中科院GenomeResearch发表环状RNA新成果

早在几十年前,生物学家们就发现了环状RNA(circRNA)。环状RNA呈封闭环状结构,不受RNA外切酶影响不易降解,比线性RNA稳定得多。随着二代测序的发展,人们逐渐意识到环状RNA其实是非常普遍的。这些分子广泛存在于多种生物的细胞中,从古生菌、酵母、小鼠到人类。 环状RNA通常表达水平比较低,但它们的表达存在细胞和组织特异性。近年来的研究表明,环状RNA可以通过不同途径影响基因表达,有效扩展真核细胞转录组的多样性和复杂性。这种内源RNA分子已经成为了生物学领域的新热点。 环状RNA来自于外显子的反向剪接。通过选择性反向剪接和选择性剪接,一个基因位点可以生成多个环状RNA。中科院上海生命科学研究院的杨力(Li Yang)研究员领导团队,为环状RNA的选择性反向剪接和选择性剪接绘制了详细图谱。这项研究发表在七月一日的Genome Research杂志上。 研究人员对此前开发的计算分析流程进行了升级(CIRCexplor......阅读全文

教你轻松玩转环状RNA测序加机制研究(一)

从表达谱至海绵机制完美进阶,教你轻松玩转环状RNA测序加机制研究文章导读:禽白血病病毒J亚群(ALV-J)属于逆转录病毒属,慢病毒亚科的家族成员,可引起禽类多种肿瘤性疾病,如骨髓细胞瘤、肉瘤、血管瘤、肾肿瘤和成红细胞增多症,以及禽类骨髓白血病,导致受感染鸡的高死亡很率。该分散的ALV-J菌株分布广泛

中科院Genome-Research发表环状RNA新成果

  早在几十年前,生物学家们就发现了环状RNA(circRNA)。环状RNA呈封闭环状结构,不受RNA外切酶影响不易降解,比线性RNA稳定得多。随着二代测序的发展,人们逐渐意识到环状RNA其实是非常普遍的。这些分子广泛存在于多种生物的细胞中,从古生菌、酵母、小鼠到人类。  环状RNA通常表达水平比较

研究发现环状RNA限制皮肤癌的转移

  一项新的研究发现,一种神秘的遗传物质可以抑制皮肤癌细胞的扩散,但随着它们的成熟,这种物质往往会丢失。这项新研究近日发表在《Cancer Cell》上。通常,DNA被转化成RNA,然后转化成具有细胞功能的蛋白质。虽然大多数RNA是线性分子,但当它们的末端循环并附着时,有些会形成圆圈。  该研究的作

教你轻松玩转环状RNA测序加机制研究(二)

3.gga-miR-373 通过与YAP1的3’UTR区结合负调控YAP1的表达,并且过表达gga-miR-375可减弱EMT生信预测揭示YAP1是gga-miR-375的潜在靶基因,进一步的双荧光素酶报告基因证实了gga-miR-375可通过结合YAP1的3’UTR区抑制YAP1的表达;在体外细胞

2020年环状RNA高分文章怎么发?

  环状RNA作为最新发现的RNA分子,从诞生之日起就是光环加身,屡屡登上Science、Nature、Cell等高分期刊。近期发表的《2019研究前沿》中,“环状RNA作为癌症新的生物标志物”成为生物科学领域6个新兴前沿之一。2019年环状RNA共发表SCI论文885篇,较2018年增长约20%,

2020年环状RNA高分文章怎么发?

  环状RNA作为最新发现的RNA分子,从诞生之日起就是光环加身,屡屡登上Science、Nature、Cell等高分期刊。近期发表的《2019研究前沿》中,“环状RNA作为癌症新的生物标志物”成为生物科学领域6个新兴前沿之一。2019年环状RNA共发表SCI论文885篇,较2018年增长约20%,

复旦大学Nature子刊发布环状RNA重要发现

  来自复旦大学、上海交通大学医学院的研究人员借助分析环状RNA,揭示出了丰富的circHIPK3通过像海绵般结合多种miRNAs调控了细胞生长。这一重要的研究发现发布在4月6日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。  复旦大学的黄胜林(Shenglin Huang)研

世界首篇非洲爪蟾环状RNA研究成果发表!

  作为最新的明星分子,环状RNA的热度与日俱增。环状RNA到底火到了什么程度?从云序客户捷报频传﹑研究成果不断就可见一斑:上期我们刚刚介绍云序客户发表了世界首个小鼠脑创伤模型外泌体环状RNA的研究,整合了外泌体和环状RNA两大科研热点。在探索新物种的环状RNA研究上,云序客户此前更是先后发表了全世

世界首篇非洲爪蟾环状RNA研究成果发表!

