Nature:U6snRNP在premRNA剪接中的作用

前体信使RNAs (pre-mRNAs) 被剪接体(它由五个被称为snRNPs的子复合物组成)和其他辅助因子处理。每个snRNP含有一个由7个成分构成的蛋白环结构和一个相关的RNA分子。 施一公及同事获得了U6 snRNP的Lsm蛋白环在有和没有一个包含U6 snRNA的3′端的 RNA两种情况下的晶体结构。这些数据揭示了RNA末端的四个尿嘧啶是怎样被几个U6 Lsm蛋白识别的,也将这些相互作用与Sm蛋白在其他snRNPs中与RNA的接触区分了开来。 ......阅读全文

长链非编码RNA:-从科研到临床(三)

肾脏疾病与糖尿病 糖尿病经常伴随着肾病的发生[5]. 比如基因间lncRNA PVT1与二类疾病都紧密关联。研究人员在II型糖尿病人的晚期肾病进程中发现了PVT1的基因变异。高糖处理可以诱导人的肾间质细胞中PVT1和纤连蛋白1、IV型胶原蛋白、TGFβ1、PAI1等因子的高表达。相反,敲除P

Nature发布大型全基因组RNA分析研究

  由来自宾夕法尼亚州立大学的化学家和植物生物学家领导的一个研究小组开发出了一种分子技术,将有助于科学团体以从前不可能达到的规模,来分析在基因表达调控中起重要作用的分子。   科学家们开发出了一种方法,能够更精确预测在活细胞内核糖核酸分子(RNAs)的折叠情况,由此阐明植物以及其他的活体生物对环境

Nat-Commun:科学家们首次对心脏中的RNA结构进行成像!

  近日,一项刊登在国际杂志Nature Communications上的研究报告中,来自洛斯阿拉莫斯国家实验室等机构的科学家们通过研究揭示了一种特殊类型RNA分子的3-D图像,其对于干细胞重编程至关重要,被称之为基因组中的“暗物质”。图片来源:Los Alamos National Laborat

专访RNAi前沿科学家刘一

   5月14日的《Nature》杂志以封面文章形式发表了德克萨斯大学西南医学中心刘一的一篇RNAi研究前沿文章,刘一教授发现了一类新的RNAi分子,qiRNA。人们对RNAi的了解又深入了一步。   为了让读者更进一步的了解qiRNA,生物通记者采访了文章的通讯作者刘一教授,百忙中的刘一教授爽

Cell:miRNA,调控子的调控

  MicroRNAs是多细胞生物体遗传程序的重要调控者。由于它们具有强大的作用,其自身的生成也受到严密地控制。来自德国马克思•普朗克发育生物学研究所的科学家们在新研究中获得了关键的研究发现。他们在拟南芥(阿拉伯芥,thale cress)中发现了一个调节micro RNAs生成的新元件,通过去

RNAi的分子机制

通过生化和遗传学研究表明,RNA干扰包括起始阶段和效应阶段(inititation and effector steps)。在起始阶段,加入的小分子RNA被切割为21-23核苷酸长的小分子干扰RNA片段(small interfering RNAs, siRNAs)。证据表明;一个称为Dicer的酶

RNAi(RNA干扰)的分子机制

通过生化和遗传学研究表明,RNA干扰包括起始阶段和效应阶段(inititation and effector steps)。在起始阶段,加入的小分子RNA被切割为21-23核苷酸长的小分子干扰RNA片段(small interfering RNAs, siRNAs)。证据表明;一个称为Dic

Nature子刊惊人发现:抑癌的snoRNA分子

  根据斯坦福大学医学院的研究人员所说,一对原以为只是充当细胞管家的RNA分子,在超过四分之一的常见人类癌症中缺失。肿瘤中丧失这些RNA分子的乳腺癌患者相比于其他的乳腺癌患者生存率要低。  研究人员发现,这些RNA分子直接结合并抑制了一个众所周知的癌症相关蛋白KRAS。在缺失这些分子的情况下,KRA

关于核糖核酸酶P的研究分析介绍

  来自美国科罗拉多州大学分子,细胞和发育生物学系,以及亚利桑那州立大学生命科学学院化学与生物化学系的研究人员通 过比较真核与细菌核糖核酸酶P RNA(Ribonuclease P RNA,RNase P)的不同,获得了一RNase P三级结构,为研究RNase P带来了突破性进展,这一研究成果公布

