首届中国计算蛋白质组学研讨会第一轮通知
The First China Workshop on Computational Proteomics (CNCP2010) 2010年11月10日至11日, 北京 一.会议简介 随着蛋白质组学的兴起,特别是质谱技术的快速发展,蛋白质组学研究中产生的数据规模越来越大。依靠简单的手工处理已经远远不能满足问题的需求, 通过先进的计算机算法与软件工具来自动处理大批量的蛋白质组数据已经成为蛋白质组学研究的重要分支,这就是“计算蛋白质组学” (Computational Proteomics)。 “计算蛋白质组学”是以计算技术为主要手段,通过开发高效的算法和实用的软件工具来处理大规模的蛋白质实验或模拟数据,解决蛋白质组学研究中的 蛋白质鉴定、翻译后修饰分析、蛋白质定量、蛋白质相互作用、蛋白质定位、蛋白质结构或蛋白质动力学等领域中的问题。我国的计算蛋白质组学与国际基本处于同 步的发展态势,特别是最近十年......阅读全文
蛋白翻译后修饰的基金申请解析与研究注意点(一)
每年三月初,都是科研界的“高考”倒计时,因为距离国自然基金申请的截止日期已不到半月。纵观历年国自然申请情况,蛋白的翻译后修饰都是申请中重大研究方向之一。2018年国自然统计表明,磷酸化、泛素化、乙酰化等修饰的相关基金项目,总研究资助金额超过2亿。 继上周的肠道微生物研究方案解析
蛋白翻译后修饰的基金申请解析与研究注意点(一)
每年三月初,都是科研界的“高考”倒计时,因为距离国自然基金申请的截止日期已不到半月。纵观历年国自然申请情况,蛋白的翻译后修饰都是申请中重大研究方向之一。2018年国自然统计表明,磷酸化、泛素化、乙酰化等修饰的相关基金项目,总研究资助金额超过2亿。继上周的肠道微生物研究方案解析后(国自然冲刺:打通菌群
用ETD线性离子阱质谱成功鉴定蛋白和翻译后修饰
By Andreas Huhmer, Director of Proteomics Marketing, Thermo Fisher Scientific 在翻译后修饰和/或极碱肽的序列分析方面,电子转移裂解( ETD )线性离子阱质谱是很有优势的工具。传统的诱导活化裂解(CAD)常用
用ETD线性离子阱质谱成功鉴定蛋白和翻译后修饰
在翻译后修饰和/或极碱肽的序列分析方面,电子转移裂解( ETD )线性离子阱质谱是很有优势的工具。传统的诱导活化裂解(CAD)常用来鉴定蛋白,并试图确定和找到他们修饰的位点,但这种技术有其本身固有的缺点,下面将详细叙述。与线性离子阱的结合使用的ETD是蛋白质组学研究的一个可靠的技术,可以很容
用ETD线性离子阱质谱成功鉴定蛋白和翻译后修饰
在翻译后修饰和/或极碱肽的序列分析方面,电子转移裂解( ETD )线性离子阱质谱是很有优势的工具。传统的诱导活化裂解(CAD)常用来鉴定蛋白,并试图确定和找到他们修饰的位点,但这种技术有其本身固有的缺点,下面将详细叙述。与线性离子阱的结合使用的ETD是蛋白质组学研究的一个可靠的技术,可以很容易
ImmuneChem产品在蛋白质翻译后生物修饰最新动向
最新Nature刊登的科技文献指出: 通过比较Sigma,SantaCruz的同类产品, 只有ImmuneChem的抗生物素抗体Agarose填料达到PTM蛋白质组学质谱分析应用的质量。蛋白质翻译后生物修饰是新的PTM研究领域。 抗生物素抗体Agarose填料也是非破坏性(Non-inv
国自然冲刺蛋白翻译后修饰的基金申请解析与研究注意点
每年三月初,都是科研界的“高考”倒计时,因为距离国自然基金申请的截止日期已不到半月。纵观历年国自然申请情况,蛋白的翻译后修饰都是申请中重大研究方向之一。2018年国自然统计表明,磷酸化、泛素化、乙酰化等修饰的相关基金项目,总研究资助金额超过2亿。 继上周的肠道微生物研究方案
国自然冲刺蛋白翻译后修饰的基金申请解析与研究注意点
每年三月初,都是科研界的“高考”倒计时,因为距离国自然基金申请的截止日期已不到半月。纵观历年国自然申请情况,蛋白的翻译后修饰都是申请中重大研究方向之一。2018年国自然统计表明,磷酸化、泛素化、乙酰化等修饰的相关基金项目,总研究资助金额超过2亿。 继上周的肠道微生物研究方案解析后(国自然冲
