LeroyHood：系统生物学将揭开后基因组时代新篇章
加利福尼亚理工学院教授，美国系统生物学研究所所长，美国科学院、美国工程院和美国医学院院士，美国总统科学顾问。Leroy Hood教授是国际系统生物学创始人，也是国际人类基因组计划倡导者之一。他多年从事分子免疫学、生物技术以及基因组学的研究，先后发表文章600多篇，获得ZL14项。他与同事发明了DNA测序仪、DNA合成仪、蛋白质合成仪和蛋白质测序仪，并成功实现产业化，对全球生命科学研究和生物产业发展产生了深远影响。 近日，应邀来湖南大学出席“第四届生物分析、生物医学工程和纳米技术国际研讨会”的Leroy Hood教授就现代生物学发展前沿问题接受了记者的专访。 记者：您多年从事分子免疫学、生物技术及基因组学研究，同时作为人类基因组计划的最早倡导者之一，请您谈谈国际人类基因组计划取得成功的重要意义。 Leroy Hood：人类基因组计划是21世纪揭示人类本身问题的一个科学工程，其意义在于：一是能把人类基因揭示......阅读全文
细菌中制备基因组DNA实验
实验方法原理 提取DNA的一般过程是将分散好的组织细胞在含SDS（十二烷基硫酸钠）和蛋白酶K的溶液中消化分解蛋白质，再用酚和氯仿/异戊醇抽提分离蛋白质，得到的DNA溶液经乙醇沉淀使DNA从溶液中析出。实验材料 细菌试剂、试剂盒 TE氯化铯溴化乙锭NaCl乙醇CTAB仪器、耗材 离心机摇床实验步骤 1
怎样对基因组DNA质量检测
怎样对基因组DNA质量检测用凝胶电泳看,有没有质白质和RNA等物质的污染,还可以测OD,用OD260/280来判断,当OD260/OD280< 1.8,表示蛋白质含量较高当OD260/OD280> 2.0,表示RNA含量较高当OD260/OD280=1.2.0,表示DNA较纯
基因组DNA的纯化与回收
实验概要质粒、噬菌体等经酶切，电泳；PCR产物经电泳后，常常需要对一些DNA电泳片段进行回收和纯化，用于亚克隆、探针标记、测序等。DNA回收和纯化常用方法有压碎法、低融点琼脂糖法、冻融法等，也有现成的试剂盒供应。主要试剂酚、氯仿、NaAc、无水乙醇、TE、Tris-HCl饱和酚、异丙醇、低融点琼脂糖
昆虫全基因组DNA的提取
实验概要利用改进的CTAB 法提取昆虫全基因组DNA。主要试剂1. 蛋白酶K[美国Merck公司]2. 三羟甲基氨基甲烷(Tris)[美国Amresco公司]3. Taq DNA聚合酶及dNTP[NEB公司]4. 琼脂糖及溴化乙锭(EB)[美国Amresco公司生产]5. 乙二胺四乙酸钠(Na2ED
生物基因组DNA的分类介绍
1、蛋白编码序列。以三联体密码方式进行编码。编码DNA在基因组中所占比例随生物而异,在人类细胞基因组中,这一比例只有1.5%左右。这类编码序列主要是非重复的单一DNA序列,一般在基因组中只有一个拷贝（单一基因）,然而,也有可能有两个或几个拷贝甚至多达上千个拷贝的情况,这些都来自于从基因家族里派生
Dreyer肽段/蛋白测序仪的小故事
上世纪70年代的生化学家在钻研细胞信号传递、循环和粘附的蛋白化学特征时遇到两个难题：高精度纯化蛋白和提纯低分子量蛋白。 比如，在人类破译干扰素结构之前的20多年中，很难对其进行纯化；血管紧缩素II（angiotensin II ，8个氨基酸）和抗利尿激素后叶加压素（vasopressin，9个
DNA指纹在生物学领域的应用
DNA指纹技术能够从DNA分子水平给每个玉米品种一个“身份证号码”，以其准确可靠、简单快速、易于自动化的优点越来越多的应用于品种管理。玉米DNA指纹，是从DNA分子水平给予每个玉米品种一个能够准确表明其身份的代码，就像每个人都有一张身份证，DNA指纹就是玉米的“分子身份证”。玉米的‘分子身份证’则是
DNA半保留复制的生物学意义
DNA既然是主要的遗传物质，它必须具备自我复制的能力，即通过复制形成新的和原来一样的DNA分子的能力。但双链DNA是如何解链、如何进行复制和如何保证DNA序列不变的，一直有很多的假说。DNA在活体内的半保留复制特征已为1958年以来的大量试验所证实。DNA分子独特的双螺旋结构，为复制提供了精确的模板
