7月8日《自然》杂志精选
封面故事： “μ子氢”中“兰姆移位”的 最新测量结果 考虑到质子是所有普通物质的一个基本亚原子组成部分及其单独作为氢离子而存在的普遍性，我们关于其结构和行为的知识还有一些令人吃惊的空白。一项试图将质子的均方根电荷半径确定为比目前“最好”值准确1%的合作研究项目表明，那些知识空白可能要比人们所认为的更大。新确定的数值来自具有技术挑战性的光谱实验——“μ子氢”中的“兰姆移位”（一对特定能量状态之间的能量差）的测量。“μ子氢”是一个奇特的原子，在其中电子被其更重的孪生兄弟μ子代替。结果是出乎意料的：所测出的电荷半径比以前的数值几乎小5%。这一偏差仍未得到解释。这一结果可能的意义是，测量得最为准确的基本常数“里德伯常数”的数值将需要修改，或者量子电动力学理论的有效性将受到质疑。能够抑制可卡因上瘾的微RNA 长期使用可卡因诱发脑中发生若干结构和功能变化，它们有可能导致强迫性吸毒......阅读全文
亚硫酸氢盐测序法检测DNA的甲基化
亚硫酸氢盐测序法（Bisulfite sequencing PCR，BSP）用亚硫酸氢盐处理基因组DNA，则未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶，而甲基化的胞嘧啶不变。随后设计BSP引物进行PCR，在扩增过程中尿嘧啶全部转化为胸腺嘧啶，最后对PCR产物进行测序就可以判断CpG位点是否发生甲基化称为BS
亚硫酸氢盐修饰后测序法检测甲基化
实验方法原理重亚硫酸盐使DNA中未发生甲基化的胞嘧啶脱氨基转变成尿嘧啶，而甲基化的胞嘧啶保持不变，用PCR扩增（引物设计时尽量避免有CpG，以免受甲基化因素的影响）所需片段，则尿嘧啶全部转化成胸腺嘧啶。最后对PCR产物进行测序，并且与未经处理的序列比较，判断是否CpG位点的甲基化状态。实验材料DNA
关于甲基化的亚硫酸氢盐测序法介绍
用亚硫酸氢盐处理基因组DNA，则未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶，而甲基化的胞嘧啶不变。随后设计BSP引物进行PCR，在扩增过程中尿嘧啶全部转化为胸腺嘧啶，最后对PCR产物进行测序就可以判断CpG位点是否发生甲基化称为BSP-直接测序方法。将PCR产物克隆至载体后进行测序，可以提高测序成功率，
亚硫酸氢盐修饰后测序法检测甲基化
DNA甲基化 实验方法原理 重亚硫酸盐使DNA中未发生甲基化的胞嘧啶脱氨基转变成尿嘧啶，而甲基化的胞嘧啶保持不变，用PCR扩增（引物设计时尽量避免有CpG，以
亚硫酸氢盐修饰后测序法检测甲基化
实验材料 DNA试剂、试剂盒 NaOH苯二酚（氢醌）亚硫酸氢钠石蜡油仪器、耗材 离心管恒温水浴锅铝箔纸实验步骤 1.将约2ugDNA于1.5mlEP管中使用DDW稀释至50ul； 2.加5.5ul新鲜配制的3M NaOH； 3. 42℃水浴30min； 水浴期间配制： 4.10mM对苯二酚（氢醌）
亚硫酸氢盐测序法检测甲基化的介绍
用亚硫酸氢盐处理基因组DNA，则未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶，而甲基化的胞嘧啶不变。随后设计BSP引物进行PCR，在扩增过程中尿嘧啶全部转化为胸腺嘧啶，最后对PCR产物进行测序就可以判断CpG位点是否发生甲基化称为BSP-直接测序方法。将PCR产物克隆至载体后进行测序，可以提高测序成功率，
DNA甲基化检测的序曲——亚硫酸氢盐转化
检测DNA甲基化的方法有很多种，在众多方法中，研究人员常常会使用到一项技术，那就是亚硫酸氢盐转化。DNA的亚硫酸氢盐处理将未甲基化的胞嘧啶转化成尿嘧啶，而甲基化的胞嘧啶保持不变。随后用测序、定量PCR和芯片等分析来比较处理和未处理DNA的序列，就能确定哪些碱基是甲基化的。尽管在理论上很简单，但亚硫酸
亚硫酸氢盐修饰后测序法甲基化检测
第一部分 基因组DNA的提取这一步没有悬念，完全可以购买供细胞或组织使用的DNA提取试剂盒，如果实验室条件成熟，自己配试剂提取完全可以。DNA比较稳定，只要在操作中不要使用暴力，提出的基因组DNA应该是完整的。此步重点在于DNA的纯度，即减少或避免RNA、蛋白的污染很重要。因此在提取过程中需使用蛋白
饶子和、刘志杰小组最新《自然》子刊解析蛋白机构