Protein-Cell:病毒感染时翻译后修饰乙酰化的动态调控
天然免疫应答是机体应对病原微生物入侵的第一道防线,在杀伤病原微生物、清除感染细胞和维持体内稳态等方面发挥关键作用。蛋白质翻译后修饰(protein post-translational modifications,PTMs)广泛参与调控各种通路中信号分子的激活。非组蛋白乙酰化修饰(non-hi
依那西普类融合蛋白的序列覆盖-度和翻译后修饰表征
电荷异构体是生物药,尤其蛋白类药物的关键质量属性之一,对药物的稳定性、溶解性、免疫原性、体内外生物学活性和药物动力学功能发挥具有重要的影响。选择一种灵敏度高、特异性强的电荷异构体检测分析方法,是控制和稳定药物生产质量的有效手段。电荷异构体作为衡量生物制剂质量的关键属性,可以反映出抗体生产工艺的稳
邵峰刘小云合作发Nature:发现新翻译后修饰解释免疫机制
【编者独家解读】首先,这篇文章结合了热点的NAD+(前面热度较高的“长生不老药”)、新冠引发的免疫研究热点。其次,对于蛋白质组学来说,以前大家常研究整个蛋白质组学体系中的常见翻译后修饰,如磷酸化修饰、糖基化修饰。这篇文章,则以质谱反映的分子量变化为切入点,发现了一种新的修饰,并且解释了其同疾病一对一
罗元明副研究员:生物质谱与蛋白翻译后修饰研究方法学
2013年12月8日,由首都医科大学附属北京朝阳医院、AB SCIEX公司主办的第四十期质谱沙龙活动在北京朝阳医院顺利举办,来自北京师范大学、北京朝阳医院、中科院微生物所、空军总医院的百余名专家学者齐聚一堂共同参加了此次沙龙活动,分析测试百科
基因翻译后调控的过程
翻译后修饰(PTM)是对蛋白质的共价修饰。像RNA剪接一样,它们有助于使蛋白质组更加丰富多样。这些修饰通常由酶催化。此外,诸如氨基酸侧链残基的共价添加这样的修饰过程通常可以被其它酶逆转。但蛋白水解酶对蛋白质骨架的水解切割是不可逆转的 。PTM在细胞中发挥着许多重要作用。例如,磷酸化主要涉及激活和失活
科学家揭示多个翻译后修饰协作调控水稻种子大小的新机制
近日,中国科学院植物研究所研究员宋献军等揭示了多个翻译后修饰协作调控水稻种子大小的新机制。相关研究成果发表于《自然—通讯》。我国未来农业的发展面临诸多挑战,随着人民生活水平的不断提高,在确保粮食安全,高产稳产的同时,也要满足人们对于优质粮的需求。水稻是我国的主粮作物,籽粒大小决定了稻米的产量和品质。
科学家揭示多个翻译后修饰协作调控水稻种子大小的新机制
近日,中国科学院植物研究所研究员宋献军等揭示了多个翻译后修饰协作调控水稻种子大小的新机制。相关研究成果发表于《自然—通讯》。我国未来农业的发展面临诸多挑战,随着人民生活水平的不断提高,在确保粮食安全,高产稳产的同时,也要满足人们对于优质粮的需求。水稻是我国的主粮作物,籽粒大小决定了稻米的产量和品质。
颉伟组分析卵子向胚胎转换过程中转录组、翻译组、蛋白质组关系
生命起始于卵子和精子的结合,终末分化的配子在受精后重编程为具有全能性的胚胎。然而,卵子发育晚期至合子基因组激活之前,基因组一直处于转录沉默状态。在此阶段发生的诸如卵子减数分裂、母源RNA去除和合子基因组转录激活等重要生物学事件都高度依赖于转录后调控。颉伟实验室前期研究表明,人和小鼠卵母细胞向胚胎
关于基因表达的翻译调控和翻译后调控的介绍
1、基因表达的翻译调控 翻译调控的效果不如转录调控或调控mRNA的稳定性,但也偶尔得到使用。抑制蛋白质翻译是毒素和抗生素的主要作用目标,因此它们可以通过超越其正常的基因表达控制来杀死细胞。蛋白质合成抑制剂包括抗生素新霉素和毒素蓖麻毒素。 2、基因表达的翻译后调控 翻译后修饰(PTM)是对蛋
Science:蛋白质翻译的真相
Yeshiva大学的科学家们开发了一个新荧光标记技术,首次确定了蛋白质合成的时间和地点。该技术允许研究者在活细胞中直接观察mRNA分子翻译成蛋白质的过程,有助于揭示蛋白质合成异常引发人类疾病的具体机制。这项研究发表在三月二十日的Science杂志上。 “过去我们一直没能确切查明mRNA翻译成蛋
蛋白质生物合成翻译模板
