RNAi表达载体构建(二)

(2)、序列同源性分析: 将潜在的序列和相应的基因组数据库(人,或者小鼠,大鼠等等)进行比较,排除那些和其他编码序列/EST同源的序列.例如使用BLAST( www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/)选出合适的目标序列进行合成.并非所有符合条件的siRNA都一样有效,其原因还不清楚,可能是位置效应的结果,因此对于一个目的基因,一般要选择3-5个靶位点来设计siRNA. 通常来说,每个目标序列设计3—4对siRNAs,选择最有效的进行后续研究. (3)、设计阴性对照: 一个完整的siRNA实验应该有阴性对照,作为阴性对照的siRNA应该和选中的siRNA序列有相同的组成,但是和mRNA没有明显的同源性.通常的做法是将选中的siRNA中的碱基序列打乱.当然,同样要保证它和其他基因没有同源性. 3、RNAi表达载体的选用 化学合成与体外转录方法都是在体外得到siRNA......阅读全文

RNAi表达载体构建

近年来的研究表明,一些短片断的双链RNA可以通过促使特定基因的mRNA降解来高效、特异的阻断体内特定基因表达,诱使细胞表现出特定基因缺失的表型, 称为RNA干扰(RNA interference,RNAi)。siRNA(small interfering RNAs)就是这种短片断双链RNA分子,能够

RNAi表达载体构建

近年来的研究表明,一些短片断的双链RNA可以通过促使特定基因的mRNA降解来高效、特异的阻断体内特定基因表达,诱使细胞表现出特定基因缺失的表型, 称为RNA干扰(RNA interference,RNAi).siRNA(small interfering RNAs)就是这种短片断双链RNA分子,能够

RNAi表达载体构建(二)

(2)、序列同源性分析: 将潜在的序列和相应的基因组数据库(人,或者小鼠,大鼠等等)进行比较,排除那些和其他编码序列/EST同源的序列.例如使用BLAST( www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/)选出合适的目标序列进行合成.并非所有符合条件的siRNA都一样有效,其原因还不清楚

RNAi表达载体构建(一)

近年来的研究表明,一些短片断的双链RNA可以通过促使特定基因的mRNA降解来高效、特异的阻断体内特定基因表达,诱使细胞表现出特定基因缺失的表型, 称为RNA干扰(RNA interference,RNAi).siRNA(small interfering RNAs)就是这种短片断双链RNA分

siRNA表达载体

多数的siRNA表达载体依赖RNA聚合酶III 启动子(pol III)中的一种,操纵一段45—50nt的发夹结构RNA(small hairpin RNA, shRNA)在哺乳动物细胞中的表达,shRNA在细胞内会自动被加工成为siRNA,从而引发基因沉默或者表达抑制。这一类启动子包括大家熟悉的人

RNAi载体pSIRENDNR-Vector

Restriction Map and Cloning Site of the RNAi-Ready pSIREN-DNR Vector. Unique restriction sites are in bold. RNAi-Ready pSIREN-DNR is provided as a lin

简述siRNA表达载体

  多数的siRNA表达载体依赖三种RNA聚合酶Ⅲ启动子(pol Ⅲ)中的一种,操纵一段小的发夹RNA(short hairpin RNA,shRNA)在哺乳动物细胞中的表达。这三类启动子包括大家熟悉的人源和鼠源的U6启动子和人H1启动子。之所以采用RNA pol Ⅲ启动子是由于它可以在哺乳动物细胞

siRNA表达载体的构建

siRNA表达载体构建可应用于:(1)作为后基因组时代基因功能分析的有力工具;(2)基因组学、细胞信号传导通路分析;(3)药物靶点筛选、疾病治疗。实验方法原理多数的siRNA表达载体依赖三种RNA聚合酶III 启动子(pol III)中的一种,操纵一段小的发夹RNA(short hairpin RN

siRNA表达载体的构建

实验方法原理 多数的siRNA表达载体依赖三种RNA聚合酶III 启动子(pol III)中的一种,操纵一段小的发夹RNA(short hairpin RNA, shRNA)在哺乳动物细胞中的表达。这三类启动子包括大家熟悉的人源和鼠源的U6启动子和人H1启动子。之所以采用RNA pol

