Nature子刊发布最全面的基因组“通讯录”
启动子是控制基因开或关的关键DNA片段，它们的功能异常与多种疾病有关。科学家们在人类基因组中全面分析了启动子和增强子的远距离互作，绘制了迄今为止最全面的启动子互作图谱，有助于进一步理解疾病的遗传学基础。 这份图谱记录了上百万的启动子互作。“这就像是一本通讯录，现在我们知道通讯录中谁和谁在通话，”这项研究的共同第一作者Filipe Tavares-Cadete说。 在基因组中进行长途通话的片段非常多，其中启动子与远距离片段（至少相隔150,000 bp）的互作占到了一半以上。这是因为DNA在细胞内是盘绕成环的，可以将相距很远的片段带到一起。 此前的分析技术分辨率不足，难以将调控元件与特定启动子关联起来。Babraham研究所的研究团队想到了一个巧妙的解决方案，他们用RNA“诱饵”从海量的基因组互作中钓出含有启动子的片段。这个高分辨率的基因组互作分析技术被称为启动子捕获Hi-C，最初发表在三月份的Genome Resear......阅读全文
RNAi在基因治疗领域中的应用
RNAi作为一种高效的序列特异性基因剔除技术在传染性疾病和恶性肿瘤基因治疗领域发展极为迅速。在利用RNAi技术对HⅣ-1、乙型肝炎、丙型肝炎等进行基因治疗研究中发现，选择病毒基因组中与人类基因组无同源性的序列作为抑制序列可在抑制病毒复制的同时避免对正常组织的毒副作用。同时将抑制序列选择在特定的位点，
RNAi在基因治疗领域中的应用
RNAi作为一种高效的序列特异性基因剔除技术在传染性疾病和恶性肿瘤基因治疗领域发展极为迅速。在利用RNAi技术对HⅣ-1、乙型肝炎、丙型肝炎等进行基因治疗研究中发现，选择病毒基因组中与人类基因组无同源性的序列作为抑制序列可在抑制病毒复制的同时避免对正常组织的毒副作用。同时将抑制序列选择在特定的位点，
研究者们解开乳腺癌“暗物质”之谜
虽然癌细胞基因组中的蛋白质编码基因往往存在突变现象，但对于非编码区域来说，它们的突变也会导致肿瘤的生长。最近一项研究则从乳腺癌中找到了这样的例子。 虽然癌细胞基因组中的蛋白质编码基因往往存在突变现象，但对于非编码区域来说，它们的突变也会导致肿瘤的生长。最近一项研究则从乳腺癌中找到了这样的例
新型合成生物学技术将实现重疾治疗领域的突破
合成生物学为未来医疗提供美好前景，可以通过重新设计细胞来对抗癌症和糖尿病等疾病。科学家使用病毒作为载体将控制电路导入细胞，以使细胞以某种理想的方式行事，但问题是细胞以高度可变的方式受到感染，使得其基因表达变得非常难以预测。直到现在为止还没有一种可靠的方法来确保所有细胞以相同的方式表现。2018年
新型合成生物学技术将实现重疾治疗领域的突破
合成生物学为未来医疗提供美好前景，可以通过重新设计细胞来对抗癌症和糖尿病等疾病。科学家使用病毒作为载体将控制电路导入细胞，以使细胞以某种理想的方式行事，但问题是细胞以高度可变的方式受到感染，使得其基因表达变得非常难以预测。直到现在为止还没有一种可靠的方法来确保所有细胞以相同的方式表现。2018年
良好的开端：破译非编码突变！
12月14日，《Science》杂志报道，一项针对将近2000个家庭的全基因组测序研究显示，自闭症患者基因组的“启动子”区发生了突变，首次在全基因组分析背景下，揭示了人类基因组中非编码突变的作用。 大多数自闭症等疾病的测序研究都集中在基因组的编码区，因为人们认为编码基因是构建蛋白质的“食谱”。
中科院发表Cell－Res文章：三维基因组组装重要新机制
来自上海交通大学系统生物医学研究院比较生物医学中心，中科院北京生物物理所的研究人员发表了题为“Molecular mechanism of directional CTCF recognition of a diverse range of genomic sites”的文章，阐明了染色质架构蛋
合成工具dCas9在DNA中传递信息
莱斯大学的研究人员已经证明，CRISPR-Cas9作为一种越来越出名的基因编辑工具，可以在人类细胞中以更强大的方式使用。由莱斯大学生物工程师艾萨克斯·希尔顿(Isaac Hilton)和研究生王开元(Kaiyuan Wang)领导的团队使用失活Cas9 (dCas9)蛋白靶向人类基因组的关键片段，并
染色质架构蛋白CTCF结合人类基因组位点的机制研究取得..
