百人博士两篇文章：如何研究细胞关键蛋白
来自中科院上海生科院生化与细胞所的研究人员利用多种细胞蛋白分析手段发现了两种关键细胞蛋白的作用机理，这两种蛋白分别是C末端Src激酶(C-terminal Src kinase，Csk)和细胞极性封闭蛋白Occludin。研究论文分别发表在《Proteomic》和《Developmental Cell》上。 领导这些研究的是生化与细胞所陈正军研究员，其早年毕业于第二军医大学，后获国家教委青年奖学金赴德国学习，2001年入选百人计划受聘于中科院上海生科院生物化学与细胞生物学研究所，主要研究方向是磷酸化蛋白质细胞信号网络与肿瘤发生。 在第一篇文章中，研究人员利用蛋白质组学分析了C末端Src激酶Csk，Src家族包括原癌基因src，yes，lyn，fyn，lck，blk，fgr，bcd和yrk编码蛋白，它们都有TPK活性.共同参与细胞转化的信号转导过程。Csk是Src同源家族激酶，是最重要的负调控因子之一，了解Csk相......阅读全文
华盈视角：蛋白质组学——质谱技术
蛋白质作为功能的直接执行者，在生物医学领域中有着重要意义，检测蛋白质表达、修饰、互作等有助于我们理解生命机体的各类机制和活动规律，为疾病的治疗、诊断，药物的开发、优化等提供有力的支持。质谱技术作为检测蛋白质组学的主流技术，有必要了解其核心原理，才能更好的服务于科学问题的解决。1.质谱的原理： 质谱是
复旦大学发表蛋白质组学新技术
复旦大学现代色谱分离分析实验室的研究人员设计出一种基于芯片的二维液相色谱系统，可在质谱分析之前去除血浆样品中的高丰度蛋白。这项成果于近日发表在《Analytical Chemistry》上。 对于血浆样品的质谱分析，一个重大挑战是高丰度蛋白往往占据了主要信号，而掩盖了人们感兴趣的低丰度蛋白的信
张丽华：搭建蛋白质组学研究平台
分析测试百科网讯 自然科学研究，原则上应该是理性思辨能力更强的男性占优；而从屠呦呦获得了诺贝尔奖可以推断，女性从事科学研究同样可以做得出色。在分析化学领域，有这样一位女性。她曾荣获2015年“中国青年女科学家奖”；在和男性同台竞争的舞台上，她2014年入选了中组部“万人计划”； 2017年获得了
实质等同性（蛋白质组学）实验（一）
实验材料 ESI-MSMALDI - MS试剂、试剂盒 提取缓冲液仪器、耗材 SDS- 聚丙烯酰胺凝胶电泳实验步骤 众所周知，在实验室内和实验室间难以保证双向聚丙烯酰胺凝胶电泳的重复性。在我们实验室，强制性地要求严格遵守标准操作程序（sop ) , 以确保不同的操作者可以获得可重复的分离结果。小
蛋白质组学几种定量方法的案例解读
上期分享的蛋白组学内容，是不是有些小伙伴还绕在云里雾里呀？这次，小编用实例说话，帮您梳理清楚。 一、Label-free定量 Label-free定量，顾名思义就是不需要对比较样本做特定标记处理，只需要比较特定肽段/蛋白在不同样品间的色谱质谱响应信号便可得到样品间蛋白表达量的变化
Bruker投资PreOmics扩展蛋白质组学研究策略
PreOmics宣布完成B轮融资，以加快蛋白质组学工具和耗材的研发和商业化PreOmics提供独特的技术、先进的自动化解决方案和高性能耗材，用于生物制药和临床研究的无偏深层蛋白质组学中活检、组织、细胞系和血浆样品的均化、富集和样品制备 德国慕尼黑——2022年1月18日——PreOmics G
蛋白质组学实用分析技术一览
分析其实也属于技术的一部分，且在蛋白质组学研究中显得尤为重要，因为蛋白质组学研究提供的数据是生物学上最庞大的，而且蛋白质组比基因组具有更大的复杂性，因此蛋白质组信息学更有挑战性。今天小编先抛砖引玉地介绍几个常用的分析方法和软件。蛋白质定性分析蛋白质定性分析通常是指利用质谱法进行蛋白质鉴定和序列分析。
蛋白质组学哪些技术需要进行重复实验？
Label free需要进行三次重复，而iTRAQ、TMT一般建议客户做3次实验重复，如果实验方案后期设计了大量的验证实验如WB或ELISA等，最好做也能做两次重复；如果不进行重复实验后期的验证实验也少，在后期发表文章的时候结果可能会受到一些审稿人的质疑，从而影响文章的发表，特别是一些高分杂志较
