微生物组测序分析的一大问题
BMC Biology杂志上的一项研究指出，许多已发表的微生物组研究其实受到了污染，错误的报告了来自于环境的杂菌。研究人员认为，在临床样本中检测到出人意料的细菌时，不应过早将其于疾病联系在一起。 我们机体内生活着不计其数的微生物，它们组成的生态系统就是微生物组。微生物组参与了许多重要的机体功能，比如消化食物、合成营养物质和抵御疾病。就算在微生物数量较少的机体区域，菌群改变也被认为与疾病的发展有关，比如肺部的慢性阻塞性肺病和哮喘。 日新月异的DNA测序技术推动了微生物组研究的快速发展。然而，Wellcome Trust Sanger研究所的科学家们发现，DNA提取试剂盒、化学试剂和实验室环境中的杂菌很容易造成污染，影响微生物组分析的结果。 研究人员发现，没有污染的话对照样本应该只有一种菌，但有时却出现了270种不同的细菌。与高生物量的样本相比（粪便样本），来自血液或肺部的低生物量样本尤其容易受到污染。 “现在的DNA测......阅读全文
北京基因组所实现对大样本全基因组数据的群体遗传学分析
计算基因组学旨在发展理论和方法学，对基因组数据进行数据挖掘、提取信息。其中对遗传多态性，如基因频谱、单倍型结构等进行建模，利用群体基因组水平的遗传变异数据来推断群体的历史和变迁是群体遗传学的核心内容。传统的群体遗传学分析方法通常基于小样本数据，所推断的多为相对古老的历史事件，例如，被广泛应用的L
果树微生物组研究获新进展
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/5/500474.shtm
全球未培养微生物培养组计划启动
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免疫球蛋白－影响肠道微生物组
IgA（免疫球蛋白A）是最丰富的黏膜抗体，动物模型实验表明它可以强化肠道屏障，防止危险细菌破坏宿主。然而，缺乏特异性IgA的人通常只有轻微的症状。法国巴黎免疫与疾病研究中心珍妮·法德拉等科学家，比较了健康个体与缺乏IgA个体的粪便微生物组，发现在缺乏IgA的不同患者中，不同属的细菌占不同的主导地
Gastroenterology：微生物组与肠癌发生的关系
最近，根据来自George Washington大学研究者们在《Gastroenterology》杂志上发表的一项新研究，患有结肠癌的患者体内的一种蛋白突变体阻断了调节细胞增殖和扩张的信号通路，从而增加了促进结肠癌发展的肠道微生物种群，这最终导致肠癌恶化的后果。这些发现表明了微生物组中细菌与结肠
迄今最久微生物基因组草图出炉
英国《自然》杂志日前在线发表的一项演化学研究报告，近乎完整地构建出了一种口腔细菌的基因组，这个有48000年历史的微生物的基因组，是迄今为止历史最悠久的微生物基因组草图，研究同时揭示了尼安德特人的饮食结构。 尼安德特人的DNA序列和现代人类的DNA序列非常相似。他们是现代欧洲人祖先的近亲，从1
肠道微生物组与儿童行为问题有关
一项新的研究表明，有行为问题的孩子的肠道微生物组可能有不同的成分，父母在差异的明显程度方面起着重要作用，值得重视。 肠道微生物很重要 肠道微生物组中至少有400种细菌，数万亿种微生物生活在消化道中，这意味着肠道中细菌的数量比体内所有细胞都要多。肠道中的微生物执行重要功能，包括合成维生素、抵御
生殖健康方向微生物组研究进展
近年来，微生物组学的研究提升了关于身体各部位共生微生物的认识。中国科学院北京生命科学研究院研究员赵方庆团队发现微生物组学或进一步拓展对女性生理和生殖健康方面的认识，并有助于提升治疗水平。 作为人体最主要的菌库之一，阴道菌群及其对女性生理和生殖健康的作用显而易见。作为“生命摇篮”的宫腔像一个黑箱
Nature惊人发现：谁可媲美微生物组
Nature惊人发现：谁可媲美微生物组 来自纽约大学Langone医学中心的微生物学家说，他们获得了第一个强有力的证据证实，天然存在于肠道中的病毒（他们将其称作为“病毒组”（virome））像居住在肠道中、构成“微生物组”（microbiome）的细菌一样发挥了维持健康以及对抗
