Nature：U6snRNP在premRNA剪接中的作用
前体信使RNAs (pre-mRNAs) 被剪接体(它由五个被称为snRNPs的子复合物组成)和其他辅助因子处理。每个snRNP含有一个由7个成分构成的蛋白环结构和一个相关的RNA分子。 施一公及同事获得了U6 snRNP的Lsm蛋白环在有和没有一个包含U6 snRNA的3′端的 RNA两种情况下的晶体结构。这些数据揭示了RNA末端的四个尿嘧啶是怎样被几个U6 Lsm蛋白识别的，也将这些相互作用与Sm蛋白在其他snRNPs中与RNA的接触区分了开来。 ......阅读全文
植物PPR蛋白调控靶标RNAs的分子机理研究取得进展
11月3日，国际学术期刊Nature Structural & Molecular Biology在线发表了中科院上海药物研究所徐华强研究组与上海植物逆境研究中心朱健康研究组合作项目——植物PPR蛋白结构与调控RNA processing分子机理研究的最新成果。这项成果是继9月18日发表
RNAi制备小分子干扰RNA（small－interfering－RNAs，siRNAs)的方法2
越来越多的研究人员开始采用小分子干扰RNA（small interfering RNAs，siRNAs)来抑制特定的哺乳动物基因表达。siRNA是一种短片断双链RNA分子，能够以同源互补序列的mRNA为靶目标降解特定的 mRNA，这个过程就是RNA干扰途径（RNA interference
RNAi制备小分子干扰RNA（small－interfering－RNAs，siRNAs)的方法1
最适用于：快速而经济地研究某个基因功能缺失的表型不适用于：长时间的研究项目，或者是需要一个特定的siRNA进行研究，特别是基因治疗体内表达前面的3种方法主要都是体外制备siRNAs，并且需要专门的RNA转染试剂将siRNAs转到细胞内。而采用siRNA表达载体和基于PCR的表达框架则属于：从转染到细
构建小鼠基因组CRISPR导向RNAs文库
研究人员开发出一种方法，构建出了一个可诱导小鼠基因组全基因靶向突变的CRISPR导向RNA(gRNAs)综合文库。人们可利用这一文库来调查不同细胞类型中每个基因的作用。这一突破性的研究成果在线发表在12月23日的《自然生物技术》(Nature Biotechnology)杂志上。 CR
Genetics：记忆形成中小RNAs的巨大作用
近期，一项刊登于国际杂志Genetics上的研究论文中，来自斯克利普斯研究所的研究人员通过研究发现，一种名为“microRNA”的遗传物质或在动物模型记忆形成的过程中扮演不同的角色，在某些情况下microRNAs会增强机体记忆，但有些时候却会减弱机体的记忆力。 研究者Ron Davis教
Cloning－of－small－RNAs－with－5’－phosphate－and－3’－OH－ends3
Load your precipitated PCR samples into 2 consecutive lanes so as not to overload the lanes. For each different sample, I would run a separate ladder
Cloning－of－small－RNAs－with－5’－phosphate－and－3’－OH－ends2
3’ Adaptor Ligation and PurificationHeat shock the RNA by putting at 90°C for 30 seconds. Snap cool on ice.Set up the 3’Adaptor ligation reaction in a
Cloning－of－small－RNAs－with－5’－phosphate－and－3’－OH－ends01
IntroductionThe following protocol describes a procedure for the purification and cloning of miRNAs and other small RNAs in the 20-30 nucleotide size
解读重要表观调控因子：保护端粒的非编码RNAs