表达载体的应用特点

表达载体(Expression vectors)就是在克隆载体基本骨架的基础上增加表达元件(如启动子、RBS、终止子等),使目的基因能够表达的载体。如表达载体pKK223-3是一个具有典型表达结构的大肠杆菌表达载体。其基本骨架为来自pBR322和pUC的质粒复制起点和氨苄青霉素抗性基因。在表达元件中

siRNA表达载体的构建

            实验方法原理 多数的siRNA表达载体依赖三种RNA聚合酶III 启动子(pol III)中的一种,操纵一段小的发夹RNA(short hairpin RNA, shRNA)在哺乳动物细胞中的表达。这三类启动子包括大家熟悉的人源和鼠源的U

植物表达载体的构建

实验概要本实验介绍了一种构建植物表达载体的方法。实验步骤1. 植物正义表达载体的构建    1) 用SmaI和SacI双酶切pTriplEx2-GhMT3a和植物表达载体pBI121:    2) 进行琼脂糖凝胶电泳,回收GhMT3a片段和pBI121载体;    3) 连接:连接体系为:混匀后4-

siRNA表达载体的技术特点

多数的siRNA表达载体依赖三种RNA聚合酶Ⅲ启动子(pol Ⅲ)中的一种,操纵一段小的发夹RNA(short hairpin RNA,shRNA)在哺乳动物细胞中的表达。这三类启动子包括大家熟悉的人源和鼠源的U6启动子和人H1启动子。之所以采用RNA pol Ⅲ启动子是由于它可以在哺乳动物细胞中表

表达载体的概念和应用

生物学中,基因工程的基本操作,表达载体(Expression vectors)就是在克隆载体基本骨架的基础上增加表达元件(如启动子、RBS、终止子等),使目的基因能够表达的载体。如表达载体pKK223-3是一个具有典型表达结构的大肠杆菌表达载体。其基本骨架为来自pBR322和pUC的质粒复制起点和氨

关于表达载体的组成介绍

  常用细菌质粒进行构建,构建过程中运用限制性核酸内切酶切割出与目的基因相合的末端(多为黏性末端,也有平末端),采用DNA连接酶连接,导入生物体实现表达。标记基因可帮助识别质粒并检测是否成功整合到染色体DNA中。  表达载体(Expression vectors)就是在克隆载体基本骨架的基础上增加表

λ噬菌体的载体表达实验

基本方案1 基本方案2             实验材料 表达载体 试剂、试剂盒

酰基载体蛋白的基本表达

  随着分子生物学和基因组学研究的不断深入,有关植物不同 ACP 功能分析的研究取得了一定进展。拟南芥 ACP1 是种子中优先表达的 ACP 基因。Branen 等人构建了 35S 启动子驱动的带有 ACP1 和其上游 400bp 序列的植物表达载体,转基因的拟南芥植株在叶组织中该基因的表达增加了

λ噬菌体的载体表达实验

实验材料 表达载体试剂、试剂盒 SDSLB仪器、耗材 培养箱分光光度计离心机实验步骤 1.  将表达载体转化携有温度敏感突变的抑制基因的大肠杆菌溶源菌。转化物涂布于LB/抗生素平皿上,32℃下温育。2.  于抗生素培养基中,32℃培养转化菌。 3.  以≥1:20的比例将过夜培养物稀释往新鲜的LB/

真核基因表达载体的构建

提高目的基因在哺乳动物细胞中表达的策略:1、DNA水平:增加基因拷贝数(1)高拷贝载体;(2)基因共扩增;2、转录水平:利用强启动子、增强子,可诱导启动子,如CMV、Tet;3、翻译水平:优化翻译起始序列和非编码区序列。本篇文章来源于网络,如有异议请联系我们,我们将在3个工作日内作出处理。

LSCM荧光表达载体的导入

荧光表达载体的导入 将构建好的荧光表达载体进行大量扩增,并通过质粒抽提试剂盒大量纯化,得到不含有内毒素的纯化质粒。将表达载体导入到培养细胞中后,经过培养即可进行荧光蛋白的检测。而将基因导入哺乳动物培养细胞的方法有很多种,生化转染法是很常用的导入培养细胞方法。常用的转染方法有:磷酸钙转染法和脂质体介导

