上海生科院通过生物大数据揭示反式剪接的基因演化功能
11月2日,Nature Communications 发表了中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所李轩研究组题为The evolutionary landscape of intergenic trans-splicing events in insects 的研究论文。该工作揭示了反式剪接引导基因功能多样化的过程,并首次阐述了反式剪接在维持破碎基因功能方面的作用。 真核生物的基因具有复杂的剪接(splicing)机制。与比较常见的发生在同一个转录本(pre-mRNA)上的顺式剪接(cis-splicing)不同,RNA反式剪接(trans-splicing)是将不同基因转录本上的外显子连接起来,形成嵌合mRNA的现象。虽然真核生物中已有一些基因反式剪接案例的报道,但反式剪接的一些关键问题仍然没有得到解决: 包括反式剪接是剪接过程中的噪音还是具有显著的生物学功能?基因反式剪接在多大程度上影响了一个物种的转录组和蛋......阅读全文
上海生科院通过生物大数据揭示反式剪接的基因演化功能
11月2日,Nature Communications 发表了中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所李轩研究组题为The evolutionary landscape of intergenic trans-splicing events in insects 的研究论文。该工作揭示了反
上海生科院揭示反式剪接的发生机制
4月1日,Genes & Development 发表了中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所徐永镇研究组题为A conserved intronic U1 snRNP-binding sequence promotes trans-splicing in Drosophila 的研究论
上海巴斯德所等基于转录组测序数据的反式剪接研究获进展
11月2日,国际学术杂志Nature Communications 发表了中国科学院上海巴斯德研究所研究员郝沛与中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所的合作研究成果:The evolutionary landscape of intergenictrans-splicing events
研究揭示抗生素抗性基因可经反式剪接参与蛋白产生
7月9日,国际知名学术期刊Cell Research在线发表了中科院上海生科院生物化学与细胞生物学研究所李伯良研究组题为Production of ACAT1 56-kDa isoform in human cells via trans-splicing involving the amp
上海生科院解析真核生物基因表达调控的新机制
2月29日,Nature Plants 杂志在线发表了中国科学院上海生命科学研究院植物逆境生物学研究中心何跃辉课题组(植物环境表观遗传学实验室)题为Coupling of histone methylation and RNA processing by the nuclear mRNA Cap
上海生科院发布基因组多样性和祖源信息数据库
该研究分析了涵盖全球范围107个国家的356个人类族群的基因组多样性和祖源信息,并发布了开放获取的专门数据库——PGG.Population(群体基因组学·族群)。PGG.Population是迄今唯一在基因组水平专门解析人类族群遗传关系和祖源信息的公开数据库,也是目前收集族群数量最大的群体基
上海生科院—安捷伦系统生物学中心揭牌
8月3日,中国科学院上海生命科学研究院和安捷伦科技有限公司在上海举行了“中国科学院上海生命科学研究院-安捷伦系统生物学中心”(SIBS-Agilent Center for Systems Biology)成立揭牌仪式。上海生科院党委书记兼副院长张建新、上海生科院副院长吴家睿、安捷伦科技公司副总
白春礼视察上海生科院
8月12日,中科院常务副院长白春礼视察上海生科院。 白春礼先后视察了营养科学研究所林旭、刘勇实验室,神经科学研究所王伟实验室,生物化学与细胞生物学研究所裴钢实验室,听取了上海生科院院长陈晓亚、药物所所长丁健关于本单位推进科技创新工作、发展态势与竞争力分析、组织谋划“创新2020
上海生科院发现新的肺鳞癌致病融合基因
9月27日,国际学术期刊《细胞研究》(Cell Research)在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所季红斌研究组的最新研究成果Identification of TRA2B-DNAH5 fusion as a novel oncogenic driver in hu
上海生科院实现转基因食蟹猴加速传代
9月15日,Cell Research 期刊在线发表了中国科学院上海生命科学研究院神经科学研究所灵长类研究平台的研究论文:Generation of macaques with sperm derived from juvenile monkey testicular xenografts。该研
上海生科院糖尿病基因研究登上权威杂志
报道:来自上海生命科学研究院的消息,中科院上海生命科学研究院营养科学研究所的研究人员分析了包括CDKAL1在内的多个糖尿病易感基因上的SNP位点与2型糖尿病及其相关代谢指标的关联关系,获得了有关中国汉族人群2型糖尿病风险基因研究的最新发现。这一研究成果公布在国际糖尿病领域权威杂志《DIABETES》
上海生科院:预处理提高定量蛋白质组数据鉴定效率
11月30日,国际学术期刊《分子与细胞蛋白质组学》(Molecular & Cellular Proteomics)在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所系统生物学重点实验室曾嵘研究组与美国范德堡大学定量科学中心石瑜研究组的最新合作研究成果,揭示了稳定同位素化学标记高精
上海生科院《Genome-Res》生物信息学新成果
十月十三日,国际基因组研究权威刊物《Genome Research》在线发表了中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所(中国科学院—马普学会计算生物学伙伴研究所)的一项最新研究,题为“A probabilistic method for testing and estimating sele
上海生科院等设计高效精确基因靶向整合新策略
