水生生物所等公布斑马鱼1号染色体全基因敲除研究成果
斑马鱼是开展生命科学、健康科学、环境科学等研究的重要模式动物。在斑马鱼研究历史上，欧美学者发起过几次大规模的随机诱变突变体库，开展基于“从表型到基因型”的正向遗传学筛选，奠定了斑马鱼作为国际公认模式动物的重要基础。 随着斑马鱼全基因组测序的完成和CRISPR/Cas9等基因组编辑技术的成熟，规模化靶向构建斑马鱼基因敲除突变体库，系统开展“从基因型到表型”的斑马鱼反向遗传学研究成为可能。近日，来自中国科学院水生生物研究所、清华大学、中国科学院动物研究所、北京大学等24家机构的学者组成“斑马鱼1号染色体全基因敲除联盟（ZAKOC）”，在国际期刊Genome Research 在线发表了“斑马鱼1号染色体全基因敲除计划”的研究成果，这是国际上首次大规模的斑马鱼反向遗传学突变体库构建和遗传筛选计划。 该联盟利用CIRISR/Cas9技术，针对斑马鱼1号染色体上的1333个基因进行系统性基因敲除，成功敲除了其中1029个基因，获得......阅读全文
水生生物所等公布斑马鱼1号染色体全基因敲除研究成果
斑马鱼是开展生命科学、健康科学、环境科学等研究的重要模式动物。在斑马鱼研究历史上，欧美学者发起过几次大规模的随机诱变突变体库，开展基于“从表型到基因型”的正向遗传学筛选，奠定了斑马鱼作为国际公认模式动物的重要基础。 随着斑马鱼全基因组测序的完成和CRISPR/Cas9等基因组编辑技术的成熟，规
斑马鱼一号染色体全基因成功敲除－有益于人类截肢再生治疗
斑马鱼，因全身布满多条蓝色条纹似斑马而得名。其基因和人类相似度达到87％，有“水中小白鼠”之称。因为其具有繁殖力强、发育迅速等生物学特征，更加便于科学研究，已经成为全球生命科学研究的新宠。 中国科学家在近日的关于斑马鱼1号染色体全基因敲除计划结题会暨第二届全国斑马鱼PI大会上宣布，他们已在全球
斑马鱼基因敲除是怎么做的
一、基因敲除的设计方案 1.1 基因的基本信息 确认斑马鱼基因的基本信息，包括名称ID号等，一般会在NCBI等查询。 1.2 分析基因结构、氨基酸序列等做生物学信息的分析 1.3分析蛋白质的保守结构功能域 通过综合考虑，设计最佳的KO靶点。 1.4
斑马鱼基因敲除是怎么做的
一、基因敲除的设计方案 1.1 基因的基本信息 确认斑马鱼基因的基本信息，包括名称ID号等，一般会在NCBI等查询。 1.2 分析基因结构、氨基酸序列等做生物学信息的分析 1.3分析蛋白质的保守结构功能域 通过综合考虑，设计最佳的KO靶点。 1.4
斑马鱼基因敲除是怎么做的？
一、基因敲除的设计方案1.1 基因的基本信息确认斑马鱼基因的基本信息，包括名称ID号等，一般会在NCBI等查询。 1.2 分析基因结构、氨基酸序列等做生物学信息的分析 1.3分析蛋白质的保守结构功能域通过综合考虑，设计最佳的KO靶点。 1.4 分析并设计CRISPR，分析其效率及脱靶的情况一般使用C
从“1”开始实现“0”的突破大规模斑马鱼定向突变体库建成记
斑马鱼，因全身布满多条深蓝色条纹似斑马而得名。这种不起眼的生物，却是撬动许多学科发展的基础——其基因和人类基因相似度达87％，因此被应用在生命科学、健康科学和环境科学等领域的研究中，与线虫、果蝇、小鼠一样，是常用的模式生物。 从2013年开始，在中国科学院院士朱作言、孟安明的号召下，国内30多
水生所关于斑马鱼基因捕获与插入突变的研究取得突破
脊椎动物后基因组时代的主要任务是解读基因的功能，而基因捕获和插入突变是揭示基因功能的重要手段。斑马鱼具有易于饲养、繁育周期短、产卵量大、体外受精与发育等优点，已成为发育和遗传学研究的理想模式动物，但尚缺乏胚胎干细胞和基于胚胎干细胞的基因敲除技术。转座子介导的基因捕获和突变研究为大规模筛选斑马鱼突
斑马鱼的基因敲除定制（Cas9KO）法介绍
利用 CRISPR/Cas9 技术，针对靶基因序列设计 sgRNA， 指导 Cas9 蛋白在特定基因位点引起 DNA 双链断裂，在非同源性末端接合修复断裂 DNA 的过程中，靶基因碱基突变或缺失被引入到斑马鱼基因组中，最终导致靶基因无法正常转录翻译，达到基因敲除的目的。目前我们利用 CRISPR
斑马鱼的基因敲除定制（Cas9KO）法介绍