附：饶子和 中国科学院院士 清华大学教授，结构生物学实验室主任 中科院生物物理所所长，学术委员会主任 清华大学"蛋白质科学"教育部重点实验室任 中国晶体学会常务理事兼生物大分子委员会主任 中国生物物理学会理事兼生物大分子委员会主任 研究方向：与重大疾病或重要生理功能
邓子新院士《自然》子刊解析DNA第六元素
来自上海交通大学的消息，2007年8月26日至30日在英国纽卡斯尔召开的第十四届国际放线菌生物学大会开幕式上，上海交通大学教授、教育部微生物代谢重点实验室主任邓子新院士做了题为“DNA大分子上一种新的硫修饰：一个新生领域的诞生”的特邀报告，获得国际同行高度重视和广泛关注，这项发现被称为“DNA上第六
“前孵化器”获《自然》子刊好评
记者从华南理工大学获悉，近日，生物技术领域顶级刊物《自然—生物技术》的年度特辑发表了题为《中国生物制药产业集群》的专题文章。 文章高度评价了中国生物制药产业和华南理工大学创办的创新医药“前孵化器”。文章写道：如何跨越科研成果和风险投资之间的“一厘米”障碍，一直是困扰全球生物
《自然》子刊：老鼠变身人类肝细胞工厂
美国俄勒冈卫生科学大学（Oregon Health & Science University）的研究人员已经能够将一只小鼠变成生产人类肝脏细胞的一个工厂，这些肝细胞能够用来检测药物如何被代谢。 这项在近期的《自然·生物技术》杂志上公布的技术在不久的将来不但会成为检测药物在肝脏中代谢的黄金标准，而
《自然子刊》：新年到，见酒笑？危！
春节即将来临，你准备好在酒桌上，同各路好汉一决高下了吗？可如果因为一时贪杯，喝坏了身体，那可就得不偿失了。 当地时间1月12日，美国科学家发布了一项最新研究成果：急性饮酒极有可能引发心房颤动。这项研究无疑给那些跃跃欲试、准备在酒桌上大展拳脚的人当头一棒。糟糕，是“心动”的感觉！ 心房颤动（简
《自然》子刊：乳腺癌竟会“遥控”骨髓！
法国巴黎西岱大学的Julie Helft及其同事们的最新研究表明，乳腺癌能够在保留其自我更新能力的情况下，诱导全身的造血干细胞向髓系细胞的分化。 他们使用转录组学分析和原位成像技术，发现乳腺癌能够远程重塑骨髓造血微环境，诱导造血干细胞和间充质干细胞在转录水平和空间定位上发生变化，从而影响造血微
2018国自然研究热点二：－RNA甲基化研究深度剖析
一、听说最近 RNA甲基化很火，它是何方神圣？ 1、高分文章频现 说起近来的科研热点，RNA甲基化修饰的相关研究可以说是当前整个生命科学领域最热门的方向之一，亮点文章频出，着实让人有些目不暇接。RNA甲基化的研究近3月发表的文章影响因子为10分以上的，就有高达 17 篇。 图：
Nature子刊：孕前饮食会影响后代的甲基化
科学家们首次在人类中证实，女性怀孕前的饮食情况会对其子女的基因功能产生永久性的影响。 研究人员在非洲冈比亚的乡村进行了这项研究，那里的人们完全依赖自己种植的食物，而且季节性气候对人们的膳食结构有很大影响（特别是雨季和旱季之间）。 研究团队选择了84名在雨季高峰期受孕的妇女，和83名在旱季高峰
Nature子刊：基于纳米孔的新甲基化检测技术
Mayo诊所与Illinois大学的研究人员合作，开发出了一种检测甲基化DNA的新单分子检测技术，这种技术以固态的纳米孔为基础。文章发表在Nature旗下的Scientific Reports杂志上。 表观遗传学修饰可以不改变基因编码，而影响基因的开启或关闭。甲基化是表观遗传学修饰的一
Nature子刊：突破性测序技术绘制甲基化图谱
通过一种新的DNA测序技术，研究人员首次绘制了致病菌全基因组甲基化标记图谱。通过比较相关菌株之间的甲基化模式，他们发现了称作噬菌体的病毒感染细菌显著改变宿主的一种方式。 布莱根妇女医院(Brigham and Women"s Hospital)、霍华德休斯医学研究所研究员Matthew K
快速可靠的甲基化分析，无需亚硫酸氢盐转化
在甲基化分析中，亚硫酸氢盐转化通常是必经之路。它将未甲基化的胞嘧啶转化成尿嘧啶，而甲基化的胞嘧啶保持不变，之后再结合PCR、测序等技术分析甲基化状态。听上去似乎很简单，但要想获得漂亮的结果，却并非那么容易。转化效率如何?回收率如何?这都是需要考量和优化的因素。 最近，QIAGEN
甲基化检测方法（亚硫酸氢盐修饰后测序法）
