mBio:揭秘新型冠状病毒

今年早些时候,首先出现在沙特阿拉伯的一种新型冠状病毒已经陆续导致三人致病,其中一人死亡。这无疑又给全球医疗卫生机构敲响了警钟。十一月二十日美国微生物学会旗下的mBio杂志发表了一项新研究,将这种新型病毒与蝙蝠体内的病毒联系起来。研究人员对HCoV-EMC/2012病毒进行了测序研究,分析了该病毒与其他病毒的关系及其潜在来源。这一测序分析的结果将有助于人们对这一新兴病毒进行治疗。 “该病毒与亚洲蝙蝠体内的病毒亲缘关系最近,与已知人类病毒并不相关。”该研究的领导者,荷兰Erasmus医疗中心的Ron Fouchier说,“因此,我们推测它来源于动物。” 早前感染这一新病毒的60岁沙特阿拉伯老人,经历了急性肺炎和肾衰竭并最终死亡,这不禁让人们联想起了以往的冠状病毒疫情,2002年SARS病毒最终导致超过900人死亡。在此之后,又有两位患者受到了类似病毒的感染,自此HCoV-EMC/2012病毒引发了人们的高度关注。......阅读全文

中国疾控中心已完成测序MERS病毒基因组

  中国疾控中心近日透露,该中心病毒病所与广东省及惠州市疾控中心合作,已完成我国首例MERS病例的病毒全基因组序列测定。  6月10日信息显示,韩国目前中东呼吸综合征(MERS)确诊病例为108人,死亡9人,死亡率在7%左右。韩国病例数仅次于沙特,列世界第二。近期MERS在韩国连续报告多例病例,被隔

Science:人巨细胞病毒病毒基因组测序

  人巨细胞病毒是一种很常见的疱疹病毒,感染约50-100%的成人,但通常没有不良影响,并且它可以保持潜伏多年。人巨细胞病毒感染是比较常见的,发展中国家感染人数比发达国家人数多。   该病毒可导致出新生儿生缺陷和免疫系统受损,可能会导致致命疾病。该病毒也与癌症发展有关联。这项新的研究分析了病毒的蛋

新冠病毒基因组测序的方法有哪几种?

新冠病毒基因组测序的方法有宏基因组测序和靶向测序。

mBio:揭秘新型冠状病毒

  今年早些时候,首先出现在沙特阿拉伯的一种新型冠状病毒已经陆续导致三人致病,其中一人死亡。这无疑又给全球医疗卫生机构敲响了警钟。十一月二十日美国微生物学会旗下的mBio杂志发表了一项新研究,将这种新型病毒与蝙蝠体内的病毒联系起来。研究人员对HCoV-EMC/2012病毒进行了测序研究,分析了该病毒

输入性MERS病例病毒基因测序完成

  6月5日,中国疾病预防控制中心在网站上发布信息称,该中心病毒病所与广东省及惠州市疾控中心合作,已完成我国首例输入性中东呼吸综合征(MERS)病例的病毒全基因组序列测定。结果表明,目前病毒传染性并未增强。   据悉,5月29日1时40分,中国疾控中心病毒病所收到广东省疾控中心送检的病例咽拭子标本,

关于病毒基因组的基本介绍

  病毒是最简单的生物,完整的病毒颗粒包括外壳蛋白和内部的基因组DNA或RNA(有些病毒的外壳蛋白外面有一层由宿主细胞构成的被膜(envelope),被膜内含有病毒基因编码的糖蛋白。病毒不能独立地复制,必需进入宿主细胞中借助细胞内的一些酶类和细胞器才能使病毒得以复制。外壳蛋白(或被膜)的功能是识别和

病毒基因组的结构特点介绍

  1.病毒基因组大小相差较大,与细菌或真核细胞相比,病毒的基因组很小,但是不同的病毒之间其基因组相差亦甚大。如乙肝病毒DNA只有3kb大小,所含信息量也较小,只能编码4种蛋白质,而痘病毒的基因组有300kb之大,可以编码几百种蛋白质,不但为病毒复制所涉及的酶类编码,甚至为核苷酸代谢的酶类编码,因此

利用现有技术,如何鉴定一个全新的病毒2

wuguojun680510网友的观点是:单纯凭分子生物学技术鉴定一个新的病毒是不可能的,只能得知可能是一个新病毒,鉴定一种新病毒还必需从经典途径走起。      1、纯化病毒。      2、大小、形态鉴定。      3、对称形式确定      4、核酸类型确定      5、细胞嗜性鉴定   