利用 CRISPR/Cas9 技术，针对靶基因序列设计 sgRNA， 指导 Cas9 蛋白在特定基因位点引起 DNA 双链断裂，在非同源性末端接合修复断裂 DNA 的过程中，靶基因碱基突变或缺失被引入到斑马鱼基因组中，最终导致靶基因无法正常转录翻译，达到基因敲除的目的。目前我们利用 CRIS
水生所揭示斑马鱼肠道微生物群落构建及演替规律
生物多样性的形成和维持机制一直以来都是生态学研究的重要内容。针对群落的构建规律，生物多样性的时空格局是研究的重点，其中关注最多的是物种-面积理论，但主要是针对动、植物在典型岛屿的分布规律，而微生物方面的研究相对较少。由于动物消化道最开始是无菌的，之后通过迁入、迁出形成了特定的群落并维持
水生所揭示急性白血病基因MLL对斑马鱼血细胞发生的作用
急性白血病基因MLL编码一个组蛋白甲基化转移酶，能通过表观遗传机制调控Hox等基因的表达。它与70多种基因发生重排是导致急性淋巴细胞白血病（ALL）和急性骨髓性白血病（AML）发生的主要原因。由于小鼠mll基因敲除导致早期胚胎死亡，因此对于它在早期胚胎发育中的作用及其分子机制仍很不
应用CRISPRCas9实现斑马鱼组织特异性基因敲除
近日，来自美国哈佛大学的研究人员在国际学术期刊Development cell发表了他们的最新研究进展，他们利用基于CRISPR-Cas9技术开发的载体系统在斑马鱼上实现了组织特异性基因敲除，这对于以斑马鱼为主要研究工具的科学家们无疑是一个好消息。 斑马鱼具有养殖方便、繁殖周期短、产卵量大、胚
水生所发布高质量AB品系斑马鱼参考基因组
斑马鱼是生命科学、健康科学和环境科学等研究领域的重要模式生物之一。常见的两种实验室斑马鱼品系分别是Tubingen品系和AB品系。其中，AB品系斑马鱼被国内外很多实验室作为研究对象。然而，却缺乏一个高质量的AB品系斑马鱼参考基因组。 由于不同品系斑马鱼来源不同，各品系之间存在着大量基因序列上的
水生所精氨酸甲基转移酶prmt5在斑马鱼性腺发育中机制
蛋白质精氨酸甲基化是一类重要的蛋白质翻译后修饰型式，它受精氨酸甲基化转移酶基因家族的介导，在RNA加工、DNA修复、蛋白与蛋白相互作用及基因调控等方面起非常重要的作用。精氨酸甲基转移酶prmt5为该基因家族成员之一，属II型精氨酸甲基化转移酶，介导对称性精氨酸双甲基化。由于Prmt5基因在小鼠中
转基因斑马鱼的构建
实验概要本实验对斑马鱼导入含 EGFP的质粒，观察其在动物体内的表达情况，在斑马鱼体内，绿色荧光蛋白从原肠胚到出苗期均能在荧光显微镜下观察到绿色荧光。主要试剂EGFP、绿色荧光蛋白基因、pEGFP-N2载体、E.coli主要设备试管、试管架、可调式微量加样器、电泳仪、电泳槽、染色缸、42℃恒温水浴箱
斑马鱼基因编辑技术介绍
斑马鱼又叫蓝条鱼，因为其体表有暗蓝色和银色的类似于斑马一样的条纹而命名。斑马鱼属于鲤科鱼类，同属鲤科的还有我们十分熟悉的鲤鱼、鲫鱼等。斑马鱼的体型较小，成鱼体长约4-6厘米，而且成鱼常年产卵且产卵量大，可达300-1000粒，还是体外受精并发育，因此十分适合进行实验室的大规模养殖与筛选。斑马鱼这种原
斑马鱼
一、概述斑马鱼是生长在印度、巴基斯坦淡水河流中的一种硬骨鱼（鲤鱼），成年鱼全身仅长4－5厘米，因全身横向分布着一道一道褐色的斑马线而得名。斑马鱼很容易在实验室饲养，一般3个月就可以达到生殖成熟期，雌鱼每次产卵200枚左右，一生可产卵数千枚，斑马鱼所产之卵经24小时即可胚胎发育成熟，仔鱼期只有1个月。
水生所等在水生实验动物研究方面取得新进展
中国科学院水生生物研究所研究员曹宏团队与西北工业大学生态环境学院博士任彦栋等合作攻关，对稀有鮈鲫组学数据及实验数据的整合分析，对稀有鮈鲫的性别决定机制及其独特的免疫机制进行了深入解析，回答了稀有鮈鲫对重金属胁迫及草鱼出血病病毒敏感的科学问题。相关研究成果近日发表在Science Advance
类泛素分子Nedd8调控斑马鱼卵巢和第二性征发育机制揭示
Nedd8是一种类泛素分子，在E1、E2和E3等酶的酶促作用下，与靶标蛋白共价结合，引起靶标分子的Neddylation修饰，影响靶标蛋白的活性、稳定性或细胞定位。然而，由于动物模型的欠缺，研究人员对Nedd8的在体生物学功能仍缺乏了解。 中国科学院水生生物研究所鱼类低氧生物学学科组博士生于光
精氨酸甲基转移酶prmt5在斑马鱼性腺发育中的功能和机制
