蛋白质组学哪些技术需要进行重复实验?
Label free需要进行三次重复,而iTRAQ、TMT一般建议客户做3次实验重复,如果实验方案后期设计了大量的验证实验如WB或ELISA等,最好做也能做两次重复;如果不进行重复实验后期的验证实验也少,在后期发表文章的时候结果可能会受到一些审稿人的质疑,从而影响文章的发表,特别是一些高分杂志较为突出,对于立志于发表高水平文章的研究人员建议客户最好进行重复实验设计。如果是进行技术重复,各实验结果之间的数据重复性会更好,而生物学重复由于多种原因可能导致重复性与偏差或者不好,一般情况下Label free最好使用技术重复,这样有利于后续数据的分析,而其他是实验可以采用生物学重复或者技术重复。代谢组根据样品的不同选择合适的数量进行生物学重复。......阅读全文
蛋白质组学哪些技术需要进行重复实验?
Label free需要进行三次重复,而iTRAQ、TMT一般建议客户做3次实验重复,如果实验方案后期设计了大量的验证实验如WB或ELISA等,最好做也能做两次重复;如果不进行重复实验后期的验证实验也少,在后期发表文章的时候结果可能会受到一些审稿人的质疑,从而影响文章的发表,特别是一些高分杂志较
蛋白质组学实验技术大全
每一个领域的发展都是基于技术的进步和革新,蛋白质组学亦然。蛋白质的可变性和多样性等特殊性质导致了蛋白质研究技术远远比核酸技术要复杂和困难得多,但正是这些特性参与和影响着整个生命过程。在开始实验之前,先看看这篇技术简介吧。一 蛋白质与DNA相互作用在许多的细胞生命活动中,例如DNA复制、mRNA转录与
蛋白质组学研究技术
可以说,蛋白质组学的发展既是技术所推动的也是受技术限制的。蛋白质组学研究成功与否,很大程度上取决于其技术方法水平的高低。蛋白质研究技术远比基因技术复杂和困难。不仅氨基酸残基种类远多于核苷酸残基(20/ 4), 而且蛋白质有着复杂的翻译后修饰,如磷酸化和糖基化等,给分离和分析蛋白质带来很多困难。此外,
蛋白质组学+AI技术
人们在吞咽的时候,颈部有个器官会随着吞咽动作上下活动,它就是甲状腺。西湖欧米有望实现临床转化的第一个项目,就是基于蛋白质标志物的甲状腺结节的良恶性诊断。甲状腺很小,但它影响到五脏六腑。数据显示,每5个成年人中就可能有1人患有甲状腺结节。其中,约60%的甲状腺结节都是良性的。但有10%的结节是恶性的,
蛋白质组,蛋白质组学及研究技术路线
基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然,不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类
蛋白质组,蛋白质组学及研究技术路线
基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然,不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类
蛋白质组学主要包括哪些分析技术及各自特点
双向凝胶电泳 双向凝胶电泳的原理是第一向基于蛋白质的等电点不同用等电聚焦分离,第二向则按分子量的不同用SDS-PAGE分离,把复杂蛋白混合物中的蛋白质在二维平面上分开。由于双向电泳技术在蛋白质组与医学研究中所处的重要位置,它可用于蛋白质转录及转录后修饰研究,蛋白质组的比较和蛋白质间的相互作用,
蛋白质组学主要包括哪些分析技术及各自特点
双向凝胶电泳 双向凝胶电泳的原理是第一向基于蛋白质的等电点不同用等电聚焦分离,第二向则按分子量的不同用SDS-PAGE分离,把复杂蛋白混合物中的蛋白质在二维平面上分开。由于双向电泳技术在蛋白质组与医学研究中所处的重要位置,它可用于蛋白质转录及转录后修饰研究,蛋白质组的比较和蛋白质间的相互作用,
蛋白质组学主要包括哪些分析技术及各自特点
为探究生物进程的分子机制,需要确定介导这个过程的蛋白质-蛋白质间的相互作用。研究蛋白质间相互作用的主要技术总结如下:一、酵母双杂交系统酵母双杂交系统是当前广泛用于蛋白质相互作用组学研究的一种重要方法。其原理是当靶蛋白和诱饵蛋白特异结合后,诱饵蛋白结合于报道基因的启动子,启动报道 基因在酵母细胞内的表
蛋白质组学鉴定技术流程
蛋白质组(Proteome)的概念,蕞早由澳大利亚Macquarie大学的Wilkins和Williams于1994年首先提出的,是指一个基因组(Genome),或一个细胞、组织表达的所有蛋白质。蛋白质组学(Proteomics)以细胞、组织或生物体全体蛋白质为研究对象,通过高通量的色谱质谱联用技术
蛋白质组学研究-可投哪些期刊?
