5月13日《自然》杂志精选
封面故事: “伯吉斯页岩型”动物群落 在早奥陶世地层被发现 加拿大的伯吉斯页岩以含有各种各样软体动物化石而出名,这些动物来自寒武纪中期,距今约5.1亿年,它们提供了一个了解早期海洋动物的窗口。现在,人们知道类似的动物来自相距非常远的不同地方,如中国和格陵兰,但过去有关证据似乎表明,这些动物在寒武纪中期灭绝了。实际上不是这样的。一种“伯吉斯页岩型”动物群落已在摩洛哥的Lower Fezouata和Upper Fezouata构造中发现,其时间在距今约4.80亿至4.72亿年前的早奥陶世。这种类型的动物在寒武纪之后显然还存在,之所以这样,既与软体化石保存机会有关,也同样与灭绝和存活有关。Fezouata生物区系为伯吉斯页岩群落和“奥陶系大规模生物多样化事件”(海洋生命史中最大事件之一,以前几乎全部由有壳类动物化石来代表)的早期阶段提供了一个联系。本期封面所示为来自Fezouata生物......阅读全文
邓子新院士《自然》子刊解析DNA第六元素
来自上海交通大学的消息,2007年8月26日至30日在英国纽卡斯尔召开的第十四届国际放线菌生物学大会开幕式上,上海交通大学教授、教育部微生物代谢重点实验室主任邓子新院士做了题为“DNA大分子上一种新的硫修饰:一个新生领域的诞生”的特邀报告,获得国际同行高度重视和广泛关注,这项发现被称为“DNA上第六
动物所发现DNA甲基化调控胚胎左右不对称发育
DNA甲基化是常见的表观遗传修饰形式,通常发生在CpG位点中的胞嘧啶,由DNA甲基转移酶所催化,将胞嘧啶(C)转变为5-甲基胞嘧啶(5mC)。DNA甲基化在基因转录调控、染色体结构稳定性、基因印记、X染色体失活等方面发挥作用。脊椎动物早期胚胎全基因组DNA甲基化图谱研究提示DNA甲基化可能在胚胎发育
将大片段插入-DNA-导入哺乳动物细胞和胚胎实验
基本方案1 通过质体融合将完整的 YAC 导入哺乳动物细胞 基本方案2 将细菌人工染色体(BAC或PAC)引入到哺乳动物细胞和小鼠胚胎中
昆明动物所揭示线粒体DNA种系突变对肿瘤易感性的影响
线粒体DNA(mtDNA)在肿瘤发生发展中的作用多年来备受关注。前期研究揭示,大部分肿瘤细胞mtDNA体细胞突变很可能都是由于其线粒体氧化磷酸化功能限制降低而产生的副产品。而mtDNA种系突变不仅存在于肿瘤组织,同样也存在于正常组织中。但是目前仍不清楚肿瘤细胞mtDNA种系突变是否和体细胞突变的
动物所发现DNA甲基化调控胚胎左右不对称发育
DNA甲基化是常见的表观遗传修饰形式,通常发生在CpG位点中的胞嘧啶,由DNA甲基转移酶所催化,将胞嘧啶(C)转变为5-甲基胞嘧啶(5mC)。DNA甲基化在基因转录调控、染色体结构稳定性、基因印记、X染色体失活等方面发挥作用。脊椎动物早期胚胎全基因组DNA甲基化图谱研究提示DNA甲基化可能在胚胎
动物中DNA转座子通过两种机制介导基因重复
转座子被认为是宿主基因组演化的重要推动力。其类型众多,包含non-LTR(Long Terminal Repeat)型逆转座子、LTR型逆转座子、Helitron型DNA转座子、TIR(Terminal Inverted Repeat)型DNA转座子等,可引起包含基因重复(gene duplic
动物细胞基因组DNA-SNP的生物芯片检测1
实验原理:1、SNP的概念及意义单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP),主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传的变异中最常见的一种。占所有已知多态性的90%以上。SNP在群体中的发生频率不小于1%。SNP在
动物细胞基因组DNA-SNP的生物芯片检测2
DNA (500 ng) is digested with Nsp I and Sty I restriction enzymes and ligated to adaptors that recognize the cohesive 4 bp overhangs. All fragment
动物细胞基因组DNA-SNP的生物芯片检测3
3.3、寡核苷酸DNA微阵列芯片检测SNP技术:寡核苷酸芯片检测基因突变技术是基因芯片技术的一种。该技术用于检测基因突变的基本原理是在玻璃、硅等载体上,根据检测需要,设计、固定多个特异的寡核苷酸探针。而后将大量经扩增、体外转录等技术掺入荧光标记分子的待测DNA样品与之杂交,若两者存在至少一个碱基的差