  作为最新的明星分子,环状RNA的热度与日俱增。环状RNA到底火到了什么程度?从云序客户捷报频传﹑研究成果不断就可见一斑:上期我们刚刚介绍云序客户发表了世界首个小鼠脑创伤模型外泌体环状RNA的研究,整合了外泌体和环状RNA两大科研热点。在探索新物种的环状RNA研究上,云序客户此前更是先后发表了全世

环状RNA(circRNA)功能研究又一利器——过表达载体

circRNAs 环状 RNA(circular RNAs,circRNA)是一类具有闭合环状结构的 RNA 分子,早在 20 世纪八十年代即有研究报道,但由于其表达丰度低,文献报道较少,一直被认为是 RNA 转录剪切的罕见错误而被忽视。直到 2012 年开始有研究者开始大批量鉴定 circRN

Molecular-Cancer:环状RNA通过经典信号通路抑制肿瘤进展

  环状RNA(circRNAs)以单链和共价闭环结构为特征,通常由preRNAs的外显子反向剪接而成。以前,circRNA被认为是低丰度剪接错误的副产品。然而,通过深入的RNA测序和生物信息学,circRNAs已被证明广泛存在于转录本中。大量证据表明,环状RNA(circRNAs)在肿瘤的发生发展

2018国自然研究热点一:环状RNA研究深度剖析

  1.环状RNA为什么火?它到底是何方神圣?   2013年两篇Nature[1][2]文章的出世,彻底颠覆了我们对RNA的传统认知,同时也迅速引爆了整个生物医学界!经过严格统计汇总后,2017年国家自然科学金获批的项目中环状RNA研究相关的项目总数高达176项,其中有两项杰出青年基金,一项优秀

脑创伤外泌体环状RNA的鉴定功能及预测

  近期,云序生物客户天津医科大学总医院张建宁教授带领的神经创伤团队针对大脑创伤的研究。该课题组集合了外泌体和环状RNA两大科研热点,应用云序生物提供的全转录组测序服务,仅通过大脑创伤外泌体中环状RNA表达谱研究就成功地于今年年初在《Journal of Neurotrauma》(影响因子5.19)

锐博生物:环状RNA研究的方法及功能作用介绍

  锐博生物:环状RNA—隐秘的未知RNA平行宇宙   环状RNA,被喻是隐秘的未知RNA平行宇宙。最近,复旦大学的郑秋鹏博士(2016交流会嘉宾之一)以第一作者身份在Nature Communications上发布了他们关于circHIPK3的最新研究成果。现在就和小编一起来学习circRNA的

锐博生物:环状RNA研究的方法及功能作用介绍

  锐博生物:环状RNA—隐秘的未知RNA平行宇宙   环状RNA,被喻是隐秘的未知RNA平行宇宙。最近,复旦大学的郑秋鹏博士(2016交流会嘉宾之一)以第一作者身份在Nature Communications上发布了他们关于circHIPK3的最新研究成果。现在就和小编一起来学习circRNA的

吉西他滨耐药胰腺导管癌环状RNA文章导读

文章导读:本篇文章主要研究的药物是吉西他滨,其主要应用于晚期胰腺癌病人的治疗,可是若病人对此类药物产生了耐药反应,那势必会影响患者的生活质量,甚至生命。目前,对于吉西他滨对胰腺癌耐药机制研究尚不明朗。作者首先构建了对吉西他滨耐药细胞系,并通过全转录组测序比较了耐药与正常细胞系之间环状RNA的表达谱。

小环状干扰-RNA-(sciRNA)-作为基因沉默的有效治疗平台

  为了实现由RNA干扰(RNAi)途径介导的有效的治疗性基因沉默,小干扰RNA (sirna)必须经过化学修饰。一些具有在代谢上稳定sirna潜力的超rna结构已被评估其诱导基因沉默的能力,但所有这些结构都有局限性或尚未在治疗相关的背景下进行探索。共价闭合环状RNA转录本普遍存在于真核生物中,有潜

脑创伤外泌体环状RNA的鉴定功能及预测

  近期,云序生物客户天津医科大学总医院张建宁教授带领的神经创伤团队针对大脑创伤的研究。该课题组集合了外泌体和环状RNA两大科研热点,应用云序生物提供的全转录组测序服务,仅通过大脑创伤外泌体中环状RNA表达谱研究就成功地于今年年初在《Journal of Neurotrauma》(影响因子5.19)

脑创伤外泌体环状RNA的鉴定功能及预测

研究背景:大脑创伤(TBI)具有极高的发病率和致死率,会不同程度地危害身体健康,目前对其致病机理,尤其是对神经系统造成伤害的分子机理尚不知晓。已知外泌体中富含环状RNA,这是一种新发现的环状非编码RNA,大多以miRNA海绵发挥调控下游功能基因的表达。而本研究作者正是集合了外泌体和环状RNA两大科研

