水稻地方品种农艺性状相关基因的全基因组关联分析获进展
水稻地方品种重要农艺性状相关基因的全基因组关联分析取得进展 近日，中国科学院北京基因组研究所/中科院上海生科院植生生态所韩斌研究员课题组，通过与中国水稻所、中科院遗传与发育研究所、美国密歇根州立大学、华中农业大学和美国康奈尔大学等单位的研究人员合作，结合第二代测序技术和自主开发的基因型分析方法，对517份中国水稻地方品种材料进行测序，构建了高密度的水稻单体型图谱（HapMap），并对籼稻品种的14个重要农艺性状进行全基因组关联分析，确定了这些农艺性状相关的候选基因位点。相关研究成果于10月24日以全文形式发表在Nature Genetics上。（doi:10.1038/ng.695） 水稻是重要的粮食作物，也是植物基因组学研究的模式作物。水稻的株型（包括分蘖数，株高等），产量（包括小穗数，籽粒大小，千粒重等），籽粒品质（糊化温度，淀粉含量等）和一些生理特征（包括抗逆性，抽穗期，落粒性等）都是水稻生产上重要的......阅读全文
水稻地方品种农艺性状相关基因的全基因组关联分析获进展
水稻地方品种重要农艺性状相关基因的全基因组关联分析取得进展 近日，中国科学院北京基因组研究所/中科院上海生科院植生生态所韩斌研究员课题组，通过与中国水稻所、中科院遗传与发育研究所、美国密歇根州立大学、华中农业大学和美国康奈尔大学等单位的研究人员合作，结合第二代测序技术和自主开发的基因
表观遗传调控水稻重要农艺性状研究获进展
转座子(transposon)是一段自身能够插入到基因组上的DNA片段，上世纪40年代，芭芭拉·麦克林托克(Barbara McClintock)首先在玉米中发现了转座子。从简单的细菌到复杂的人类，转座子广泛存在。转座子随机插入到重要基因中，会引发疾病、癌症和其他生理缺陷。DNA甲基化、组蛋
水稻重要农艺性状蛋白功能活性的梯度获调节
广东省农业科学院水稻研究所副研究员谭健韬/研究员刘琦团队与华南农业大学教授祝钦泷团队合作，研究开发出植物精准碱基编辑器实现水稻重要农艺性状蛋白功能活性的梯度调节。近日，相关成果发表于《先进科学》（Advanced Science）。基于精准碱基编辑的植物内源蛋白功能梯度调节。研究团队供图该研究在国家
Science－Advance|农科院揭示lncRNAs调控水稻农艺性状变异机制
2019年12月18日，Science Advances杂志在线发表了来自中国农业科学院作物科学研究所杨庆文团队、刘君团队和华盛顿圣路易斯大学的Ken Olsen团队完成了水稻（亚洲栽培稻）及其祖先种（普通野生稻）非编码区lncRNA的注释，结合多重组学方法研究了水稻lncRNA的进化历史，从全
吃了一辈子的水稻，为何如此多样？
近日，中国农业科学院作物科学研究所水稻优异种质资源发掘与创新利用创新团队、作物基因组选择育种创新团队和华盛顿圣路易斯大学的肯·奥尔森团队合作完成了水稻（亚洲栽培稻）及其祖先种（普通野生稻）非编码区长链非编码RNA（lncRNA）的注释，研究了水稻lncRNA的进化历史，并从全基因组水平揭示了ln
《自然—遗传学》发表我国科学家水稻研究成果引关注
由中科院上海生命科学研究院、北京基因组研究所、中国水稻研究所等单位合作的研究成果《水稻地方品种重要农艺性状相关基因的全基因组关联分析》，日前在线发表在《自然—遗传学》（Nature Genetics）杂志上。 该研究报道了中国水稻地方品种的全基因组的遗传多态性和单倍体型图谱，并对籼稻
马铃薯基因组完成图揭示复杂区域存在重要农艺性状相关
中国农业科学院蔬菜花卉研究所马铃薯遗传育种与栽培创新团队和蔬菜分子设计育种创新团队，对马铃薯单倍型DM的基因组进行了全序列组装，获得了包含24个端粒和12个着丝粒完整序列的马铃薯单倍型DM的端粒到端粒（T2T）的基因组完成图（DM8.1），并在之前马铃薯基因组未能完整组装的高度重复序列区域中，发
水稻功能基因组研究：我国要继续保持领先优势
以“水稻功能基因组研究的现状和未来”为主题的第520次香山科学会议学术讨论会近日在北京召开。与会专家就水稻基因组测序及注释、水稻重要性状的调控网络、水稻多组学（表观组、蛋白组、代谢组、表型组等）研究，以及水稻基因组解析等方面展开了深入的讨论。 此次会议由中国科学院院士、华中农业大学教授张启发
“水稻等主要农作物功能基因组研究”重大项目取得进展
