Nature子刊发布重磅测序技术：基因组和转录组平行测序
四月二十七日的Nature Methods杂志上发布了一项引人注目的测序技术，G&T-seq（Genome and Transcriptome Sequencing）。该技术能够实现大规模的DNA和RNA平行测序，同时展现单个细胞的基因组序列和基因活性。 研究人员用G&T-seq对220个小鼠和人类细胞进行测序，获得了空前详细的信息。他们首次观察到，当细胞丢失或获得染色体拷贝时，该区域的基因表达也会出现相应的变化（减少或增加）。 “在单个细胞中同时测序基因组和转录组，我们可以看到基因变异的功能性影响，”文章的通讯作者之一，鲁汶大学和Wellcome基金会桑格研究所的Thierry Voet,教授说。“G&T-seq有助于更深入的理解正常组织和疾病组织之间的遗传学差异，为人们提供正常发育和疾病发展的新线索。举例来说，人们可以通过G&T-seq更好的理解肿瘤中的癌细胞多样性。” 在此之前，人......阅读全文
一项基于国产单分子测序平台的微量细胞研究成果
近日，由中信湘雅生殖与遗传专科医院（以下简称“中信湘雅”）林戈课题组和深圳市真迈生物科技有限公司（以下简称“真迈生物”）联合组成的研究团队在预印本服务网站BioRxiv在线发表了题为Accurate CNV identification from only a few cells with lo
研究发现RNA测序新方法：检测亚细胞水平转录组空间分布
斯坦福大学研究团队在RNA测序方面取得突破性进展，发明了一种亚细胞水平转录组空间分布的RNA测序新方法，研究论文于近日在线发表于国际期刊Cell，论文标题为“Atlas of subcellular RNA localization revealed by APEX-Seq”。 该研究发明了一
从事单细胞测序技术方面的实验室或研究机构介绍
在单细胞测序技术方面处于领先地位的实验室和研究机构：M20 Genomics：是一家从事单细胞测序技术开发及其相关应用的生命科技公司，总部位于杭州未来科技城，拥有全球首创和领先的新一代单细胞测序技术。公司创始团队由来自浙江大学和浙江省良渚实验室的科研人员以及来自麻省理工学院、杜克大学、加州大学洛杉矶
如何让单细胞测序变得简单？
单细胞生物学研究一直是当今的热门话题，而且最前沿的领域就是单细胞RNA测序了（scRNA-seq）。常规RNA测序方法一次性能够对成千上万个细胞进行加工测序，并给出平均差异，但并没有两个细胞是完全一样的，而新型的scRNA-seq方法就能够揭示出制造每一种特异性的微小改变，甚至这种技术还能够阐明完整
Fluidigm推出单细胞TCR测序产品
解析细胞表型是免疫学中一个共同的单细胞分析目标。然而，T细胞受体V(D)J基因区域的随机重排带来了T细胞群体的复杂变化。这形成了庞大的T细胞部队，以便识别特定的外源蛋白，引发有效的免疫反应。 为了在单细胞水平实现深度的T细胞分析，Fluidigm近日在C1™系统上推出了一个全新的免疫学应用 –
！单细胞测序的”CPU－2.0”时代
对单个人类细胞的基因组进行准确的变异检测和大范围单倍体型分析一直以来都是测序领域的巅峰挑战。单细胞测序使我们能在更高的分辨率下研究生命的机制。一方面，在像癌症这样的组织样本中存在大量具有不同基因组类型的单个细胞,因此需要分析单细胞水平基因组而不是大量细胞的平均值；另一方面，对于非常珍贵的细胞样品
单个循环肿瘤细胞RNA测序结果
由麻省总医院，哈佛大学主持的一项最新研究发现了前列腺癌细胞对一种常见的癌症治疗方法产生抗性的原因，研究人员完成了前列腺癌单个循环肿瘤细胞的RNA测序，其中找到了非经典Wnt信号所起的关键作用。 这一研究成果公布在9月18日的Science杂志上。 Androgendeprivationthe
单细胞测序基准数据的特点
单细胞测序基准数据集是用于评估和比较不同单细胞测序数据分析方法和工具的标准化数据集。这些数据集通常具有以下特点：高质量和准确性：经过严格的质量控制和验证，以确保数据的可靠性。多样性：涵盖不同的细胞类型、组织、物种和实验条件，以全面测试分析方法的通用性。详细的注释：包括细胞类型、状态、疾病信息等，以便
单细胞测序技术的技术特点
单细胞测序技术是一种在单个细胞水平上对基因组、转录组、表观遗传组等进行高通量测序分析的技术。 它具有以下几个重要特点和优势： 1. 揭示细胞异质性：能够发现细胞群体中不同细胞之间的细微差异，识别罕见细胞类型和细胞的不同状态。 2. 深入了解细胞发育和分化：追踪细胞从干细胞到成熟细胞的发育轨迹，揭