近日，国际著名学术期刊《Cell Research》杂志在线发表了上海交通大学系统生物医学研究院比较生物医学中心吴强课题组和中科院北京生物物理所王艳丽课题组合作研究成果，“Molecular mechanism of directional CTCF recognition of a diver
RNAi技术在功能基因组中的应用
在功能基因组研究中，需要对特定基因进行功能丧失或降低突变，以确定其功能。由于RNAi具有高度的序列专一性，可以特异地使特定基因沉默，获得功能丧失或降低突变，因此RNAi可以作为一种强有力的研究工具，用于功能基因组的研究。将功能未知的基因的编码区（外显子）或启动子区，以反向重复的方式由同一启动子控制表
RNA干涉实验——采用RNA聚合酶Ⅲ启动子表达siRNA分子
实验方法原理因为哺乳动物细胞不具备低等真核生物细胞所具有的扩增 RNAi 信号的机制，因此人工合成或体外转录的 siRNA 分子在细胞内的作用是瞬时性的，不适合用于进行靶基因的表达受到抑制后细胞表型的长期变化观察，也不适于进行文库的筛选。此外，体外制备 siRNA 分子的成本比较高，而且 siRNA
为什么增强子对启动子没有专一性
（1）增强子可提高同一条DNA链上基因转录效率，可以远距离作用，通常距离l～4kb，个别情况下离开所调控的基因30kb仍能发挥作用，而且在基因的上游或下游都能起作用。 （2）增强子作用与其序列的正反方向无关，将增强子方向倒置依然能起作用。而将启动子倒置就不能起作用，可见增强子与启动子是很不相同
乳腺癌相关究发现BRCA改变类型与治疗反应之间存在联系
新的研究表明，在三阴性乳腺癌 (TNBC) 或卵巢癌患者中，BRCA1 启动子区域的表观遗传变化对治疗反应的影响似乎与 BRCA1 或 BRCA2 的基因组改变不同。 对于周四发表在《科学转化医学》上的一项研究，杰克逊基因组医学实验室、华盛顿大学医学中心、弗雷德哈钦森癌症研究中心和其他机构的研
概述杆状病毒表达系统的载体和发展
杆状病毒基因组十分庞大，不能直接对其进行操作插入外源基因，因此需要通过中间转染载体而获得重组杆状病毒。经过十多年来研究者们的不断探索，已构建出用于表达不同基因产物的各种转移载体。这些转移载体的共同特征是[3]： ①在一个基础质粒（如pUC系列）中插入一个多角体蛋白基因启动子（或p10基因启动子
因美纳发布突破性算法PromoterAI，加速获得罕见病诊断洞察
——全新人工智能算法首次大规模实现对人类基因组非编码区域中致病性调控遗传变异的准确解析美国加利福尼亚州圣迭戈——近日，全球基因测序和芯片技术的领导者因美纳（纳斯达克股票代码：ILMN）发布全新人工智能算法PromoterAI，该算法可以准确解析人类基因组非编码区域中的致病性调控遗传变异。2025年5
转录模板的必要条件
转录模板必须满足：1. 在基因组全长克隆过程中，在正向引物5‘末端添加T7启动子序列；2. 以T7启动子作为体外转录启动子，在启动子后面靶位序列连续带有3个G,转录效率最 高；3. 在正向引物5/端添加一个帽子G,有利于提高体外转录RNA分子的侵染活性。
关于体外转录的转录条件介绍
转录模板必须满足： 1. 在基因组全长克隆过程中，在正向引物5‘末端添加T7启动子序列； 2. 以T7启动子作为体外转录启动子，在启动子后面靶位序列连续带有3个G,转录效率最 高； 3. 在正向引物5/端添加一个帽子G,有利于提高体外转录RNA分子的侵染活性。
上海巴斯德所在流感病毒启动子/复制起点研究中取得进展
近日，国际学术期刊Virology在线发表了中国科学院上海巴斯德研究所丰田哲也研究组最新研究成果，揭示了流感病毒基因组C4启动子/复制起点具有较弱的聚合酶识别活性，从而减弱了流感病毒的转录和复制。 流感病毒基因组具有8个负链RNA片段。在自然情况下，甲型流感病毒基因组片段3’末端
双荧光素酶报告基因实验中的质粒怎么找
（1） 用生物信息学方法分析并预测启动子区可能的转录因子结合位点。（2）设计引物用PCR法从基因组DNA中克隆所需的靶启动子片段，将此片段插入到荧光素酶报告基因质粒（pGL3-basic）中。（3）筛选阳性克隆，测序。扩增克隆并提纯质粒备用。是检测启动子的荧光报告载体，当然是将miR的启动子序列构建
关于增强元件因子的基本信息介绍
增强元件因子是存在于高等真核生物和各种病毒的基因组中的一种DNA序列。通常位于基因转录起始位点的上游，在与专一的转录因子结合后能提高该基因的转录水平。与启动子不同，单独的增强元件因子不足以使基因表达。它们在两个方向和与启动子的任何距离处都能发挥作用。 与增强元件因子不同的是，启动子是基因(ge
谁在先？“鸡基因组”和“鸡蛋基因组”
是先有鸡还是先有鸡蛋？这个问题相当恼人，恐怕很难说清楚。现在，研究人员回答了与这个问题一样恼人的问题：是人类基因组中的成千上万的长重复DNA片段中，那个是第一个产生的？那些被复制了？ 这个答案发表在10月7日的《自然·遗传学》杂志上。该研究给出了人类基因组中DNA重复片段复制的第一个进化证据，这种
Nature子刊：用CRISPR操控表观基因组
杜克大学的研究人员开发出了一种新方法，可以精确地控制基因开启及激活的时间。借助这一新技术研究人员可通过化学操控包装DNA的蛋白，来开启特异的基因启动子和增强子——控制基因活性的基因组片段。 研究人员说，拥有操控表观基因组的能力将有助于他们探究特殊启动子和增强子在细胞命运或遗传病风险中所起的作用
AAVTBGCre/GOI在小鼠肝脏特异性基因表达或敲除中的应用...