中国科技大学Nature子刊聚焦环状RNA

  来自中国科技大学、华中师范大学等处的研究人员报告称,他们鉴别出了一类与RNA聚合酶Ⅱ相关的环状RNA(circRNAs),将之命名为外显子-内含子circRNAs(EIciRNAs)。并证实这些EIciRNAs调控了细胞核中的转录。这些研究成果在线发表在2月9日的《自然结构与分子生物学

我国科学家首次发现苹果具有核酶活性环状RNA

  近日,中国农业科学院植物保护研究所研究员李世访研究团队与中国科学技术大学吴清发教授研究团队合作,在世界上首次发现苹果中存在具有核酶活性的环状RNA。  上世纪80年代,在研究苹果上一种危害严重的病害——苹果锈果病时,中国农业科学院兴城果树研究所的果树病毒专家刘福昌研究员和日本果树病毒专家小金泽硕

默沙东大举押注,环状RNA明星公司Orna要做什么?

默沙东正在深入研究RNA药物制造,周二宣布与生物技术初创公司Orna Therapeutics达成一项交易,希望能够开发出多种新药和疫苗。通过这笔交易,默沙东将先向Orna支付1.5 亿美元预付款,并将在Orna的B 轮2.21亿美元中再投资1亿美元。同时,Orna可能会收到高达35亿美元的下游付款

北大乔杰、汤富酬、黄岩谊发表环状RNA新成果

  早在几十年前,生物学家们就发现了环状RNA。与线性RNA相比,环状RNA受到的关注比较少,一直被认为是剪切过程中发生的错误。随着二代测序的发展,近几年人们意识到环状RNA其实是非常普遍的。这些分子广泛存在于多种生物的细胞中(从古生菌、酵母、小鼠到人类),能够通过不同途径影响基因表达,很可能在细胞

Nature:为什么环状RNA会是下一代重磅药物?

  基于RNA的疫苗是COVID-19大流行中的英雄,它们创下了历史上最快疫苗开发时间的记录,从开发到获FDA批准上市仅仅用时一年时间。  而最近,mRNA技术更是获得了诺贝尔奖的认可,Katalin Karikó 和 Drew Weissman 因发现了核苷碱基修饰,从而开发出了有效的mRNA疫苗

又是魔剪CRISPR!首次揭秘“环状RNA”与大脑功能有关

  近年来,环状RNA(Circular RNAs,circRNAs)越来越受到科学界的关注,但它们在活体内的功能一直是一个谜。8月10日,发表在Science杂志上题为“Loss of a mammalian circular RNA locus causes miRNA deregulation

揭示登革热媒介白纹伊蚊环状RNA的功能和机制

近日,南方医科大学公共卫生学院/热带医学研究所教授顾金保团队研究揭示了登革热媒介白纹伊蚊circRNA(circular RNA,环状RNA)的功能和机制。相关研究论文发表于PLoS Pathogens。白纹伊蚊是一种传播疾病的蚊子,它是多种病毒的媒介。白纹伊蚊是登革病毒主要的传播媒介,其种群在全球

环状RNA在肠道干细胞自我更新中的重要作用

  肠道是食物消化和吸收的主要场所,由单层上皮细胞形成肠上皮屏障。除了上皮细胞,肠道中还有大量的免疫细胞。即使在成体稳态(homeostasis)条件下,肠上皮仍经历着快速的自我更新,在小鼠中大约5天可以更新一次【1】。定位于肠道隐窝中的干细胞可以分化为肠道中所有的上皮细胞类型【2】。肠干细胞的自我

高度保守的环状RNA如何调控骨骼肌生长发育

   circFgfr2调控骨骼肌生长发育和再生的分子机制。中国农科院供图 近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所猪基因组设计育种创新团队系统绘制了猪骨骼肌生长发育环状RNA图谱,并揭示了物种间高度

高度保守的环状RNA如何调控骨骼肌生长发育

ircFgfr2调控骨骼肌生长发育和再生的分子机制。中国农科院供图  近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所猪基因组设计育种创新团队系统绘制了猪骨骼肌生长发育环状RNA图谱,并揭示了物种间高度保守环状RNA-circFgfr2调控骨骼肌生长发育的新机制。相关研究成果在线发表在《恶病质、肌少症与肌肉

从表达谱至海绵机制完美进阶-环状RNA测序加机制研究!

  禽白血病病毒J亚群(ALV-J)属于逆转录病毒属,慢病毒亚科的家族成员,可引起禽类多种肿瘤性疾病,如骨髓细胞瘤、肉瘤、血管瘤、肾肿瘤和成红细胞增多症,以及禽类骨髓白血病,导致受感染鸡的高死亡很率。该分散的ALV-J菌株分布广泛,既能水平传播又能垂直传播,往往造成禽类养殖领域的巨大经济损失。目前我