上海生科院揭示反式剪接的发生机制

4月1日,Genes & Development 发表了中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所徐永镇研究组题为A conserved intronic U1 snRNP-binding sequence promotes trans-splicing in Drosophila 的研究论文。 RNA剪接通常发生在一个前体RNA (pre-RNA) 的分子内部,即“顺式剪接”(cis-splicing),但也可以发生在两个前体RNA分子之间,最终生成杂合的mRNA,称为“反式剪接”(trans-splicing)。发生反式剪接的两个前体RNA分子可以来自同一基因的同义链或正反义链,甚至来自于不同染色体上的两个基因。已知的反式剪接基因数量相对较少,但普遍存在于真核生物中。低等真核生物,如锥虫与线虫,其绝大多数基因都需要进行反式剪接的加工,上世纪90年代的研究证明它们是由SL(Spliced Leader) RN......阅读全文

上海生科院通过生物大数据揭示反式剪接的基因演化功能

  11月2日,Nature Communications 发表了中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所李轩研究组题为The evolutionary landscape of intergenic trans-splicing events in insects 的研究论文。该工作揭示了反

上海巴斯德所等基于转录组测序数据的反式剪接研究获进展

  11月2日,国际学术杂志Nature Communications 发表了中国科学院上海巴斯德研究所研究员郝沛与中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所的合作研究成果:The evolutionary landscape of intergenictrans-splicing events

研究揭示抗生素抗性基因可经反式剪接参与蛋白产生

  7月9日,国际知名学术期刊Cell Research在线发表了中科院上海生科院生物化学与细胞生物学研究所李伯良研究组题为Production of ACAT1 56-kDa isoform in human cells via trans-splicing involving the amp

上海生科院揭示反式剪接的发生机制

  4月1日,Genes & Development 发表了中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所徐永镇研究组题为A conserved intronic U1 snRNP-binding sequence promotes trans-splicing in Drosophila 的研究论

CreloxP重组系统技术详解

Cre-loxP重组系统一.Cre-loxP重组系统作用原理1. Cre重组酶和loxP位点Cre重组酶(Cyclization Recombination Enzyme)由大肠杆菌噬菌体P1的Cre基因编码,是由343个氨基酸组成的38kD的蛋白质。它不仅具有催化活性,而且与限制酶相似,能够特异性

重组系统腺相关病毒产品说明

一.Cre-loxP重组系统作用原理Cre重组酶和loxP位点Cre重组酶(Cyclization Recombination Enzyme)由大肠杆菌噬菌体P1的Cre基因编码,是由343个氨基酸组成的38kD的蛋白质。它不仅具有催化活性,而且与限制酶相似,能够特异性识别loxP位点。LoxP(l

关于内含肽的种类介绍

  从内含肽的内部有无自导引归巢核酸内切酶结构域,可将内含肽分为2种类型。一种是全功能型内含肽(maxi—intein),具有蛋白剪接活性和自导引核酸内切酶序列(homingendonuclease);另一种是微型内含肽(mini—intein),只有蛋白剪接活性。其中自导引归巢核酸内切酶结构域的缺

内含肽的种类

从内含肽的内部有无自导引归巢核酸内切酶结构域,可将内含肽分为2种类型。一种是全功能型内含肽(maxi—intein),具有蛋白剪接活性和自导引核酸内切酶序列(homingendonuclease);另一种是微型内含肽(mini—intein),只有蛋白剪接活性。其中自导引归巢核酸内切酶结构域的缺失在

外显子重复的定义

中文名称外显子重复英文名称exon duplication定  义(1)一个基因内部产生一个或者多个外显子的复制拷贝。(2)两分子同种前体RNA进行反式剪接时,成熟RNA分子上出现重复的外显子序列。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)

知识分享:维真-CreloxP-重组系统腺相关病毒产品说明

  一.Cre-loxP重组系统作用原理  Cre重组酶和loxP位点  Cre重组酶(Cyclization Recombination Enzyme)由大肠杆菌噬菌体P1的Cre基因编码,是由343个氨基酸组成的38kD的蛋白质。它不仅具有催化活性,而且与限制酶相似,能够特异性识别loxP位点。