“鸟枪法(shotgun)”定量蛋白质组学技术
1999年，Yates研究组提出“鸟枪法”(shotgun)，其基本技术路线是针对液体或SDS-PAGE条带的复杂混合物用酶(Trypsin)酶解成肽段混合物，然后对肽混合物进行多维毛细管液相色谱分离和串联质谱分析以及数据库检索，从而确定蛋白质的种类，可同时鉴定成百上千种蛋白质。他们把这种思路称
CASMS分论坛：相互作用组学和结构蛋白质组学前沿
分析测试百科网讯 美国东部时间2021年8月9日-13日，首届美国华人质谱学会（CASMS）学术研讨会暨展览会在Gather.Town隆重举行。8月11日的“Frontiers in Interactomics and Structural Proteomics” （相互作用组学和结构蛋白质组学
APT分享－|－蛋白质组学解锁木薯保鲜新技能
木薯是热带和亚热带地区的重要作物，与马铃薯和甘薯并称为世界三大薯类作物。当然，在中国大部分地区，我们最常见到的木薯，应该是这个样子出现的： 图1 吃货们看过来~ 好，看完美食我们接着聊。木薯虽然不错，但是采后很容易变质，难以贮存。这在吃货界显然是不可以忍受的事
APT分享－|－蛋白质组学解锁木薯保鲜新技能
木薯是热带和亚热带地区的重要作物，与马铃薯和甘薯并称为世界三大薯类作物。当然，在中国大部分地区，我们最常见到的木薯，应该是这个样子出现的： 吃货们看过来~ 好，看完美食我们接着聊。木薯虽然不错，但是采后很容易变质，难以贮存。这在吃货界显然是不可以忍受的事！还好，大批
顽拗性植物组织的蛋白质组学研究实验
顽拗性植物组织的蛋白质组学研究（苯酚法提取蛋白质）实验材料植物组织 试剂、试剂盒苯酚
蛋白质组学牛人Cell发表病毒研究新工具
科学家们在质谱分析的基础上，开发了一种全新的蛋白质组学技术——QTV（quantitative temporal viromics）。这一技术能够在病毒感染的过程中，对宿主和病毒蛋白的实时动态进行系统性定量分析，展现病毒与宿主的具体互作过程。这一技术发表在六月五日的Cell杂志上。 在QTV技
APAF选择TripleTOF－5600系统推进蛋白质组学研究
全球生命科学分析技术的 领导者AB SCIEX公司，今天宣布，澳大利亚的蛋白质组分析中心(APAF)选择了AB SCIEX TripleTOF 5600系统，通过显著增加蛋白质组覆盖率来帮助推进蛋白质组学研究。TripleTOF 5600 系统是生命科学产业界最快、最灵敏的高分
新蛋白质组学方法引领蛋白功能研究革命
人类细胞是通过成千上万个蛋白质的协同作用来控制它们生长和分化的。但是，到目前为止，大多数人类蛋白质的特定功能还不清楚。 疾病的发生常常是由于冠军细胞蛋白质功能的失常。目前，世界各地已经启动了大量大规模的研究计划以了解所有人类蛋白质的功能。 现在，来自IRCM（Instiut de recherc
我国在单细胞蛋白质组学研究获突破
浙江大学化学系微分析系统研究所方群教授团队，联合北京大学医学部精准医疗多组学研究中心主任黄超兰教授团队，在单细胞蛋白质组学分析研究领域取得突破性进展。研究论文近日在线发表在美国《分析化学》杂志上。 黄超兰介绍，近年来，基于细胞群体内的蛋白质组学研究，已越来越难以满足对生命功能深入探究的需要。从
蛋白质组学几种定量方法的案例解读（三）
经典案例题目：Proteome-wide Mapping of Cholesterol-Interacting Proteins in Mammalian Cells（采用甾醇探针结合SILAC定量技术在哺乳动物细胞中分析胆固醇-蛋白质相互作用）期刊：Nat Methods主要技术：SILAC定量文
蛋白质组学大会及学术研讨会
第五届中国蛋白质组学大会暨首届粤港澳蛋白质组学学术研讨会 会议时间： 2007-8-20 会议地点： 广州 主办单位： 中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会（CNHUPO） 承办单位： 南方医科大学 暨南大学 香港大学 香港中文大学 北京蛋白质组研究中心 协办单位： 广州市科学技术协会
