么作用
Nat－Commun：微生物组的可靠“时钟”
尽管人类微生物组在过去几年中受到了人们的广泛关注，但一直以来难以观察其在各种刺激下随时间变化的情况。最常见的分析方法是从粪便样本中提取细菌，然后对它们的基因组进行测序，但是这种方法会丢失肠道中细菌的位置和时间等关键信息。 如今，来自哈佛大学的研究人员创建的一种新工具提供了解决此问题的方法，他们
微生物组研究：关乎人类的未来
当人类第一次认识到微生物的存在时，并不知道这种个头微小的生命体是地球生态系统的基石、关系人类健康的重要因素——它不仅将极大地帮助人类克服当今所面临的生存挑战，还能提供人类未来生存之道。如今，人类基因组的神秘面纱已渐渐揭开，微生物组又成为各国生命科学竞争的焦点，纷纷启动微生物组研究计划。科学家们呼吁，
人类微生物组影响健康机制揭秘
英国《自然》杂志8月31日发表的一篇生物学论文称，美国科学家发现，肠道菌群会产生名为N-酰基酰胺的小型有机复合物，它们与受体相互作用，参与人体生理的包括免疫等各方面活动，而这正是人类微生物组影响生理健康的背后机制。 科学家已经意识到，人类基因组并不能完全解释人类疾病与健康的关键问题，因为人类对
Nature：皮肤微生物组与免疫应答
皮肤是机体和环境接触的主要界面，也是无数微生物的家园，这些微生物组成的复杂生态系统被称为皮肤微生物组。 美国国立过敏与传染病研究所（NIAID）领衔的研究团队，在一月五日的Nature杂志上发表文章指出，皮肤微生物组能够显著影响机体的免疫力。 皮肤上共生的微生物群体有着很高的多样性，这个群体
中国微生物组计划：机遇与挑战
微生物组是指一个特定环境或者生态系统中全部微生物及其遗传信息，包括其细胞群体和数量、全部遗传物质（基因组），它界定了涵盖微生物群及其全部遗传与生理功能，其内涵包括了微生物与其环境和宿主的相互作用。微生物组学是一个崭新的学科，微生物组研究取得的成果，必将为国家经济社会发展、人类生活质量改善提供源源
用于微生物组研究的人造肠道
微生物存在于人体、植物、土壤、海洋等各种环境中，这些微生物群落的集合被称为微生物组。近年来，微生物组研究成为一个热门，去年10月份，Science和Nature两大期刊同时发文，倡议开展浩大的微生物组研究，以理解和利用微生物组——栖息在多种多样生态系统（如人类肠道和海洋）的微生物群落，来改善人类
微生物组研究：关乎人类的未来
当人类第一次认识到微生物的存在时，并不知道这种个头微小的生命体是地球生态系统的基石、关系人类健康的重要因素——它不仅将极大地帮助人类克服当今所面临的生存挑战，还能提供人类未来生存之道。如今，人类基因组的神秘面纱已渐渐揭开，微生物组又成为各国生命科学竞争的焦点，纷纷启动微生物组研究计划。科学家们呼吁，
肠道细胞利用microRNAs控制微生物组
生物学前沿之一就是谈论操纵我们的肠道微生物组（microbiome）。这听起来像一个大胆的想法，但它看起来像是我们可能一直就在修改我们的微生物组，甚至都没有意识到这一点。一篇新的来自美国哈佛大学医学院的Howard Weiner、Shirong Liu及其研究团队的论文提示着
肠道微生物组进展一览
本期为大家带来的是肠道微生物相关领域的研究进展，希望读者朋友们能够喜欢。 1. Nutrition Reviews：饮食对肠道菌群的影响 DOI: 10.1093/nutrit/nuz106 根据乔治华盛顿大学（GW）和美国国家标准研究院（National Institute of Sta
组培培养室的污染原因分析
目前，组培培养室广泛应用于科研单位和花木生产企业中，是生物技术应用中，重要的仪器或环境之一，但是近年来发现，虽然组培技术应用比较多，但是组培培养室培苗的数量和质量都没有得到较大的提高，究其原因，我们发现，其中一个最大的影响因素就是组培培养室的污染。实际应用中，组培培养室的污染原因主要包含以下几个方面
从鼠尾或其他小样本中制备基因组DNA
这一简单的实验方案在成百上千的实验室被广泛应用于转基因或基因剔除小鼠的基因型鉴定以及从小量培养的细胞或组织块中提取 DNA。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理这一简单的实验方案在成百上千的实验室被广泛应用于转基因或基因剔除小鼠的基因型鉴定以及从小量培养的细胞或组织块中提取
