高产学者Nature揭示RNA甲基化的新功能
MicroRNA(miRNA)是一类约22nt大小的内源RNA,在基因表达中起着重要的调控作用,参与了多种生理和病理过程。miRNA生成是一个复杂的过程,初级miRNA(pri-miRNA)需要经过细胞核和细胞质内的一系列加工才能形成成熟的miRNA。 整个流程的第一步是microprocessor复合体加工pri-miRNA。microprocessor复合体由RNA结合蛋白DGCR8和内切酶Drosha组成,DGCR8负责识别pri-miRNA茎环结构,然后招募DROSHA切割双链RNA,生成前体miRNA(pre-miRNA)。虽然人们对pri-miRNA加工机制研究得比较透彻,但至今还不清楚DGCR8在众多转录本二级结构中识别并结合pri-miRNA的机制。 洛克菲勒大学的研究团队发现,m6A是促进miRNA生成的关键性转录后修饰。这项研究发表在三月十八日的Nature杂志上,文章的通讯作者是洛克菲勒大学副教授S......阅读全文
CCAAT转录因子
中文名称CCAAT转录因子英文名称CCAAT transcription factor定 义可与启动子中的CCAAT元件发生特异性相互作用的转录因子。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞遗传(二级学科)
核转录分析
实验材料 cDNA0.45um 硝酸纤维素 尼龙膜 酵母 tRNA试剂、试剂盒 PBS NP-40 裂解缓: 20XSSC LNaOH 甘油储存缓冲液 10X 转录缓冲液 核苷酸:ATPGTPCTP 200uCi「α32P]-UTP 10XSET 蛋占酶 K 无 RNase 的 DNase
RNA-反转录
实验材料 poly(A)+RNA反转录酶鼠源反转酶 或禽源反转录酶试剂、试剂盒 oligo(dT)12-18 lmol LTris-Cl 1mol LTris-Cl lmol LKC1 25 mmol LMgCl2 dNTP 混合物 0.lmol LDTT RNasin实验步骤 一材料与设备1)p
辅助转录因子
中文名称辅助转录因子英文名称ancillary transcription factor定 义协助RNA聚合酶同启动子结合,并促进已结合的RNA聚合酶启动转录速率的转录因子。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞遗传(二级学科)
转录因子组成
真核生物在转录时往往需要多种蛋白质因子的协助。一种蛋白质是不是转录结构的一部分往往是通过体外系统看它是否是转录起始所需要的。一般这些促成转录起始所需的转录结构包括三个重要的组成部分:亚基RNA聚合酶的亚基,它们是转录必须的,但并不对某一启动子有特异性。复合物某些转录因子能与RNA聚合酶结合形成起始复
体外转录
· In Vitro RNA Transcription (Promega)For in vitro preparation single-stranded RNA probes or microgram quantities of defined RNA transcripts f
转录组测序和全转录组测序的区别
全转录组广义上是指细胞在特定状态下所能转录出来的 所有RNA的总和,包括mRNA和非编码RNA 。借助高通量测序技术,可以全面获取样本中转录产物信息,结合竞争性内源RNA ( ceRNA)机制, 进行联合分析,深入挖掘转录水平调控网络。转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有
RNA的转录与逆转录相关介绍
转录是以DNA为模板合成RNA的过程,经过转录DNA分子中的贮存信息传递到RNA分子中,再由mRNA做为模板合成蛋白质分子。逆转录也是从RNA的一个特定位置开始的,以RNA分子中的一条链为模板,在逆转录酶的作用下,以四种脱氧核苷酸为原料,合成方向仍是5'→3',完成cDNA的合成。大
转录组测序与转录表达谱测序的异同
转录组测序可以得到特定条件下所有mRNA转录本的丰度信息,从而发现新的转录本和可变剪接体基因表达谱(gene expression profile):指通过构建处于某一特定状态下的细胞或组织的非偏性cDNA文库,大规模cDNA测序,收集cDNA序列片段、定性、定量分析其mRNA群体组成,从而描绘该特
从修饰肽序列中判定修饰肽的溶解性方法
1.非HPLC纯化的修饰肽中有哪些杂质?答:粗品和脱盐级别的修饰肽中修饰肽和非修饰肽类杂质:如非全长修饰肽和修饰肽后处理的一些原料如DTT、TFA等。2.HPLC纯化的修饰肽有哪些杂质?答:经过HPLC纯化的修饰肽,仍会有一些一些杂质存在,其中的杂质主要是短肽和微量TFA。3.多长的修饰肽为合适?答
信使RNA的反转录酶与反转录过程
定义:以反义RNA为模版,通过反转录酶,进行的RNA转录 1.概念反转录是以RNA为模板合成DNA的过程,也称逆转录。这是DNA生物合成的一种特殊方式。 2.反转录酶与反转录过程 反转录过程由反转录酶催化,该酶也称依赖RNA的DNA聚合酶(RDDP),即以RNA为模板催化DNA链的合成。合
RNA复制的转录与逆转录的过程介绍
转录是以DNA为模板合成RNA的过程,经过转录DNA分子中的贮存信息传递到RNA分子中,再由mRNA做为模板合成蛋白质分子。逆转录也是从RNA的一个特定位置开始的,以RNA分子中的一条链为模板,在逆转录酶的作用下,以四种脱氧核苷酸为原料,合成方向仍是5'→3',完成cDNA的合成
GSDMD的棕榈酰化修饰
GSDMD是细胞焦亡过程中的关键蛋白,此前的研究表明GSDMD在细胞焦亡发生时可被Caspase切割,从而释放出N端结构域,释放出的N端结构域进一步形成寡聚体并上膜打孔,最终造成细胞死亡。但此前的研究发现人源GSDMD的C191A突变体会影响其寡聚和造成细胞死亡的能力,因此本文作者尝试探究GSDMD
什么是化学修饰?