CreloxP重组系统技术详解

  Cre-loxP重组系统   一.Cre-loxP重组系统作用原理   1. Cre重组酶和loxP位点   Cre重组酶(Cyclization Recombination Enzyme)由大肠杆菌噬菌体P1的Cre基因编码,是由343个氨基酸组成的38kD的蛋白质。它不仅具有催化活性,

杨雪瑞课题组发现广泛存在的异链嵌合RNA:cscRNA

  转录组的复杂性是高等生物的标志性特征,是蛋白质组多样性的主要来源,同时也极大扩充了非编码RNA的种类与功能。除经典的RNA可变剪接之外,不同基因间的分子融合产生嵌合RNA(chimeric RNA),也是转录组复杂性的重要来源。DNA水平的基因重组与RNA水平的非经典剪接事件,包括顺、反式剪接(

Cell-Systems:构建RNA结合蛋白的剪接调控作用预测模型

   基因组研究结果显示,人体内超过90%的基因存在选择性剪接(alternative splicing)。该过程在不同组织以及不同生理阶段受到严格的调控,其失调会导致多种疾病的发生。选择性剪接的体内调控主要由前体mRNA中的顺式元件(cis-elements) 招募反式剪接作用因子(trans-a

关于外显子的表达序列介绍

  在反式剪接中,不同mRNA的外显子可以被接合在一起。外显子在剪接(Splicing)后仍会被保存下来,并可在蛋白质生物合成过程中被表达为蛋白质。外显子是最后出现在成熟RNA中的基因序列,又称表达序列。既存在于最初的转录产物中,也存在于成熟的RNA分子中的核苷酸序列。术语外显子也指编码相应RNA外

18亿美元合作-罗氏与Ascidian共同开发RNA外显子编辑疗法

  6月18日,Ascidian Therapeutics宣布与罗氏(Roche)达成一项总额高达约18亿美元的研究合作与许可协议,将共同发现和开发针对神经系统疾病的RNA外显子编辑疗法。  根据协议,Ascidian将向罗氏提供公司针对特定未公开神经科学靶点的RNA外显子编辑技术独家权益。作为合作

PNAS:-融合基因组学揭示横纹肌肉瘤细胞起源

  基因融合一直被认为是肿瘤独有的特征。基因融合是指染色体上两个异位的基因嵌合在一起,由于染色体发生易位、缺失或者倒置造成的,通常在癌症的发生发展扮演着重要的角色,并且可以作为诊断和治疗癌症的靶标。基因融合现象最早在慢性粒细胞白血病中发现 BCR-ABL基因融合(费城染色体)。除血液系统肿瘤外,在实

转基因——基因标靶

Gene Targeting Outline (University of Michigan Transgenic Animal Model Core)This is a brief outline of the steps necessary to produce mice with a muta

基因和基因检测

基因一词来自希腊语lγένος (génos),意为“种族、后代”,是指携带有遗传信息的一段DNA(脱氧核糖核酸)或RNA(核糖核酸)序列。基因是控制性状的基本遗传单位:比如人的身高、体重、皮肤颜色甚至寿命都部分或全部由基因控制。我们每个人都和他人不同(即所谓的个体差异),也是由基因序列上的差异控制

Adv-Sci|中山大学陈旭/林天歆/白守民合作揭示增强前列腺癌的放射抗性

  放射疗法是治疗前列腺癌(PCa)的武器库,但放射抗性严重损害了其有效性。失调的RNA剪接因子广泛参与肿瘤进展。尽管如此,剪接因子在PCa中对放射抗性的作用仍未得到充分探索。2024年9月17日,中山大学陈旭、林天歆、白守民共同通讯在Advanced Science在线发表题为“PTBP1 Reg

转录组测序揭示乳腺癌重排

即将在本周《美国科学院院刊》(PNAS)的网络版上发表的一篇论文中,一个国际研究小组介绍了一项利用高通量的转录组测序来发现乳腺癌细胞系中的基因组重排的原理论证研究。美国克莱格凡特研究院(J.Craig Venter Institute)、Lugwig癌症研究所的三个分所、以及纽约斯隆-凯特琳癌症