AAV-TBG-Cre/GOI在小鼠肝脏特异性基因表达或敲除中的应用与优势分析AAV-TBG-Cre/GOI系统简介：l AAV-TBG-Cre系统是整合了肝脏特异性TBG启动子和Cre重组酶的腺相关病毒载体。Ø TBG启动子是一种基于人甲状腺结合球蛋白(TBG)启动子和微球蛋白增强子的混合型启动子
AVTBGCre/GOI在小鼠肝脏特异性基因表达敲除应用与分析
AAV-TBG-Cre/GOI系统简介： l AAV-TBG-Cre系统是整合了肝脏特异性TBG启动子和Cre重组酶的腺相关病毒载体。 Ø TBG启动子是一种基于人甲状腺结合球蛋白(TBG)启动子和微球蛋白增强子的混合型启动子，用于肝脏特异性转外源基因表达。 Ø Cre重组酶是
中国科学院揭示调控因子σI的启动子识别机制
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/10/510398.shtm2023年10月13日，中国科学院生物物理研究所朱平研究团队与中国科学院青岛生物能源与过程研究所冯银刚研究团队合作，在《Nature Communications》杂志发表了题为"S
NCBI使用方法之一：Map－viewer查找基因序列，RNA，启动子
下面以人的IL6（白细胞介素6）为例讲述一下具体的操作步骤一、打开Map viewer页面，网址为在search的下拉菜单里选择物种，for后面填写你的目的基因。二、点击“GO”：三、在步骤二图示的右下角有一个Quick Filter,下面是让你选择的几个复选框，在Gene前面的小方框里打勾，然后点
NCBI使用方法之一：Map－viewer查找基因序列，RNA，启动子
下面以人的IL6（白细胞介素6）为例讲述一下具体的操作步骤 一、打开Map viewer页面，网址为 在search的下拉菜单里选择物种，for后面填写你的目的基因。 二、点击“GO”： 三、在步骤二图示的右下角有一个Quick Filter,下面是让你选择的几个复选框，在Gene前面的小方框
俄罗斯科学家绘制出小分子RNA完整基因图
俄罗斯科学院普通基因研究所与莫斯科物理技术学院联合课题组共同绘制了人和鼠的小分子RNA完整基因图，相关成果刊登在《Nature Biotechnology》科学期刊上。 该课题组研发出专门的算法，不仅可用于寻找新型小分子RNA，而且还可确定不同组织上小分子RNA的活性。课题组收集和分析了人和
杆状病毒昆虫细胞表达系统
实验步骤一、杆状病毒表达载体最简单的经典杆状病毒表达载体是一个重组的杆状病毒，其基因组含有一段外源核酸序列，通常为编码目标蛋白质的dDNA，在多角体蛋白启动子控制下进行转录。这个嵌合的基因由多角体蛋白启动子和外源蛋白编码序列组成，其位于病毒基因组多角体座位，替代了非必需的野生型多角体基因。在实验室中
叶绿体基因组
叶绿体是地球上绿色植物把光能转化为化学能的重要细胞器，叶绿体中进行的光合作用是严格地受到遗传控制的。早在20世纪初，人们就已知叶绿体的某些性状是呈非孟德尔式遗传的，但直到60年代才发现了叶绿体DNA(chloroplast DNA，ctDNA)。叶绿体基因组是一个裸露的环状双链DNA分子，其大小在1