动物组织基因组DNA提取试剂盒使用说明(一)
动物组织基因组DNA提取试剂盒一、简介动物组织基因组DNA提取试剂盒(DePure Tissue DNA Kit)适用于动物组织、培养细胞、抗凝血液、体液、分泌液等生物样品的DNA提取。试剂盒基于硅胶柱纯化技术,提取过程中无需使用有毒的酚氯仿抽提,也无需进行耗时的醇类沉淀,整个提取过程只需30分
动物组织基因组DNA提取试剂盒使用说明(二)
六、方案1. 动物组织DNA提取该方案适合于从1~20mg动物组织,如肝脏、脾脏、肾脏、老鼠尾巴等组织样品中提取DNA,以下离心操作都在室温进行。把1~20 mg组织样品(或10 mg肝脏、肺或脾脏)剪切成尽量小的碎片,并转移至1.5ml离心管中。加入230µl Buffer MTL和20µl
自然保护区“孤岛化”不利于野生动物保护
痴迷鸟类保护的天津摄影家王建民终于可以舒一口气了。最近发生在天津市滨海新区北大港湿地自然保护区的东方白鹳中毒事件已经告一段落。 11月24日,王建民和另一位护鸟志愿者李志勇在北大港拍到了两只佩戴脚环、编号分别为962和971的东方白鹳,它们是11月11日中毒、经过10天救治
食用动物的“自然杂交等同”分类新原则与基因修饰有关
2021年4月21日,著名学术期刊《国家科学评论》在线发表了中国农业科学院农业基因组所、中国农业科学院北京畜牧兽医研究所、中国医学科学院北京协和医学院、中国科学院水生生物研究所、美国明尼苏达大学和国际育种企业Acceligen公司等单位共同撰写的观点性文章《Social Acceptance f
李平伟团队《自然》最新发文——揭示DNA免疫详细分子机制
今日,来自德州农工大学( Texas A&M University)的李平伟教授团队在《自然》杂志上在线发表了一篇最新研究论文,揭示了关于DNA免疫的一个详细分子机制。这个发现有望为自身免疫疾病和炎症疾病带来新的治疗思路。 我们知道,来自细菌和病毒的核酸会在细胞内引起强烈的免疫反应。那么,细胞
《自然》揭示DNA损伤应答过程中染色质松散新机制
4月16日,深圳大学医学部基础医学院、卡尔森国际肿瘤中心教授朱卫国团队在《自然》杂志在线发表最新研究。他们揭示了连接组蛋白H1脱酰胺化修饰促进染色质开放和DNA损伤修复的机制,为肿瘤放化疗的精准靶标设计夯实了理论基础,是肿瘤防治基础研究领域取得的突破性进展。 癌症现已成为世界范围内死亡的主要原
《自然》揭示DNA损伤应答过程中染色质松散新机制
4月16日,深圳大学医学部基础医学院、卡尔森国际肿瘤中心教授朱卫国团队在《自然》杂志在线发表最新研究。他们揭示了连接组蛋白H1脱酰胺化修饰促进染色质开放和DNA损伤修复的机制,为肿瘤放化疗的精准靶标设计夯实了理论基础,是肿瘤防治基础研究领域取得的突破性进展。 癌症现已成为世界范围内死亡的主要原
将大片段插入-DNA-导入哺乳动物细胞和胚胎实验1
基本方案1 通过质体融合将完整的 YAC 导入哺乳动物细胞实验材料靶细胞:培养的贴壁生长的哺乳动物细胞带有以neo(G418-resistance)为筛选标记的 YAC 的酵母菌株试剂、试剂盒山梨糖醇SCE 溶液ST 溶液EDTA小鼠 Cot-1 DNA仪器、耗材SD dropout 培养基和培养板
将大片段插入-DNA-导入哺乳动物细胞和胚胎实验2
基本方案2 将细菌人工染色体(BAC或PAC)引入到哺乳动物细胞和小鼠胚胎中实验材料纯化的 BAC DNA试剂、试剂盒RNase A原核的注射缓冲液透析缓冲液I乙醇小鼠胚胎哺乳动物细胞灭菌素仪器、耗材含有合适的抗生素的LB培养基Qiagen Midi-prep 试剂盒培养箱高速离心机高速离心管玻璃离
动物所研发出面向DNA数据库的物种界定规程
公共DNA数据库中包含很多生物类群,为系统学提供了大量数据来源。目前,基于分子数据的物种鉴别和界定工作已经逐步开展。现代测序技术的飞速发展,带来了海量分子数据的同时,也导致很多研究人员无法为相关数据提供准确的分类学信息。这些分类信息不够完整的分子数据,阻碍了在物种一级水平上开展精细的数据挖掘。同
动物所发现转录能够远程诱导DNA产生G四链体结构
含有连续鸟嘌呤碱基的核苷酸能够形成G-四链体结构,倾向形成G-四链体结构的序列(PQS)广泛分布在原核生物和真核生物的基因组中,G-四链体结构参与一些重要的生理和病理过程,如DNA的复制,转录和癌症的发生等。然而对于G-四链体结构如何在基因组中产生这一问题仍然不清楚。 中科院动物研究所端粒
