最新基因组测序成果盘点
近来，各大杂志上陆续发表了不少重要的基因组测序成果。the scientist杂志对此进行了盘点，以飨读者。 种属：野鸭，绿头鸭(Anas platyrhynchos) 基因组：约13 billion bp 鸭子是几乎所有甲型流感病毒的天然宿主(包括H5N1)。日前，研究人员测序了一只北京雌鸭的基因组，并将其与其他鸟类和哺乳动物基因组进行比较。研究显示，鸭基因组中的免疫相关基因与鸡类似，差不多是哺乳动物的一半。 研究人员通过深度转录组分析，在鸭基因组中，鉴定了应答禽流感病毒的基因。大多数情况下，鸭在感染流感病毒之后并不表现出症状。研究人员发现，鸭的β-防御素基因多样性很高，赋予这种水鸟独特的病毒防御机制。他们还分别研究了，感染H5N1高致病菌株和弱毒株的鸭子，并在此基础上阐明了与病毒免疫有关的基因。(详见：北京鸭基因组研究或助力抗击“禽流感”) Y. Huang et al., “The duc......阅读全文
斑马鱼
一、概述斑马鱼是生长在印度、巴基斯坦淡水河流中的一种硬骨鱼（鲤鱼），成年鱼全身仅长4－5厘米，因全身横向分布着一道一道褐色的斑马线而得名。斑马鱼很容易在实验室饲养，一般3个月就可以达到生殖成熟期，雌鱼每次产卵200枚左右，一生可产卵数千枚，斑马鱼所产之卵经24小时即可胚胎发育成熟，仔鱼期只有1个月。
Nature：系统解析斑马鱼参考基因组
斑马鱼(Zebrafish)是研究发育生物学的新兴模式动物。斑马鱼由于具有饲育容易、胚胎透明、体外受精、突变种多、遗传学工具成熟等诸多优点，近年来已成为研究脊椎动物发育与人类遗传疾病的新兴模式动物。 近日，英国桑格研究所(Wellcome Trust Sanger Institute)
斑马鱼出生就识数！
意大利科学家发现，斑马鱼幼鱼在孵化后96小时里可以识别不同数量的黑条，研究者表示这一发现表明数字能力可能在新生斑马鱼中是与生俱来的。相关研究3月24日发表于《通讯—生物学》。 过去的研究表明，人类新生儿和新孵化的孔雀鱼、小鸡（孵化时脑已经高度发育的物种）具有数学能力。但在此之前，人们对新生时处
斑马鱼基础研究
近期，我们收到了很多小伙伴提交的文献奖励申请，其中，有2篇成功吸引了小编的注意，这2篇文章的内容都是斑马鱼研究相关的。我们都知道，斑马鱼是一种常见的模式生物，但是市面上针对斑马鱼的抗体却非常少，我们不仅有一百多种斑马鱼抗体，而且还可以根据客户需求来进行定制生产。下面来看看这2篇文章吧。01标题：Sa
斑马鱼显微CT实验
斑马鱼作为传统的脊椎动物模型已经广泛应用于人类疾病和胚胎发育过程的研究，斑马鱼全基因已经完全清楚，与人类基因组有85%同源性，这意味着在斑马鱼身上进行的实验，其结果很多都适用于人类。斑马鱼与其他实验常用动物相比，具有较高的繁殖率和生长速率，并且其胚胎发育过程是在体外进行的，科研人员通过显微镜直接观察
基因组学突破性成果：斑马鱼序列解析
人类发育，生理功能及疾病发生的过程涉及到成千上万的基因和其变异体，但是大部分的基因和其变异体的功能依然是未知的。过去的20年里，斑马鱼逐渐成为研究人类基因功能的重要模式动物。在《自然》杂志网站发表的两篇文章里1,2，报道了斑马鱼参考基因组序列和完成超过10,000个蛋白编码基因的断裂性突变体的鉴
斑马鱼基因编辑技术介绍
斑马鱼又叫蓝条鱼，因为其体表有暗蓝色和银色的类似于斑马一样的条纹而命名。斑马鱼属于鲤科鱼类，同属鲤科的还有我们十分熟悉的鲤鱼、鲫鱼等。斑马鱼的体型较小，成鱼体长约4-6厘米，而且成鱼常年产卵且产卵量大，可达300-1000粒，还是体外受精并发育，因此十分适合进行实验室的大规模养殖与筛选。斑马鱼这种原
斑马鱼胚胎细胞的培养
成纤维细胞饲养层 原代培养 细胞系 实验方法原理 通过用链酶蛋白酶除去绒毛膜、用添加成分的 FGF 培养液培养细胞和采用不同的胰蛋白酶消化
转基因斑马鱼的构建
实验概要本实验对斑马鱼导入含 EGFP的质粒，观察其在动物体内的表达情况，在斑马鱼体内，绿色荧光蛋白从原肠胚到出苗期均能在荧光显微镜下观察到绿色荧光。主要试剂EGFP、绿色荧光蛋白基因、pEGFP-N2载体、E.coli主要设备试管、试管架、可调式微量加样器、电泳仪、电泳槽、染色缸、42℃恒温水浴箱
斑马鱼胚胎DNA的制备
材料和试剂1. 蛋白酶K（罗氏03115836001）2. 1M的Tris，pH值8.33. 氯化钾4. 吐温20（10％，EMD4 biosciences，655207）5. NP40（10％，Merck，492018）设备1.