在2008年，西班牙国家癌症研究中心（CNIO）的Maria A. Blasco博士领导的端粒和端粒酶研究组是世上首个发现TERRAs的团队。这是一段非编码端粒RNAs，属于染色质端粒的一部分。从那时起，该团队就致力于研究这些序列有什么作用。 最近他们在《Nature Communicatio
长链非编码RNAs介导的表观遗传调控基础
近日，中国科学院昆明动物研究所李家立、胡新天和郑永唐课题组与中国科学技术大学生命科学学院汪香婷课题组、武汉生命之美生物科技公司合作，揭示了长链非编码RNAs在灵长类大脑发育和老化过程中表达动态变化和作用。该研究成果以Annotation and cluster analysis of spati
Nature子刊构建小鼠基因组CRISPR导向RNAs文库
研究人员开发出一种方法，构建出了一个可诱导小鼠基因组全基因靶向突变的CRISPR导向RNA(gRNAs)综合文库。人们可利用这一文库来调查不同细胞类型中每个基因的作用。这一突破性的研究成果在线发表在12月23日的《自然生物技术》(Nature Biotechnology)杂志上。 CR
环状RNAs帽独立的翻译蛋白及其在癌中的作用
环状RNA是一种共价封闭RNA，在真核生物中广泛表达。circRNA参与多种生理和病理过程，但其调控机制尚不完全清楚。随着RNA深度测序技术的发展和算法的改进，发现了一些circRNA通过cap-independent机制编码蛋白质，参与肿瘤发生发展的重要过程。本文在概述CircRNAs的基础上
Nature－Communications：环形RNAs在脑衰老过程中的生物学作用
大脑衰老的生物学机理十分复杂，受到遗传、年龄和环境等多个因素的调控和影响，其中随年龄和环境等因素而变化的表观遗传调控被认为是重要的调控环节之一。基因组中大约90%的DNA都具有转录活性，但其中仅有1.5%的基因能够编码蛋白质，环状非编码RNAs（circRNAs）属于不具有编码功能的非编码RNA
973首席科学家发现新型小RNA
来自中国科学院动物所的研究人员在成熟精子中发现了一种特殊的小分子RNAs，他们将其命名为“成熟精子富集-tRNA来源小分子RNAs”(mse- tsRNAs)，这些小分子RNAs在成熟精子中大量积累，其功能和生物学特征还有待探索。相关成果公布在Cell Research杂志在线版上。
华人学者Nature开发革命性RNA新技术
来自美国国立卫生研究院、科罗拉多大学等机构的研究人员报告称，他们开发出了一种更有效的RNA合成新方法。这一革命性的成果发表在5月4日的《自然》（Nature）杂志上。 领导这一研究的是美国国立卫生院下属国家癌症研究所的王云星（Yun-Xing Wang，音译）博士。王博士早年毕业于吉林大学，后
新型工具在细胞中发现大量新的RNA亚型分子
从指甲到眉毛，基因组是机体所有部分的“总体规划”，但并不仅仅是蓝图决定建造什么，所有根据蓝图绘制指令的细胞成员都会在设计中加入自己的解释，而如今研究人员在不断发现新的成员；近日，一项刊登在国际杂志PLoS Genetics上的研究报告中，来自托马斯杰斐逊大学等机构的科学家们通过研究利用他们所开发
Nature里程碑研究：新型非编码反义RNA
在研究帕金森氏病的过程中，一个国际研究小组获得了一个可以提高工业蛋白质合成用于治疗用途的新发现。他们设法了解了非蛋白质编码RNA的一个新功能：借助这类称作“反义”的非编码RNA的活性可以提高编码基因的蛋白质合成活性。相关成果发表在10月14日的《自然》(Nature)杂志上。 为了合成蛋白
RNA干扰相关知识Dicer（DCR）
Dicer（DCR）：是RNAase Ⅲ家族中的一员，主要切割dsRNA或者茎环结构的RNA前体成为小RNAs分子。对应地，我们将这种小RNAs分子命名为siRNAs和miRNA。Dicer有着较多的结构域，最先在果蝇中发现，并且在不同的生物体上表现出很高的保守性。
什么是Dicer（DCR）？
Dicer（DCR）：是RNAase Ⅲ家族中的一员，主要切割dsRNA或者茎环结构的RNA前体成为小RNAs分子。对应地，我们将这种小RNAs分子命名为siRNAs和miRNA。Dicer有着较多的结构域，最先在果蝇中发现，并且在不同的生物体上表现出很高的保守性