从鼠尾或其他小样本中制备基因组DNA
实验方法原理 这一简单的实验方案在成百上千的实验室被广泛应用于转基因或基因剔除小鼠的基因型鉴定以及从小量培养的细胞或组织块中提取 DNA。实验材料 蛋白酶 K培养的细胞鼠尾或小鼠组织试剂、试剂盒 乙醇异丙醇酚氯仿异戊醇磷酸盐缓冲溶液SNETTE仪器、耗材 Sorvall 离心机及 H1000B、SH
做代谢组学检测的血液样本怎么采集与前处理
采集：由于生物样本通常采用组内平行样本，不可避免的会由于时间、环境等因素产生“个体差异”，所以在采集动物血液时需要使用麻醉剂以减少采血过程中动物的疼痛感、不适感、创伤性，以减小应激反应造成的代谢物的变化、尽量缩短采集时间、保持一致的采集部位等细节问题；另外也考虑到样本采集或制备的原则和易实现性，操作
从鼠尾或其他小样本中制备基因组DNA
实验方法原理 这一简单的实验方案在成百上千的实验室被广泛应用于转基因或基因剔除小鼠的基因型鉴定以及从小量培养的细胞或组织块中提取 DNA。 实验材料 蛋白
质谱技术在临床微生物样本直接检测中的应用
基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight mass spectrometry, MALDI-TOF MS)是20世纪80年代发展起来的一种新型软电离有机质谱, 作为一
质谱技术在临床微生物样本直接检测中的应用
基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight mass spectrometry, MALDI-TOF MS)是20世纪80年代发展起来的一种新型软电离有机质谱, 作为一种新兴的蛋白质组学
质谱技术在临床微生物样本直接检测中的应用
基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight mass spectrometry, MALDI-TOF MS)是20世纪80年代发展起来的一种新型软电离有机质谱, 作为一种新兴的蛋白
食品微生物污染控制良好操作规范
通过加工控制可确保食品安全，加工控制就是控制食品在加工设施和车间内的流程。 但加工控制必须符合必备的程序，建立在一定的基础上。这包括：卫生、良好操作规范(GMP)、培训、产品回收程序和设备维修保养计划等。这里重点讲卫生和良好操作规范。 确保食品在卫生状态下加工最重要的是卫生操作，
怎样进行食品微生物的污染控制
一、用水分活度、pH、化学物质及包装控制 食品加工可以利用水分活度、pH、化学物质及包装来控制病原体生长。而对食品加工来讲，通过控制病原体所需的营养成分，则难以达到目的，因为除特别情形之外，大多数食品为病原体生长产提供了充足的营养。我们还是集中精力通过水分活度、pH、化学物质及包装
细胞污染过程中常见的微生物污染和预防（三）
6.非同种细胞污染即细胞交叉污染，一般来自细胞建株和细胞传代过程中两种或两种以上细胞之间的混合污染。一种是由于细胞培养操作时各细胞株所需的器材和溶液没有严格分开，往往会使一种细胞被另一种细胞污染，另一种情况则是提取原代细胞时在消化过程中由于剪割的组织块不够纯，消化时间把握不好，容易把杂质细胞消化混入
细胞污染过程中常见的微生物污染和预防（一）
导语你正在细胞科学的海洋愉快遨游，如果有一天，细胞污染忽然跑过来说：“大家好，我是细胞污染~”这时候，科研的小船说翻就翻。今天Esco就同大家浅谈细胞污染，抛砖引玉。体外细胞污染分类: 物理性、化学性、生物性污染。其中生物性污染常见且造成的后果也较为严重，培养的细胞一旦遭到微生物污染，将具有不可逆转
细胞污染过程中常见的微生物污染和预防（二）
念珠菌污染呈链状排列，呈卵圆形散在细胞周边和细胞之间。图5 白色念珠菌污染 常见的细胞污染之一，左侧为倒置显微镜下视图，右侧为革兰氏染色图片，其中，长梭型的是处于分裂期的链珠菌酵母污染很容易观察到，培养物变浑浊，尤其在后期。一般pH值变化很小，严重时，pH值升高。显微镜下呈卵圆形或球形颗粒，有些会芽