水生所发布高质量AB品系斑马鱼参考基因组
斑马鱼是生命科学、健康科学和环境科学等研究领域的重要模式生物之一。常见的两种实验室斑马鱼品系分别是Tubingen品系和AB品系。其中，AB品系斑马鱼被国内外很多实验室作为研究对象。然而，却缺乏一个高质量的AB品系斑马鱼参考基因组。 由于不同品系斑马鱼来源不同，各品系之间存在着大量基因序列上的
北大、加大等联手探索斑马鱼全基因组突变新技术
来自北京大学生命科学学院、美国国立人类基因组研究所和加州大学生物系的研究人员，最近在利用逆转录病毒插入法引发斑马鱼全基因组范围内基因突变的研究中取得重大进展。文章刊登于7月18日在线版《PNAS》。 研究人员采用其研制的一组技术，用假性逆转录病毒（pseudotyped retroviruses）
斑马鱼色素细胞如何形成条带
一项研究发现，斑马鱼的特征条带反映了这种动物的皮肤上的色素细胞的运动和它们之间的相互作用。尽管科研人员长久以来就注意到了数学模型可以准确地重现动物界的许多特征条带和斑点，动物图案背后的生物过程在很大程度上尚未得到解释。为了更好地理解这些过程，Hiroaki Yamanaka 和Shigeru
斑马鱼人类疾病模型的构建
斑马鱼是唯一的经过大规模遗传筛选的脊椎动物物种。许多斑马鱼的哺乳动物同源基因已经被克隆，并且发现有相似的功能，证实了斑马鱼作为人类疾病模型的可行性。通过Tol2转座子技术、基因突变（插入诱变、ENU化学诱变）、基因敲除（TALEN,CRISPER）等技术，构建在特点靶点标记荧光蛋白的转基因品系及
基因组学研究成果让斑马鱼研究“快马加鞭”
基因组学研究成果让斑马鱼研究快马加鞭（Genomics: Zebrafish earns its stripes）作者：谢训卫人类发育，生理功能及疾病发生的过程涉及到成千上万的基因和其变异体，但是大部分的基因和其变异体的功能依然是未知的。过去的20年里，斑马鱼逐渐成为研究人类基因功能的重要模式动物。
定向基因编辑改写斑马鱼的DNA
斑马鱼是基因研究中一种常用的模式生物。现在科学家可以对它们的基因组进行定向的编辑。 据Nature近日报导，在对脊椎动物和人类疾病的研究中，斑马鱼是一种重要的模式生物。它的卵是透明的，在体外孵化，它的繁殖周期很短，生长速度快，这些都意味着，很适合在生物生存的条件下对它的胚胎进行密切研究。而
斑马鱼造血干细胞生成机理
法国家日前通过对斑马鱼胚胎进行即时监控，发现了其造血的生成机理。这一成果为医学界研究白血病疗法提供了新思路。该研究由法国国家中心和巴斯德研究所共同完成。研究人员在最新一期英国杂志上报告说，他们采用即时成像对斑马鱼的胚胎进行了观察。结果发现，斑马鱼胚胎主动脉的部分内皮细胞先是发生卷曲，随后蜷缩成一团，
斑马鱼平台助力HSP发病机理研究
遗传性痉挛性截瘫（HSP）又称家族性痉挛性截瘫，是一种神经系统退行性变性疾病。其病理改变主要是脊髓中双侧皮质脊髓束的轴索变性或脱髓鞘，以胸段最重。 临床表现为双下肢肌张力增高，腱反射活跃亢进，病理反射阳性，呈剪刀步态。2018年5月11日，中国国家卫生健康委员会等5部门联合制定了《第一批罕见病目录》
方案27.6－斑马鱼胚胎细胞的培养
成纤维细胞饲养层 原代培养 细胞系 实验方法原理 通过用链酶蛋白酶除去绒毛膜、用添加成分的 FGF 培养液培养细胞和采用不同的胰蛋白酶消化
武汉研究斑马鱼揭示器官再生之谜
身长约4厘米，具暗蓝与银色纵条纹 基因与人类的相似度达87% 心脏能再生 约2000种人类疾病能出现在其身上 胚胎在体外发育，且完全透明 一种经济实惠的实验动物，一对斑马鱼一次可生产300只“鱼宝宝” “斑马鱼的基因与人类相似度高达87%，人类无法长出第二个心脏，而斑马鱼的心脏却能再生
