Science公布三个低成本完整人类基因组测序结果

来自Complete Genomics公司,华盛顿大学,哈佛医学院等处的研究人员在11月6日《科学》(Science)杂志上发表论文,描述其ZLDNA测序平台,并公布了对三个完整人类基因组序列分析的结果,文章还报道了不同样本的测序成本,包括了从$8,005(87x coverage)到$1,726(45x coverage)的范围。 文章的通讯作者是来自Complete Genomics公司(CG)Radoje Drmanac博士和Dennis G. Ballinger博士。CG公司首席执行官Cliff Reid博士表示,“这项研究证明了是有可能进行精确测序,并从整个人类基因组中发现差异的”,“这种高质量,低成本的基因组测序方法能帮助研究人员对成千上百个某种疾病患者的完整基因组序列进行分析,从而获得对这种疾病的深入了解,最终找出预防和治疗的方法。” 这篇题为“Human Genome Sequencing Usi......阅读全文

Science公布最新基因组测序结果

  来自法国农业科学研究院(Institut National de Recherche Agronomique)的研究人员发表了题为“Early allopolyploid evolution in the post-Neolithic Brassica napus oilseed genome”

-Science:宏基因组学测序技术

  宏基因组学技术(Metagenomic approaches)正快速拓宽我们对微生物代谢能力(microbial metabolic potential)的认识。   长期以来,对微生物(microorganism)功能开展的研究主要依赖的都是以在实验室里培养的单一物种(individua

Science:基因组测序揭示电鱼的惊人秘密

  第一次,研究人员完成了对电鳗(electric eel)的基因组测序。研究发现揭示出了带有发电器官的鱼类如何在生命史中进化6次,实现体外发电的惊人秘密。  发表在最新一期《科学》(Science)杂志上的这项研究,阐明了被利用来进化出这些复杂的新奇器官的遗传蓝图。密歇根州立大学、威斯康辛麦迪逊大

Science:全基因组测序探究疟疾传播机制

  近日,发表在国际杂志Science上的一篇研究论文中,来自加拿大西蒙弗雷泽大学等处的研究人员对可传播疟疾的16种按蚊进行了遗传测序,从而为揭示人类为何对其易感提供了新的思路和线索。  文章中,研究者Cedric Chauve表示,我们利用计算机方法来重新构建蚊子祖先的基因组,并且分析在过去1亿年

Science:三项鸟类全基因组测序研究

  目前,一个国际科学家小组完成了一项迄今为止最大的动物全基因组研究。为了构建鸟类的生命树,研究小组测定、组装和比较了48种鸟类的全基因组,这些鸟包括鸵鸟、蜂鸟、乌鸦、鸭、猎鹰、鹦鹉、鹤、朱鹭、啄木鸟和鹰,囊括了现代鸟类的所有主要分支。作为鸟类系统基因组学财团(由来自20个国家80家机构的200多名

Science:基因组测序或将颠覆近亲繁殖

  山地大猩猩是一种广泛近亲繁殖而且濒临灭绝的动物。日前,科学家们首次完成了山地大猩猩的全基因组测序,并将结果发表在四月九日的Science杂志上。这项研究不仅有助于理解种群衰退对动物产生的影响,还颠覆了人们对近亲繁殖的认识。  “山地大猩猩是野外研究得最多的灵长动物之一,而我们首次进行了深度的全基

Science新闻:英国公布大型全基因组测序计划

  基因分析技术在快速发展,昨日英国首相宣布了一项大型计划,将对患有癌症及罕见疾病的十万英国人进行全基因组测序。现在许多国家都在为治疗疾病而努力解码国民的DNA,而英国这一新项目的不同之处在于,其测序的是全基因组而非基因组个别区域。   英国首相David Cameron在声明中称,英国国民医

Science:华大参与三种鳄鱼基因组测序

  最近,德克萨斯理工大学的生物学家带领一个50多名科学家的研究小组,测定了三种鳄鱼——美洲鳄、咸水鳄和印度鳄的基因组序列。  生物学副教授David Ray指出,通过测定这些基因组序列,科学家们可以更好地了解鸟类的进化,它们是这类食肉动物的最近亲缘种。该研究小组完成了这三种鳄鱼的基因组,可以说真正