不同mRNA序列的分子大小和碱基排列顺序各不相同,但都具有5ˊ-端非翻译区、开放阅读框架区、和3ˊ-端非翻译区;真核生物的mRNA的5ˊ-端还有帽子结构、3ˊ-端有长度不一的多聚腺苷酸(polyA)尾。帽子结构能与帽子结合,在翻译时参与mRNA在核糖体上的定位结合,启动蛋白质生物的合成;帽子结构和p
基因表达的翻译后调控的简介
翻译后修饰(PTM)是对蛋白质的共价修饰。像RNA剪接一样,它们有助于使蛋白质组更加丰富多样。这些修饰通常由酶催化。此外,诸如氨基酸侧链残基的共价添加这样的修饰过程通常可以被其它酶逆转。但蛋白水解酶对蛋白质骨架的水解切割是不可逆转的。PTM在细胞中发挥着许多重要作用。例如,磷酸化主要涉及激活和失
Cell解析蛋白质翻译调控机制
一个细胞的内部运作涉及到不计其数的单个分子,它们参与到重复循环的相互作用之中来维持生命。蛋白质形成就是这种生命活动的基础。 宾夕法尼亚大学的Joshua B. Plotkin教授说,由于蛋白质是细胞功能的基础构件,科学家们一直以来对于细胞生成蛋白质的机制都极其地感兴趣。 “蛋白质
蛋白质易位之共翻译易位
大多数分泌蛋白和膜结合蛋白是共翻译易位的。驻留在内质网(ER)、高尔基体或内体中的蛋白质也使用共翻译易位途径。这个过程开始于蛋白质在核糖体上合成时,此时信号识别粒子(SRP)识别新生蛋白质的N端信号肽。SRP的结合会暂时停止合成,而核糖体-蛋白质复合物会转移到真核生物ER上的SRP受体和原核生物的质
叶明亮研究员:蛋白质组修饰谱分析新方法
中国科学院大连化学物理研究所 叶明亮研究员 2014年4月26日,首届全国质谱分析学术研讨会在北京西郊宾馆盛大开幕。来自中国科学院大连化学物理研究所的叶明亮研究员为大家带来题为《蛋白质组修饰谱分析新方法》的报告。翻译后修饰大多发生在具有重要生理调控功能的低丰度蛋白质
通过蛋白质组学技术对营养胁迫中泛素化修饰变化情况...
通过蛋白质组学技术对营养胁迫中泛素化修饰变化情况的分析与解读Cell Death and Disease IF=5.965Liver ubiquitome uncovers nutrient-stress-mediated trafficking and secretion of complemen
蛋白质的泛素化修饰
蛋白质的泛素化修饰主要发生在赖氨酸残基的侧链,且通常是多聚化 (多泛素化) 过程。被多泛素化修饰的蛋白质会被蛋白酶体(proteasome)识别进而被降解。三种关键的酶共同介导了这一多泛素化过程, 包括泛素活化酶 E1 (ubiquitin activating enzyme),泛素结合酶 E2 (
蛋白质修饰与肿瘤研究
蛋白质的修饰这一领域已成为全球生物医学界关注的焦点。除了一些传统的磷酸化和泛素化,硝基化、乙酰化、SUMO化引发关注外,还有一些修饰策略,如PEG化修饰、脂质体化、糖基化,这些复杂的调控作用在众多慢性疾病(退行性疾病、代谢性疾病、肿瘤、心血管、内分泌等)以及一些炎症等中都起到关键调控作用。通过对
花粉管钙通道抑制后蛋白质组学研究
实验概要本实验运用蛋白质组学技术手段对钙通道受抑制后花粉管中蛋白质表达模式进行研究,以期鉴定出与Ca2 调节花粉管生长相关的蛋白质,拓展对Ca2 在花粉管生长调节机制的认识。主要设备IPGphor II等电聚焦系统(Amersham Biosciences,Sweden)ZipTipC18 (Mil
关于生物反应器的应用—翻译与修饰的介绍
生物反应器— 转基因动物分泌的蛋白,特别是糖链成分的结构与人体蛋白有差异。因此研究分泌蛋白的修饰就显得很重要。在乳腺生物反应器中,蛋白质翻译前修饰的主要方式是在多个位点对乳腺中的蛋白前体进行信号肽剪切和对糖链进行修饰。例如,从山羊乳液中得到的长效组织型纤溶酶原激活剂与人体内和相比较,含有少量的异
蛋白质组学技术对营养胁迫中泛素化修饰变化情况分析与
吃货们,为了健康,少吃点吧! 小编知道一名资深的吃货,无论什么都阻挡不了美食的诱惑。但我忍不住要阻止:“吃货们!为了健康,少吃点吧!” 为什么要让热爱美食的你们做出如此痛苦的选择呢?看看下面这篇文献解读你就知道了。 Cell Death and Disease IF=5.96