3月24-25日，“十二五”国家863计划现代农业技术领域“水稻等主要农作物功能基因组研究”重大项目交流会在海南陵水召开。来自中国科学院、中国农业科学院、华中农业大学、中国农业大学、浙江大学、上海交通大学等全国18所大专院校、科研院所的课题骨干和专家共计40余人参加此次交流会。农村中心相关人员参
研究揭示水稻基因组－“垃圾－DNA”－的真相
对于动植物的 DNA 来说，仅有不到 5% 能够翻译成蛋白质，进行生命活动。而大部分 DNA 转录成 RNA 之后，便不再继续翻译，这些非编码 RNA 一度被认为是转录中的 “噪音”“暗物质”， 甚至有人认为这是 “垃圾 DNA”。 近十年来，随着探索未知的技术的进步，这些所谓 “垃圾 DNA
研究揭示水稻基因组“垃圾DNA”的真相
对于动植物的DNA来说，仅有不到5%能够翻译成蛋白质，进行生命活动。而大部分DNA转录成RNA之后，便不再继续翻译，这些非编码RNA一度被认为是转录中的“噪音”“暗物质”， 甚至有人认为这是“垃圾DNA”。 近十年来，随着探索未知的技术的进步，这些所谓“垃圾DNA”的重要性才开始为人们所了解。
华中农大张启发院士PNAS发布水稻研究重要成果
来自华中农业大学的研究人员报告称，他们通过分析1479个水稻品种绘制出基因组变异图谱，揭示出了水稻改良的育种标签。这一重要的研究成果发布在9月10日的《美国国家科学院》（PNAS）杂志上。 华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室主任张启发(Qifa Zhang)院士及练兴明(Xingming
华中农大张启发院士PNAS发布水稻研究重要成果
来自华中农业大学的研究人员报告称，他们通过分析1479个水稻品种绘制出基因组变异图谱，揭示出了水稻改良的育种印迹。这一重要的研究成果发布在9月10日的《美国国家科学院》（PNAS）杂志上。 华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室主任张启发(Qifa Zhang)院士及练兴明(Xingming
中国诞生全球首张水稻全基因组育种芯片
中国中化集团公司下属中国种子集团有限公司联合华中农业大学、北京大学近日共同研制出全球首张水稻全基因组育种芯片，将大幅提高种子真实性检测准确性，有助提高育种效率，杜绝假种子危害。 中种公司生命科技中心喻辉辉博士表示，目前业内判断水稻种子真实性通常采用国标推荐的24个SSR标记检测结果，
PNAS：下一代测序助力张启发研究“转基因水稻”
水稻是世界上最重要的粮食作物之一，与玉米、小麦、土豆被称为“世界四大主粮”。在过去的50年里水稻尤其是籼稻（indica ）的改良取得了一些里程碑式的成果。其中一项重大的突破是在上世纪的五六十年代中国及国际水稻研究所（IRRI）开发出了一系列半矮杆水稻品种，促成了水稻的“绿色革命”。 此后，半
遗传发育所等在亚洲稻群体结构和演化研究中取得进展
亚洲栽培稻是世界上最重要也是最古老的粮食作物之一，在亚洲文明和日常生活中扮演着举足轻重的角色。水稻起源问题也引起了广泛的研究兴趣。经过一个多世纪不同学科研究者的不断探索，已经积累了大量水稻驯化起源知识。但水稻驯化是单次起源还是多次起源尚没有统一结论。 美国农业部（USDA）种质资源库在过去10
美国科学家开发全基因组测序水稻变体
水稻不仅是全球一半人口的主食，也为研究能源作物提供了模型。为优化生物燃料作物，科学家正寻找决定水稻产量、抗病性和灌溉效率等性状的基因。 最近在《植物细胞》杂志刊登的一篇论文中，美国加州大学戴维斯分校的研究团队与来自能源部联合基因组研究所的合作者，宣布开发出粳稻Kitaake的第一个全基因组测
谷子单倍体型图谱及全基因组关联分析研究出炉
由中国农科院作物所、中科院上海生科院植生生态所国家基因中心、中科院遗传发育所等8家单位合作，在国际上率先完成了谷子单倍体型图谱的构建和大量农艺性状的全基因组关联分析，该成果于6月24日在Nature Genetics(自然-遗传学)发表，标志着我国在谷子遗传学研究领域取得了重要的突破。
植物表型研究文章TOP10（三）
TOP 4● 高通量表型和全基因组关联分析：研究揭示水稻的自然遗传变异(Nat Commun,2014)通过使用高通量测序技术对植物基因组学的研究迅速发展，传统的植物表型测试已远远落后。此文的作者开发了一个高通量水稻表型测定设施（HRPF），用于监测水稻生育期的13个传统农艺性状和2个新定义的性状。
解析杂交水稻粒型和垩白性状的遗传基础