质疑：肥胖真的与微生物组有关么？
我们体内生活着不计其数的微生物，它们组成的生态系统就是微生物组。近几年人们发现微生物组对人体健康有着重要的影响，微生物组研究因此受到了极大的重视，甚至被称为是人体的“第二基因组”。 研究者们普遍认为微生物组参与了许多重要的生理活动，比如消化食物、合成营养物质和抵御疾病。包括肥胖在内的许多人类疾
抗生素干扰婴儿肠道微生物组
在我们的肠道里，生活着许多微生物群落，它们在调控机体代谢和免疫防御功能上起着关键作用。这些微生物群落的集合被称为肠道微生物组。美国《科学转化医学》杂志6月15日发表的研究结果显示，使用抗生素会降低婴儿肠道微生物组的多样性和稳定性。 在世界大部分地区，对患病婴幼儿用抗生素治疗已成常规做法，美国孩
The－Scientist：肺部微生物组决定你的健康
近年来，肺部微生物组对呼吸道健康的重要性逐渐受到了科学家们的重视。The Scientist杂志特别撰文介绍了这一领域的最新进展。 如果将人类的消化系统看作是从口腔延伸至胃和肠道的一条河流，那么肺就是河流旁的湖泊，常常被湍急的水流波及，密歇根大学的Gary Huffnagle说。Huffnag
北京生科院提出微生物组解析新技术
1月23日，国际学术期刊《自然-通讯》（Nature Communications）在线发表了中国科学院北京生命科学研究院计算基因组学实验室赵方庆团队题为MetaSort untangles metagenome assembly by reducing microbial community
微生物组影响免疫反应复杂化
这项研究今天发表在Journal of Clinical Investigation该研究还表明，这种抗微生物免疫反应可以由免疫细胞对之前与细菌接触的记忆触发，这进一步复杂化了身体接受救命新器官的能力。“以前，我们认为人类器官移植比受保护的实验室动物更不容易被接受的原因是，人类可以在器官细胞上产生交
2025蛋白质组学大会之微生物蛋白质组学
2025年10月14日下午，聚焦于微生物蛋白质组学领域的专题分会场在广州白云国际会议中心107会议室正式拉开帷幕。会议由王恒樑、马庆伟、刘小云、李乐园四位教授召集，现场由刘小云、Paola Roncada教授主持。来自意大利卡坦扎罗“大希腊”大学、比利时根特大学、复旦大学、西湖大学、国家蛋白质科学中
太平洋珊瑚礁微生物样本包括28.7亿遗传序列
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/502069.shtm
MALDITOF－MS在临床微生物样本直接检测中的应用
基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight mass spectrometry, MALDI-TOF MS)是20世纪80年代发展起来的一种新型软电离有机质谱, 作为一种新兴的蛋白质组学检测技
微生物絮凝剂的反应条件优化实验需要多少样本量？
微生物絮凝剂的反应条件优化实验所需的样本量取决于多个因素，包括所研究的因素数量、因素水平、实验设计类型以及对结果准确性和可靠性的要求等。一般来说，如果采用较为简单的实验设计，如单因素实验，每个水平可能至少需要 3 个重复样本。但如果使用更复杂的实验设计，如正交实验或响应面实验，样本量通常会更多。以常
微生物组测序分析的一大问题
BMC Biology杂志上的一项研究指出，许多已发表的微生物组研究其实受到了污染，错误的报告了来自于环境的杂菌。研究人员认为，在临床样本中检测到出人意料的细菌时，不应过早将其于疾病联系在一起。 我们机体内生活着不计其数的微生物，它们组成的生态系统就是微生物组。微生物组参与了许多重要的机体功能
京津塘环境污染调控技术：环境治理的跨界样本
