LeroyHood:系统生物学将揭开后基因组时代新篇章

加利福尼亚理工学院教授,美国系统生物学研究所所长,美国科学院、美国工程院和美国医学院院士,美国总统科学顾问。Leroy Hood教授是国际系统生物学创始人,也是国际人类基因组计划倡导者之一。他多年从事分子免疫学、生物技术以及基因组学的研究,先后发表文章600多篇,获得ZL14项。他与同事发明了DNA测序仪、DNA合成仪、蛋白质合成仪和蛋白质测序仪,并成功实现产业化,对全球生命科学研究和生物产业发展产生了深远影响。 近日,应邀来湖南大学出席“第四届生物分析、生物医学工程和纳米技术国际研讨会”的Leroy Hood教授就现代生物学发展前沿问题接受了记者的专访。 记者:您多年从事分子免疫学、生物技术及基因组学研究,同时作为人类基因组计划的最早倡导者之一,请您谈谈国际人类基因组计划取得成功的重要意义。 Leroy Hood:人类基因组计划是21世纪揭示人类本身问题的一个科学工程,其意义在于:一是能把人类基因揭示......阅读全文

基因组DNA文库构建的基本流程

基因组  DNA文库有十分广泛的用途,如用于分析、分离特定的基因片段,用以基因表达调控、人类及动植物基因组工程的研究。通常情况下,基因组文库构建的基本流程可以归为4大步骤:分离基因组DNA、对基因组DNA作相关的处理、将基因组DNA片段连接入载体、将重组载体转入宿主细胞。 一、分离基因组DN

动物细胞基因组DNA的制备

实验概要本实验介绍了动物细胞基因组DNA的制备原理及操作流程。本方法一般可从5×107培养的非整倍体细胞(如HeLa细胞)中获得大约200μg DNA。DNA的长度可达到100~150kb。20ml正常血的DNA产量约为250μg。实验原理真核生物的一切有核细胞(包括培养细胞)都能用来制备基因组  

利用CTAB法提取植物基因组DNA

一、实验原理 CTAB(十六烷基三甲基溴化铵)是一种去污剂,可溶解细胞膜并能与核酸形成复合物,该复合物在高离子强度(0.7mol/L)的溶液里是可溶的,通过离心可将复合物同蛋白质、多糖类物质分开。在酚仿变性的条件下,去除残留的CTAB和蛋白质等杂质,然后利用异戊醇或无水乙醇将DNA分

单头昆虫基因组DNA的提取

实验概要一种简单快速提取单头小型昆虫基因组DNA的方法。主要试剂1. 蛋白酶K[美国Merck公司]2. 三羟甲基氨基甲烷(Tris)[美国Amresco公司]3. Taq DNA聚合酶及dNTP[NEB公司]4. 琼脂糖及溴化乙锭(EB)[美国Amresco公司]5. 乙二胺四乙酸钠(Na2EDT

基因组DNA提取与PCR扩增技术

一、基因组DNA提取实验目的基因组DNA的制备是基因分析的前提。 本实验要求掌握基因组DNA提取的基本方法。实验原理 DNA在生物体内是与蛋白质形成复合物的形式存在的。核酸与蛋白质之间的结合力包括离子键、氢键、范德华力等,破坏或降低这些结合力就可把核酸与蛋白分开。 DNA、RNA所含有的嘌呤环和嘧啶

美科学家:大数据驱动的健康将革新医疗范式

“利用每个人的基因组学图谱和表型组学测量来生成一个独特的‘可操作的可能性’列表。在大多数情况下,这些积极主动的行为,经过临床研究验证,将优化健康,或防止/阻止躯体和大脑从健康向疾病的演变。当疾病演化发生时,全面的、整体的和数据驱动的方法将为精准医疗应对提供信息,即利用大规模数据分析为每个个体提供有效

质粒dna的提取与基因组dna的提取有何异同

  质粒DNA提取一般用沸水浴法和碱裂解法,现在一般都采用碱裂解法,并有试剂盒可用。它主要是将细胞内的环状质粒提取出来,一般需要用SDS裂解,RNA酶降解,然后过柱,再进行洗脱.过程比较简单。  而基因组DNA提取则较为复杂,也需要用SDS裂解和RND酶降解,但降解时间较长,同时对有些革兰氏阳性细菌

DNA合成仪在生物学中的应用

DNA合成仪在分子生物学领域中的应用非常广泛,大体可以概括为以下几个方面。1.合成PCR引物,DNA测序引物和杂交探针2.合成生物素标记的DNA包括生物素标记的引物用于DNA固相测序法(solid-phasesequencing),采用生物素标记的引物进行PCR扩增,再用抗生物素蛋白钓出扩增产物,由