凡通过化学基团的引入或除去,而使蛋白质或核酸共价结构发生改变的现象。
组蛋白修饰的意义
通过影响组蛋白与DNA双链的亲和性,从而改变染色质的疏松或凝集状态,或通过转录因子与结构基因启动子的亲和性来发挥基因调控作用。这些修饰之间存在协同和级联效应,更为灵活地影响染色质的结构与功能,通过多种修饰方式的组合发挥其调控功能。
细胞化学词汇DNA修饰
中文名称:DNA修饰英文名称:DNA modification定 义:DNA合成后,通过一系列化学加工使其结构发生某些改变。如DNA的甲基化等。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
细胞化学基础修饰碱基
又称稀有碱基,这些碱基在核酸分子中含量比较少,但他们是天然存在不是人工合成的,是核酸转录之后经甲基化、乙酰化、氢化、氟化以及硫化而成。多半是主要碱基的甲基衍生物。如:5-甲基胞苷、5,6-双氢脲苷等。另外有一种比较特殊的的核苷:假尿嘧啶核苷是由于碱基与核糖连接方式的与众不同,即尿嘧啶5位碳与核苷形成
何谓化学修饰调节
凡通过化学基因的引入或除去,而使蛋白质或核酸共价结构发生改变的现象。化学修饰(chemical modification)调节方式有别于别构调节。它以引起酶分子共价键的变化、化学结构的改变而影响酶活性。酶的化学修饰是在另一种酶的催化下完成的,是体内快速调节的另一种重要方式。化学修饰的方式包括磷酸化与
表观遗传学修饰
组蛋白修饰 表观遗传学是指表观遗传学改变 (DNA 甲基化、组蛋白修饰和非编码 RNA 如 miRNA) 对 表观基因组基因表达的调节,这种调节不依赖基因序列的改变且可遗传表观。因素如 DNA 甲基化、组蛋白修饰和 miRNA 是对环境刺激因素变化的反映,这些表观遗传学因素相互作用以调节基因
限制修饰系统结构
细菌的限制修饰系统包含三个连锁基因:(1)hsd R:编码限制性核酸内切酶(2)hsd M:编码限制性甲基化酶(3)hsd S:编码限制性酶和甲基化酶的协同表达
多肽合成与修饰技术
实验技术:多肽 合成是一个固相合成顺序一般从C端(羧基端)向 N端(氨基端)合成。过去的多肽合成是在溶液中进行的称为液相合成法。从1963年Merrifield发展成功了固相多肽合成方法以来,经过不断的改进 和完善,到今天固相法已成为多肽和蛋白质合成中的一个常用技术,表现出了经典液相合成
mRNA转录加工过程
加帽即在mRNA的5'-端加上m7GTP的结构。此过程发生在细胞核内,即对HnRNA进行加帽。加工过程首先是在磷酸酶的作用下,将5'-端的磷酸基水解,然后再加上鸟苷三磷酸,形成GpppN的结构,再对G进行甲基化。加尾这一过程也是细胞核内完成,首先由核酸外切酶切去3'-端一些过
RNA-大量转录合成
实验材料 模板 DNA 或质粒试剂、试剂盒 TE TE 饱和酚 氯仿异内醇 3mol LNaAc 无水乙醇 5X 转录缓冲液 lOOmmoL LDTT RNasin rATPrGTPrUTPrCTP SF6T3 或 T7RNA 聚合酶 异戊醇 DNase 7.5mol L 乙酸铵 无水乙醇 乙醇实验
RNA-标准转录反应
实验材料 模板 DNA 或质粒试剂、试剂盒 TE 异丙醇 3mol LNaAc 无水乙醇 5×转录缓冲液 l00 mmol L DTT RNasin rATPrGTPrUTP 各 2.5 mmol L [α42P] rCTP SPGT3 或 T7RNA 聚合酶 TE-饱和的酚氯仿异戊醇 DN
转录图谱的定义
转录图谱是在识别基因组所包含的蛋白质编码序列的基础上绘制的结合有关基因序列、位置及表达模式等信息的图谱。在人类基因组中鉴别出占具2%~5%长度的全部基因的位置、结构与功能,最主要的方法是通过基因的表达产物mRNA反追到染色体的位置。
转录的定义介绍
转录(Transcription)是遗传信息从DNA流向RNA的过程。即以双链DNA中的确定的一条链(模板链用于转录,编码链不用于转录)为模板,以A、U、C、G四种核糖核苷酸为原料,在RNA聚合酶催化下合成RNA的过程。作为蛋白质生物合成的第一步,进行转录时,一个基因会被读取并被复制为mRNA,即特
什么是转录中止?
转录终止: 当RNA链延伸到转录终止位点时,RNA聚合酶不再形成新的磷酸二酯键,RNA-DNA杂合物分离,转录泡瓦解,DNA恢复成双链状态,而RNA聚合酶和RNA链都被从模板上释放出来,这就是转录的终止(termination。
转录组测序原理
而转录组测序即是利用高通量测序技术,将细胞或组织中的全部或部分mRNA, miRNA, lnc RNA 进行测序分析的技术。通过RNA-seq,也就是转录组测序,可以帮助我们了解各种比较条件下所有基因的表达差异包括:正常组织与肿瘤组织;药物治疗前后的表达差异;发育过程中,不同发育阶段,不同组织的表达
RNA-大量转录合成
实验材料 模板 DNA 或质粒 试剂、试剂盒 TE TE 饱和酚 氯仿
转录物的概念
中文名称转录物英文名称transcript定 义在DNA模板上由RNA聚合酶催化转录生成的mRNA。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)