中科院GenomeResearch发表环状RNA新成果
早在几十年前，生物学家们就发现了环状RNA（circRNA）。环状RNA呈封闭环状结构，不受RNA外切酶影响不易降解，比线性RNA稳定得多。随着二代测序的发展，人们逐渐意识到环状RNA其实是非常普遍的。这些分子广泛存在于多种生物的细胞中，从古生菌、酵母、小鼠到人类。 环状RNA通常表达水平比较低，但它们的表达存在细胞和组织特异性。近年来的研究表明，环状RNA可以通过不同途径影响基因表达，有效扩展真核细胞转录组的多样性和复杂性。这种内源RNA分子已经成为了生物学领域的新热点。 环状RNA来自于外显子的反向剪接。通过选择性反向剪接和选择性剪接，一个基因位点可以生成多个环状RNA。中科院上海生命科学研究院的杨力（Li Yang）研究员领导团队，为环状RNA的选择性反向剪接和选择性剪接绘制了详细图谱。这项研究发表在七月一日的Genome Research杂志上。 研究人员对此前开发的计算分析流程进行了升级（CIRCexplor......阅读全文
云序环状RNA研究策略在环状RNA研究的应用（一）
环状RNA作为新发现的RNA分子，从诞生之日起就是光环加身，屡屡登上Science、Nature、Cell等高分期刊。近期发表的《2019研究前沿》中，“环状RNA作为癌症新的生物标志物”成为生物科学领域6个新兴前沿之一。2019年环状RNA共发表SCI论文885篇，较2018年增长约20%，其中大
云序环状RNA研究策略在环状RNA研究的应用（二）
4.对年龄相关性白内障circRNA的分析显示，circZNF292可以通过海绵机制调节miR-23b-3p功能发表期刊：Aging-us影响因子：4.831发表时间：2020.9.10研究方法：全转录组测序、qRT-PCR、RIP、RNA pull down、双荧光素酶实验等云序提供文章链接：Pr
环状－RNA－测序案例分析
案例：以结肠癌，卵巢癌，特发性肺纤维化及正常的人组织为例探讨 circular RNAs 的富集与增殖的相关性 背景：最新研究表明，circular RNAs 大量存在，是构成生物体 RNA 网络的一部分，而且研究者们推测 circular RNAs 与 miRNAs 一样具有生物学功能。 目的
环状RNA研究深度剖析
1.环状RNA为什么火？它到底是何方神圣？ 2013年两篇Nature[1][2]文章的出世，彻底颠覆了我们对RNA的传统认知，同时也迅速引爆了整个生物医学界！经过严格统计汇总后，2017年国家自然科学金获批的项目中环状RNA研究相关的项目总数高达176项，其中有两项杰出青年基金，一项优秀
环状RNA结合功能蛋白
环状RNA作为研究持续火热的明星分子，不同于对其丰富的表达谱研究，环状RNA功能机制研究还仅仅处在起步阶段。环状RNA研究多为miRNA海绵机制，部分circRNA可竞争性结合miRNA，解除miRNA对靶基因的抑制作用，上调靶基因的表达。其实，环状RNA可以通过结合不同种类的功能蛋白，分别在转录前
环状RNA研究方法（一）
至2015起云序生物已经完成10000+例环状RNA全转录组测序服务，涵盖了50+疾病，20+物种，帮助众多客户在环状RNA分子的研究中取得突破性进展。客户发表的环状RNA文章高达20篇以上。此外云序生物还提供环状RNA机制研究手段，rip&RNA pull down技术，帮助客户冲刺高分机制文章。
环状RNA研究方法（二）
在此基础上，哪些环状RNA分子发生了差异表达？在这里火山图、Venn图应有尽有。根据p=2的标准，一共发现42个环状发生上调，47个环状发生下调。 图3. 差异环状RNA的筛选2. 差异环状RNA分子的qPCR验证对于一篇做谱的文章，差异环状RNA的结果验证只需做到qPCR即可。对5个上调和5个下调
环状RNA研究文章汇总（二）
4.世界首篇人胶质瘤环状RNA研究（影响因子：3.0）胶质瘤作为最常见的颅内恶性肿瘤占颅脑肿瘤的40%~50%，电磁辐射等其他环境致癌因素会导致胶质瘤的发生，尽管手术切除、术后放疗、药物化疗等方法可以作为主流的胶质瘤治疗手段，但是多形性胶质母细胞瘤（GBM）的强侵袭、增殖能力仍给病人的治疗造成很大的
环状RNA研究文章汇总（一）
