新一代蛋白结构预测技术

《Nature Chemical Biology》杂志在线版一篇文章介绍,伊利诺斯州立大学John A. Gerlt博士率领的研究小组研制出一种新途径,能够确定氨基酸序列已知的蛋白的结构和功能。 这是首次利用计算机程序,根据蛋白的氨基酸序列精确预测蛋白功能。Gerlt等的“in silico”预测结果被实验室酶分析和X 射线结晶学手段所证实。 研究过程大致为搜寻序列已知的蛋白的数据库,寻找氨基酸序列与未知蛋白的氨基酸序列具有很大同源性的蛋白,然后根据搜索到的与未知蛋白最为贴近的蛋白的三维结构,分析未知蛋白的功能。这种方法提高了鉴别功能未知蛋白的生物学作用的工作效率。 研究小组利用这种同源模型中得到的结构数据,进行计算机化的分子对接实验(docking experiments,生物通编者译),快速评估是否未知蛋白偏向于结合任何潜在靶标分子或底物。确定与目的蛋白相结合的底物对于了解蛋白功能非常重要。Gerlt说,不需要对3万个......阅读全文

酶蛋白的结构特点

酶蛋白具有一般蛋白质的物理化学性质,由20种天然氨基酸构成的生物大分子化合物,是由氨基酸以肽健(酰胺健)聚合成的肽链,一个蛋白质分子可能由一条肽链构成,也可能由几条肽链构成。在蛋白质肽链上的氨基酸残基按严格确定的顺序排列,它的侧链可以是各种天然氨基酸,不是单一氨基酸残基的重复。   酶蛋白是球蛋白,

新一代蛋白结构预测技术

《Nature Chemical Biology》杂志在线版一篇文章介绍,伊利诺斯州立大学John A. Gerlt博士率领的研究小组研制出一种新途径,能够确定氨基酸序列已知的蛋白的结构和功能。 这是首次利用计算机程序,根据蛋白的氨基酸序列精确预测蛋白功能。Gerlt等的“in silico”预测

弹性蛋白酶的结构

弹性硬蛋白是一种由丙氨酸、亮氨酸、异亮氨酸等非极性氨基酸残基交联而成的网状结构,它可以耐受酸碱处理,并能抵抗一般蛋白酶的消化。

钙蛋白酶的基本结构

钙蛋白酶(EC3,4,22,17)是细胞内依钙中性半胱氨酸内肽酶。在体内,通过Ca2+激活及自溶而表现出蛋白水解酶的活性,并通过钙蛋白酶抑制活化的钙蛋白酶活性。钙蛋白酶系统的主要作用对象是细胞骨架蛋白、蛋白激酶和磷酸酶以及激素受体。广泛存在的钙蛋白酶有钙蛋白酶1(u-calpain)、钙蛋白酶2(m

简述钙蛋白酶的结构

  钙蛋白酶(EC3,4,22,17)是细胞内依钙中性半胱氨酸内肽酶。在体内,通过Ca2+激活及自溶而表现出蛋白水解酶的活性,并通过钙蛋白酶抑制活化的钙蛋白酶活性。钙蛋白酶系统的主要作用对象是细胞骨架蛋白、蛋白激酶和磷酸酶以及激素受体。广泛存在的钙蛋白酶有钙蛋白酶1(u-calpain)、钙蛋白酶2

木瓜蛋白酶的组成结构

番木瓜未成熟果实中含有木瓜蛋白酶(Papain)、木瓜凝乳蛋白酶A(Chymopapain A )、木瓜凝乳蛋白酶B(Chym opapain B )、木瓜肽酶B (PapayaPeptidase B ) 等多种蛋白水解酶。且已知四种半胱氨酸蛋白酶的一级结构具有高度的同源性。其中,木瓜蛋白酶属巯基蛋

木瓜蛋白酶的结构功能

木瓜蛋白酶别名木瓜酶(Papain)纯木瓜蛋白酶是由212个氨基残基组成的单条肽链,相对分子量23406。木瓜蛋白酶制品可含有木瓜蛋白水解酶、木瓜凝乳酶和溶菌酶。是一种巯基蛋白酶,其专一性差!能分解比胰脏蛋白酶更多的蛋白质。木瓜凝乳酶相对分子量36000,约占可溶性蛋白酶的45%,溶菌酶相对分子量2

木瓜蛋白酶的组成结构

番木瓜未成熟果实中含有木瓜蛋白酶(Papain)、木瓜凝乳蛋白酶A(Chymopapain A )、木瓜凝乳蛋白酶B(Chym opapain B )、木瓜肽酶B (PapayaPeptidase B ) 等多种蛋白水解酶。且已知四种半胱氨酸蛋白酶的一级结构具有高度的同源性。其中,木瓜蛋白酶属巯基蛋