漫谈单细胞测序及其临床应用
一、概述随着现代生物学的发展，细胞群体的研究已不再能满足科研需求。单细胞测序解决了用组织样本测序或样本少时无法解决的细胞异质性难题，为科学家研究解析单个细胞的行为、机制、与机体的关系等提供了新方向。单细胞测序正在成为科研热点。二、单细胞测序倍受青睐的原因人们最初以为一个细胞类群是均质的（即各细胞都是
单细胞分离对单细胞测序领域的作用
单细胞分离可以采用特制的毛细管在载玻片的琼脂涂层上选取单孢子并切割下来，然后移到合适的培养基进行培养，分离法对操作技术有比较高的要求，多限于高度专业化的科学研究中采用。 它不仅仅可以用于分离单细胞，还可以用于nl级别试剂的分配和磁珠的分选，对于单细胞测序领域有着很大的帮助。快速高效接种单个活细胞至
玉米单细胞转录组测序，11种细胞类型
近日，广东省科学院南繁种业研究所生物育种研究室在玉米单细胞转录组测序研究方面取得新进展。相关研究在线发表于《作物学报》（The Crop Journal）。广东省科学院南繁种业研究所李旭辉博士为该论文第一作者，齐永文研究员为通讯作者。玉米是全球重要的粮食和能源作物，而其产量形成的基础依赖其特殊的根系
通过单细胞测序解析体细胞重编程路径
随着单细胞技术日新月异的发展和应用，准确有效地解读数据提供的信息尤为重要。这项研究提供了利用单细胞测序数据研究细胞命运动态变化的新方法，通过发现细胞命运分支的产生，找到影响分支产生的原因，更好的实现对生理或病理条件下细胞命运变化理解，实现控制细胞命运变化的目标。 体细胞重编程是研究细胞命运转
tRF测序应用于Biomarker研究
南京医科大学第一附属医院肿瘤科副主任医师殷咏梅教授长期从事消化道肿瘤和乳腺肿瘤的内科治疗，近来，其实验室利用tRF&tiRNA测序，发现在曲妥单抗敏感和耐受的乳腺癌细胞中，tRNA来源的小非编码RNA分子tRF&tiRNA表达差异显著。其中tRF-30-JZOYJE22RR33和tRF-27-ZDX
DNA测序技术的研究与发展
70年代末，WalterGilbert发明化学法、FrederickSanger发明双脱氧终止法手动测序，同位素标记80年代中期，出现自动测序仪（应用双脱氧终止法原理）、荧光代替同位素，计算机图象识别90年代中期，测序仪重大改进、集束化的毛细管电泳代替凝胶电泳2001年完成人类基因组框架图
PNAS：新测序方法助力癌症研究
在去年圣诞节期间的加拿大落基山脉冰攀之旅中，两位来自华盛顿大学的年轻研究人员：Michael Schmitt和Jesse Salk突发奇想，谈到了一个简单但功能强大，可用于检测癌细胞，获得更好结果的新方法――如果他们能降低DNA测序中的错误率，那么就可以更好的检测出这些细胞中的变异，这种改进
近期基因测序研究领域新成果！
本文中，小编整理了多篇研究报道，共同聚焦科学家们在测序研究领域取得的新成就，与大家一起学习！图片来源：Nature 【1】Nature：中国科学家使用单细胞测序来揭示人类胚胎植入的秘密 doi：10.1038/s41586-019-1500-0 近日，中国多家机构的一个研究团队利用单细胞测
时空分辨单细胞测序技术的应用对生物医学研究有哪些影响？
时空分辨单细胞测序技术的应用对生物医学研究产生了多方面的深远影响，包括但不限于以下几点：疾病机制的深入理解肿瘤研究：更精确地揭示肿瘤细胞的异质性、起源、转移路径以及与肿瘤微环境的动态相互作用，为肿瘤的诊断、治疗和预后评估提供新的靶点和策略。神经退行性疾病：帮助解析神经细胞在疾病进展中的时空变化，了解
研究人员通过单细胞测序技术揭示骨关节炎发病机制
骨关节炎是目前世界上广泛发生的软骨退变疾病。我国研究人员近期通过单细胞转录组测序技术，发现了与骨关节炎软骨退变有关的新的细胞亚型及其分子标志物。据悉，这一研究有助于揭示骨关节炎软骨退变发病机制，将为骨关节炎的诊断和治疗提供重要参考。 这一由北京大学生命科学院汤富酬课题组和中国人民解放军总医院王
研究人员通过单细胞测序技术揭示骨关节炎发病机制
骨关节炎是目前世界上广泛发生的软骨退变疾病。我国研究人员近期通过单细胞转录组测序技术，发现了与骨关节炎软骨退变有关的新的细胞亚型及其分子标志物。据悉，这一研究有助于揭示骨关节炎软骨退变发病机制，将为骨关节炎的诊断和治疗提供重要参考。 这一由北京大学生命科学院汤富酬课题组和中国人民解放军总医院王