分子生态学词汇分子适应

中文名称:分子适应英文名称:molecular adaptation定  义:生物体在分子水平上的变化以适应其生存环境的过程。应用学科:生态学(一级学科),分子生态学(二级学科)

分子构型与分子构造的区别

构造一般都是指有机物的原子连接的方式,构型主要指基团的空间排列不同,特别是立体异构。结构是用元素符号和短线表示化合物(或单质)分子中原子的排列和结合方式的式子。有机物中构造包括结构式,结构简式、短线构造式、键线构造式、路易斯构造式。其中结构式就是所有原子间都有短线连接的,画起来最复杂。

Nature子刊:从基因组序列快速发现新药的突破性方法

  在一项寻找新药的研究中,美国Scripps研究所(TSRI)佛罗里达所区的科学家们开发出一种突破性方法,能够从基因组序列中设计新的候选药物。作为原理验证,他们发现了一种高效的化合物,能够导致癌细胞攻击自己而死。   TSRI的副教授Matthew Disney博士指导了这项研究,他说:“这

北大长江学者Science揭示基因沉默新机制

  RNA干扰保护细胞抵御了诸如病毒或转基因等入侵的遗传因子。然而在侵入RNAs遭到攻击的同时,是什么保护了细胞正常的內源RNAs呢?来自北京大学的研究人员在拟南芥中发现了一个重要的监控系统:细胞通过双向细胞质衰减(RNA-decay)在抑制內源基因沉默保护正常转录组的同时,将攻击焦点集中放在了入侵

非编码small-RNA参与缺氧下的血管生成(一)

非编码RNA是近年来转录组学研究的热点,其中,long non-coding RNA(lncRNA),microRNA,circularRNA是大家研究的非常多的非编码。其实,在small non-coding RNAs世界,除了我们熟知的microRNA之外,还包括piwi-interac

分子标记

内容:一、遗传标记 二、DNA分子标记 三、染色体原位杂交 四、DNA分子标记的应用 长期以来,植物育种中选择都是基于植株的表型性状进行的,当性状的遗传基础较为简单或即使较为复杂但表现加性基因遗传效应时,表型选择是有效的。但水稻的许多重要农艺性状为数量性状,如产量等;或多基因控制的质量性状,如抗性等

分子杂交

一、杂交通过碱基对之间非共价键(主要是氢键)的形成即出现稳定的双链区,这是核酸分子杂交的基础。杂交分子的形成并不要求两条单链的碱基顺序完全互补,所以不同来源的核酸单链只要彼此之间有一定程度的互补顺序(即某种程度的同源性)就可以形成杂交双链。分子杂交可在DNA与DNA、RNA与RNA或RNA与DNA的

环状-RNA-测序案例分析

案例:以结肠癌,卵巢癌,特发性肺纤维化及正常的人组织为例探讨 circular RNAs 的富集与增殖的相关性 背景:最新研究表明,circular RNAs 大量存在,是构成生物体 RNA 网络的一部分,而且研究者们推测 circular RNAs 与 miRNAs 一样具有生物学功能。 目的

Science突破性成果:鸟瞰细胞RNA

  如同在房地产中一样,在生物学中位置也很重要。活化基因的mRNAs战略性定位在整个活体组织中,它们的位置往往帮助调控了细胞和组织的生长及发育方式。然而为了同时分析许多的mRNAs,科学学家们不得不将细胞碾磨成浆,这使得他们没有好的办法精确确定这些mRNAs在细胞内的定位。   现在,哈佛大学Wy

非同一般的非编码small-RNA,参与缺氧下的血管生成

  非编码RNA是近年来转录组学研究的热点,其中,long non-coding RNA(lncRNA),microRNA,circularRNA是大家研究的非常多的非编码。其实,在small non-coding RNAs世界,除了我们熟知的microRNA之外,还包括piwi-interacti