Dicer（DCR）蛋白的概念和应用特点
Dicer（DCR）：是RNAase Ⅲ家族中的一员，主要切割dsRNA或者茎环结构的RNA前体成为小RNAs分子。对应地，我们将这种小RNAs分子命名为siRNAs和miRNA。Dicer有着较多的结构域，最先在果蝇中发现，并且在不同的生物体上表现出很高的保守性。
四川农大BMC发表lncRNA新成果
在过去的几年里，长非编码RNAs（lncRNAs）已经得以广泛研究。有研究已在小鼠、大鼠和人类中鉴定了大量的lncRNAs，其中一些已被证明在肌肉发育和生成过程中起着重要的作用。然而，对于覆盖家畜骨骼肌所有发育阶段的lncRNAs的特性，报道还较少。 8月22日，四川农业大学动物科技学院的研究
Nature揭秘RNA“碎纸机”
就像我们用碎纸机破坏掉不再有用或是包含潜在破坏性信息的文件一样，细胞利用分子机器来降解不必要的或是有缺陷的大分子。德国马克思普朗克生物化学研究所的科学家们现在破解了负责真核生物中核糖核酸(RNAs)降解的大分子机器――外来体(exosome)的结构和运作机制。 RNAs是一类广泛大量存在于
Nature重要发现：独特的非编码RNA
我们的皮肤表皮是由许多不同细胞类型构成的混合体，每种细胞类型都有非常明确的职责。这样复杂的组织，其生成或分化在细胞水平上需要进行大量的协调，这一过程发生故障可以导致灾难性的后果。现在，来自斯坦福大学医学院的研究人员确定了这一分化过程的一个主要调控因子。研究成果发表在12月2日的《自然》(Natu
Science、EMBO重要发现：编码蛋白质的lncRNAs
不久之前，研究人员还认为RNA分为两类：生成蛋白质的编码RNAs和发挥结构作用的非编码 RNAs。发现小分子RNAs开启了全新的研究领域。然而现在研究人员兜了个圈又回到了原地，推测一些长链非编码RNAs可能生成了具有生物功能的小蛋白。近期发表在《EMBO Journal》杂志上的一项研究
Cell：小分子RNA的大作用
所有有性繁殖多细胞生物体都依赖于卵子来支持早期的生命。加州大学圣地亚哥医学院及Ludwig癌症研究所的研究人员利用微小线虫作为模型，更好地了解了卵子仅借助于已存在的物质实现胚胎发育的机制。发表在3月24日《细胞》（Cell）杂志上的这项研究，揭示出了小分子RNA(Small RNAs)和辅助蛋白
深度测序发现细菌中存在大量msRNAs
具有调控作用的非编码小分子RNA，调控基因的表达，而microRNAs在真核生物中恰恰提供了一个最好的例子。然而，与真核生物microRNAs相同大小的细菌小RNAs却鲜被关注。近日，韩国庆北国立大学的研究人员，对细菌中的msRNAs(microRNA-size, small RNAs)进行
《Cell》：lncRNAs开辟增强子生物学新时代
长链非编码RNAs(long noncoding RNAs ，LncRNAs)是在真核生物中发现的一类长度大于200个核苷酸、没有长阅读框架、但往往具有mRNA结构特征的RNA。LncRNAs在基因组中存在普遍的转录现象，但较之编码蛋白质的基因，往往表达水平比较低。LncRNAs自身的表达水
科学家成功优化CRISPRCpf1技术使其更高效编辑人类基因组
一项刊登在国际杂志Nature Chemical Biology上的研究报告中，来自斯克里普斯研究所的研究人员通过研究改善了当前最先进的基因编辑技术，使其能够更加精准地靶向切割并且粘贴人类和动物细胞中的基因，同时研究者还扩展了CRISPR-Cpf1基因编辑系统使其能够用来研究以及帮助抵御人类疾病
分子探针还是分子铁锤？
这一期的《Nat. Chem. Biol.》有一篇题为“The promise and peril of chemical probes”的评论文章，二十几个作者都是化学生物领头人，其中包括Stuart Schreiber和Brian Shoichet这样的大腕。文章回顾了早期分子探针的缺陷并对
分子荧光和分子磷光
分子和原子一样，也有它的特征分子能级，分子内部的运动可分为价电子运动、分子内原子在平衡位置附近的振动和分子绕其重心的转动。因此分子具有电子能级、振动能级和转动能级。 分子从外界吸收能量后，就能引起分子能级的跃迁，即从基态跃迁到激发态，分子吸收能量同样具有量子化的特征，即分子只能吸收等于二个能级