蛋白质精氨酸甲基化是一类重要的蛋白质翻译后修饰型式，它受精氨酸甲基化转移酶基因家族的介导，在RNA加工、DNA修复、蛋白与蛋白相互作用及基因调控等方面起非常重要的作用。精氨酸甲基转移酶prmt5为该基因家族成员之一，属II型精氨酸甲基化转移酶，介导对称性精氨酸双甲基化。由于Prmt5基因在小鼠中
Nature－Aging：肠道特异性端粒酶可延长端粒并延缓全身衰老
端粒是真核细胞线性染色体的末端结构，在细胞复制过程中起保护作用，避免DNA受到损伤，并且像帽子一样有效防止染色体间末端重组、融合和染色体退化。 在细胞有丝分裂的过程中，端粒会随着分裂次数的增加逐渐缩短，当端粒缩短到一定程度时便无法继续维持染色体的稳定，从而导致细胞功能障碍直至死亡。因此端粒缩短
孕酮信号可独立维护斑马鱼精巢正常发育
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/3/474828.shtm 近日，中国科学院水生生物研究所一项研究发现，揭示了孕酮/ NPGR信号对斑马鱼精巢发育的调控作用。研究发现，动物体内增强的孕酮/NPGR信号，可以发挥不依赖于雄激素信号通路，促进
GnRH3在早期PGCs的增殖和性别分化中扮演重要角色
促性腺激素释放激素（Gonadotropin-releasing hormone, GnRH）是脊椎动物“下丘脑-垂体-性腺（hypothalamic-pituitary-gonad, HPG）轴”上的一个关键因子，在脊椎动物性腺发育成熟及繁殖中发挥着重要作用。利用斑马鱼模型，中国科学院水生生物
迄今最全斑马鱼基因图谱发布
一个国际科研团队在5日出版的《自然·遗传学》杂志上发布了迄今最全面的斑马鱼基因图谱。斑马鱼是医学和生命科学研究领域使用量第二大的动物模型，这一成果将帮助科学家们更好地研究各种癌症、心脏病和神经退行性疾病，以及在研究中用斑马鱼模型取代哺乳动物模型。 最新研究由DANIO-CODE联盟开展，该联盟由
定向基因编辑改写斑马鱼的DNA
斑马鱼是基因研究中一种常用的模式生物。现在科学家可以对它们的基因组进行定向的编辑。 据Nature近日报导，在对脊椎动物和人类疾病的研究中，斑马鱼是一种重要的模式生物。它的卵是透明的，在体外孵化，它的繁殖周期很短，生长速度快，这些都意味着，很适合在生物生存的条件下对它的胚胎进行密切研究。而
科研人员利用斑马鱼探究增塑剂DBP的水生态毒理
西北农林科技大学动物科技学院水域生态团队基于前期黄河流域（陕西段）中增塑剂污染情况的调研工作基础，使用斑马鱼探究了典型增塑剂—邻苯二甲酸二丁酯（Dibutyl Phthalate，DBP）的水生态毒理，从mtDNA-cGAS-STING信号通路角度为增塑剂的水生态毒理研究提供了新的视角，近日该研究成
科研人员利用斑马鱼探究增塑剂DBP的水生态毒理
西北农林科技大学动物科技学院水域生态团队基于前期黄河流域（陕西段）中增塑剂污染情况的调研工作基础，使用斑马鱼探究了典型增塑剂—邻苯二甲酸二丁酯（Dibutyl Phthalate，DBP）的水生态毒理，从mtDNA-cGAS-STING信号通路角度为增塑剂的水生态毒理研究提供了新的视角，近日该研究成
从鱼缸到太空：“鱼航员”肩负科研使命
4月24日17时17分，神舟二十号载人飞船在酒泉卫星发射中心成功发射。此次发射不仅标志着中国航天事业的又一重要里程碑，更因6条来自华南理工大学医学院的斑马鱼“鱼航员”的加入而备受瞩目。 “这些斑马鱼将在太空站停留30天以上，执行失重性骨丢失及心肌重塑的蛋白稳态调控机制研究项目，这也是国际上首次
北大、加大等联手探索斑马鱼全基因组突变新技术
来自北京大学生命科学学院、美国国立人类基因组研究所和加州大学生物系的研究人员，最近在利用逆转录病毒插入法引发斑马鱼全基因组范围内基因突变的研究中取得重大进展。文章刊登于7月18日在线版《PNAS》。 研究人员采用其研制的一组技术，用假性逆转录病毒（pseudotyped retroviruses）
水生所等发现转透明颤菌血红蛋白可提高斑马鱼低氧耐受力
2011年4月，Marine Biotechnology刊登了中科院水生生物研究所鱼类基因工程学科组与北京大学生命科学院合作的封面研究论文：Vitreoscilla Hemoglobin (VHb) Overexpression Increases Hypoxia Toleranc