Science:人巨细胞病毒病毒基因组测序

  人巨细胞病毒是一种很常见的疱疹病毒,感染约50-100%的成人,但通常没有不良影响,并且它可以保持潜伏多年。人巨细胞病毒感染是比较常见的,发展中国家感染人数比发达国家人数多。   该病毒可导致出新生儿生缺陷和免疫系统受损,可能会导致致命疾病。该病毒也与癌症发展有关联。这项新的研究分析了病毒的蛋

Science:华大参与三种鳄鱼基因组测序

  最近,德克萨斯理工大学的生物学家带领一个50多名科学家的研究小组,测定了三种鳄鱼——美洲鳄、咸水鳄和印度鳄的基因组序列。  生物学副教授David Ray指出,通过测定这些基因组序列,科学家们可以更好地了解鸟类的进化,它们是这类食肉动物的最近亲缘种。该研究小组完成了这三种鳄鱼的基因组,可以说真正

Science:新生儿测序遇冷,“基因组计划”行路难

  新生儿测序是近年来比较热门的话题,中国新生儿基因组也于今年8月份正式起航,不过在此之前,美国已经开展了一项名为“BabySeq”的新生儿测序计划。10月19日,在加拿大温哥华召开的美国人类遗传学协会(ASHG)年会上,科学家们表示首个探讨利用新生儿基因测序来指导健康护理的研究项目——BabySe

基因组测序

如果楼主指的是人类基因组计划,那时用的方法叫做双脱氧终止法,也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成过程中,DNA聚合酶能够使用ddNTP(双脱氧核苷酸)来作为原料,但它的反应会在加入ddNTP的时候终止。具体实验是通过PCR来完成的,但与普通PCR不同,它只需要一个引物而不是一对。在4个相同的

Science封面6连发:人类最完整的基因组测序完成!

  全世界科学家近40年的努力,今天终于圆满了!Science连发6篇封面文章,宣布人类完整基因组测序计划正式完成。  据路透社、Science等报道,这项成果填补了前人几十年努力后仍然存在的空白,为全球 79 亿人中寻找有关致病突变和遗传变异的线索提供了新的希望。  算起来,距离人类最早讨论基因组

Science封面6连发:人类最完整的基因组测序完成!

  全世界科学家近40年的努力,今天终于圆满了!Science连发6篇封面文章,宣布人类完整基因组测序计划正式完成。  据路透社、Science等报道,这项成果填补了前人几十年努力后仍然存在的空白,为全球 79 亿人中寻找有关致病突变和遗传变异的线索提供了新的希望。  算起来,距离人类最早讨论基因组

解码“基因组学之父”桑格:测序,测序,测序

  “桑格当之无愧地被称为‘基因组学之父’,他的工作为人类读取和理解基因代码奠定了基础,彻底变革了生物学并极大促进了当今的医学发展。”、   有一天,65岁的英国生物化学家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的试验,转身走出实验室,宣布自己正式退休。那一年是1983

Science公布三个低成本完整人类基因组测序结果

  来自Complete Genomics公司,华盛顿大学,哈佛医学院等处的研究人员在11月6日《科学》(Science)杂志上发表论文,描述其ZLDNA测序平台,并公布了对三个完整人类基因组序列分析的结果,文章还报道了不同样本的测序成本,包括了从$8,005(87x coverage)到$1,72

基因组测序仪简介

  基因组测序仪是一种用于生物学领域的分析仪器,于2012年12月19日启用。  技术指标  个体化基因组测序仪主机/ION TORRENT主机。  主要功能  样品处理、快速的运行时间以分析单个或多个样品 支持多重文库,从而实现最大的效率和经济性 可在必要时禁用个别测序通道,以节约试剂用量。

认识泛基因组测序

什么是泛基因组?2005年,Tettelin等人提出了微生物泛基因组概念(pangenome,pan源自希腊语‘παν’,全部的意思),泛基因组即某一物种全部基因的总称。2009 年,Li等人首次采用新全基因组组装方法对多个人类个体基因组进行拼接,发现了个体独有的DNA序列和功能基因,并首次提出了“

PNAS:甜瓜基因组测序

  甜瓜在世界范围具有很高的经济价值,日前西班牙的九个研究中心通力合作,利用罗氏454平台完成了甜瓜基因组的测序。除了甜瓜的全基因组,科学家还得到了 7个特定甜瓜品种的基因组,文章发表在Proceedings of the National Academy杂志上。   联合国粮农组织2009年