曹雪涛院士Cancer-Cell揭示癌症转移机制

  第二军医大学、中国医学科学院的研究人员证实,肿瘤外泌体RNAs通过激活肺泡上皮TLR3招募中性粒细胞促进了肺转移前微环境形成。这一研究发现发布在8月8日的《癌细胞》(Cancer Cell)杂志上。  我国著名的免疫学家曹雪涛(Xuetao Cao)院士是这篇论文的通讯作者。曹雪涛现任职浙江大学

分子育种和分子设计育种的区别

区别如下:1、分子设计育种。通过多种技术的集成与整合, 对育种程序中的诸多因素进行模拟、筛选和优化,,提出最佳的符合育种目标的基因型以及实现目标基因型的亲本选配和后代选择策略, 以提高作物育种中的预见性和育种效率,实现从传统的“经验育种”到定向、高效的“精确育种”的转化。2、分子育种,就是将基因工程

脂质大分子和小分子

  脂肪到底是不是生物大分子,这是一个让很多生物老师都很纠结的问题,高中生物人教版必修一并没有生物大分子的定义(必修一33页提到“多糖、蛋白质、核酸等都是生物大分子”),很多辅导书籍及练习题也经常添乱,搞得我们在备课时一头雾水。开卷有益,让我们翻开高校教材找找答案吧!  一、高分子化合物  根据《有

全转录组测序技术揭示circRNA新的调控机制(一)

2月7日,加拿大多伦多大学的Paul C. Boutros教授和Housheng Hansen He教授团队对144例前列腺癌样本进行全转录组测序,结合后续的功能机制研究,揭示了前列腺癌circRNA新的调控机制!该研究成果以题为“Widespread and Functional RNA Circ

小RNA领域牛人Science发表重要研究成果

  来自奥地利科学院分子生物技术研究所(IMBA)的研究人员,揭示出了细胞利用来生成一类生殖细胞特异性的小分子调控RNAs——piRNAs的分子机制。他们的研究结果发表在5月15日的《科学》(Science)杂志上。  领导这一研究的是IMBA的分子生物学家Julius Brennecke,这位学者

科学家发现精子中一个来源于-28S-rRNA-的新小-RNA

  5 月 10 日,国际学术期刊《分子细胞生物学杂志》(J Mol Cell Biol)在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所张永莲研究组的最新研究成果:A sequence of 28S rRNA-derived small RNAs is enriched in mature sper

研究发现评估IVF中精子质量的小RNA分子标志物

  4月9日,国际学术期刊Cell Discovery 在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所吴立刚研究组、上海市计划生育科学研究所施惠娟实验室和复旦大学附属妇产科医院上海集爱遗传与不育诊疗中心陈国武实验室的合作研究成果“Identification of small noncoding R

科学家开发出能有效检测呼吸道病毒感染的新技术

  近日,一项刊登在国际杂志The Journal of Infectious Diseases上的研究报告中,来自耶鲁大学医学院的研究人员通过研究开发出了一种能检测人类细胞中RNA或蛋白质分子的新型检测技术,该技术能够准确鉴别出诱发呼吸道感染疾病的病毒性感染,通过利用简单的鼻拭子,这种检测技术或许

Cell-Discovery:评估IVF中精子质量的小RNA分子标志物

  国际学术期刊Cell Discovery在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所吴立刚研究组、上海市计划生育科学研究所施惠娟实验室和复旦大学附属妇产科医院上海集爱遗传与不育诊疗中心陈国武实验室的合作研究成果“Identification of small noncoding RNAs as

PNAS:-融合基因组学揭示横纹肌肉瘤细胞起源

  基因融合一直被认为是肿瘤独有的特征。基因融合是指染色体上两个异位的基因嵌合在一起,由于染色体发生易位、缺失或者倒置造成的,通常在癌症的发生发展扮演着重要的角色,并且可以作为诊断和治疗癌症的靶标。基因融合现象最早在慢性粒细胞白血病中发现 BCR-ABL基因融合(费城染色体)。除血液系统肿瘤外,在实

云序高分文章利器:​ctDNA(羟)甲基化测序案例分享

  新型肿瘤标志物筛选利器-----ctDNA(羟)甲基化测序   cfDNA(Cell free DNA)是人体组织排放到血液、尿液或脑脊液等循环体系中降解的DNA小片段,是一种新型的分子标记物。ctDNA(Circulating tumor DNA)特指来源于肿瘤细胞的cfDNA,是液体活检主