Drupal7发行中国区庆祝活动在植物所举行
1月7日,全球96个国家有326个相关活动庆祝Drupal 7的发布。中国区的庆祝活动于1月8日在中科院植物研究所举行。 Drupal是一个基于PHP语言编写的用于开发网站的开发型CMF内容管理框架,诞生于2000年。Drupal的代码在安全性和健壮性上均具有优异表现,因此包括美国白宫、美国商务部、法国政府、纽约时报、SONY等著名政府和机构纷纷采用Drupal建设网站。在生物多样性信息学领域,目前世界上两大生物多样性社区系统——LifeDesks和Scratchpads都是基于Drupal开发的。 为了更好地IT界学习Drupal的建设经验,也为让更多的人了解植物所的信息化平台建设工作,1月8日,植物所文献与信息管理中心联合Drupal中国社区在植物所举行“Drupal 7正式版本全球发行的中国地区庆祝活动”。来自优众网、北京软件出口中心、北京图信时代科技有限公司等10余家企业的近40余位Drup......阅读全文
Drupal-7发行中国区庆祝活动在植物所举行
1月7日,全球96个国家有326个相关活动庆祝Drupal 7的发布。中国区的庆祝活动于1月8日在中科院植物研究所举行。 Drupal是一个基于PHP语言编写的用于开发网站的开发型CMF内容管理框架,诞生于2000年。Drupal的代码在安全性和健壮性上均具有优异表现,因此包
生物信息学教程
Sequence - Evolution - FunctionComputational Approaches in Comparative GenomicsbyEugene V. KooninNational Center for Biotechnology Information, Bethes
生物芯片用于生物信息学研究
人类基因组计划是人类为了认识自己而进行的一项伟大而影响深远的研究计划。目前的问题是面对大量的基因或基因片断序列如何研究其功能,只有知道其功能才能真正体现HGP计划的价值--破译人类基因这部天书。后基因组计划、蛋白组计划、疾病基因组计划等概念就是为实现这一目标而提出的。生物信息学将在其中扮演至关重要的
生物信息学新进展
计算机技术和人类基因组计划的发展,应运而生了一门新兴的学科——生物信息学,该学科包含了两个交叉领域的工作:用于建立现代生物学所需信息系统框架(支持生物学的信息管理系统、分析工具和通讯网络)的研究开发工作,即传统意义上的生物信息学(bioinformatics);旨在理解基本生物学问题的基于计算的研究
生物信息学技术的原理
生物信息学在生命科学研究中起着越来越重要的作用。利用生物信息学对蛋白质组的各种数据进行处理和分析,也是蛋白质组研究的重要内容。生物信息学是蛋白质组学研究中不可缺少的一部分。生物信息学的发展,已不仅是单纯的对基因组、蛋白质组数据的分析,而且可以对已知的或新的基因产物进行全面分析。在蛋白质组数据库中储存
生物芯片技术用于生物信息学研究
人类基因组计划是人类为了认识自己而进行的一项伟大而影响深远的研究计划。目前的问题是面对大量的基因或基因片断序列如何研究其功能,只有知道其功能才能真正体现HGP计划的价值--破译人类基因这部天书。后基因组计划、蛋白组计划、疾病基因组计划等概念就是为实现这一目标而提出的。生物信息学将在其中扮演至关重要的
生物芯片技术用于生物信息学研究
人类基因组计划是人类为了认识自己而进行的一项伟大而影响深远的研究计划。目前的问题是面对大量的基因或基因片断序列如何研究其功能,只有知道其功能才能真正体现HGP计划的价值--破译人类基因这部天书。后基因组计划、蛋白组计划、疾病基因组计划等概念就是为实现这一目标而提出的。生物信息学将在其中扮演至关重要的
成都生物所开发新型生物信息学软件
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/1/472859.shtm 近年来,随着测序技术的快速发展,动物(尤其是非模式动物)全基因组数据(WGS)获取变得简单、便宜,这使得数据库中全基因组数据量呈指数态势增长。全基因组测序数据往往同时包含