PNNL发表开源蛋白质组学软件InformedProteomics
分析测试百科网讯 一则消息可能对蛋白组学研究者们最头痛的事有一定的缓解。美国一机构介绍了一款用于分析鉴定完整蛋白质的新型开源软件。 ProMex中的LS-MS特征查找，该功能是Informed-Proteomics软件套件的第一个组件的特征检测算法。 它被开发用于检测完整蛋白质离子的同位素包膜
蛋白质组学几种定量方法的案例解读（二）
经典案例题目：A tumour suppressor network relying on the polyamine-hypusine axis（一种基于多胺Hypusine轴（Polyamine-hypusine axis）的新型肿瘤抑制网络）期刊：Nature主要技术：iTRAQ定量文章摘要：
植物蛋白质组学和糖基化实验
实验材料链霉亲和素-过氧化物酶 牛胰核糖核酸酶 B
蛋白质组学揭示植物干旱胁迫的分子机制
Significant and unique changes in phosphorylation levels of four leaf phosphoproteins in two apple rootstock genotypes under drought stress.干旱胁迫对
蛋白质组学（TMT+labelfree）破译衰老密码
众所周知，干细胞的老化被认为是导致组织和器官老化的根本原因，尤其是在高周转率的生物系统中，比如造血作用。随着干细胞的老化，受损组织被替换的潜能也会随之减弱，在人体中，贫血，适应性免疫系统能力的下降，以淋巴细胞为代价的骨髓细胞的扩张，以及频发的血液系统恶性肿瘤，这些都已经被报道与衰老息息相关。但是这些
定量蛋白质组学质谱采集技术进展（四）
无论是相对定量还是绝对定量方法,DIA很好地克服了DDA鸟枪法和SRM目标监测的种种不足, 在定量蛋白质组学中具有良好的应用前景。然而,目前DIA 方法的循环时间仍然较长,只能与纳流液相联用,并使用较长的梯度以获得足够的色谱峰宽,限制了DIA 的应用范围。这也是DIA 技术下一步需要解决
最先进的蛋白质组学实验室建立
赛默飞世尔科技公司与英国癌症研究院合作建立最先进的蛋白质组学实验室 2009年7月20号，英国赫默尔亨普斯特德—服务科技，世界领先的赛默飞世尔科技公司在英国的癌症研究院(ICR)宣布一项整合生物网络的合作。癌症研究院是世界上新型、先进的蛋白质组学实验室，配有完整的Thermo Scientif
定量蛋白质组学揭开巨噬细胞活化的秘密
巨噬细胞活化是许多疾病发展过程中的关键步骤，包括动脉疾病。最近，布莱根妇女医院和哈佛医学院的研究人员通过蛋白质组学及其他分析，强调了PARP9和PARP14在调节巨噬细胞活化中的作用。这项成果发表在《Nature Communications》上。布莱根妇女医院的Masanori Aikawa及其同
蛋白质组学几种定量方法的案例解读（一）
一、Label-free定量Label-free定量，顾名思义就是不需要对比较样本做特定标记处理，只需要比较特定肽段/蛋白在不同样品间的色谱质谱响应信号便可得到样品间蛋白表达量的变化，通常用于分析大规模蛋白鉴定和定量时所产生的质谱数据。Label-free技术又可分为基于谱图数（Spectra Co
定量蛋白质组学质谱采集技术进展（一）
摘要 质谱是定量蛋白组学的主要工具。近年来随着定量蛋白质组学研究的深入,传统质谱定量技术面临着复杂基质干扰、分析通量限制等诸多问题。而最近一系列质谱新技术的发展,包括同步母离子选择(SPS)、质量亏损标记、平行反应监测(PRM)、多重累积(MSX)和多种全新数据非依赖性采集(DIA)等,为解决目前蛋
ETD：将成为蛋白质组学研究的标准方法
——访赛默飞ETD技术发明人John E.P. Syka 博士 【导语】质谱已经成为开展蛋白质组学研究的基础平台，更确切地说，具有MS/MS功能的质谱已成为蛋白质组学研究的基础平台。过去，CID/CAD技术是实现MS/MS功能的唯一手段，在蛋白质鉴定的自下而