1月10日清晨，北京大雾弥漫，局地能见度不足200米。灰蒙蒙的马路上，大多数汽车亮起雾灯，自觉放慢了车速；不少行人戴上了口罩，或者用围巾捂着口鼻。当日，天津、河北也都相继发布了大雾预警信号。 “随着区域社会经济的快速发展，区域环境质量与生态健康状况正在持续恶化，已成为制约国家实施京津冀都市
鄱阳湖污染样本：纸厂屡罚不改折射产业承接之痛
江西省德安县聂桥镇有一家造纸厂，在未通过环评的情况下，开工生产了十年。废水直接排放博阳河中，博阳河系鄱阳湖的支流，受污染的河水最终注入鄱阳湖。 博阳河下游有个梓坊村，全村千亩葡萄园的灌溉，要从河流中取水，葡萄也受到了造纸厂的污染。不仅如此，村民们的饮用水和生活用水，均受到了不同程度的影
细胞生物基本方法：微生物污染的排除
微生物污染的排除细胞受各种霉菌、细菌和支原体污染后，一般都较难排除或杀灭，其中以支原体更难排除，因此从预防着眼为上。 1） 抗生素除菌法：用BM－1（截耳素衍生物）和BM－2（四环素衍生物）抑制支原体1．抗生素制备：均可用PBS配成250×浓缩液－20℃备用，使用浓度参考《组织培养和分子细胞学技术
细胞培养中微生物污染的排除
细胞受各种霉菌、细菌和支原体污染后，一般都较难排除或杀灭，其中以支原体更难排除，因此从预防着眼为上。1、抗生素除菌法：用BM－1（截耳素衍生物）和BM－2（四环素衍生物）抑制支原体（1）抗生素制备：均可用PBS配成250×浓缩液－20℃备用，使用浓度参考《组织培养和分子细胞学技术》117页表6－2。
吴清平：建议加强食品微生物污染研究
“影响食品安全的有三个因素：微生物因素、化学因素和物理因素，其中，微生物因素的影响需要全过程控制，也是未来我们一定要解决的问题。”全国人大代表、中国工程院院士吴清平在接受《中国科学报》记者采访时说。 吴清平介绍，微生物个体小、繁殖快，受其污染后，即使杀死食物中的微生物，仍会有毒素残留，对人体健
防治污染，让微生物“吃掉”有害气体
常用的生物大气治理技术主要有生物过滤、生物滴滤和生物洗涤3种。与其他有机废气处理技术相比，生物大气治理技术具有安全性好、无二次污染等优点，对处理低浓度或生物可降解性强的有机废气效果较好。 随着我国工业的快速发展，为社会带来了巨大经济利益的同时，也产生了大量有害气体，不但污染了环境，同时影响
微生物修复技术应对土壤农药污染
目前我国每年使用的化学农药量超过130万吨，平均每亩施用931.3克，比发达国家高一倍。然而由于施药技术落后，农药利用率仅为20%-30%左右，70%-80%农药进入土壤和水体，导致土壤和农产品中农药残留污染严重。据中科院南京土壤所及全国各地的环境监测站的检测数据表明，全国受农药污染的农田约16
地球微生物或可污染地外天体环境
导语：地球微生物可污染地外天体环境？据国外媒体报道，外层空间对生命而言是个非常极端的环境，但科学家发现一些顽强的生命能够在外太空生存。而这些微生物可能会污染地外天体环境，导致不清楚地外生命的起源。 据国外媒体报道，地球生命是否能够在外太空存活？外层空间对生命而言是个非常极端的环境，但科学家发
干货|食品中常见18种微生物污染
大肠菌群大肠菌群，它不代表某一个或某一属细菌，而指的是具有某些特性的一组与粪便污染有关的细菌。大肠菌群都是直接或间接地来自人和温血动物的粪便。一般食品中大肠菌群超标，表示食品受动温血动物的粪便污染，其中典型大肠杆菌为粪便近期污染，其他菌属则可能为粪便的陈旧污染。人吃了大肠菌群超标的食物可能会导致：
冰皮月饼更容易被微生物污染！
随着中秋佳节离我们越来越近，在超市，商店里都能见到各式各样的月饼，其中高颜值、口味清凉软糯的冰皮月饼成为市场上的新宠越来越受到我们的欢迎。但是！！！日前在江苏省食药监局抽检的153批次月饼中，不合格3批次均为冰皮月饼，而且霉菌最高超标15倍！ 以下这三批次的月饼千万别买！ 这3批次
食品中常见的19种微生物污染
食源性微生物是影响食品安全的第一大危害，也是全球性的威胁。以下总结了食品中常见的19种微生物污染，供大家参考。1、大肠菌群大肠菌群，它不代表某一个或某一属细菌，而指的是具有某些特性的一组与粪便污染有关的细菌。大肠菌群都是直接或间接地来自人和温血动物的粪便。一般食品中大肠菌群超标，表示食品受动温血动物