关于慢病毒表达载体的介绍

  慢病毒表达载体,即通常所说的穿梭载体,包含了包装、转染、稳定整合所需要的遗传信息。慢病毒包装质粒可提供所有的转录并包装RNA 到重组的假病毒载体所需要的所有辅助蛋白。为产生高滴度的病毒颗粒,需要利用表达载体和包装质粒同时共转染细胞,在细胞中进行病毒的包装,包装好的假病毒颗粒分泌到细胞外的培养基中

甲醇酵母表达载体及其元件1

P.Pastoris表达载体及其元件由于甲醇营养型酵母菌体内无天然质粒,所以携带外源基因的重组体必须整合于染色体中才能实现外源基因的表达。整合表达的优点在于保持外源基因稳定性并可产生多拷贝基因。典型的毕赤氏酵母表达载体含有醇氧化酶基因的调控序列,主要的结构包括:5’AOX1启动子片段、多克隆位点(M

表达载体的组成及结构特点

表达载体四部分:目的基因、启动子、终止子、标记基因常用细菌质粒进行构建,构建过程中运用限制性核酸内切酶切割出与目的基因相合的末端(多为黏性末端,也有平末端),采用DNA连接酶连接,导入生物体实现表达。标记基因可帮助识别质粒并检测是否成功整合到染色体DNA中。

原核表达载体的构建介绍

  1、获得目的基因  (1)通过PCR方法:以含目的基因的克隆质粒为模板,按基因序列设计一对引物(在上游和下游引物分别引入不同的酶切位点),PCR循环获得所需基因片段。  (2)通过RT-PCR方法:提取总RNA,以mRNA为模板,逆转录形成cDNA第一链,以逆转录产物为模板进行PCR循环获得产物

有关融合蛋白表达载体的克隆

在构建融含蛋白表达载体时除了要注意插入片段的方向、读码框架与载体保持一致外,注意以下问题可能会减少一些不必要的麻烦,当外源片的插入载体起始密码的后面,另一个基因的前面时,注意检查插入后基因的两端是否引入了新的终止密码,特别是用到Klenow mung bean 核酸酶,T4 Polymerase

甲醇酵母表达载体及其元件2

2、选择标记选择标记一般为对应于营养缺陷型受体的野生型基因,常用HIs4。由于P.Pasotris不利用蔗糖,所以也可用啤酒酵母的蔗糖酶基因suC2作为标记。AMP:氨苄抗性基因,可在大肠 杆菌中筛选。G418和Zeocinr(Invitrogen,sandiego,CA)也是筛选标记,使得到高

基因编辑鼠-sgRNA表达载体构建

继上次发表的Guide RNA设计和筛选的相关知识之后,希望大家还没有忘记相关的操作和技巧,今天,我们就来和大家聊聊后续的实验,在基因编辑鼠的过程中,sgRNA表达载体是如何构建的呢?在靶点筛选结束之后,下一步就要进行sgRNA载体构建。在构建表达载体前,应根据实验目的选取合适的表达质粒。比如进行实

真核细胞表达系统的类型与常用真核细胞表达载体

原核表达系统是常被用来研究基因功能的成熟系统,由于原核表达系统具有包涵体蛋白不易纯化、蛋白修饰不完整等缺陷,人们也开始利用真核细胞表达系统来研究基因。自上世纪70年代基因工程 技术诞生以来,基因表达技术已渗透到生命科学研究的各个领域。并随着人类基因组计划实施的进行,在技术方法上得到了很大发展,时至今

λ噬菌体的载体表达实验1

pSKF是利用了λ噬菌体的调节信号的pBR222衍生质粒。λ噬菌体阻遏蛋白cI 可完全抑制PL。启动子的转录,使得含PL启动子的质粒可稳定存在于宿主菌中。 实验材料 表达载体 试剂、试剂盒 SDSLB 仪器、耗材 培养箱分光光度计离心机 实验步骤

λ噬菌体的载体表达实验2

实验材料 表达载体 试剂、试剂盒 SDSLB 仪器、耗材 培养箱分光光度计离心机 实验步骤 1.  将表达载体转化一种复制缺陷型的大肠杆菌cI+溶源菌。转化物涂布于LB/抗生素平皿上并于37℃下温育。    2.  在LB/抗生素培养基中,37℃过夜