DNA新“写法”提振合成生物学
虽然科学家能以更快的速度阅读DNA序列，但其编写DNA的能力并未跟上。那些想要的用于诸如合成生物学等领域的“定制”DNA，只能勉强对付在缓慢且昂贵的化学过程中被合成的短链。 这种情况似乎即将改变。近日，来自法国一家生物技术初创公司的研究人员在于美国旧金山举行的合成生物学会议上宣布，利用生物体内
分离基因组DNA和质粒DNA有哪些不同之处
分离质粒时，可以将质粒去得很干净。方法为：先用TE之类的试剂将菌液悬浮起来，再用NaOH和SDS将菌液裂解（起裂解作用的主要是NaOH，但此时，SDS可以与蛋白很好的结合）。第三步，加入酸中合第二步中的碱，并且将SDS沉淀下来，同时，SDS和蛋白也一起沉淀下来，而基因组上面有很多的蛋白，这样基因组就
提取基因组dna后，怎样判断dna的纯度和质量
用紫外分光光度计测od值a260/a280正常1.8左右如果制备的dna样品a260/a2802，说明样品中rna过高，可用rnase消化后，用酚、氯仿、异戊醇抽提，再用乙醇沉淀dna
卫星DNA的系统特点
多态性和保守性卫星DNA具有多态性和保守性，卫星位点由微卫星的核心序列与其两侧的侧翼序列构成，侧翼序列使某一卫星特异地定位于染色体的某一部位，而卫星本身的重复单位变异则是形成微卫星多态性的基础。在某一个体基因组中两条同源染色体的相对（侧翼序列相同）位置上如两侧翼序列间所包含的卫星重复单位数相同与不同
卫星DNA的系统特点
多态性和保守性卫星DNA具有多态性和保守性，卫星位点由微卫星的核心序列与其两侧的侧翼序列构成，侧翼序列使某一卫星特异地定位于染色体的某一部位，而卫星本身的重复单位变异则是形成微卫星多态性的基础。在某一个体基因组中两条同源染色体的相对（侧翼序列相同）位置上如两侧翼序列间所包含的卫星重复单位数相同与不同
卫星DNA的系统特点
多态性和保守性卫星DNA具有多态性和保守性，卫星位点由微卫星的核心序列与其两侧的侧翼序列构成，侧翼序列使某一卫星特异地定位于染色体的某一部位，而卫星本身的重复单位变异则是形成微卫星多态性的基础。在某一个体基因组中两条同源染色体的相对（侧翼序列相同）位置上如两侧翼序列间所包含的卫星重复单位数相同与不同
卫星DNA的系统特点
多态性和保守性卫星DNA具有多态性和保守性，卫星位点由微卫星的核心序列与其两侧的侧翼序列构成，侧翼序列使某一卫星特异地定位于染色体的某一部位，而卫星本身的重复单位变异则是形成微卫星多态性的基础。在某一个体基因组中两条同源染色体的相对（侧翼序列相同）位置上如两侧翼序列间所包含的卫星重复单位数相同与不同
基因组所阿尔兹海默症致病机理的系统生物学研究获进展
近日，中国科学院北京基因组研究所“百人计划”研究员雷红星开展的“阿尔兹海默症致病机理的系统生物学研究”取得阶段性进展，其研究论文《阿尔兹海默症中的能量代谢下调是神经元在微环境下的一种自我保护机制》(Down-Regulation of Energy Metabolism in Alzheim
美科学家：大数据驱动的健康将革新医疗范式
“利用每个人的基因组学图谱和表型组学测量来生成一个独特的‘可操作的可能性’列表。在大多数情况下，这些积极主动的行为，经过临床研究验证，将优化健康，或防止/阻止躯体和大脑从健康向疾病的演变。当疾病演化发生时，全面的、整体的和数据驱动的方法将为精准医疗应对提供信息，即利用大规模数据分析为每个个体提供有效
推进后基因组时代物理生物学探索
5月7日~8日，科学与技术前沿论坛在中科院学术会堂召开，此次论坛的主题为“后基因组时代的物理生物学”。欧阳钟灿、郝柏林、陈润生、欧阳颀等多名来自全国各大高校和科研院所的院士和学者出席了此次论坛，并发表了主题演讲。 本次论坛召集人中科院院士杨玉良表示，上世纪末以来，生命科学获得了飞速发展，积累了
于军：从基因组生物学到精准医学
今年是“人类基因组计划”宣布完成10周年。选择2003年结束这个计划是为了纪念美国沃森和英国克里克两位生物学家发现DNA双螺旋结构50周年，而沃森博士正是这个宏大计划早期的实际推动者之一。 科学界往往以重要人物和他们的重要科学发现及技术发明为里程碑。基因组学应属于分子生物学范畴，其学科的真
