上海药物所计算机靶标预测及发现技术研究取得新进展
中科院上海药物所蒋华良课题组与华东理工大学药学院李洪林课题组合作,继反向对接方法——TarFisDock后,该研究团队构建了药效团靶标库—PharmTargetDB(包含7000余个重要靶标结构的信息和药效团模型,涵盖了349种生物功能和110种临床适应症)。通过药效团匹配方法,课题组刘晓峰博士发展了以活性小分子为探针、搜寻潜在药物靶标、进而预测化合物生物活性的“反向药效团匹配方法”;并建立了相应的公共网络服务器PharmMapper ,相关结果发表在《核酸研究》杂志上(Nucleic Acids Research 2010, 38: W609-W614)。 药物潜在靶标的识别对于早期药物分子的研发、安全性评价和老药新用等领域都有着非常重要的意义,但是受制于通量、精度和费用的影响,实验手段的应用难以广泛开展。作为一种快速而低成本的手段,计算机辅助的靶标识别算法的开发正在受到越来越多的重视,发展快速、精确的......阅读全文
新的抗癌药物靶标——脂质化学信使
一半以上的人类癌症都具有脂质代谢化学信号异常上调,但这些信号在肿瘤形成过程中是如何被调控的仍没有得到充分的理解。 近日,宾夕法尼亚大学Youhai Chen博士等人发现:TIPE3(一种新近被新发现的致癌蛋白),通过靶向这些脂质信号途径促进癌症。 第二信使--脂质在细胞膜外信号到细胞内部的传
华人学者《Cancer-Cell》解析癌症药物新靶标
目前,美国北卡罗莱纳大学(UNC)医学院的研究人员发现,蛋白质RBM4——对基因剪接过程至关重要的一个分子,在多种形式的人类癌症中急剧下降,包括肺癌和乳腺癌。相关研究结果发表在2014年9月8日的《Cancer Cell》杂志,为开发某种治疗方法,来阻止使癌细胞增殖和扩散的遗传通路变化,提供了一
利用“数据+知识+AI”实现新靶标药物虚拟筛选
6月6日,中国科学院上海药物研究所郑明月课题组在《自然-机器智能》(Nature Machine Intelligence)上发表了题为Generic protein–ligand interaction scoring by integrating physical prior knowled
新算法突破实现药物靶标亲合力快速精准预测
海南大学药学院教授罗海彬团队联合中山大学药学院副教授李哲团队提出了一种基于组合结构的相对结合自由能 (CS-FEP) 的药物设计新方法,实现小分子药物与生物大分子靶标间的结合自由能(以下简称药物-靶标亲合力)的快速精准预测,取得药物设计关键技术的突破,实现自由能微扰(FEP)在药物设计新方法领域
癌症细胞补给线或为药物研发提供新靶标
如果血管生成拟态的确为转移铺就了道路,那么阻止它就会拯救生命。 2000年3月的一个大冷天,上百位研究人员挤在美国盐湖城一个宾馆的礼堂内,迫切想观看就癌症研究中最具争议性的观点发起的终极对决。一边是爱荷华大学癌症中心癌症生物学家Mary Hendrix。1年前,她的团队报告称,肿瘤细胞能利用
癌症细胞补给线或为药物研发提供新靶标
如果血管生成拟态的确为转移铺就了道路,那么阻止它就会拯救生命。 2000年3月的一个大冷天,上百位研究人员挤在美国盐湖城一个宾馆的礼堂内,迫切想观看就癌症研究中最具争议性的观点发起的终极对决。一边是爱荷华大学癌症中心癌症生物学家Mary Hendrix。1年前,她的团队报告称,肿瘤细胞能利用血液
新算法突破实现药物靶标亲合力快速精准预测
海南大学药学院教授罗海彬团队联合中山大学药学院副教授李哲团队提出了一种基于组合结构的相对结合自由能 (CS-FEP) 的药物设计新方法,实现小分子药物与生物大分子靶标间的结合自由能(以下简称药物-靶标亲合力)的快速精准预测,取得药物设计关键技术的突破,实现自由能微扰(FEP)在药物设计新方法领域的国
细胞瘤新靶标
科学研究人员发现可能用于治疗神经母细胞瘤的新靶点。神经母细胞瘤是zui致命的儿童癌症之一,占所有儿童癌症死亡人数的15%。多数患者无法得到完全治愈,往往在确诊时癌症已经扩散至全身。在过去的20年中,儿童接受的治疗通常伴有非常大的副作用,不仅杀死肿瘤细胞,也杀伤正常细胞。相较于其他大部分癌症,神经母细
数据+知识+AI,科学家解锁新靶标药物虚拟筛选