基因组测序

如果楼主指的是人类基因组计划,那时用的方法叫做双脱氧终止法,也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成过程中,DNA聚合酶能够使用ddNTP(双脱氧核苷酸)来作为原料,但它的反应会在加入ddNTP的时候终止。具体实验是通过PCR来完成的,但与普通PCR不同,它只需要一个引物而不是一对。在4个相同的

-英公开埃博拉病毒基因测序数据

  一个英国科研团队成功完成了对埃博拉病毒的基因测序,并已将数据在网上公开发布,免费提供给全球科研人员使用。这有助于各国研发更高效的治疗药物和疫苗。  剑桥大学3日发布公告称,2014年埃博拉疫情在西非暴发后,来自该校及英国多个科研机构的研究人员开始在塞拉利昂采集病毒样本,并利用美国一家公司开发的新

SARS病毒基因组复制机制研究获突破

  近日,武汉大学生命科学学院教授郭德银领导的研究组以选择冠状病毒特有的多个RNA加工酶作为主要研究目标,通过酵母菌系统的功能筛选和体外生物化学分析,发现SARS病毒基因组1b区编码的一种非结构蛋白nsp14同时具有两种RNA加工酶活性,一是参与RNA 5’-端加帽的N7-甲基转移酶,二是进行RNA

酵母还能快速“重建”新冠病毒基因组?

  据《自然》杂志6日发表的一项合成生物学研究,瑞士一个研究团队开发出一种可以快速重建新冠病毒的方法。重建病毒有助于研究人员开发诊疗方法和疫苗,同时,拥有合成能力也被认为是未来防治相关疫情的重要一环。  在实验室重建病毒,是一种有效的研究疾病暴发所涉病原体的方法。发生疫情时,将病毒样本送至研究机构可

牛乳头瘤病毒基因组结构和功能

  乳头瘤病毒(papillomavirus)是感染人和动物皮肤、粘膜并引起乳头状瘤病变的一种DNA病毒,属于乳多空泡病毒(papovavirus)科。根据病毒感染的宿主不同可以分为牛乳头瘤病毒(BPV),人乳头瘤病毒(HPV)等。已发现的乳头瘤病毒基因组都具有相似的结构。下面以BPV为例说明乳头瘤

Nature重大成果:揭示125000个病毒基因组

  在地球的内部、地球之上以及地球的周围,微生物的数量达到了10^30,估计超过了银河系中的星星。微生物已知在调控碳固定,维持全球氮、硫、磷和其他营养素的循环中起至关重要的作用,但目前大多数的微生物仍然是无法培养和未知的。美国能源部正以这一“微生物暗物质”作为目标,更好地了解地球微生物的多样性,收集

Nature重大成果:揭示125000个病毒基因组

  在地球的内部、地球之上以及地球的周围,微生物的数量达到了10^30,估计超过了银河系中的星星。微生物已知在调控碳固定,维持全球氮、硫、磷和其他营养素的循环中起至关重要的作用,但目前大多数的微生物仍然是无法培养和未知的。美国能源部正以这一“微生物暗物质”作为目标,更好地了解地球微生物的多样性,收集

Nature-Biotechnology定义病毒基因组标准:何谓高质量基因组

  据说,地球上的微生物总量超过了银河系中的恒星数量,而且病毒总量也要比之前预计的多得多。  在最新的Nature Biotechnology杂志上,美国能源部(DOE)联合基因组研究所(JGI)构建了重要的病毒序列数据库,同时提出了病毒基因组标准,指出了三类基因组质量的分级。  目前虽然许多病毒未

70种节肢动物中发现112种全新病毒-负链RNA病毒危害最大

  中国疾控中心张永振研究员带领的人兽共患病研究团队,在70种节肢动物中发现了112种从未被报道过的全新病毒,并命名了一个全新病毒科。该研究成果日前发表在生命科学领域的顶级期刊eLife杂志上。  张永振介绍,该研究在我国的湖北、浙江、新疆等地采集了昆虫纲、蛛形纲、唇足纲、软甲亚纲的70种节肢动物,

解码“基因组学之父”桑格:测序,测序,测序

  “桑格当之无愧地被称为‘基因组学之父’,他的工作为人类读取和理解基因代码奠定了基础,彻底变革了生物学并极大促进了当今的医学发展。”、   有一天,65岁的英国生物化学家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的试验,转身走出实验室,宣布自己正式退休。那一年是1983

基因组测序仪简介

  基因组测序仪是一种用于生物学领域的分析仪器,于2012年12月19日启用。  技术指标  个体化基因组测序仪主机/ION TORRENT主机。  主要功能  样品处理、快速的运行时间以分析单个或多个样品 支持多重文库,从而实现最大的效率和经济性 可在必要时禁用个别测序通道,以节约试剂用量。