于军：从基因组生物学到精准医学
今年是“人类基因组计划”宣布完成10周年。选择2003年结束这个计划是为了纪念美国沃森和英国克里克两位生物学家发现DNA双螺旋结构50周年，而沃森博士正是这个宏大计划早期的实际推动者之一。 科学界往往以重要人物和他们的重要科学发现及技术发明为里程碑。基因组学应属于分子生物学范畴，其学科的真
《基因组生物学》：一种超级细菌的基因组测序完成
最近，英国桑格研究所（Wellcome Trust Sanger Institute）和布里斯托尔大学的研究者们共同完成了一种名为Steno的超级细菌的基因测序工作，研究结果显示，这是一种具有显著抗药性的生物体。对这种细菌基因组的了解将有助于研究者们发现如何应对这种具有独特抗药性的生物体。这一研究论
动物细胞基因组DNA的制备
实验概要本实验介绍了动物细胞基因组DNA的制备原理及操作流程。本方法一般可从5×107培养的非整倍体细胞（如HeLa细胞）中获得大约200μg DNA。DNA的长度可达到100~150kb。20ml正常血的DNA产量约为250μg。实验原理真核生物的一切有核细胞（包括培养细胞）都能用来制备基因组
基因组DNA文库构建必备实验技巧
基因组DNA文库用途十分广泛，如用于人类及动植物基因组学研究，基因表达调控研究，分析、分离特定的基因片段等。通常情况下，基因组文库构建的基本流程可以归为四大步骤：分离基因组DNA、对基因组DNA作相关的处理、将基因组DNA片段连接入载体、将重组载体转入宿主细胞。一、分离基因组DNA（gDNA） 毫无
动物组织细胞基因组DNA提取
一、实验原理真核生物的一切有核细胞（包括培养细胞）都能用来制备基因组 DNA.真核生物的DNA是以染色体的形式存在于细胞核内，因此，制备DNA的原则是既要将DNA与蛋白质、脂类和糖类等分离，又要保持DNA分子的完整。提取DNA的一般过程是将分散好的组织细胞在含SDS（十二烷基硫酸钠）和蛋白酶K的溶液
基因组DNA提取与PCR扩增技术
一、基因组DNA提取实验目的基因组DNA的制备是基因分析的前提。 本实验要求掌握基因组DNA提取的基本方法。实验原理 DNA在生物体内是与蛋白质形成复合物的形式存在的。核酸与蛋白质之间的结合力包括离子键、氢键、范德华力等，破坏或降低这些结合力就可把核酸与蛋白分开。 DNA、RNA所含有的嘌呤环和嘧啶
动物基因组DNA－的分离纯化实验
盐溶法 实验方法原理 根据核糖核蛋白与脱氧核糖核蛋白在一定浓度的氯化钠溶液中的溶解度不同进行分离, 然后用蛋白质变性沉淀剂去除蛋白,使核酸释放出来, 再利用
动物组织细胞基因组DNA提取
一、实验原理真核生物的一切有核细胞（包括培养细胞）都能用来制备基因组 DNA。真核生物的DNA是以染色体的形式存在于细胞核内，因此，制备DNA的原则是既要将DNA与蛋白质、脂类和糖类等分离，又要保持DNA分子的完整。提取DNA的一般过程是将分散好的组织细胞在含SDS（十二烷基硫酸钠）和蛋白酶K的溶液
酵母基因组DNA简易高效提取方案
1. 10ml菌液过夜培养至饱和（OD600值为2-3） 2. 离心沉降细胞（Sorvall中以2000rpm的速度），然后以冷的、等体积的无菌蒸馏水洗涤 3. 将细胞沉淀在200μl 裂解缓冲液中重悬浮，然后加入约300μl 玻璃珠和200μl的1：1苯酚：氯仿混和液 4. 漩涡摇匀1-2min
利用CTAB法提取植物基因组DNA
一、实验原理 CTAB（十六烷基三甲基溴化铵）是一种去污剂，可溶解细胞膜并能与核酸形成复合物，该复合物在高离子强度（0.7mol/L）的溶液里是可溶的，通过离心可将复合物同蛋白质、多糖类物质分开。在酚仿变性的条件下，去除残留的CTAB和蛋白质等杂质，然后利用异戊醇或无水乙醇将DNA分
基因组DNA甲基化分析方法
早期的基因组DNA甲基化分析技术，如SssI甲基转移酶分析法、氯乙醛反应法、免疫学抗体技术等，已经不能满足现代表观遗传学研究的需求。今年来常用的基因组甲基化的方法有以下两种。1. 甲基化敏感扩增多态性实验甲基化敏感扩增多态性实验技术被用于检测双向型真菌的DNA甲基化，它是在扩增片段长度多态性技术的基