PNAS打开基因组生物学的黑盒子

  最近,美国佛罗里达州立大学、贝勒医学院和哈佛大学-麻省理工学院Broad研究所的科学家们,开辟了人类遗传学中一个鲜为人知的领域。相关研究结果发表在7月18日的《PNAS》杂志。  在这项研究中,研究人员表明,一条不活跃的X染色体上的一段不寻常的DNA重复序列,实际上对于这种女性特有的遗传现象的整

《PLoS生物学》:乳齿象线粒体基因组测定完成

这的确有些不可思议。德国科学家利用一颗远古牙齿化石,成功确定了乳齿象完整的线粒体基因组,这也是迄今为止科学家得到的最古老的线粒体基因组。该研究成果有望加深科学家对于象类分化的理解。相关论文发表在的7月24日的《PLoS生物学》上。 2800万年前出现的乳齿象是现代大象的近亲,它们大约有3米高,有和猛

Biological Reviews:探明IgY基因组成和生物学功能

  近日,西北农林科技大学张小莺教授领衔,与英国伦敦大学国王学院Sutton教授团队的一项国际合作成果《IgY: a key isotype in antibody evolution》在Biological Reviews期刊(IF=10.75)发表。  IgY,由两条重链(H)和轻链(L)组成,

《PLoS生物学》:老鼠全基因组测序图公布

  最新一期的开放存取的《公共科学图书馆·生物学》(PLoS Biology)杂志上,美国、英国和瑞典的研究人员公布了老鼠的全基因组测序图。老鼠成为继人类之后第二个完成全基因组测序的哺乳动物。   在对人类和老鼠的基因测序图进行综合性比较后,研究人员发现两者之间的遗传差异要比人们预想的大得多。老鼠

生物学术语基因组复杂度的概念

中文名称基因组复杂度英文名称genome complexity定  义衡量基因组所含信息量的参数,由单一序列的核苷酸数目表示。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)

《基因组生物学》:孤独是一个分子

已经知道一个人的社交环境能够影响他的健康。与社会隔离的人往往死亡率较高。在最新一期的《Genome Biology》杂志上发表的首项此类研究中,来自美国加州大学洛杉矶分校的研究人员从慢性、严重孤独者的免疫细胞中发现了一种不同的基因表达模式。 这些发现揭示出社会孤立感与驱动炎症的基因活性改变有关。

攻克基因组测序难题-探究茶树生物学奥秘

  我国现存最早的中医医药典籍《本草经》记载:“神农尝百草,日遇七十二毒,得荼(茶)而解之。”这说明了茶的神奇功效。茶树起源于我国的云南、四川等地,在从中国向世界各地数千年漫长传播历程里,与全球多元文化邂逅交融,发展形成了今天地球上复杂而美妙的茶文化。茶之所以广受欢迎,除了有迷人的香气和令人愉悦的滋

张锋导师-Karl-Deisseroth荣获“引文桂冠奖”

  引文桂冠奖,是通过对Web of Science数据库平台(全球最重要的学术研究与发现平台,涵盖自然科学、社会科学和人文艺术三大领域)中科研论文及其引文进行深入分析,对遴选出的可能摘取诺贝尔奖的全球最具影响力的研究人员所颁发的奖项。  引文桂冠奖包括生理学或医学、物理、化学和经济学这四个领域,根

可穿戴设备引发大规模健康研究

  6月27日,周二上午,一名年轻人走进一间位于美国加州北部的办公室,签署了一份知情同意书,并且获得了两个将监控其心跳、睡眠模式和一系列其他身体机能的设备。他是一项按计划将持续4年且有1万人参加的研究的首批参与者之一。此项研究由谷歌的衍生公司——Verily 生命科学公司开展,旨在确定来自智能设备的

nature:-大脑中控制社交记忆的区域同时引发攻击性行为

  哥伦比亚科学家已经确定了一个可以帮助机体做出什么时候攻击入侵者以及何时接受入侵者的决定的大脑区域。这个大脑区域称CA2,是海马体的一部分。海马体是一个更大的脑结构,此前相关研究表明海马体对于机体感受其它人,地方,事物和事件的记忆至关重要。  已知CA2专注于社交记忆,即记住与他人相遇的能力。令人

基因组学为生物学家们揭示软体动物神经系统演化的奥秘

  本周的英国《自然》杂志在13日公开的基因学论文中,发表了章鱼的基因组序列,为生物学家们提供了一个机会,得以深入了解这一类神奇生物复杂神经系统的演化过程。  章鱼属于软体动物门头足纲,它的“伙伴”还包括鱿鱼和墨鱼,都是有着丰富而复杂行为的积极捕食者。在无脊椎动物当中,它们拥有多个引人注目的形态特征