蛋白质作为功能的直接行使者,已经被科研工作这广泛应用于不同领域中,目前蛋白组学有很多优秀的科研成果,在各个领域及期刊上发表,其中也不乏CNS在内的顶级期刊。那我们的蛋白组学文章可以投哪些期刊呢?了解已发表文章的情况可以帮助我们很好的解决这个问题。这里,我们以“Proteomics”为关键词,
蛋白质组学技术的功能介绍
“读”,在字典里的意思是识取、读取,放在蛋白研究中可以理解为对生物样本中未知单一蛋白或复杂蛋白的筛选、鉴定或者定量检测。 自2003年4月14日人类基因组计划(HGP)宣告完成以来,基因组研究取得了举世瞩目的成就。基因组学虽然在基因活性和疾病的相关性方面为人类提供了有力证据,但实际上绝大
Nature年度技术:定向蛋白质组学
时近岁末,各大杂志接连进行了年终盘点,此前出版的《Nature》杂志也对2012年进行了回顾,评点了2012年的科技进展,科技政策以及重要人物,中国科学家王俊入选了人物篇。同时《Nature Methods》也盘点了今年与明年的技术热点,选出了2012年度技术成果:定向蛋白质组学(targe
蛋白质组学技术的功能介绍
“读”,在字典里的意思是识取、读取,放在蛋白研究中可以理解为对生物样本中未知单一蛋白或复杂蛋白的筛选、鉴定或者定量检测。自2003年4月14日人类基因组计划(HGP)宣告完成以来,基因组研究取得了举世瞩目的成就。基因组学虽然在基因活性和疾病的相关性方面为人类提供了有力证据,但实际上绝大多数疾病并不是
定量蛋白质组学的优势有哪些?
质谱方法比抗体方法更先进的一个原因,就是已经开发出了一种新的定向分析技术,比生产一个新的抗体要快得多,并大大减少了检测特异性方面的问题(抗体方法存在交叉反应的问题)。 虽然抗体方法在低丰度蛋白的检测方面更加灵敏,但是质谱技术的一个明显优势就是能在单个实验中检测多种蛋白,比如说,系统生物学研究人
生物学重复和技术重复的区别
生物学重复是指不同生物个体或者不同生物群体的样品之间进行地相同处理而进行的实验,而技术重复是指同一样品进行的多次相同实验。举例:对来自三只健康小鼠A、B、C的血清样品分别各进行一次双向电泳,这三次双向电泳就是生物学重复;而取其中一只小鼠的血清样品进行三次双向电泳,或者将三只小鼠的血清混合后的样品进行
成功进行凝胶迁移实验需要优化哪些因素?
凝胶迁移实验在理论上很简单也很快速,但要成功地进行凝胶迁移实验,需要优化一些参数,这主要受结合蛋白的来源和探针结合位点特点的影响。以下是需要优化的因素:抽提液的制备(核酸酶和磷酸酶污染会使探针降解),结合蛋白的浓度,探针的浓度,非特异性探针的浓度,缓冲液的配方和pH,聚丙烯凝胶电泳的特点和电泳条件,
实质等同性(蛋白质组学)实验
实验材料ESI-MSMALDI - MS试剂、试剂盒提取缓冲液仪器、耗材SDS- 聚丙烯酰胺凝胶电泳实验步骤众所周知,在实验室内和实验室间难以保证双向聚丙烯酰胺凝胶电泳的重复性。在我们实验室,强制性地要求严格遵守标准操作程序(sop ) , 以确保不同的操作者可以获得可重复的分离结果。小麦白面粉样品
实质等同性(蛋白质组学)实验
实验材料ESI-MSMALDI - MS试剂、试剂盒提取缓冲液仪器、耗材SDS- 聚丙烯酰胺凝胶电泳实验步骤众所周知,在实验室内和实验室间难以保证双向聚丙烯酰胺凝胶电泳的重复性。在我们实验室,强制性地要求严格遵守标准操作程序(sop ) , 以确保不同的操作者可以获得可重复的分离结果。小麦白面粉样品
实质等同性(蛋白质组学)实验
实验材料:ESI-MS MALDI - MS 试剂、试剂盒:提取缓冲液仪器、耗材:SDS- 聚丙烯酰胺凝胶电泳 实验步骤:众所周知,在实验室内和实验室间难