解锁电鳗发电之谜，让斑马鱼发电
研究人员证实，他们发现的基因控制区只控制肌肉中钠通道基因的表达，而不控制其他组织。电鱼和电鳗一样，可以根据种类、性别、甚至个体来区分其他电鱼，这要归功于它们的电器官，它还允许它们传输和接收类似于鸟叫声的信息。最近发表在《科学进展》(Science Advances)上的一项研究描述了微小的基因改变是
研究揭示斑马鱼“自我定位”神经回路
斑马鱼幼鱼能够弄清它们在哪里，去过哪里，以及如何回到原来的位置。幼体斑马鱼在被洋流推离航道后如何追踪自己的位置并导航呢？科学家发现，这与一种多区域的大脑回路有关。相关研究近日发表于《细胞》。 “我们研究了一种行为，在这种行为中，斑马鱼幼鱼必须记住过去的位移，以准确地保持它们的位置，因为水流可能把
斑马鱼研究全套装备配置清单
斑马鱼由于养殖方便、繁殖周期短、产卵量大、胚胎体外受精、体外发育、胚体透明等特点，已成为生命科学研究的新宠，是最受重视的脊椎动物发育生物学模式之一。你的实验室在做斑马鱼研究吗？斑马鱼研究需要哪些工具？你知道斑马鱼研究的最强装备吗？服务全球科学家48年历史，WPI为您供全套的斑马鱼研究工具，包括斑马鱼
The－scientist：2013年度最热基因组
新的一年即将来临，The scientist杂志盘点了2013年度的高引基因组研究，让我们看看今年又有哪些新解码的基因组受到热捧。 斑马鱼基因组 种属：Zebrafish, Danio rerio 基因组大小：~1.41 billion base pairs 斑马鱼(Da
Dev－Cell：转基因斑马鱼的彩色皮肤
美国杜克大学的研究人员，利用基因工程改造的方法，造成单个的皮肤细胞可以产生70种不同颜色的荧光。该研究发表在最近的《Developmental Cell》上。 该团队并非是为了好玩才做成这样五彩斑斓的斑马鱼，实际上，他们希望通过颜色标记来研究斑马鱼皮肤的愈合。利用颜色来标记细胞，可以让斑马鱼皮
敲降斑马鱼基因的方法学比较
一、基因敲降的前期准备工作相同 1.1 生物信息学分析目标基因在斑马鱼早期胚胎发送过程中是否有表达。 1.2 收集斑马鱼早期发育胚胎（通常为48 hpf前的胚胎），提取总RNA，然后进行体外转录（RT）。 1.3 设计检测目标基因表达的PCR引物，以1.2获得的cDNA为模板，
斑马鱼基因敲除是怎么做的
一、基因敲除的设计方案 1.1 基因的基本信息 确认斑马鱼基因的基本信息，包括名称ID号等，一般会在NCBI等查询。 1.2 分析基因结构、氨基酸序列等做生物学信息的分析 1.3分析蛋白质的保守结构功能域 通过综合考虑，设计最佳的KO靶点。 1.4
斑马鱼基因敲除是怎么做的
一、基因敲除的设计方案 1.1 基因的基本信息 确认斑马鱼基因的基本信息，包括名称ID号等，一般会在NCBI等查询。 1.2 分析基因结构、氨基酸序列等做生物学信息的分析 1.3分析蛋白质的保守结构功能域 通过综合考虑，设计最佳的KO靶点。 1.4
斑马鱼如何长出新的神经元
研究人员已经发现了使得斑马鱼的大脑能够在其受到创伤性损害之后再生的机制。与哺乳动物不同，这些在淡水中生长的小鲦鱼因为脑部损伤所致的炎症会伴有新神经元的产生。 如今，Nikos Kyritsis及其同事展示，在损伤反应中，斑马鱼脑部的炎症会激活特定的信号传导分子及神经胶质细胞，后者可促进
寄生虫感染或破坏斑马鱼实验
研究人员表示，一种感染实验室斑马鱼的常见寄生虫可能令多年的行为实验结果产生混淆。不过，批评者认为，这个案例仍有待证实。 和小鼠一样，斑马鱼被用在全球的实验室中，以研究从药物疗效到诸如精神分裂症和自闭症等遗传性疾病和障碍的所有事情。由于斑马鱼和人类都具有高度社会性，因此研究人员认为，和啮齿类动物