5月19日,《细胞研究》期刊在线发表了题为《运用CRISPR/Cas9 技术实现以同源臂介导的末端接合为基础的靶向整合》的研究论文,该研究由中国科学院上海生命科学研究院神经科学研究所、脑科学与智能技术卓越创新中心杨辉研究组、基因编辑平台施霖宇团队与苏州非人灵长类研究平台孙强团队合作完成。该研究设
上海生科院最新成果:基因突变致癌新发现
2013年8月29日, Cancer letters在线发表了中科院上海生物化学与细胞生物学研究所季红斌研究组、赵允研究组与复旦大学附属肿瘤医院陈海泉教授合作的最新研究成果“ Two co-existing germline mutations P53 V157D and PMS2 R2
上海生科院发现乳腺干细胞的细胞表面标记基因
10月19日,国际学术期刊《自然》(Nature)在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所/细胞生物学国家重点实验室曾艺研究团队的研究成果——Identification of Multipotent Mammary Stem Cells by Protein C Rec
上海生科院最新PNAS文章
4月19日,《美国科学院院刊》(PNAS)杂志在线发表了中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所巫永睿研究组题为Gene duplication confers enhanced expression of 27-kDa γ-zein for endosperm modification
上海生科院发现调控种子印迹基因表达的新机制
图A:ape1l 和zdp双突变对种子发育的影响图B:APE1L蛋白调控拟南芥中DNA主动去甲基化途径的工作模型 1月8日,中国科学院上海生命科学研究院上海植物逆境生物学研究中心朱健康课题组与科尔多瓦大学合作研究发现,拟南芥主动去甲基化途径中的新组件APE1L蛋白不仅是DNA主动去甲基化途径中的一
首届全国合成微生物学学术研讨会召开
由中国微生物学会分子微生物学及生物工程专业委员会和上海市微生物学会共同主办,中科院上海生科院植物生理生态研究所中科院合成生物学重点实验室和上海医药工业研究院创新药物与制药工艺国家重点实验室(筹)联合承办的“首届全国合成微生物学学术研讨会”于9月26日只9月27日在上海举行。
张亚平调研上海生科院
9月4日,中国科学院副院长、党组成员张亚平到中科院上海生命科学研究院调研,分别听取四个实体科研机构贯彻落实深化上海生科院改革各项任务推进情况工作报告,并与相关机构领导班子成员进行了座谈交流。 张亚平指出,在中科院党组领导下,在院机关和上海分院指导支持下,四个实体科研机构坚决贯彻落实决策部署,深
张亚平调研上海生科院
9月4日,中国科学院副院长、党组成员张亚平到中科院上海生命科学研究院调研,分别听取四个实体科研机构贯彻落实深化上海生科院改革各项任务推进情况工作报告,并与相关机构领导班子成员进行了座谈交流。 张亚平指出,在中科院党组领导下,在院机关和上海分院指导支持下,四个实体科研机构坚决贯彻落实决策部署,深
上海生科院JNeurosci解析神经调控
来自中科院上海生命科学研究院神经所,新乡医学院的研究人员第一次通过直接的电生理证据,证明了顶叶皮层的神经元在急速快速眼动过程中的活性不同,介绍了后顶叶皮层神经活动对快速眼动过程的影响,相关成果公布在神经学重要期刊Journal of Neuroscience杂志上。 领导这一研究的是中
上海生科院举办“生物技术创新创业案例分析”讲座
3月29日晚,中科院上海生命科学研究院二楼报告厅座无虚席,美国哈森生物技术研究所研究员韩健应邀来到第31期求索讲坛,以“生物技术创新创业案例分析”为题,为同学们做了一场精彩的报告。 韩健研究员为同学们介绍了多重PCR技术的原理,指出tem-PCR和arm-PCR技术在分子鉴别
上海生科院总结多种基因内部来源的非编码RNA生成机制
10月1日,中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所研究员杨力受邀在WIREs RNA 发表了题为Splicing noncoding RNAs from the inside out 的综述论文,系统总结了多种来自于前体RNA内部序列的非编码RNA分子及其产生机制和潜在功能作用。 真核基
上海生科院发现调控造血干细胞自我更新的新基因
7月2日,国际学术期刊PLOS Genetics在线发表了中国科学院上海生命科学研究院健康科学研究所潘巍峻研究组的最新研究成果“TopBP1 governs hematopoietic stem/progenitor cells survival in zebrafish definitive
上海生科院等设计出高效精确基因靶向整合的新策略
5月19日,《细胞研究》期刊在线发表了题为《运用CRISPR/Cas9 技术实现以同源臂介导的末端接合为基础的靶向整合》的研究论文,该研究由中国科学院上海生命科学研究院神经科学研究所、脑科学与智能技术卓越创新中心杨辉研究组、基因编辑平台施霖宇团队与苏州非人灵长类研究平台孙强团队合作完成。该研究设
上海生科院合作研究发现控制植物砷含量的关键基因
近年来,我国重金属污染问题日益突出,耕地和灌溉用水的污染导致砷等重金属通过食物链进入人体,严重威胁我国的食品安全和公众健康。阐明植物控制砷积累的分子遗传机制,进而限制砷向植物以及食物链的迁移是解决这一问题的根本出路。 12月3日,国际学术期刊PLoS Biology 在线刊发了由中国科学院上海
上海生科院发现肿瘤恶病质的潜在基因治疗方法
12月5日,国际学术期刊《分子治疗》(Molecular Therapy)发表了中国科学院上海生命科学研究院营养科学研究所丁秋蓉研究组的最新研究成果Prevention of Muscle Wasting by CRISPR/Cas9 -mediated Disruption of Myosta
上海生科院在玉米胚乳储存蛋白基因转录调控中取得进展
7月29日,《遗传学》(Genetics)杂志在线发表了中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所巫永睿研究组题为Divergent Transactivation of Maize Zein Storage Genes by the Transcription Factors Opaque
上海生科院合作在胆囊癌基因测序研究中获进展
7月6日,国际学术期刊《自然—遗传学》(Nature Genetics)杂志在线发表了中国科学院上海生命科学研究院营养科学研究所王慧研究组与上海交通大学附属新华医院刘颖斌教授、复旦大学生物医学研究院刘赟副教授等实验室合作的研究成果: Whole-exome and targeted gene s