蛋白质谱的原理及使用
质谱仪性能参数我们作为质谱仪的使用者，怎么来评估一台质谱仪的性能呢？或者说，我们如何选择质谱仪呢？质谱仪主要的性能参数如下图，就让我来依次为大伙儿解释一下这些高大上的参数名称到底是啥意思吧。检测限“官方”的定义是，与三倍噪音相当的物质的量，我们可以理解为这是质谱仪能够检测到的最低含量化合物的浓度，或者量。比这个值再低的化合物，这台质谱仪就无能为力了。我怎么知道我的质谱仪的检测限是多少呢？通常，我们会用利血平来作为一个标准的化合物测定质谱仪的检测限。比如，当我们在质谱仪中注入50 fg（飞克）利血平，如果我们获得的信噪比能达到100-1000，那么可以认为这台质谱仪的检测限是不错的。50 fg（飞克）利血平中大概只包含了几万个利血平分子，也就是说，如果能实现对含有几万个小分子的化合物进行检测，那么这台质谱仪的灵敏度是挺高的了。大家可以认为，灵敏度与检测限评估的是同一种性能。线性范围这个性能参数也是挺重要的。它表示在什么样的浓度范围......阅读全文
蛋白质质谱测序
蛋白质谱一般来讲是用来对某个蛋白质进行鉴定的方法而蛋白质测序实际上就是检测蛋白质的多肽链数目，不一定要用到质谱技术简单说，蛋白质测序的方法有很多，一般是在构建完成后，通过测序来对比之前的预测的序列是否正确。而质谱检测一般是用在蛋白质表达纯化完成后，用来鉴定是否是最初设计的那个蛋白。
蛋白质谱测定蛋白质的基础原理
蛋白质是一条或者多条肽链以特殊方式组合而成的生物大分子，大多数蛋白质会自然折叠为一个特定的三维结构。蛋白质的结构层次可以分为一级结构、二级结构、三级结构和四级结构： 一级结构：组成蛋白质多肽链的线性氨基酸序列。 二级结构：依靠不同氨基酸之间的C=O和N-H基团间的氢键形成的稳定结构，主要为α
蛋白质谱样品制备指南（二）
1 蛋白提取 1. 细胞或组织样品裂解细胞裂解及高效地蛋白提取对于高质量的蛋白纯化至关重要。以下提供针对细菌、哺乳动物、酵母和植物细胞的裂解方案，以取得较之传统物理裂解法更高的蛋白得率，甚至可从细胞样品中选择性提取目的蛋白及总蛋白的、亚组分蛋白，以及线粒体、叶绿体、细胞核、高尔基体及溶酶体等重要的细
蛋白质谱样品制备指南（一）
研究过蛋白的人都能深刻体会其复杂性和多功能性，为解决蛋白研究的困境，应运而生了一系列技术、方法、仪器等。质谱技术就是其中一个典型代表，常被用于几个蛋白研究的重要方向：蛋白基础功能探究（结构、相互作用核酸/蛋白/蛋白组、修饰功能等），蛋白鉴定（定位、机理等），蛋白定量等。 很多初入门者一般谈“谱”色变
蛋白质谱的原理及使用
质谱仪性能参数我们作为质谱仪的使用者，怎么来评估一台质谱仪的性能呢？或者说，我们如何选择质谱仪呢？质谱仪主要的性能参数如下图，就让我来依次为大伙儿解释一下这些高大上的参数名称到底是啥意思吧。检测限“官方”的定义是，与三倍噪音相当的物质的量，我们可以理解为这是质谱仪能够检测到的最低含量化合物的浓度，或
质谱检测法与蛋白质分析
质谱分析法是蛋白质研究领域和生物大分子研究领域中最重要的分析技术。由于我们对蛋白质鉴定、定量和分析的要求越来越高，希望检测技术的灵敏度也越来越高，同时能够对更为复杂的样品进行分析处理，因此推动了质谱检测技术的发展，出现了一大批新兴的质谱分析方法和仪器。 在生命科学研究工作中有一个重要问
质谱检测法与蛋白质分析
在生命科学研究工作中有一个重要问题，就是发现、鉴定蛋白质并弄清楚它们的一级结构。知道了蛋白质的氨基酸序列信息，我们就可以通过遗传密码将其与编码序列对应起来，从原则上来说，也就将细胞的生理学与遗传学联系起来了。发现、鉴定出了一个蛋白质就好像给我们打开了一扇窗，透过这个窗口，我们就能够对复杂的细胞调控网
质谱检测法与蛋白质分析（二）
离子回旋加速器与轨道离子阱质谱仪 随着功能强大的带有外部离子源的傅里叶变换-离子回旋加速器(FT-ICR)质谱仪的出现以及商业化，我们在质谱仪的分辨率与准确性方面取得了质的飞跃。有了这种新型的质谱仪，我们现在可以对ppm级乃至亚ppm级的样品进行分析了。该质谱仪的高分辨率特性不仅提高了数
质谱检测法与蛋白质分析（三）