蛋白质组学技术分析方法及概括
1 蛋白质组学概述“蛋白质组”一词的英文是Proteome,它是proteins 和genome 两个词的组合,意思是proteins expressed by a genome,即为基因组表达的蛋白质[1]。蛋白质组的概念是1994 年由Wilkins首先提出,并首次在1995 年7月的“Elec
定量蛋白质组学的技术发展
以质谱为基础的定向蛋白质组学研究领域的发展历程并不短,早在上个世纪70年,三重四极杆质谱仪就已经出现,并在80年代首次在发表的文章中,证明可以被用来检测肽段。 过去几年间,更广泛的范围内定向质谱技术的应用迅速攀升,而且新方法,新工具,新资源和新一代方法,也令更多研究领域的科学家们能利用到这项技
董孟秋·科学:蛋白质组学新技术
来自美国斯克利普斯研究所(Scripps Research Institute)Salk生物研究院,加州大学圣地亚哥分校的研究人员利用一种蛋白定量分析新方法对长寿命线虫进行了研究,发现了能延长和缩短寿命的蛋白。这对于进一步丰富蛋白定量研究方面来说意义重大。这一研究成果公布在《Science》杂志上。
蛋白质组学技术分析方法及概括
1 蛋白质组学概述“蛋白质组”一词的英文是Proteome,它是proteins 和genome 两个词的组合,意思是proteins expressed by a genome,即为基因组表达的蛋白质[1]。蛋白质组的概念是1994 年由Wilkins首先提出,并在1995 年7月的“Electr
植物蛋白质组学中的双向电泳技术实验
试剂、试剂盒尿素裂解溶液 IPG 干胶条水化液
植物蛋白质组学中的双向电泳技术实验
试剂、试剂盒尿素裂解溶液IPG 干胶条水化液IPG 胶条平衡液SDS 凝胶缓冲液电极缓冲液储液丙烯酰胺 甲叉双丙烯酰胺溶液过硫酸铵溶液琼脂糖溶液仪器、耗材等电聚焦仪IPGphor多重垂直 SDS 电泳仪实验步骤3.1 第一向:在 IPG 胶条中进行等电聚焦( IPG-IEF)采用 IPG ( IPG
进入生物安全实验室之前需要进行哪些操作?
你或许有时会看到这样照片。这是哪里?他们在做什么?是太空站吗?是宇航员吗?不,这只不过是研究人员在生物安全四级实验室开展病原实验。微观世界的病原微生物如果探索太空需要一套宇航服,那么进入高级别的生物安全实验室探索微观世界前,必须换上一套密不透风的防护服。就像下面这样的↓↓↓中国疾病预防控制中心一楼多
蛋白质组学牛人利用新技术分析蛋白质图谱
蛋白质组(proteomics)分析是针对不同条件下细胞中蛋白的功能和特性进行研究的统称,这一领域的研究一直以来都落后于基因组研究,后者在技术创新方面取得了不少成果,一些令人眼花缭乱的快速基因组图谱绘制技术,还有无需借助核心实验室设备就能完成实验的技术,都令我们印象深刻。 但是与基因组研究
实验室分析技术基于HPLCMS/MS的蛋白质组学技术
基于高效液相色谱串联质谱(HPLC-MS/MS)的蛋白质组学技术的发展主要取决于液相色谱-质谱联用分析设备、样品分离和制备技术、鉴定以及生物信息学。目前,shotgun鸟枪法是最常用的大规模蛋白质鉴定策略。如下图所示,在自下而上分析策略中,蛋白质通过蛋白水解酶水解成肽的混合物,然后通过色谱法或亲和分
质谱在蛋白质组学中的应用实验
实验材料 冷冻干燥样品试剂、试剂盒 校准标准品基质溶液甲醇仪器、耗材 MALDI 质谱仪MALDI 板实验步骤 1.吸取 0.5ul 的基质溶液,加到 MALDI-MS 分析所用的金属样品板上的样品孔中(为了准确起见,请使用2ul 的移液器)。2.在基质干燥之前,迅速加入 0.5ul 的标准品或样品