甲基化是目前的研究热点，就我所做的一点工作并其中一点心得，与大家分享。希望能够对大家有所帮助。 第一部分 基因组DNA的提取。 这一步没有悬念，完全可以购买供细胞或组织使用的DNA提取试剂盒，如果实验室条件成熟，自己配试剂提取完全可以。DNA比较稳定，只要在操作中不要使用暴力，提出的基因组DNA应
游中胜《自然》子刊颠覆原有理论
当细胞核中的遗传物质开始分离的时候，一种称为ATM蛋白开始行使功能，这种蛋白由共济失调-毛细血管扩张突变基因（ataxia-telangiectasia mutated gene，ATM基因）编码。近期来自萨克生物研究学院（the Salk Institute for Biological Stud
区域选择性氢胺甲基化反应研究取得新进展
有机胺是一类重要的化工中间体，广泛用于农药医药、生物活性天然产物以及功能材料单体等化学品的合成。烯烃的氢胺甲基化是一类重要的串联羰基化反应，能以一锅的方式直接合成有机胺，具有100%原子经济性。然而，目前的氢胺甲基化反应中，均相催化体系存在昂贵铑、钌金属难以重复使用，双相催化工艺反应效率较低，同时多
甲基化检测方法（亚硫酸氢盐修饰后测序法）2
此步细节：1：在使用注射器时，一定要用力均匀且轻，如使用暴力，会将小柱内的薄膜挤破，失去作用。2：乙酸铵、糖原不需新鲜配制，糖原配好后放在-20度保存，乙酸铵室温即可，因为这样浓度的乙酸铵非常难溶，一旦放在4度，取出用时也会有很多溶质析出。3：异丙醇、70%乙醇都不需要新鲜配制，但如果用量大，现场配
甲基化检测方法（亚硫酸氢盐修饰后测序法）（2）
第三部分 修饰后DNA纯化回收EP管如无特别说明均为高压蒸汽灭菌的。1. 将移液器枪头伸入石蜡油层下，先轻轻加压使其中一小段石蜡油排出，然后吸取混合液至一洁净1.5mlEP管中。2：以下使用Promega Wizard Cleanup DNA纯化回收系统（Promega，A7280）1）70℃水浴预
甲基化检测方法（亚硫酸氢盐修饰后测序法）1
第一部分 基因组DNA的提取。这一步没有悬念，完全可以购买供细胞或组织使用的DNA提取试剂盒，如果实验室条件成熟，自己配试剂提取完全可以。DNA比较稳定，只要在操作中不要使用暴力，提出的基因组DNA应该是完整的。此步重点在于DNA的纯度，即减少或避免RNA、蛋白的污染很重要。因此在提取过程中需使用蛋
北京大学Nature子刊开发甲基化分析新技术
来自北京大学的研究人员称他们开发出了一种单细胞简化代表性重亚硫酸盐测序（single-cell reduced-representation bisulfite sequencing，scRRBS），并利用它绘制哺乳动物细胞的DNA甲基化组景观图。这一重要的成果发布在4月2日的《Nature P
自然子刊：揭示基因组编辑新机制
中国科学院上海生命科学研究院（人口健康领域）中科院-马普学会计算生物学伙伴研究所杨力研究组与上海科技大学陈佳研究组、南京医科大学沈彬研究组合作研究揭示了胞嘧啶脱氨酶（APOBEC）在CRISPR/Cas9引发的DNA断裂修复过程中产生突变的新机制，为进一步提高基因组编辑保真度提供了新思路。 C
《自然》新子刊将聚焦催化和电子学
《自然》系列研究期刊将于2018年1月增加两个新刊《自然—催化》）和《自然—电子学》，并自2017年春季开始接受投稿。两刊仅在线出版，均为订阅模式。 《自然—电子学》将涵盖电子学各领域，如电子学研究的商业和工业应用，其核心是关注新技术的发展并了解其对社会所产生的影响。该刊将发表电子学各领域的基
川大教授丘小庆最新《自然》子刊文章
来自四川大学华西医院生物治疗国家重点实验室（State Key Laboratory of Biotherapy），移植免疫卫生部重点实验室（Key Laboratory of Transplant Immunology of Ministry of Health）等处的研究人员通过一个同类骨架区（
《自然》子刊：全新AI诊断工具——阅读病历－智能诊断
今日最新上线的《自然》子刊《Nature Medicine》上，发表了一项激动人心的成果：利用机器学习和自然语言处理等人工智能（AI）技术，广州市妇女儿童医疗中心的夏慧敏教授和加州大学圣地亚哥分校（UCSD）张康教授领衔的一支研究团队，合作带来一款全新的AI诊断工具。这项工具和人类医生一样，当填