生物信息学—促动BT与IT双赢
无论是与结构基因组学对应的“基因时代”,还是与功能基因组学、蛋白质组学相应的“后基因时代”;无论你称呼21世纪是“信息时代”、“后信息时代”,还是“生物时代”,所有这一切,都将BT(生物技术)与IT(信息技术)紧密结合起来。而这其中,无疑“生物信息学”占据了天时地利、出尽了风头,虽然它自身及其相
生物信息学技术的技术原理
生物信息学在生命科学研究中起着越来越重要的作用。利用生物信息学对蛋白质组的各种数据进行处理和分析,也是蛋白质组研究的重要内容。生物信息学是蛋白质组学研究中不可缺少的一部分。生物信息学的发展,已不仅是单纯的对基因组、蛋白质组数据的分析,而且可以对已知的或新的基因产物进行全面分析。在蛋白质组数据库中储存
生物芯片技术应用与生物信息学研究
人类基因组计划是人类为了认识自己而进行的一项伟大而影响深远的研究计划。目前的问题是面对大量的基因或基因片断序列如何研究其功能,只有知道其功能才能真正体现HGP计划的价值--破译人类基因这部天书。后基因组计划、蛋白组计划、疾病基因组计划等概念就是为实现这一目标而提出的。生物信息学将在其中扮演至关重要的
国际生物多样性日:保护生物多样性全球在行动
5月22日,是国际生物多样性日,而今年又是联合国确定的国际生物多样性年。 生物多样性与人类息息相关。如果没有生物多样性,人类难以感受到树林的绿意,还可能失去空气、食物和水。如果没有多姿多彩的其他生命形式,不仅生活会变得索然无味,而且人类可能
Science:生物信息学,神秘的新职业
今天的生物信息学家迎来了好时候。由于各个部门生成了几乎无穷无尽的生物数据,因此形成了对于生物、统计学和计算机科学交叉领域中有经验的专业人才的高度需求。科学家如果能够分析大量信息并将其清晰地展示给决策制定者,就会发现自己的工作和职业生涯前途无量,尤其是在大型制药和生物技术部门。 “在大数据时代,
生物信息学中的HSP的含义
热休克蛋白(英文:heat shock protein )又称应激蛋白,是机体细胞在一些理化因素刺激后高效表达的一组蛋白质,因最先发现于果蝇唾液腺的热应激反应中而得名,此后的研究表明,热休克蛋白广泛存在于人、动物、微生物和植物的细胞中,是一类在遗传上高度保守的分子,能保护细胞并促进细胞对各种刺激所造
Cystatin基因家族的生物信息学分析
实验概要半胱氨酸蛋白酶抑制剂(cystatin)基因广泛存在于植物物种中。该类基因能够起到抑制某些病原微生物和昆虫体内半耽氨酸蛋白酶的作用,在植物的防卫体系中起到重要作用。我们利用已经分离出植物cystatin基因的cystatin结构域为检索序列在基因组水平上对拟南芥和水稻中的cystatin基因
生物专业最强“杀手锏”:如何自学生物信息学?
当下,在部分学习生物专业的学生面临工作难找、科研难做的多重窘境之际,基因产业和个体化用药却在以前所未有的速度蓬勃发展,遗传咨询师行业亦初露头角。传统学习生物专业的学生,可谓是赶上了“最好的时代”,倘若你知道如何解开维系健康的生命密码信息,你将变得无可替代。那么问题来了,如何自学生物信息学?本文是
生物多样性的概念
生物多样性(biodiversity)是雷蒙德在1968年提出的生态学术语。生物多样性是生物(动物、植物、微生物)与环境形成的生态复合体以及与此相关的各种生态过程的总和,包括生态系统多样性、物种多样性和基因多样性三个层次。生物多样性使地球充满生机,也是人类生存和发展的基础,可通过就地保护和迁地保护等
生物多样性的特点
全球特点从整个地球范围来看,生物多样性分布明显与纬度有关,南北两极是生物多样性最少的区域。相反,在热带地区则集中了大部分的生物种类。处于这两个典型地带的中间区的温带,其生物多样性少于热带而多于寒带。例如,在国土面积大致相等的委内瑞拉和法国,其哺乳动物的种数相差3倍以上,前者有350种,而后者只有11
特征选择在生物信息学中的应用
随着生物信息学的发展,许多模式识别技术无法满足处理大量不相关特征的需求,因此特征选择技术(FS techniques)在生物信息学中的应用就变得越来越重要了。在过去的几年里,应用特征选择技术已经从仅仅作为一个说明性的例子发展到了建立模型所需要的先决条件了。特征选择技术最重要的目的有3点:(1)避免过