环状RNA“一站式”服务一直以来是云序生物的主打产品，严格的质控把关、严谨的实验设计、出色的生信分析以及贴心的售后服务造就了多项世界首篇环状RNA研究文章，受到了广大客户的一致好评。迄今为止，云序已经积累了超过10000例环状RNA测序的经验，样本覆盖20多个物种以及50多种疾病，客户发表文章达20
环状RNA研究深度剖析（一）
1.环状RNA为什么火？它到底是何方神圣？2013年两篇Nature[1][2]文章的出世，彻底颠覆了我们对RNA的传统认知，同时也迅速引爆了整个生物医学界！经过严格统计汇总后，2017年国家自然科学金获批的项目中环状RNA研究相关的项目总数高达176项，其中有两项杰出青年基金，一项优秀青年基金，两
环状RNA研究深度剖析（二）
目标circRNA的机制研究 a RIP-qPCR：挑选功能最为明显的1个circRNA做RIP-qPCR实验，检测circRNA是否与AGO2蛋白结合。（AGO2是circRNA发挥海绵作用的指示蛋白） b RNA pull down：对上述circRNA进行RNA pull down实验，拉
非洲爪蟾环状RNA研究成果
作为最新的明星分子，环状RNA的热度与日俱增。环状RNA到底火到了什么程度？从云序客户捷报频传﹑研究成果不断就可见一斑：上期我们刚刚介绍云序客户发表了世界首个小鼠脑创伤模型外泌体环状RNA的研究，整合了外泌体和环状RNA两大科研热点。在探索新物种的环状RNA研究上，云序客户此前更是先后发表了全世界第
环状RNA高分文章怎么发？
文章导读环状RNA作为最新发现的RNA分子，从诞生之日起就是光环加身，屡屡登上Science、Nature、Cell等高分期刊。近期发表的《2019研究前沿》中，“环状RNA作为癌症新的生物标志物”成为生物科学领域6个新兴前沿之一。2019年环状RNA共发表SCI论文885篇，较2018年增长约20
环状RNA，飞速发展的新前沿
生物学家们几十年前就知道存在一种不寻常的分子，环状RNA（circRNA）。与线性RNA相比，circRNA受到的关注比较少，也比较难于研究。举例来说，circRNA很难与其它RNA区分开，扩增或片段化会破坏RNA环，而且早期RNA测序的分析算法会过滤掉circRNA的标志性序列。因为技术和方法
环状RNA（circRNA）主要有哪些类型
目前发现的circRNA主要来源于基因外显子，但多项研究也表明circRNA的类型比想象的要复杂，可以来自基因组上多种基因结构。 同一基因位置可以产生不同类型的环状RNA
环状rna，为什么blast上标注mrna
环状RNA(circRNA)区别传统线性RNA类新型RNA具闭环结构量存于真核转录组部环状RNA由外显序列构同物种具保守性同存组织及同发育阶段表达特异性由于环状RNA核酸酶敏比线性RNA更稳定使其作新型临床诊断标记物发应用具明显优势近已新热点阅微基于2015始提供lncRNA环状RNA表达检测服务运
云序生物环状RNA研究文章汇总
环状RNA“一站式”服务一直以来是云序生物的主打产品，严格的质控把关、严谨的实验设计、出色的生信分析以及贴心的售后服务造就了多项世界首篇环状RNA研究文章，受到了广大客户的一致好评。迄今为止，云序已经积累了超过10000例环状RNA测序的经验，样本覆盖20多个物种以及50多种疾病，客户发表文章达
当外泌体遇上环状RNA（三）
2. 外泌体circSHKBP1通过调控miR-582-3p/HUR/VEGF过程以及抑 制HSP90降解来促进胃ai发展发表期刊：Molecular Cancer影响因子：15.302发表时间：2020.6.29文章链接：Exosomal circSHKBP1 promotes gastric
当外泌体遇上环状RNA（六）
3. 外泌体circPACRGL通过miR-142-3p/miR-506-3p- TGF- cm1过程驱动大肠ai的恶化发表期刊：Molecular Cancer影响因子：15.302发表时间：2020.7.27文章链接：Exosomal circPACRGL promotes progressio
当外泌体遇上环状RNA（四）