​木瓜蛋白酶的基本结构

番木瓜未成熟果实中含有木瓜蛋白酶(Papain)、木瓜凝乳蛋白酶A(Chymopapain A )、木瓜凝乳蛋白酶B(Chym opapain B )、木瓜肽酶B (PapayaPeptidase B ) 等多种蛋白水解酶。且已知四种半胱氨酸蛋白酶的一级结构具有高度的同源性。其中,木瓜蛋白酶属巯基蛋

枯草杆菌蛋白酶的结构

枯草杆菌蛋白酶的结构已通过X射线晶体学确定。成熟的形式是一种含有275个残基的球状蛋白质,带有几个α螺旋和一个大的β折叠片。N端包含一个I9前肽结构域(InterPro:IPR010259),它有助于枯草杆菌蛋白酶的折叠。域的蛋白水解去除激活酶。它在结构上与丝氨酸蛋白酶的糜蛋白酶族无关,但在活性位点

孕烯醇酮的结构和作用

孕烯醇酮是合成黄体酮、非那甾胺等的重要中间体,用于甾体类药物中间体和甾体类药物的合成。

重要的结构烯醇式互变

酮式-烯醇式互变酮式-烯醇式互变是指因酮或醛和烯醇之间的化学平衡。在有机化学中,酮-烯醇互变异构(Keto-Enol Tautomerism)是指因酮或醛和烯醇之间的化学平衡。酮或醛和烯醇称为互变异构体。此平衡出现的原因是,酮和醛等羰基化合物具有酸性的α-质子,在不同的PH值下进行质子的转移,形成酮

寨卡病毒蛋白酶结构机理揭秘

  伊蚊叮咬是寨卡病毒最主要的传播途径   德国吕贝克大学生物化学研究所所长罗尔夫·希尔根菲尔德教授领导的研究小组,日前揭秘了寨卡病毒蛋白酶结构机理,这项成果被刊登在最新一期的《科学》杂志上,为抗病毒剂的研发奠定了基础。   寨卡病毒是种蚊虫传播的病毒,可通过孕妇传染给胎儿,目前全球已有60个国家超

中性蛋白酶的结构功能介绍

中性蛋白酶所起的作用就是把蛋白质大分子分解成能被动物机体吸收的小分子。蛋白质由氨基酸组成,是自然界中发现的最复杂的有机化合物之一。由盐酸和蛋白酶分解成易被高等动物的肠道和微生物有机体的细胞膜吸收的氨基酸。 包括人类在内的每种动物,必须要有足够的蛋白质来维持自身生长,来生成每个细胞所必需的氨基酸,一些

关于米曲霉蛋白酶的结构简介

  酶的催化性质与酶分子的结构密切相关。特别是酶的三级结构,对酶对催化机制有重大影响,同一种酶,由于高级机构的不同,参与的反应可能就不同。郭继平等采用结构生物学和生物信息学手段对米曲霉碱性蛋白酶的三维结构进行了同源模建。通过序列相似性搜索蛋白序列数据库和布鲁克海文PDB蛋白结构数据库,找到了编号pd

蛋白酶体的结构和分布

蛋白酶体广泛分布于细胞质和细胞核中,26s蛋白酶体是一种分子量为2000的多亚基复合物,约有50种蛋白质亚基组成。具有多种蛋白水解酶活性,并且具有泛素依赖性。

合成端粒酶主要蛋白结构被揭开

  加利福尼亚大学洛杉矶分校的生化学家近日绘制出合成端粒酶(核糖体蛋白酶)的主要蛋白质及RNA(核糖核酸)的结构,从而揭示了这种对于医治癌症与衰老具有十分重要意义的酶的合成机理。研究成果刊登在7月13日出版的《分子细胞》杂志上。   长期以来,由于端粒酶与癌症及衰老有很大关系,所以一直吸引着科学家

木瓜蛋白酶的组成结构介绍

  番木瓜未成熟果实中含有木瓜蛋白酶(Papain)、木瓜凝乳蛋白酶A(Chymopapain A )、木瓜凝乳蛋白酶B(Chym opapain B )、木瓜肽酶B (PapayaPeptidase B ) 等多种蛋白水解酶。且已知四种半胱氨酸蛋白酶的一级结构具有高度的同源性。其中,木瓜蛋白酶属巯

固氮酶结构Fe蛋白的相关介绍

  Fe蛋白由 nifH基因编码 。对多种生物固氮酶铁蛋白的一级结构的测定结果表明 , Fe蛋白都不含色氨酸 ,酸性氨基酸的含量均高于碱性氨基酸 ,各属种间的同源性为 45% ~ 90%,说明铁蛋白的基本结构较为保守 。  Fe蛋白是两个相同的亚基组成的 γ2型二聚体 。二聚体的分子量约为 59 ~

胰蛋白酶的化学结构是什么?