Protein(s)：待测蛋白质样品;Enz. Digestion：酶解;Pep. Mixture：裂解产物混合物; MS Analysis：质谱检测分析;DB Search：数据库比对搜索;Identities：鉴定; Prot.DB ：蛋白质数据库;Proteom
质谱检测法与蛋白质分析（一）
质谱分析法是蛋白质研究领域和生物大分子研究领域中最重要的分析技术。由于我们对蛋白质鉴定、定量和分析的要求越来越高，希望检测技术的灵敏度也越来越高，同时能够对更为复杂的样品进行分析处理，因此推动了质谱检测技术的发展，出现了一大批新兴的质谱分析方法和仪器。本文将对近几年质谱技术的发展以及质谱技术在蛋白质
质谱研究蛋白质相互作用（一）
质谱技术已经成为了蛋白质组学研究的主力。这种技术方法能精确的检测多肽，从而帮助研究人员识别并测序多肽分子，分析它们的特征，了解它们如何进行化学修饰的。 但大多数蛋白质并不是单独行动的，一些关键的生物学过程，如DNA 复制、转录、翻译、细胞分裂和能量生成都依赖于大型蛋白复合物的行为，这些蛋白复合
质谱检测法与蛋白质分析（二）
传统的和最新的蛋白质组学研究策略虽然到目前为止，还没有一种蛋白质组学研究策略能够对某个蛋白质组进行常规的、完整的分析，但是现在的技术已经非常强大，我们相信，很快就能进行全蛋白质组学研究了。而且，对某个亚蛋白质组（比如某个细胞器或亚细胞结构的蛋白质组）进行研究早就已经不是什么难题了，这已经成为了一种常
质谱和蛋白质组学：击中目标
Nature Methods - 5, 741 - 747 (2008) 作者：Nathan Blow 分析测试百科 译 近年来，质谱仪大幅提高了动态范围和灵敏度，使研究者们在疾病生物标志物的发现和验证方面，更从容地面对挑战。 在2008年6月的美国质谱大会（ASMS）
质谱检测法与蛋白质分析（一）
质谱分析法是蛋白质研究领域和生物大分子研究领域中最重要的分析技术。由于我们对蛋白质鉴定、定量和分析的要求越来越高，希望检测技术的灵敏度也越来越高，同时能够对更为复杂的样品进行分析处理，因此推动了质谱检测技术的发展，出现了一大批新兴的质谱分析方法和仪器。本文将对近几年质谱技术的发展以及质谱技术在蛋
Orbitrap质谱蛋白质组沙龙在京举行
【导语】使用质谱仪器进行蛋白质组研究中有三个关键环节，第一个是样品的处理阶段，这是最简单，也是最重要的一个步骤。第二个阶段是仪器的操作部分，使用液相、质谱等仪器把蛋白质进行分离、分析。主要涉及仪器参数的优化调整。第三步是生物信息学分析部分，这也是最难的部分。本期沙龙中中科院生物物理所的
华盈视角：蛋白质组学——质谱技术
蛋白质作为功能的直接执行者，在生物医学领域中有着重要意义，检测蛋白质表达、修饰、互作等有助于我们理解生命机体的各类机制和活动规律，为疾病的治疗、诊断，药物的开发、优化等提供有力的支持。质谱技术作为检测蛋白质组学的主流技术，有必要了解其核心原理，才能更好的服务于科学问题的解决。1.质谱的原理： 质谱是
质谱检测法如何进行蛋白质分析？
串联质谱仪通常使用的都是离子模式来鉴定蛋白质的氨基酸序列。目前所有的MS/MS质谱仪都具有该功能。不过其它特殊的质谱仪也具有MS/MS功能。如果要发现蛋白质中的某个功能基团则需要用到母离子扫描功能或者中性丢失扫描功能，而这就必须用到三重四级杆质谱仪，如Q-Q-Q质谱仪，或四级杆离子阱质谱仪，如Q
质谱检测法如何进行蛋白质分析？
MS/MS操作模式 串联质谱仪通常使用的都是离子模式来鉴定蛋白质的氨基酸序列。目前所有的MS/MS质谱仪都具有该功能。不过其它特殊的质谱仪也具有MS/MS功能。如果要发现蛋白质中的某个功能基团则需要用到母离子扫描功能或者中性丢失扫描功能，而这就必须用到三重四级杆质谱仪，如Q-Q-Q质谱仪，或四
蛋白质比DNA更靠谱？质谱方法可分析古骨骼生命特征
分析测试百科网讯 那些致力于寻找古老琥珀中的蚊子，以期发现侏罗纪时期恐龙DNA的科学家们可能会很失落，因为这种行为只在《侏罗纪公园》系列电影中实现过。毕竟，一只刚吸完血的蚊子，恰好被树脂包裹，并且留存数千万甚至上亿年，还被科学家们发现，这概率微乎其微。当基因测序仪苦于没有远古生物的DNA用于测序
室温下探测到单个蛋白质分子磁共振谱