6月6日,中国科学院上海药物研究所研究员郑明月课题组构建了一种通用蛋白质-配体相互作用评分方法EquiScore,在药物虚拟筛选场景和先导化合物优化场景中,EquiScore对训练未见的新靶标表现出了良好的泛化性能,其可解释性分析为基于结构的药物设计提供了有价值的线索。相关研究发表于《自然—机器智能
上海药物所计算机靶标预测及发现技术研究取得新进展
中科院上海药物所蒋华良课题组与华东理工大学药学院李洪林课题组合作,继反向对接方法——TarFisDock后,该研究团队构建了药效团靶标库—PharmTargetDB(包含7000余个重要靶标结构的信息和药效团模型,涵盖了349种生物功能和110种临床适应症)。通过药效团匹配方法,课
科学家找到动物冠状病毒药物研发新靶标
近日,华中农业大学教授彭贵青团队和赵书红团队合作,鉴定出冠状病毒复制所需的关键宿主因子TMEM41B并阐明了其分子机制,为动物冠状病毒的药物研发和抗病育种提供新的靶标。 冠状病毒“利用”和“劫持”宿主因子来调节细胞内环境,并在细胞内修建一个病毒复制的“老巢”(双层囊泡DMVs)来实现高效复制。
Cell-Metabolism:代谢性疾病生化机理并发现新的潜在药物靶标
蛋白翻译后修饰是细胞生命活动的基本形式之一,也是细胞精细调控其诸多生理过程关键生物学通路之一,并与很多疾病的发生发展休戚相关。因此,负责蛋白翻译后修饰的调控酶成为当今新药研究领域的前沿和热点靶标。以其中蛋白激酶为例,近十年来在美国年销售额超过十亿美元的抗肿瘤药超过一半是靶向此类蛋白翻译后修饰调控
华中农大团队发现抗弓形虫药物设计新靶标
近日,华中农业大学农业微生物资源发掘与利用全国重点实验室、湖北洪山实验室、动物医学院申邦团队在人兽共患寄生原虫——弓形虫的营养代谢机制研究方面取得重要进展。该团队发现定位于弓形虫顶质体的一类全新的丙酮酸转运蛋白,并解析其生物学功能,为抗弓形虫药物研发提供了新的靶标。研究结果在《美国国家科学院院刊》发
华中农大团队发现抗弓形虫药物设计新靶标
近日,华中农业大学农业微生物资源发掘与利用全国重点实验室、湖北洪山实验室、动物医学院申邦团队在人兽共患寄生原虫——弓形虫的营养代谢机制研究方面取得重要进展。该团队发现定位于弓形虫顶质体的一类全新的丙酮酸转运蛋白,并解析其生物学功能,为抗弓形虫药物研发提供了新的靶标。研究结果在《美国国家科学院院刊
单靶标or多靶标:新冠检测试剂该如何选择?
目前,国家药品监督管理局(NMPA)批准的新型冠状病毒检测试剂中,大部分采用的方法为实时荧光RT-PCR。它具有简便快速、特异性强、灵敏度高等特点。那么,其高灵敏度和高特异性的基础究竟是什么呢?让我们来一探究竟。01试剂的检测性能如何体现?检测性能评价中最主要的就是灵敏度与特异性。PCR扩增产物以指
NEJM:癌症药物研发的新型靶标
SALL4基因负责调节胚胎干细胞的自我更新,是许多癌症中的关键基因,例如肝癌。现在,哈佛干细胞研究所HSCI的研究人员,在肝癌模型中对SALL4基因进行研究,找到了阻断其活性的新型药物。这项研究发表在新英格兰医学杂志(New England Journal of Medicine)上。
科学家开发出新方法筛选新的癌症药物靶标
在一项新的研究中,来自美国达纳-法伯癌症研究所和波士顿儿童医院癌症与血液疾病中心等研究机构的研究人员开发出一种新的筛查方法,即利用CRISPR-Cas9基因组编辑技术在小鼠体内测试上千个肿瘤基因的功能。他们利用这种方法揭示出新的药物靶标,从而可能潜在地改进PD-1检查点抑制剂(一类新的有前景的癌
研究揭示调节炎症的新靶标
炎症是人体自愈过程不可分割的组成部分,但是,当它变成慢性炎症时就会导致癌症、阿尔兹海默症和心血管疾病等。炎性体(inflammasomes)是遇到各种细胞应激信号时触发炎症反应的蛋白质分子机器。 都柏林圣三一学院的科学家们发现了一个调节炎症的潜在新靶点,炎症会引发一系列疾病,包括糖尿病、癌症和
肿瘤早期诊断新靶标之ctDNA
肿瘤液态活检是目前最具发展潜力的肿瘤无创诊断和实时疗效监测手段,区别于传统的临床诊断手段,该方法具有简便、安全、无创、实时等特点。广义而言,肿瘤液态活检主要是指以外周血液为主的体液标本中细胞及核酸的检测。通常包括了循环肿瘤细胞(CTC)和游离的DNA(ctDNA)两大类,是目前精准医疗的最前沿领