知识分享:动物细胞基因组DNA提取

  实验原理   真核生物的DNA是以染色体的形式存在于细胞核内,制备DNA将DNA与蛋白质、脂类和糖类等分离,同时保持DNA分子的完整。提取DNA的过程是指将分散好的组织细胞在含SDS(十二烷基硫酸钠)和蛋白酶K的溶液中消化分解蛋白质,再用酚和氯仿/异戊醇抽提分离蛋白质,得到的DNA溶液经乙醇沉

酵母菌基因组DNA的提取实验

基本方案             实验材料 酵母菌 试剂、试剂盒

研究揭示水稻基因组-“垃圾-DNA”-的真相

  对于动植物的 DNA 来说,仅有不到 5% 能够翻译成蛋白质,进行生命活动。而大部分 DNA 转录成 RNA 之后,便不再继续翻译,这些非编码 RNA 一度被认为是转录中的 “噪音”“暗物质”, 甚至有人认为这是 “垃圾 DNA”。  近十年来,随着探索未知的技术的进步,这些所谓 “垃圾 DNA

Southern印迹及基因组DNA杂交技术实验

Southern 印迹 放射性标记的探针与固定化核酸进行杂交             实验方法原理 硝酸纤维膜或尼龙滤膜对单链DNA的吸附能力很强,当电泳后凝胶经过DNA变

从总-RNA-中除去基因组-DNA-实验

试剂、试剂盒 变性(甲醛)琼脂糖凝胶琼脂糖蒸馏水甲醛蒸馏水乙醇 甲醛MOPS 缓冲液乙二胺四乙酸MOPS乙酸钠酚 氯仿(3:1) 溶液氯仿液体酚Tris-HCl电泳缓冲液仪器、耗材 离心机和转头离心管配胶板微波炉实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂变性(甲醛)琼脂糖凝胶(配制过程见第 18步)

癌基因转化细胞:基因组DNA转染法

实验概要 癌基因转化细胞实验步骤1.提取基因DNA(含癌基因)。2.DNA准备:取供体DNA50~100微克,加3M NaCl或醋酸钠使最终浓度至0.3M混匀。3.再加2倍体积无水乙醇,3000转/分离心10分钟,去上清。4.加入转染缓冲液,待DNA充分融解后,再加入2.5M CaCl2,令最终浓度

Southern印迹及基因组DNA杂交技术实验

放射性标记的探针与固定化核酸进行杂交试剂、试剂盒预杂交液SSCSDS仪器、耗材硝酸纤维素滤膜实验步骤1. 准备适合即将进行的工作的杂交溶液。每平方厘米硝酸纤维素滤膜或尼龙膜大约需要 0.2 ml 预杂交液。预杂交液:用于检测低丰度序列:或者6x SSC ( 或 6x SSPE)5 x Denhard

应用黏粒载体构建基因组DNA文库

            实验方法原理 在 λ 噬菌体中构建基因组 DNA 文库的步骤与在黏粒载体中的步骤基本一致。在这两种系统中,真核 DNA 在体外与载体 DNA 连接,形成能包装到 λ 噬菌体颗粒中的多联体。构建在 λ 噬菌体中的文库以具有感染性的重组噬菌体

应用黏粒载体构建基因组DNA文库

在 λ 噬菌体中构建基因组 DNA 文库的步骤与在黏粒载体中的步骤基本一致。在这两种系统中,真核 DNA 在体外与载体 DNA 连接,形成能包装到 λ 噬菌体颗粒中的多联体。构建在 λ 噬菌体中的文库以具有感染性的重组噬菌体形式贮存和增殖。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理

Southern印迹及基因组DNA杂交技术实验

实验材料 基因组 DNA试剂、试剂盒 限制性缓冲液仪器、耗材 琼脂糖凝胶实验步骤 1. 7~20 μg 基因组 DNA 稀释到 500 μl 合适的限制性缓冲液中。4℃ 过夜。2. 每管加 10~20 单位限制性酶。孵育 4~6 小时。10 μl 消化液在小琼脂糖凝胶上电泳检测消化的程度。如果需要,

酵母菌基因组DNA的提取实验

实验材料 酵母菌试剂、试剂盒 SE缓冲液山梨醇EDTA溶菌酶PVP蛋白酶K缓冲液 Tris仪器、耗材 高速冷冻离心机台式离心机恒温水浴低温冰箱冷冻真空干燥器取液器电泳仪水平电泳槽紫外观测仪实验步骤 1.  1.5 ml  对数生长期细菌细胞。2.  离心,12 000 rpm,1-2 min。3.