David-Liu首次通过AAV病毒载体在动物体内进行碱基编辑作用

  碱基编辑器用于研究和治疗遗传性疾病的成功取决于将其体内传递给相关细胞类型的能力。通过腺相关病毒(AAV)的传送受AAV打包能力的限制(AAV的基因组包装大小限制为≤5kb),因此无法使用全长碱基编辑器。  2020年1月14日,博德研究所David Liu团队在Nature Biomedical

死亡基因的基因类型

这一研究成果发表在美国神经学年鉴上,科学家在研究阿尔兹海默症等病时,意外发现这一基因,该基因有AA型、GG型、AG型三种类型。一个人有36%的可能性是AA型,有16%的几率是GG型,有48%的几率是AG型。

ras基因的基因结构

ras基因在进化中相当保守,广泛存在于各种真核生物如哺乳类,果蝇,真菌,线虫及酵母中,提示它有重要的生理功能.哺乳动物的ras基因家族有三个成员,分别是H-ras,K-ras,N-ras,其中K-ras的第四个外显子有A,B两种变异体.各种ras基因具有相似的结构,均由四个外显子组成,分布于全长约3

基因及基因产物分析

  基因突变引起的单基因病往往表现在酶和蛋白质的质和量的改变或缺如。因此,酶和蛋白质的定性定量分析是诊断单基因病或分子代谢病的主要方法。根据分子代谢病的临床特点可以从三个层次检测和分析。  1.代谢产物的检测酶缺陷导致一系列生化代谢紊乱,从而使代谢中间产物、底物、终产物旁路代谢产物发生变化。因此,检

基因靶向的基因敲除

实验步骤构建重组基因载体绝大多数的基因敲除策略都是基于同源重组的机制,其基因载体包括载体骨架、靶基因同源序列和突变序列及选择性标记基因等非同源序列,其中同源序列是影响同源重组效率的关键因素。用电穿孔显微注射方法把重组DNA转入受体细胞(一般是胚胎干细胞)核内。同源重组基因重组时以载体的同源序列取代染

假基因的代表基因介绍

Hirotsune博士指出:“这些发现将有助于未来人类疾病的治疗。当老鼠的假基因功能被阻断,疾病就产生了,因此,理论上来说,假基因的功能异常也可能是导致人类疾病产生的因子。”其实这项发现是随机发生的,因为当时研究人员是为了另一项完全不同的实验制作转殖鼠,他们将DNA注入受精卵,使得DNA随机嵌入老鼠

假基因的代表基因介绍

加工假基因有一类假基因除了一般的特征之外,还有一些其他的特征暗示着它们的形成与mRNA有关:①在假基因中完全缺少在相应的正常基因中存在的内含子顺序;②在假基因的3'末端有一段连贯的脱氧腺嘌呤核苷酸;③有些假基因与相应的正常基因在顺序组成上的相似性只限于相应的mRNA的3'末端之前的部

癌基因与抑癌基因

  癌基因(oncogene)一般可定义为某种基因,它的异常表达或表达产物的异常直接决定细胞恶性表型的产生。  抑癌基因或称抗癌基因(anti-oncogene)与肿瘤抑制基因(tumor suppressor gene)属同义词,是指某种基因当其受阻抑、失活、丢失、或其表达产物丧失功能可导

基因重组应用——转基因技术

基因重组中转基因技术的理论基础来源于进化论衍生来的分子生物学。基因片段的来源可以是提取特定生物体基因组中所需要的目的基因,也可以是人工合成指定序列的DNA片段。基因重组DNA片段被转入特定生物中,与其本身的基因组进行重组,再从重组体中进行数代的人工选育,从而获得具有稳定表现特定的遗传性状的个体。该技

与基因沉默相关特殊基因

奥地利格雷戈尔·门德尔植物分子生物学研究所日前宣布,一个包括该研究所、中国同济大学、美国加利福尼亚大学等机构科学家在内的国际科研小组发现了一种特殊基因,没有它,植物细胞内其他一些基因就只能保持沉默。最新一期英国《自然》杂志网络版发表了这个国际科研小组的论文。这一科研小组发现的特殊基因名为RDM1,它