（3）GC来源的外泌体circSHKBP1在体外能促进GC细胞的增殖、迁移和侵袭为了探索circSHKBP1是否影响GC细胞的生物学过程，分析了circSHKBP1在4种人GC细胞系（BGC823、HGC27、AGS和MGC803）和正常胃上皮细胞系GES1中的表达水平。结果表明，circSHKBP
当外泌体遇上环状RNA（五）
（6）circSHKBP1直接HSP90相互作用并抑 制其降解在HGC27细胞中用circSHKBP1探针的RNA pull-down和蛋白质谱结果显示两个差异表达蛋白HSP90β和HSP90α（HSP90的异构体）在过表达circSHKBP1的GC细胞中富集。RIP实验显示，circSHKBP1能
当外泌体遇上环状RNA（二）
（4）circUHRF1通过miR-449c-5p相关途径来抑 制NK细胞功能作者利用生物信息学预测了14个miRNA，在NK-92细胞中进行circUHRF1-RIP以及qPCR，结果表明miR-449c-5p是NK-92细胞中一个与circUHRF1相互作用的miRNA。在NK-92细胞中进行抗
环状RNA研究的方法及功能作用（二）
RNA是怎样变成环状的呢？a. 在可变剪切过程中，外显子迁移，剪切形成套索结构，拉近剪切位点，促进序列成环b. 依赖邻近的反向互补序列配对，拉近剪切位点，使其相互攻击，促进序列成环c. 单个内含子直接成环d. RNA结合蛋白、反式作用因子参与成环研究功能，敲降看看据文献报道，环状RNA可以被小干扰R
当外泌体遇上环状RNA（七）
（3）circPACRGL作为海绵分子结合miR-142-3p和miR-506-3p作者使用生物信息学数据库预测发现circPACRGL同时具有miR-142-3p和miR-506-3p的结合位点，双荧光素酶报告实验检测也证实miR-142-3p和miR-506-3p可与circPACRGL直接结合
环状RNA研究的方法及功能作用（一）
环状RNA—隐秘的未知RNA平行宇宙环状RNA，被喻是隐秘的未知RNA平行宇宙。最近，复旦大学的郑秋鹏博士（2016交流会嘉宾之一）以第一作者身份在Nature Communications上发布了他们关于circHIPK3的最新研究成果。现在就和小编一起来学习circRNA的研究思路，认识圆圈重塑
当外泌体遇上环状RNA（一）
文章导读外泌体是细胞分泌的大小为30-200nm的盘状囊泡，它在人体体液中分布广 泛。2013年，科学家通过研究外泌体细胞囊泡调控机制获得诺贝尔奖，这使外泌体开始被广 泛关注，随着研究的深入，人们发现外泌体可作为细胞间信息交流的桥梁，在细胞间往来穿梭进行信息传递。另外，外泌体与疾病的发生尤其
Nat－Rev－Genetics－|－环状RNA的合成与功能
环状RNA(circular RNA,circRNA)是一种新兴的内源性非编码RNA(noncoding RNA,ncRNA)，是继microRNA (miRNA)以及long noncoding RNA (IncRNA)后非编码RNA家族中极具研究潜力的新成员。越来越多的研究表明，环状RNA具
研究发现环状RNA限制皮肤癌的转移
一项新的研究发现，一种神秘的遗传物质可以抑制皮肤癌细胞的扩散，但随着它们的成熟，这种物质往往会丢失。这项新研究近日发表在《Cancer Cell》上。通常，DNA被转化成RNA，然后转化成具有细胞功能的蛋白质。虽然大多数RNA是线性分子，但当它们的末端循环并附着时，有些会形成圆圈。 该研究的作
中科院Genome－Research发表环状RNA新成果
早在几十年前，生物学家们就发现了环状RNA（circRNA）。环状RNA呈封闭环状结构，不受RNA外切酶影响不易降解，比线性RNA稳定得多。随着二代测序的发展，人们逐渐意识到环状RNA其实是非常普遍的。这些分子广泛存在于多种生物的细胞中，从古生菌、酵母、小鼠到人类。 环状RNA通常表达水平比较
教你轻松玩转环状RNA测序加机制研究（一）
从表达谱至海绵机制完美进阶，教你轻松玩转环状RNA测序加机制研究文章导读：禽白血病病毒J亚群(ALV-J)属于逆转录病毒属，慢病毒亚科的家族成员，可引起禽类多种肿瘤性疾病，如骨髓细胞瘤、肉瘤、血管瘤、肾肿瘤和成红细胞增多症，以及禽类骨髓白血病，导致受感染鸡的高死亡很率。该分散的ALV-J菌株分布广泛