PNAS:甜瓜基因组测序

  甜瓜在世界范围具有很高的经济价值,日前西班牙的九个研究中心通力合作,利用罗氏454平台完成了甜瓜基因组的测序。除了甜瓜的全基因组,科学家还得到了 7个特定甜瓜品种的基因组,文章发表在Proceedings of the National Academy杂志上。   联合国粮农组织2009年

认识泛基因组测序

什么是泛基因组?2005年,Tettelin等人提出了微生物泛基因组概念(pangenome,pan源自希腊语‘παν’,全部的意思),泛基因组即某一物种全部基因的总称。2009 年,Li等人首次采用新全基因组组装方法对多个人类个体基因组进行拼接,发现了个体独有的DNA序列和功能基因,并首次提出了“

454测序用于美洲奶牛种牛基因组测序项目

  一只名为Pawnee Farm Arlinda Chief的种牛和它的儿子Walkway Chief Mark大约有60000个后代,其后代是牛奶生产的主力。最近一项研究中1,科学家通过454全基因组测序,掌握了他们的基因组中控制重要性状的基因,包括抗病能力、牛奶产量,这些性状已通过北美的当

我国完成小麦A基因组测序

本报讯(记者丁佳)5月10日,《自然》杂志刊发了中国科学院的一项最新成果,该项研究完成了小麦A基因组的测序和染色体精细图谱的绘制。 这项由中科院遗传与发育生物学研究所植物细胞与染色体工程国家重点实验室、中科院种子创新研究院和遗传发育所基因组分析平台等合作完成的研究,全面揭示了小麦A基因组的结构和

测序解读基因组,真的好吗?

测序解读基因组,真的好吗?   “对基因组了解过多也不全是好事。”贝勒医学院生物医学伦理学副教授、医学伦理和健康中心主任Amy McGuire,在今年旧金山举办的TEDMED机构年度大会上说,“尤其是对自己基因组信息的了解。”  虽然McGuire 从事人类基因组学研究已有多年,但

白肉灵芝完成基因组测序

 在韶关产业园种植的白肉灵芝。吴清平团队 供图 近日,中国工程院院士、广东省科学院微生物研究所名誉所长吴清平团队完成了第一个白肉灵芝全基因组测序。据悉,这是世界上首次对白肉灵芝的基因组进行组装和注释。相关研究发表于《G3:基因,基因组,遗传学》(G3-Genes Genomes Genet

我国完成小麦A基因组测序

   5月10日,《自然》杂志刊发了中国科学院的一项最新成果,该项研究完成了小麦A基因组的测序和染色体精细图谱的绘制。这项由中科院遗传与发育生物学研究所植物细胞与染色体工程国家重点实验室、中科院种子创新研究院和遗传发育所基因组分析平台等合作完成的研究,全面揭示了小麦A基因组的结构和表达特征,对深入和

简化基因组测序好做吗

简化基因组方法是一种利用酶切技术、序列捕获芯片技术或其他实验手段降低物种基因组复杂程度,进而研究基因组各类遗传结构性变异的技术手段。目前常见的简化基因组技术包括RAD(Restriction site Associated DNA)和GBS(Genotyping By Sequencing)。这些技

基因组测序拯救鸮鹦鹉

  为了保护极度濒危的新西兰鸮鹦鹉kakapo,几乎所有剩余个体的基因组都已被测序,这为其保护管理提供了重要信息。  新西兰鸮鹦鹉kakapo(Strigops habroptila)有几个特性。它是世界上最重的鹦鹉,有的雄性甚至超过3公斤,被认为有达90年的最长寿命。它是唯一一种不会飞的鹦鹉,通过

测序基因组勘探食品污染

   上周,两家公司因李斯特菌食品感染发令召回其所有产品。Sabra Dippin召回30,000例鹰嘴豆泥制成的食品,至今疾病防治中心未发现因食用该公司食品造成的食物中毒或死亡的病例。然而,堪萨斯州的蓝铃冰激淋工厂(Blue  Bell Creameries)已确认有少量食品原料已感染李斯特菌,目

454用于西红柿基因组测序

  最近,西红柿基因组学会完成了一个农业种植西红柿品系Solanum lycopersicum的基因组图谱,以及一个野生型西红柿品系S. pimpinellifolium的基因组图谱,并将其与已知的土豆基因组以及其他植物比较,寻找与水果有些特性相关的基因,相关文献在Nature杂志作为封面文章发