关于全基因组测序的测序指标介绍

  一、全基因组测序的测序指标— 深度  测序深度(Sequencing depth)是指测序得到的碱基总量(bp)与基因组大小的比值,它是评价测序量的指标之一。测序深度与基因组覆盖度之间是一个正相关的关系,测序带来的错误率或假阳性结果会随着测序深度的提升而下降。测序的个体,如果采用的是双末端或Ma

Science发表超深度线粒体RNA测序

  蒙特利尔大学的一项新研究显示,线粒体遗传物质在个体内和个体间具有显著的多样性,而线粒体RNA上的修饰影响着我们每个人的身体健康。   线粒体基因组中的突变与多种疾病和生物学过程有关,然而此前人们还不了解线粒体转录组中的序列多样性。这项研究通过超深度线粒体RNA测序,首次为人们展示了线粒体RNA

454测序用于美洲奶牛种牛基因组测序项目

  一只名为Pawnee Farm Arlinda Chief的种牛和它的儿子Walkway Chief Mark大约有60000个后代,其后代是牛奶生产的主力。最近一项研究中1,科学家通过454全基因组测序,掌握了他们的基因组中控制重要性状的基因,包括抗病能力、牛奶产量,这些性状已通过北美的当

白肉灵芝完成基因组测序

 在韶关产业园种植的白肉灵芝。吴清平团队 供图 近日,中国工程院院士、广东省科学院微生物研究所名誉所长吴清平团队完成了第一个白肉灵芝全基因组测序。据悉,这是世界上首次对白肉灵芝的基因组进行组装和注释。相关研究发表于《G3:基因,基因组,遗传学》(G3-Genes Genomes Genet

让基因组测序绕过PCR

 在基因组测序中,PCR扩增似乎是绕不过去的一步。然而,PCR也带来一些问题,包括不均匀扩增,导致某些序列的比例过高。对目前的新一代测序(NGS)平台而言,测序某些碱基组成上存在严重偏向的基因组区域仍是一大挑战。在GEN杂志上,Patricia Fitzpatrick Dimond博士介绍了PCR-

454用于西红柿基因组测序

  最近,西红柿基因组学会完成了一个农业种植西红柿品系Solanum lycopersicum的基因组图谱,以及一个野生型西红柿品系S. pimpinellifolium的基因组图谱,并将其与已知的土豆基因组以及其他植物比较,寻找与水果有些特性相关的基因,相关文献在Nature杂志作为封面文章发

Nature突破:香蕉基因组测序

  由法国的研究人员领导的一个国际小组近日完成了对香蕉品种小果野蕉(Musa acuminata)的基因组测序,并开始分析这一基因组草图。相关研究成果发布在了7月11日的《自然》(Nature)杂志上。   研究人员采用Roche 454、Sanger和Illumina的测序方法绘制出了双单倍

人类全基因组测序计划

  全基因组测序是对未知基因组序列的物种进行个体的基因组测序。 1986年, Renato Dulbecco是Z早提出人类基因组测序的科学家之一。他认为如果能够知道所有人类基因的序列,对癌症的研究将会很有帮助。美国能源部(DOE)与美国国家卫生研究院(NIH),分别在1986年与1987年加入人类基

什么是基因组测序技术

自1998年美国塞莱拉遗传公司组建以来,人类基因组研究开始由两部分科学家同时展开,分别是由公共经费支持的人类基因组工程和美国塞莱拉遗传公司。在研究过程中,他们也分别采用了两种不同的测序和分析的方法。塞莱拉公司的核心分析方法被称为"霰弹法",人类基因组工程则采用了"克隆法"。所谓"霰弹法",其实是一种

测序基因组勘探食品污染

   上周,两家公司因李斯特菌食品感染发令召回其所有产品。Sabra Dippin召回30,000例鹰嘴豆泥制成的食品,至今疾病防治中心未发现因食用该公司食品造成的食物中毒或死亡的病例。然而,堪萨斯州的蓝铃冰激淋工厂(Blue  Bell Creameries)已确认有少量食品原料已感染李斯特菌,目

基因组测序的具体过程

讲起来很复杂哈,简单来说,就是边合成边测序,把所要测序的序列通过各种手段来建库,然后加上5‘和3’都加上接头,放在一个小玻璃片一样的芯片上,上面一般是8个lane,把样品加入到lane上之后和上面长好的接头序列相结合(之前的建库时加的接头与之反向互补),然后再经过PCR扩增的过程形成一个DNA簇,然