神秘DNA可使最顽强动物水熊无水无食物仍存活30年
水熊是地球上生命力最顽强的动物,在没有食物和水的情况下,它们可以存活30年时间。目前科学家最新一项DNA分析揭晓了水熊长寿的秘密。 最新基因序列表明水熊拥有特殊能力幸存于恶劣环境,水熊具有特殊的蛋白质,可以快速补充细胞失去的水分,其它蛋白质可以修复受损细胞,使它们接近于“不可毁灭”的状态。 新
动物所等开发出低DNA用量、无扩增的PacBio建库技术
基因组信息在生命科学研究中具有重要价值。基于三代长读长的测序组装越来越广泛地应用于基因组学研究。其中,PacBio高保真测序技术因高精度的测序质量被认为是三代测序的金标准。然而,PacBio标准建库方法需要大量DNA输入,限制了其在小型昆虫或珍稀样本中的应用。DNA扩增虽然可以降低样本输入量,但会引
动物、植物、微生物中提取高质量的基因组DNA
概 述 基因组DNA的提取通常用于构建基因组文库、Southern杂交(包括RFLP)及PCR分离基因等。利用基因组DNA较长的特性,可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。加入一定量的异丙醇或乙醇,基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中, 可用玻棒将其取出,而小分子DNA则
动物所等揭示去泛素化酶调控DNA损伤的应答机制
基因组DNA持续受到各种来源DNA损伤攻击,如自然环境中的UV、正常代谢产生的ROS等。为维持基因组稳定性,真核生物进化出了一种保护机制即DNA损伤应答。DNA损伤应答是一个复杂的信号转导网络系统,它能感知DNA损伤并将信号进行传递,进而引起一系列的应答反应,如细胞周期检验点、DNA修复、转录改
动物、植物、微生物中提取高质量的基因组DNA
基因组DNA的提取通常用于构建基因组文库、Southern杂交(包括RFLP)及PCR分离基因等。利用基因组DNA较长的特性,可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。加入一定量的异丙醇或乙醇,基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中, 可用玻棒将其取出,而小分子DNA则只形成颗粒状沉淀
世界自然基金会:野生动物数量40年减少近六成
世界自然基金会(WWF)27日发布报告称,受人类活动影响,全球野生动物数量40多年里减少了近六成。 WWF引用伦敦动物学会发布的“地球生命力指数”指出,在1970年至2012年期间,野生哺乳动物、鸟类、鱼类、两栖动物和爬行动物的数量减少了58%。生活在湖泊、河流和湿地中的野生动物数量减少最多。
昆明动物所等利用蚂蝗iDNA评估自然保护区管理成效
生物多样性的灾难性丧失是当前全球面临的重要问题之一,建立自然保护区是公认的保护生物多样性的关键措施。截至2015年,全球已有约15%的陆地面积被划为自然保护区,但由于缺乏野生动物(尤其是脊椎动物)的多样性信息,如何判断这些保护区是否真正有效地保护了当地生物多样性,成为全球性难题。为解决这一难题,
世界自然基金会:野生动物数量40年减少近六成
世界自然基金会(WWF)27日发布报告称,受人类活动影响,全球野生动物数量40多年里减少了近六成。 WWF引用伦敦动物学会发布的“地球生命力指数”指出,在1970年至2012年期间,野生哺乳动物、鸟类、鱼类、两栖动物和爬行动物的数量减少了58%。生活在湖泊、河流和湿地中的野生动物数量减少最多。
专家:自然保护区“孤岛化”不利于野生动物保护
痴迷鸟类保护的天津摄影家王建民终于可以舒一口气了。最近发生在天津市滨海新区北大港湿地自然保护区的东方白鹳中毒事件已经告一段落。 11月24日,王建民和另一位护鸟志愿者李志勇在北大港拍到了两只佩戴脚环、编号分别为962和971的东方白鹳,它们是11月11日中毒、经过10天救治后
“古DNA解密现代人起源”入选《自然》2014年十大科学事件
据中国科学院古脊椎动物与古人类研究所:在2015年即将到来之际,著名的《自然》周刊回顾了过去一年的科学进展,评选出2014年度十大科学事件,“古DNA解密现代人起源”名列其中,以中国科学院古脊椎动物与古人类研究所为第一完成单位的一项重大成果是这项进展的核心部分。 2014年,中科院古脊椎所脊椎