肿瘤早期诊断新靶标之ctDNA
肿瘤液态活检是目前最具发展潜力的肿瘤无创诊断和实时疗效监测手段,区别于传统的临床诊断手段,该方法具有简便、安全、无创、实时等特点。广义而言,肿瘤液态活检主要是指以外周血液为主的体液标本中细胞及核酸的检测。通常包括了循环肿瘤细胞(CTC)和游离的DNA(ctDNA)两大类,是目前精准医疗的最前沿领
上海药物所发布免费在线药物靶标预测平台
药物靶标的识别与验证是药物发现过程中至关重要的第一步,在药物研发过程中,30%-40%的在研药物由于药物靶标选择的不恰当而以失败告终。因此,发展一种高效的计算方法来预测新的药物靶标就显得尤其重要。 最近,中国科学院上海药物研究所朱维良研究组发布免费在线药物靶标预测平台D3TPredictor
Cell子刊:详解热点药物靶标
美国Scripps研究所TSRI的科学家确定了一个热点酶与一些重要蛋白相互作用时的结构,这些蛋白涉及了神经退行性疾病和胰岛素抵抗。这种酶就是C- jun氨基末端激酶JNK,它对神经细胞的存活有关键影响,被视为治疗帕金森症、阿尔茨海默症、肌萎缩侧索硬化ALS等大脑疾病最具价值的药物靶点之一。该
广州生物院发现抗结核一线药物吡嗪酰胺的新靶标
根据世界卫生组织的最新统计,全世界每年新发结核病病例从900万增加至1400万,每年死亡140-150万人(2015年死亡180万人)。结核病(tuberculosis,TB)是由结核分枝杆菌( Mycobacterium tuberculosis, Mtb)引发的主要通过呼吸传播的致死性传染病
乳腺癌治疗有潜在新靶标
近日从中国科学院昆明动物研究所了解到,该研究所陈策实课题组研究发现,转录因子KLF5在乳腺癌的发生发展过程中发挥重要作用。近日,该研究论文发表在《病理学杂志》上。 此前的研究表明,KLF5在乳腺癌干细胞的自我更新和维持过程中发挥关键的促进作用,但KLF5在正常干细胞以及乳腺发育过程中的作用还没
学者发现影响记忆维持的新靶标
11月16日,陆军军医大学基础医学院副研究员张宽课题组、研究员谌小维课题组与德国慕尼黑工业大学团队等合作,在《自然-神经科学》上发表论文,发现学习过程可诱导皮层星形胶质细胞产生新的钙信号,该信号由尼古丁受体所介导,对记忆维持至关重要。
研究发现新的抗衰老靶标基因
我国科学家从神经系统和基因层面揭示了衰老的原理,并发现了BAZ2B这一全新的抗衰老靶标基因,为延缓大脑衰老提供了新的理论依据。2月27日凌晨,相关研究成果以《两个保守的表观遗传调控因子妨碍健康衰老》为题在国际著名学术论文期刊《自然》上在线发表。 该研究由中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心(
我国科研团队发现哮喘治疗新靶标
记者近日从常州大学获悉,上海中医药大学杨永清教授研究团队与该校邓林红教授研究团队合作,发现了哮喘治疗新靶标——肌动蛋白结合蛋白2(Transgelin-2),这将为研发哮喘治疗新药与有效控制哮喘,找到了一条新的路径。研究成果日前已刊登在国际著名期刊《Science Translational M
eNeuro:发现治疗饮酒上瘾的新靶标
根据一项在雄性大鼠身上进行的最新临床前研究,激活大脑中一个功能未知的受体可以降低大量酗酒以及戒酒带来的痛苦。这项发表在《eNeuro》上的新研究为治疗过度饮用酒精带来了一种新方法。 超过1/3的被批准的药物都是靶向G蛋白偶联受体(GPCRs)。该家族的一个受体GPR139在松果体中高表达,而松
细胞分裂研究带来癌症新靶标
最近,结构生物学家在一项研究中表明,细胞分裂过程中一个明显关键的步骤,取决于特定蛋白质之间的一种独特的相互作用,包括一个与癌症密切相关的蛋白质。现在他们希望,这种相互作用的新特性,将使其成为探索癌症新疗法的一个靶标。相关研究结果发表在8月30日的《eLife》杂志。 细胞分裂或有丝分裂,是高中
学者发现影响记忆维持的新靶标
11月16日,陆军军医大学基础医学院副研究员张宽课题组、研究员谌小维课题组与德国慕尼黑工业大学团队等合作,在《自然-神经科学》上发表论文,发现学习过程可诱导皮层星形胶质细胞产生新的钙信号,该信号由尼古丁受体所介导,对记忆维持至关重要。 示意图 记忆是如何维持的?人们对其详细机制尚不清楚,相关研