中国科学技术大学杜江峰教授领衔的研究团队首次在室温大气条件下获得了世界上首张单蛋白质分子的磁共振谱。该成果3月6日发表在国际著名学术期刊《科学》上。《科学》专文报道称赞“此工作是通往活体细胞中单蛋白质分子实时成像的里程碑”。 磁共振技术能够准确、快速和无破坏地获取物质的组成和结构信息。然而当
Cell子刊：蛋白质减肥法并不靠谱？
如今有不少人信奉蛋白质减肥法，认为高蛋白饮食减肥效果好，不仅可以对抗饥饿感，还能避免肌肉损失。然而华盛顿大学医学院的研究人员发现，过量摄入蛋白会消除减肥对胰岛素敏感性的改善。这项研究于十月十一日发表在Cell Reports杂志上。 “我们看到，通过高蛋白饮食减肥的女性，胰岛素敏感性没有得到任
默克蛋白质谱样品制备超全指南（二）
2. 体液样本预处理体液样本在biomarker的发现中有重要意义，虽然目前还没有通过质谱筛选或鉴定的方法发现的biomarker，但科学家们正在尝试改良低丰度蛋白的富集和鉴定效率。这就需要我们能高效地去除体液样本中的高丰度蛋白，如Albumin，IgG，transferrin等。相比市面上只能去除
定量蛋白质组学质谱采集技术进展（四）
无论是相对定量还是绝对定量方法,DIA很好地克服了DDA鸟枪法和SRM目标监测的种种不足, 在定量蛋白质组学中具有良好的应用前景。然而,目前DIA 方法的循环时间仍然较长,只能与纳流液相联用,并使用较长的梯度以获得足够的色谱峰宽,限制了DIA 的应用范围。这也是DIA 技术下一步需要解决
蛋白质质谱测序技术和仪器国产化
2015年10月17日，第二届全国质谱分析学术报告会在浙江大学紫荆港校区体育馆盛大开幕，在5位院士的精彩报告后，多位学者做了高水平的大会报告。 复旦大学杨芃原教授：蛋白质质谱测序技术和仪器国产化 复旦大学教授杨芃原教授做题为《蛋白质质谱测序技术和仪器国产化》的报告。蛋白质质谱测
默克蛋白质谱样品制备超全指南（一）
研究过蛋白的人都能深刻体会其复杂性和多功能性，为解决蛋白研究的困境，应运而生了一系列技术、方法、仪器等。质谱技术就是其中一个典型代表，常被用于几个蛋白研究的重要方向：蛋白基础功能探究（结构、相互作用核酸/蛋白/蛋白组、修饰功能等），蛋白鉴定（定位、机理等），蛋白定量等。 很多初入门者一般谈“谱”色变
蛋白质组的飞行时间质谱技术介绍
表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱技术于2002 年由诺贝尔化学奖得主田中发明，刚刚产生便引起学术界的高度重视。SELDI 技术是蛋白质组学研究中比较理想的技术平台，其全称是表面增强激光解吸电离飞行时间质谱技术(SELDI-tof)。其方法主要如下：通常情况下将样品经过简单的预处理后直接滴加到表
定量蛋白质组学质谱采集技术进展（一）
摘要 质谱是定量蛋白组学的主要工具。近年来随着定量蛋白质组学研究的深入,传统质谱定量技术面临着复杂基质干扰、分析通量限制等诸多问题。而最近一系列质谱新技术的发展,包括同步母离子选择(SPS)、质量亏损标记、平行反应监测(PRM)、多重累积(MSX)和多种全新数据非依赖性采集(DIA)等,为解决目前蛋
陆豪杰：蛋白质糖基化的质谱解析
分析测试百科网讯 2020年9月14日，由中国质谱学会（中国物理学会质谱分会）主办，分析测试百科网和中国质谱学会网承办的2020年中国质谱学会质谱网络研讨会（2020 CMSS）正式开幕。本届质谱网络研讨会正值中国质谱学会成立40周年，按报告内容涉及领域包括生命科学与组学、药物药理毒理分析、元素
定量蛋白质组学质谱采集技术进展（二）
同步母离子选择(Synchronous precursor selection, SPS)技术的出现彻底解决了MS3 响应弱的问题。SPS 技术利用多频切迹的选择波形电压(MultiNotch) [27] ,在线性离子阱中实现一次选择同时获得多个离子,最多可同时选择15 个(图2A)。利用这一原理,
不溶性蛋白质怎么测圆二色谱
1、首先取浓度大于0.5mg/ml，体积大于400ul的不溶性蛋白质。2、其次倒在一个容器中，然后倒入氢氧化钠。3、最后静置十分钟，即可测出圆二色谱。