严军研究组通过单细胞测序技术发现新的神经元亚型
2月18日，《自然-神经科学》期刊在线发表了题为《小鼠视交叉上核基因表达的时空单细胞分析》的研究论文。该研究由中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心（神经科学研究所）、上海脑科学与类脑研究中心、神经科学国家重点实验室严军研究组完成。该研究通过单细胞测序技术对小鼠昼夜节律中枢——视交叉上核进行了系
单细胞测序揭示肺癌肿瘤免疫细胞亚型的细胞图谱
最近免疫疗法的出现标志着多种癌症的研究和护理发生了巨大变化，给世界各地的患者和家庭带来了新的希望。对于那些对治疗有反应的人来说，结果可能是激动人心的。激活病人的癌症免疫系统可以杀死或缩小肿瘤，在某些情况下，会导致完全缓解。 尽管取得了重大进展，但只有少数人从免疫治疗中获益，原因尚不清楚。 免
艺高人胆大！相当“嚣张”的测序技术——单细胞器测序
线粒体疾病如何诊断和治疗？（运用成熟的单线粒体分离技术在显微镜下挑取单个小鼠线粒体。） 宾夕法尼亚大学医学院James Eberwine领导的研究小组刚开发了一种适用于单个线粒体的分离和测序技术“单线粒体测序（single-mitochondrion sequencing）”利用这种新方法他们
Cell：单细胞测序绘制骨髓基质细胞全景图谱
最新发布在Cell上的一项研究表明，单细胞测序可以绘制骨髓基质细胞的完整类群，并为白血病研究提供新的视角。这一新研究由美国哈佛大学的David T. Scadden教授和马萨诸塞州综合医院Broad研究所的Aviv Regev团队合作而成。他们创新地使用单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术
Nature：如何利用单细胞mRNA测序发现罕见细胞类型？
近日，来自荷兰的科学家在著名国际学术期刊nature上发表了一项最新研究进展，他们利用一种新的计算方法结合转录组测序发现了小肠中一些罕见的细胞类型，这对于深入了解器官的细胞组成，探究健康和疾病状态下的组织生物学具有重要意义。 理解一个器官的发育和功能需要对组成该器官的所有细胞类型的特性有一个清
新型单细胞测序方法可有效追踪癌症免疫细胞
澳大利亚加文医学研究所的科学家开发了一种新的单细胞测序方法RAGE-Seq（Repertoire and Gene Expression by Sequencing），该方法兼备高通量、靶向、长读长和单细胞测序特征，能够高准确度和灵敏度的识别全长抗原受体序列，追踪与癌症免疫反应相关的免疫细胞。7
干细胞先驱发表单细胞RNA测序新成果
人多能干细胞是研究人类胚胎发育的理想模型，可以揭示谱系分化背后的细胞和分子机制。不过，人们还不清楚单个干细胞如何退出多能状态并转化为相应的前体细胞。 Morgridge研究院的科学家们使用单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术，对来自人胚胎干细胞的谱系特异性前体细胞进行了转录组分析，揭示了
汤富酬最新综述：单细胞测序与干细胞
干细胞能够分化成为机体内任何类型的细胞，既是研究人体早期发育的理想工具，也是细胞治疗的宝贵资源。细胞间差异和异质性是干细胞群体固有的基本特性。如果我们对一群细胞进行组学分析，这些关键的信息就会被掩盖。 单细胞测序技术是近几年备受关注的强大工具，可以在同种干细胞中全面剖析细胞异质性，鉴定不同表型
应用Arraystar－ChIRP测序和RNA测序于糖尿病性肾病研究
美国德克萨斯大学安德森癌症研究中心Farhad R. Danesh教授主要从事肾脏病理的基础与临床研究。近期，其实验室通过Arraystar RNA-seq发现lncRNA分子——Tug1在糖尿病小鼠体内低表达。表达谱芯片及Arraystar CHIRP-seq等证明，Tug1能够直接结合PGC
应用Arraystar－ChIRP测序和RNA测序于糖尿病性肾病研究
美国德克萨斯大学安德森癌症研究中心Farhad R. Danesh教授主要从事肾脏病理的基础与临床研究。近期，其实验室通过Arraystar RNA-seq发现lncRNA分子——Tug1在糖尿病小鼠体内低表达。表达谱芯片及Arraystar CHIRP-seq等证明，Tug1能够直接结