  胰蛋白酶是一种消化酶,由胰腺分泌。它的化学结构是一种由32个氨基酸组成的多肽链,分子量为25,700道尔顿。胰蛋白酶的氨基酸序列为:Asp-Ala-Val-Asp-Val-Thr-Glu-Lys-Asp-Leu-Ser-Glu-Ile-Glu-Glu-Glu-Ala-Val-Ala-Lys-Ar

蛋白酶体的结构和功能

蛋白酶体广泛分布于细胞质和细胞核中,26s蛋白酶体是一种分子量为2000的多亚基复合物,约有50种蛋白质亚基组成。具有多种蛋白水解酶活性,并且具有泛素依赖性。

α角蛋白的结构

  α-角蛋白主要是由α-螺旋构象的多肽链构成的,并与角蛋白的长向平行,即其氨基酸序列分为富含α螺旋的中央棒状区和两侧的非螺旋区域。其立体构造是α-螺旋的典型实例,几何表示为:两股右手α-螺旋向左缠绕,拧成一根称为原纤维的结构,直径为2nm,这就是aa组合的超二级结构。原纤维再排列成“9+2”的电缆

糖蛋白的结构

  糖蛋白中的糖链变化较大,含有丰富的结构信息。寡糖链往往是受体、酶类的识别位点。  1、 N-糖苷键型(N-连接)  N-糖苷键型主要有三类寡糖链:  ① 高甘露糖型,由GlcNAc和甘露糖组成;  ② 复合型:除了GlcNAc和甘露糖外、还有果糖、半乳糖、唾液酸;  ③ 杂合型,包含①和②的特征

扩展蛋白的结构

  其氨基末端为约 2 2个氨基酸编码的信号肽,进入分泌途径后被剪切, 使扩张蛋白成为成熟肽 。该蛋白碳末端假定的结合 区域 ( 约10kDa ) 含有一系列保守的色氨酸残基 ( w) , 这些色氨酸残基有一定的间隔,很像纤维酶 的纤维素结合区域。中间区域 ( 1 5 k Da ) 被认为是重要的催

木瓜蛋白酶的结构和功能特点

木瓜蛋白酶(Papain),又称木瓜酶,是一种蛋白水解酶。木瓜蛋白酶是番木瓜(Carieapapaya)中含有的一种低特异性蛋白水解酶,广泛地存在于番木瓜的根、茎、叶和果实内,其中在未成熟的乳汁中含量最丰富。木瓜蛋白酶的活性中心含半胱氨酸,属于巯基蛋白酶,它具有酶活高、热稳定性好、天然卫生安全等特点

枯草杆菌蛋白酶的作用及结构

枯草杆菌蛋白酶催化水解蛋白质为氨基酸 ,在有机溶剂中也能催化多肽的合成。这些碱性蛋白酶具有重要的应用价值 ,被广泛应用于洗涤剂、制革及丝绸工业。产生这类酶的菌有地衣芽孢杆菌、解淀粉芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌、缓慢芽孢杆菌、嗜碱芽孢杆菌和南极嗜冷芽孢杆菌等。它们产生的酶分别被称为枯草杆菌蛋白Carlsbe

关于骨桥蛋白的蛋白结构的介绍

  OPN作为带负电的非胶原性骨基质糖蛋白,广泛的分布于多种组织和细胞中,其相对分子质量约为44 kDa,约含300 个氨基酸残基,其中天冬氨酸、丝氨酸和谷氨酸残基占有很高的比例,约占总氨基酸量的一半。骨桥蛋白多肽链的二级结构中包括8个α螺旋和6个β折叠结构,高度保守的RGD基元两端各有一个β折叠结

简述黏蛋白的蛋白质结构

  成熟黏蛋白是由两个不同的区域:  氨基和羧基末端区域被轻度糖基化,且富含半胱氨酸。半胱氨酸残基参与建立二硫内和黏蛋白单体之间的联系。  的10〜80残基序列的多个串联重复序列,其中多达一半的形成的大的中央区域的氨基酸是丝氨酸或苏氨酸。这个区域被与数百饱和O-连接的寡糖。N-连接寡糖中也发现对粘蛋

瘦蛋白的结构特点

瘦蛋白(leptin; OB protein)又称OB蛋白。系肥胖基因(obese gene)在脂肪细胞内的表达产物。分子量16 000,含167个氨基酸残基的单链蛋白质分子、具有高度亲水性,在N端含有分泌信号肽。

波形蛋白的结构

波形蛋白单体,与所有其他中间丝一样,具有一个中心α-螺旋结构域,其末端由非螺旋氨基(头部)和羧基(尾部)结构域覆盖。两种单体可能以促进它们形成卷曲螺旋二聚体的方式共翻译表达,这是波形蛋白组装的基本亚基。α-螺旋序列包含有助于在螺旋表面形成“疏水密封”的疏水氨基酸模式。此外,酸性和碱性氨基酸呈周期性分