安捷伦科技生物信息学套装新增整合生物学分析功能
安捷伦科技生物信息学套装新增整合生物学分析功能 GeneSpring 现可实现通路水平的多组学及新一代测序数据分析 2012 年 3 月 27 日,加利福尼亚州圣克拉拉市——安捷伦科技公司(纽约证交所:A)今日发布了其广受欢迎的生物信息学软件的重要扩展版本
德国生物信息学家发现新冠病毒新弱点
近日,德国的生物信息学家通过计算机模型识别出人体中一种对新冠病毒繁殖至关重要的酶,如果抑制这种酶,病毒就会停止繁殖而不影响宿主细胞。该研究有助于找到对抗新冠病毒感染的新方法。 除了疫苗,寻找有效的治疗新冠病毒感染的药物也是战胜疫情的重要手段之一。现在,来自德国感染研究中心和蒂宾根大学的德尔格
第五届全国生物信息学大会召开
第五届全国生物信息学与系统生物学学术大会日前在哈尔滨召开,来自海内外的600余位生物信息学专家、学者出席会议。与会专家以“高通量时代的生物信息学与系统生物学”为主题,分别就利用基因组信息学分类细菌的新方法、细菌基因组组织形式、系统生物学在医学发展中的应用和研究策略以及基因组非编码
生物信息学应用:序列分析,电子克隆等初探
生物信息学可指利用信息技术管理和分析生物学数据。这就意味着生物信息学所涉及的范围相当广泛,从人工智能、机器人一直到基因组(genome)分析。就基因组分析这一角度来看,生物信息学主要是指核酸和蛋白质序列数据的计算机处理和分析。近年来,蛋白质结构数据的快速增长,使蛋白质三维结构的处理分析也归入到生物信
上海生科院《Genome-Res》生物信息学新成果
十月十三日,国际基因组研究权威刊物《Genome Research》在线发表了中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所(中国科学院—马普学会计算生物学伙伴研究所)的一项最新研究,题为“A probabilistic method for testing and estimating sele
北京大学PLOS生物信息学新成果
近日,北京大学分子医学研究所李川昀课题组与何爱彬研究员合作,在国际著名遗传学杂志《PLOS Genetics》发表一项重要研究成果,题为“Emergence, Retention and Selection: A Trilogy of Origination for Functional De
生物多样性危机,谁之过?
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/507964.shtm
评价生物多样性的指标
从物种水平来讲,一个地区的物种(植物和动物物种)多样性,既可以用物种的数量来衡量,也可以用相对种数多度(relative abundance of species)来衡量。从理论上讲,这两方面的原始数据可以转换成物种多样性指数(species diversity indices)。能实现这一点的公式
滇池生物多样性逐步恢复
6月5日,游人在昆明滇池国家旅游度假区永昌湿地公园内游览。 一群红嘴鸥在昆明滇池草海上自由飞翔。 近年来,云南省昆明市已对滇池治理投入约100亿元资金,滇池水质总体保持了稳定,部分污染指标略有下降。现在滇池沿湖地区已完成近6万亩湖滨湿地和生态林建设,逐步恢复湖内的
原核生物的多样性
虽然它不完全、虽然它简单,但是能在这个竞争激烈的环境中长久地活下去都会拥有自己的专属技能——原核生物的多样性。比如细胞形态的多样性、运动的多样性、生长发育多样性、细胞结构多样性、细胞化学多样性、代谢功能多样性、遗传变异多样性等。所以它是有着极高利用价值的生物资源。这一资源不仅表现为与人类生存着动
生物多样性的影响因素
土地用途改变土地用途改变是20世纪70年代以来陆地和淡水生态系统退化的最大直接驱动因素。主要包括开垦、基础设施建设、城市扩张、采矿、道路扩建、水电大坝以及管线建设等。这些活动造成毁林、生境破碎化等,进而导致生物多样性丧失。海洋和沿海土地利用变化包括沿海挤占生境、近海水产养殖、海水养殖、底拖网捕捞、陆