近日，中国水稻研究所杨仕华课题组联合中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所韩斌课题组和上海师范大学黄学辉课题组合作完成的“应用多套群体解析杂交稻粒型和垩白性状的遗传基础”的研究论文在线发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。该研究解析了我国当前杂交水稻外观品质性状的遗传学
水稻多器官单细胞多组学图谱问世
记者杨舒从中国农业科学院生物技术研究所获悉，该所作物耐逆性调控与改良创新团队日前联合国内外研究机构，构建了首个水稻的多器官单细胞多组学图谱，系统解析了水稻不同细胞类型的功能及其对复杂性状的调控作用，有力助力水稻设计育种。相关研究成果近日发表在国际学术期刊《自然》上。 单细胞组学是近年来生命科学
韩斌院士：破译水稻“基因密码”
从率领团队完成水稻第4号染色体的精确测序，到发现几百个与水稻性状有关的遗传位点，2013年新当选中国科学院院士、中国科学院上海生科院副院长、中国科学院国家基因研究中心主任韩斌，通过破译水稻“遗传密码”为全球育种专家提供了培育优良水稻品种的“金钥匙”。 水稻第4号染色体的精确测序图 1
研究揭示木薯重要农艺性状形成的遗传机制
近日，中国热科院生物所、品资所和三亚研究院联合福建农林大学、伊利诺伊大学、华中科技大学、中国农业科学院等单位在《基因组生物学》（Genome Biology）上发表研究论文，绘制了388份木薯种质的全基因组变异图谱，揭示了木薯群体水平杂合性变异影响木薯重要农艺性状的遗传机制，为木薯及其它高杂合作物遗
研究揭示木薯重要农艺性状形成的遗传机制
近日，中国热科院生物所、品资所和三亚研究院联合福建农林大学、伊利诺伊大学、华中科技大学、中国农业科学院等单位在《基因组生物学》（Genome Biology）上发表研究论文，绘制了388份木薯种质的全基因组变异图谱，揭示了木薯群体水平杂合性变异影响木薯重要农艺性状的遗传机制，为木薯及其它高杂合作
研究揭示西瓜3个重要农艺性状遗传机制
西瓜果皮颜色性状相关基因的定位及分析 刘文革供图 近日，中国农业科学院郑州果树研究所刘文革团队对西瓜果皮颜色、种皮颜色和节间长短3个性状的重要功能基因进行了挖掘和功能分析，阐述了其遗传和分子机理。相关研究成果分别在线发表于国际期刊《理论与应用遗传学》《植物科学前沿》和《国际分子科学杂志》。 论文
研究证实无融合生殖杂交水稻的遗传稳定性
近日，中国水稻研究所基因组编辑及无融合生殖创新团队将无融合生殖杂交水稻材料繁殖至第4代，从植株表型、基因组、甲基化、转录组和亚基因组转录等层面比较了不同世代克隆材料，证实了无融合生殖杂交稻在不同世代间的遗传稳定性，为未来人工无融合生殖体系在作物中应用奠定了理论基础。相关研究成果在线发表在《植物通
新研究可大幅提高杂交水稻全基因组选择预测精度
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/505572.shtm水稻是人类重要的粮食作物之一，水稻杂交种的产量高于常规自交系品种，但由于杂交稻存在显性等非加性效应，稻米品质的遗传改良比自交稻更具挑战性。湖南农业大学植物保护学院副教授李兰芝团队联合美
高质量黑麦基因组揭示重要的农艺基因
Nature Genetics 2021年3月18日，由河南农业大学王道文研究员团队联合多个单位共同破译黑麦基因组。相关研究成果“A high-quality genome assembly highlights rye genomic characteristics and agronomi
华中农大连发两项水稻重要成果
近期，华中农业大学水稻研究团队在水稻基因组研究中接连取得重要进展，相关研究结果接连发表在国际著名学术期刊《PNAS》、《Genome Biology》。 九月十日，张启发教授和练兴明教授作为共同通讯作者，在《PNAS》发表题为“Breeding signatures of rice impro
上海生科院揭示水稻籽粒大小调控机制
中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所国家基因研究中心团队在水稻控制籽粒大小的分子机制研究方面取得重要进展。他们经过多年的努力成功克隆和鉴定了一个控制水稻粒长与千粒重的关键基因GLW7，并深入研究了其分子机理及在水稻遗传改良中的作用，相关研究论文于3月7日在线发表在Nature Gene